MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_021005	GACTA	2	10	1125653	1125662	40 %	20 %	20 %	20 %	480531354
23002	NC_021005	A	6	6	1125739	1125744	100 %	0 %	0 %	0 %	480531355
23003	NC_021005	TGT	2	6	1125787	1125792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531355
23004	NC_021005	ATC	2	6	1125797	1125802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531355
23005	NC_021005	TCC	2	6	1125831	1125836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531355
23006	NC_021005	AGA	2	6	1125853	1125858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531355
23007	NC_021005	A	6	6	1125903	1125908	100 %	0 %	0 %	0 %	480531355
23008	NC_021005	ACA	2	6	1125990	1125995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531355
23009	NC_021005	TGA	2	6	1126023	1126028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531355
23010	NC_021005	GAA	2	6	1126034	1126039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531355
23011	NC_021005	GGT	2	6	1126118	1126123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531355
23012	NC_021005	AAC	2	6	1126128	1126133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531355
23013	NC_021005	CAT	2	6	1126171	1126176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531355
23014	NC_021005	CCCTT	2	10	1126646	1126655	0 %	40 %	0 %	60 %	480531356
23015	NC_021005	TA	3	6	1126663	1126668	50 %	50 %	0 %	0 %	480531356
23016	NC_021005	CTA	2	6	1126814	1126819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531356
23017	NC_021005	ATG	2	6	1126828	1126833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531356
23018	NC_021005	CTT	3	9	1126916	1126924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531356
23019	NC_021005	GCAA	2	8	1127046	1127053	50 %	0 %	25 %	25 %	480531356
23020	NC_021005	GAA	2	6	1127085	1127090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531356
23021	NC_021005	AGA	2	6	1127237	1127242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531356
23022	NC_021005	GTG	2	6	1127245	1127250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531356
23023	NC_021005	CTA	2	6	1127252	1127257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531356
23024	NC_021005	CTT	2	6	1127307	1127312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531356
23025	NC_021005	CTC	2	6	1127316	1127321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531356
23026	NC_021005	ATC	2	6	1127395	1127400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531356
23027	NC_021005	TGA	2	6	1127405	1127410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531356
23028	NC_021005	CAA	2	6	1127512	1127517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531356
23029	NC_021005	CTT	2	6	1127540	1127545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531356
23030	NC_021005	CGAT	2	8	1127555	1127562	25 %	25 %	25 %	25 %	480531356
23031	NC_021005	GTG	2	6	1127566	1127571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531356
23032	NC_021005	CTTT	2	8	1127575	1127582	0 %	75 %	0 %	25 %	480531356
23033	NC_021005	GACT	2	8	1127599	1127606	25 %	25 %	25 %	25 %	480531356
23034	NC_021005	CAAC	2	8	1127697	1127704	50 %	0 %	0 %	50 %	480531356
23035	NC_021005	TC	3	6	1127713	1127718	0 %	50 %	0 %	50 %	480531356
23036	NC_021005	GAA	2	6	1127745	1127750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531356
23037	NC_021005	ATG	2	6	1127836	1127841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531356
23038	NC_021005	AAC	2	6	1127850	1127855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531356
23039	NC_021005	AACT	2	8	1127858	1127865	50 %	25 %	0 %	25 %	480531356
23040	NC_021005	TTGA	2	8	1127901	1127908	25 %	50 %	25 %	0 %	480531356
23041	NC_021005	A	7	7	1128067	1128073	100 %	0 %	0 %	0 %	480531356
23042	NC_021005	GATTA	2	10	1128110	1128119	40 %	40 %	20 %	0 %	480531357
23043	NC_021005	ATC	2	6	1128169	1128174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531357
23044	NC_021005	T	6	6	1128177	1128182	0 %	100 %	0 %	0 %	480531357
23045	NC_021005	CAAT	2	8	1128192	1128199	50 %	25 %	0 %	25 %	480531357
23046	NC_021005	TTC	2	6	1128217	1128222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531357
23047	NC_021005	CCT	2	6	1128242	1128247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531357
23048	NC_021005	AAG	2	6	1128356	1128361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531357
23049	NC_021005	ATA	2	6	1128395	1128400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531357
23050	NC_021005	GAC	2	6	1128447	1128452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531357
23051	NC_021005	CAG	2	6	1128453	1128458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531357
23052	NC_021005	ATCA	2	8	1128460	1128467	50 %	25 %	0 %	25 %	480531357
23053	NC_021005	GCTG	2	8	1128520	1128527	0 %	25 %	50 %	25 %	480531357
23054	NC_021005	TAC	2	6	1128550	1128555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531357
