MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22504	NC_021005	TCT	2	6	1100789	1100794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22505	NC_021005	T	6	6	1100806	1100811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22506	NC_021005	TCAA	2	8	1100832	1100839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22507	NC_021005	TTTGG	2	10	1100875	1100884	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22508	NC_021005	GTT	2	6	1100934	1100939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22509	NC_021005	AAC	2	6	1100948	1100953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22510	NC_021005	CAA	2	6	1101166	1101171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22511	NC_021005	TAA	2	6	1101301	1101306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22512	NC_021005	GCT	2	6	1101309	1101314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22513	NC_021005	CAA	2	6	1101364	1101369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22514	NC_021005	ATT	2	6	1101420	1101425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22515	NC_021005	GA	3	6	1101493	1101498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22516	NC_021005	TCAA	2	8	1101621	1101628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22517	NC_021005	GCT	2	6	1101654	1101659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22518	NC_021005	TCC	2	6	1101666	1101671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22519	NC_021005	GTT	2	6	1101693	1101698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22521	NC_021005	ACC	2	6	1101851	1101856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22522	NC_021005	TGT	2	6	1101869	1101874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22523	NC_021005	TCA	2	6	1101945	1101950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22524	NC_021005	A	6	6	1101956	1101961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22525	NC_021005	TGT	2	6	1101962	1101967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22526	NC_021005	TAG	2	6	1101994	1101999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22529	NC_021005	TAT	2	6	1102156	1102161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22530	NC_021005	TGAAAA	2	12	1102169	1102180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22531	NC_021005	A	6	6	1102177	1102182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22541	NC_021005	T	8	8	1102708	1102715	0 %	100 %	0 %	0 %	480531332
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22545	NC_021005	TTA	2	6	1102842	1102847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531332
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22549	NC_021005	GCAA	2	8	1102964	1102971	50 %	0 %	25 %	25 %	480531332
22550	NC_021005	AAAT	2	8	1102984	1102991	75 %	25 %	0 %	0 %	480531332
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22554	NC_021005	TAG	2	6	1103091	1103096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22604	NC_021005	T	6	6	1106275	1106280	0 %	100 %	0 %	0 %	480531334
22605	NC_021005	ATTC	3	12	1106307	1106318	25 %	50 %	0 %	25 %	480531334
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22610	NC_021005	TAA	2	6	1106629	1106634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22611	NC_021005	ACA	2	6	1106671	1106676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531335
22612	NC_021005	A	6	6	1106678	1106683	100 %	0 %	0 %	0 %	480531335
22613	NC_021005	CTTCA	2	10	1106833	1106842	20 %	40 %	0 %	40 %	480531335
22614	NC_021005	A	7	7	1106846	1106852	100 %	0 %	0 %	0 %	480531335
22615	NC_021005	TTG	2	6	1106892	1106897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531335
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22974	NC_021005	TCA	2	6	1124262	1124267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531354
22975	NC_021005	CAG	2	6	1124272	1124277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531354
22976	NC_021005	AT	3	6	1124330	1124335	50 %	50 %	0 %	0 %	480531354
22977	NC_021005	TTC	2	6	1124348	1124353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531354
22978	NC_021005	TGAAAT	2	12	1124444	1124455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480531354
22979	NC_021005	TGC	2	6	1124474	1124479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531354
22980	NC_021005	TGTC	2	8	1124527	1124534	0 %	50 %	25 %	25 %	480531354
22981	NC_021005	TAC	2	6	1124574	1124579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531354
22982	NC_021005	CTT	2	6	1124623	1124628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531354
22983	NC_021005	TTC	2	6	1124741	1124746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531354
22984	NC_021005	GAT	2	6	1124790	1124795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531354
22985	NC_021005	A	6	6	1124886	1124891	100 %	0 %	0 %	0 %	480531354
22986	NC_021005	CAA	2	6	1124921	1124926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531354
22987	NC_021005	CTAG	2	8	1124982	1124989	25 %	25 %	25 %	25 %	480531354
22988	NC_021005	CAA	2	6	1125007	1125012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531354
22989	NC_021005	AAC	2	6	1125026	1125031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531354
22990	NC_021005	GCTT	2	8	1125040	1125047	0 %	50 %	25 %	25 %	480531354
22991	NC_021005	ACAA	2	8	1125058	1125065	75 %	0 %	0 %	25 %	480531354
22992	NC_021005	TGA	2	6	1125223	1125228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531354
22993	NC_021005	TCT	2	6	1125244	1125249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531354
22994	NC_021005	CAA	2	6	1125285	1125290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531354
22995	NC_021005	CTCA	2	8	1125329	1125336	25 %	25 %	0 %	50 %	480531354
22996	NC_021005	GCT	2	6	1125342	1125347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531354
22997	NC_021005	TCGT	2	8	1125361	1125368	0 %	50 %	25 %	25 %	480531354
22998	NC_021005	GGT	2	6	1125369	1125374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531354
22999	NC_021005	AGCC	2	8	1125404	1125411	25 %	0 %	25 %	50 %	480531354
23000	NC_021005	TCT	2	6	1125625	1125630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531354

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