MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021005	ATT	2	6	1027617	1027622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531279
21003	NC_021005	AGT	2	6	1027679	1027684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531279
21004	NC_021005	ACC	2	6	1027769	1027774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531280
21005	NC_021005	TGG	2	6	1027797	1027802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531280
21006	NC_021005	TTGA	2	8	1027813	1027820	25 %	50 %	25 %	0 %	480531280
21007	NC_021005	CAG	2	6	1027876	1027881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531280
21008	NC_021005	ATA	2	6	1027883	1027888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531280
21009	NC_021005	CTT	2	6	1027942	1027947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531280
21010	NC_021005	AGT	2	6	1027987	1027992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531280
21011	NC_021005	TAC	2	6	1028008	1028013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531280
21012	NC_021005	CTT	2	6	1028020	1028025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531280
21013	NC_021005	CAAAC	2	10	1028048	1028057	60 %	0 %	0 %	40 %	480531280
21014	NC_021005	TTA	2	6	1028081	1028086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531280
21015	NC_021005	ACA	2	6	1028122	1028127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531280
21016	NC_021005	A	6	6	1028152	1028157	100 %	0 %	0 %	0 %	480531280
21017	NC_021005	AAGA	2	8	1028164	1028171	75 %	0 %	25 %	0 %	480531280
21018	NC_021005	TTCT	2	8	1028219	1028226	0 %	75 %	0 %	25 %	480531280
21019	NC_021005	TTGA	2	8	1028305	1028312	25 %	50 %	25 %	0 %	480531280
21020	NC_021005	GAA	3	9	1028320	1028328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531280
21021	NC_021005	A	6	6	1028332	1028337	100 %	0 %	0 %	0 %	480531280
21022	NC_021005	TTA	2	6	1028445	1028450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531280
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21025	NC_021005	GTA	2	6	1028594	1028599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531280
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21042	NC_021005	TGG	2	6	1029763	1029768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531281
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21048	NC_021005	ATCT	2	8	1030102	1030109	25 %	50 %	0 %	25 %	480531281
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21052	NC_021005	TG	3	6	1030346	1030351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_021005	AGA	2	6	1030380	1030385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_021005	TGAT	2	8	1030388	1030395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21055	NC_021005	GA	3	6	1030404	1030409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_021005	GAG	2	6	1030457	1030462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_021005	TTG	2	6	1030501	1030506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21105	NC_021005	GT	3	6	1033040	1033045	0 %	50 %	50 %	0 %	480531283
21106	NC_021005	TGC	3	9	1033062	1033070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531283
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21118	NC_021005	TGC	2	6	1033497	1033502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531283
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21120	NC_021005	ATC	2	6	1033561	1033566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531283
21121	NC_021005	TTG	2	6	1033646	1033651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531283
21122	NC_021005	GAC	2	6	1033654	1033659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531283
21123	NC_021005	TTC	2	6	1033660	1033665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531283
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21126	NC_021005	TGC	2	6	1033707	1033712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531283
21127	NC_021005	AAG	2	6	1033784	1033789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531283
21128	NC_021005	CTG	2	6	1033799	1033804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531283
21129	NC_021005	CAA	2	6	1033838	1033843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531283
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21132	NC_021005	A	6	6	1034126	1034131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21133	NC_021005	A	6	6	1034147	1034152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21134	NC_021005	ATTG	2	8	1034178	1034185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21139	NC_021005	CGTT	2	8	1034362	1034369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21140	NC_021005	GA	3	6	1034379	1034384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21141	NC_021005	GTT	2	6	1034464	1034469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21142	NC_021005	TA	3	6	1034484	1034489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21146	NC_021005	TAG	2	6	1034703	1034708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21148	NC_021005	TAA	2	6	1034806	1034811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21149	NC_021005	A	6	6	1034861	1034866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21152	NC_021005	T	7	7	1035008	1035014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21153	NC_021005	TCTATC	2	12	1035128	1035139	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21154	NC_021005	TGG	2	6	1035168	1035173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21155	NC_021005	TAC	2	6	1035259	1035264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21157	NC_021005	T	6	6	1035290	1035295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21158	NC_021005	AT	3	6	1035395	1035400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21161	NC_021005	T	6	6	1035573	1035578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21162	NC_021005	TCTA	2	8	1035608	1035615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21239	NC_021005	AG	3	6	1040006	1040011	50 %	0 %	50 %	0 %	480531285
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21478	NC_021005	TGG	2	6	1052666	1052671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531290
21479	NC_021005	A	6	6	1052684	1052689	100 %	0 %	0 %	0 %	480531290
21480	NC_021005	TGG	2	6	1052767	1052772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531290
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21482	NC_021005	GCA	2	6	1052840	1052845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531290
21483	NC_021005	GCA	2	6	1052876	1052881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531290
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