23055	NC_021005	TCG	2	6	1128568	1128573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531357
23056	NC_021005	AGCT	2	8	1128583	1128590	25 %	25 %	25 %	25 %	480531357
23057	NC_021005	CTG	2	6	1128618	1128623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531357
23058	NC_021005	CTT	2	6	1128637	1128642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531357
23059	NC_021005	GTT	2	6	1128683	1128688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531357
23060	NC_021005	CAA	2	6	1128708	1128713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531357
23061	NC_021005	ATG	2	6	1128797	1128802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531357
23062	NC_021005	ACG	2	6	1128805	1128810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531357
23063	NC_021005	TCC	2	6	1128860	1128865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531357
23064	NC_021005	CAG	2	6	1128907	1128912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531357
23065	NC_021005	TTC	2	6	1128913	1128918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531357
23066	NC_021005	TTC	2	6	1128934	1128939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531357
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23088	NC_021005	AACCA	2	10	1129996	1130005	60 %	0 %	0 %	40 %	480531358
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23100	NC_021005	TA	3	6	1130712	1130717	50 %	50 %	0 %	0 %	480531359
23101	NC_021005	TCA	2	6	1130836	1130841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531359
23102	NC_021005	AAT	2	6	1130854	1130859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531359
23103	NC_021005	CCCGA	2	10	1130879	1130888	20 %	0 %	20 %	60 %	480531359
23104	NC_021005	AG	3	6	1130930	1130935	50 %	0 %	50 %	0 %	480531359
23105	NC_021005	CTA	2	6	1130999	1131004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531359
23106	NC_021005	TAACT	2	10	1131041	1131050	40 %	40 %	0 %	20 %	480531360
23107	NC_021005	ACG	2	6	1131135	1131140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531360
23108	NC_021005	AAT	2	6	1131257	1131262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531360
23109	NC_021005	GCAAG	2	10	1131271	1131280	40 %	0 %	40 %	20 %	480531360
23110	NC_021005	CAC	3	9	1131298	1131306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531360
23111	NC_021005	TCA	2	6	1131489	1131494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531360
23112	NC_021005	ATC	2	6	1131542	1131547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531360
23113	NC_021005	CTT	2	6	1131583	1131588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531360
23114	NC_021005	CTT	2	6	1131655	1131660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531360
23115	NC_021005	TCTT	2	8	1131777	1131784	0 %	75 %	0 %	25 %	480531360
23116	NC_021005	TTGC	2	8	1131800	1131807	0 %	50 %	25 %	25 %	480531360
23117	NC_021005	CTC	2	6	1131815	1131820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531360
23118	NC_021005	CTG	2	6	1131824	1131829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531360
23119	NC_021005	ATC	2	6	1131857	1131862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531360
23120	NC_021005	ATC	2	6	1131878	1131883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531360
23121	NC_021005	TTG	2	6	1131911	1131916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531360
23122	NC_021005	TTC	2	6	1131941	1131946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531360
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23151	NC_021005	CTTT	2	8	1133523	1133530	0 %	75 %	0 %	25 %	480531360
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23156	NC_021005	TCT	3	9	1133751	1133759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531360
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23181	NC_021005	TAT	2	6	1135276	1135281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23183	NC_021005	A	6	6	1135388	1135393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23184	NC_021005	TAT	2	6	1135507	1135512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23186	NC_021005	T	6	6	1135538	1135543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23187	NC_021005	ATA	2	6	1135779	1135784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531362
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23199	NC_021005	TAT	2	6	1136623	1136628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23202	NC_021005	AAAG	2	8	1136705	1136712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23203	NC_021005	ATT	2	6	1136720	1136725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531363
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23222	NC_021005	A	6	6	1137745	1137750	100 %	0 %	0 %	0 %	480531363
23223	NC_021005	TCA	2	6	1137763	1137768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531363
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23227	NC_021005	CAT	2	6	1138035	1138040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531363
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23229	NC_021005	ATT	2	6	1138090	1138095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531364
23230	NC_021005	T	6	6	1138111	1138116	0 %	100 %	0 %	0 %	480531364
23231	NC_021005	TCA	2	6	1138139	1138144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531364
23232	NC_021005	AGT	2	6	1138158	1138163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531364
23233	NC_021005	AGC	2	6	1138288	1138293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531364
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23235	NC_021005	CAA	2	6	1138383	1138388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531364
23236	NC_021005	ACG	3	9	1138396	1138404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531364
23237	NC_021005	TCAT	2	8	1138442	1138449	25 %	50 %	0 %	25 %	480531364
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23242	NC_021005	GAT	2	6	1138615	1138620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531364
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23273	NC_021005	T	7	7	1140233	1140239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23274	NC_021005	TAA	2	6	1140244	1140249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23337	NC_021005	GGCTA	2	10	1143153	1143162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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23341	NC_021005	CAA	2	6	1143374	1143379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23342	NC_021005	ACCA	2	8	1143420	1143427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23343	NC_021005	TGA	2	6	1143437	1143442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23349	NC_021005	GCTC	2	8	1143673	1143680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23350	NC_021005	CAG	2	6	1143728	1143733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23352	NC_021005	GAT	2	6	1143786	1143791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23354	NC_021005	TTC	2	6	1143880	1143885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23355	NC_021005	ATT	2	6	1143922	1143927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23356	NC_021005	T	6	6	1143939	1143944	0 %	100 %	0 %	0 %	480531367
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23476	NC_021005	AGCTG	2	10	1149450	1149459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23477	NC_021005	ATC	3	9	1149483	1149491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23478	NC_021005	TAA	2	6	1149511	1149516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23479	NC_021005	ATTTT	2	10	1149519	1149528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23480	NC_021005	TTCT	2	8	1149549	1149556	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23481	NC_021005	GAA	2	6	1149584	1149589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23482	NC_021005	ATCA	2	8	1149652	1149659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23483	NC_021005	GCT	2	6	1149725	1149730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23484	NC_021005	AATT	2	8	1149745	1149752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23485	NC_021005	GTT	2	6	1149769	1149774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23486	NC_021005	TAT	2	6	1149964	1149969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23487	NC_021005	A	6	6	1149973	1149978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23488	NC_021005	CTCTA	2	10	1149981	1149990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23489	NC_021005	A	6	6	1150004	1150009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23490	NC_021005	TAT	2	6	1150050	1150055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23491	NC_021005	T	6	6	1150089	1150094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23492	NC_021005	AAATTC	2	12	1150123	1150134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	480531372
23493	NC_021005	CTT	2	6	1150173	1150178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531372
23494	NC_021005	ATG	2	6	1150186	1150191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531372
23495	NC_021005	CTT	2	6	1150248	1150253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531372
23496	NC_021005	GCTC	2	8	1150259	1150266	0 %	25 %	25 %	50 %	480531372
23497	NC_021005	CAC	2	6	1150314	1150319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531372
23498	NC_021005	ATG	2	6	1150334	1150339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531372
23499	NC_021005	GTT	2	6	1150371	1150376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531372
23500	NC_021005	TTG	2	6	1150436	1150441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531372

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