MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021005	ACC	2	6	662146	662151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530954
13502	NC_021005	CT	3	6	662248	662253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13503	NC_021005	TTC	2	6	662262	662267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_021005	GATT	2	8	662422	662429	25 %	50 %	25 %	0 %	480530955
13505	NC_021005	GACT	2	8	662437	662444	25 %	25 %	25 %	25 %	480530955
13506	NC_021005	GTT	2	6	662524	662529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530955
13507	NC_021005	TCAG	2	8	662541	662548	25 %	25 %	25 %	25 %	480530955
13508	NC_021005	A	6	6	662579	662584	100 %	0 %	0 %	0 %	480530955
13509	NC_021005	TCT	2	6	662646	662651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530955
13510	NC_021005	GA	3	6	662700	662705	50 %	0 %	50 %	0 %	480530955
13511	NC_021005	GCA	2	6	662742	662747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530955
13512	NC_021005	TGA	2	6	662788	662793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530955
13513	NC_021005	TAA	2	6	662864	662869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530955
13514	NC_021005	CAG	2	6	662878	662883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530955
13515	NC_021005	ACC	2	6	662966	662971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530955
13516	NC_021005	TGT	2	6	662972	662977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530955
13517	NC_021005	T	6	6	663041	663046	0 %	100 %	0 %	0 %	480530955
13518	NC_021005	ACC	2	6	663080	663085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530955
13519	NC_021005	TTTTC	2	10	663097	663106	0 %	80 %	0 %	20 %	480530955
13520	NC_021005	ATA	2	6	663117	663122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530955
13521	NC_021005	CTGG	2	8	663138	663145	0 %	25 %	50 %	25 %	480530955
13522	NC_021005	A	6	6	663194	663199	100 %	0 %	0 %	0 %	480530955
13523	NC_021005	TGA	2	6	663202	663207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530955
13524	NC_021005	AAAG	2	8	663241	663248	75 %	0 %	25 %	0 %	480530955
13525	NC_021005	TTG	2	6	663294	663299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530955
13526	NC_021005	CCA	2	6	663318	663323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530955
13527	NC_021005	T	7	7	663335	663341	0 %	100 %	0 %	0 %	480530955
13528	NC_021005	T	7	7	663354	663360	0 %	100 %	0 %	0 %	480530955
13529	NC_021005	GAG	2	6	663365	663370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530955
13530	NC_021005	CAT	2	6	663407	663412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530955
13531	NC_021005	CAG	2	6	663415	663420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530955
13532	NC_021005	A	7	7	663474	663480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_021005	GAT	2	6	663486	663491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_021005	ACA	2	6	663642	663647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530956
13535	NC_021005	CCA	2	6	663682	663687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530956
13536	NC_021005	TCA	2	6	663709	663714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530956
13537	NC_021005	TTC	2	6	663850	663855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530956
13538	NC_021005	T	6	6	663896	663901	0 %	100 %	0 %	0 %	480530956
13539	NC_021005	CTT	2	6	663929	663934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530956
13540	NC_021005	TCAA	2	8	663952	663959	50 %	25 %	0 %	25 %	480530956
13541	NC_021005	CAC	2	6	663992	663997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530956
13542	NC_021005	CAG	2	6	663998	664003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530956
13543	NC_021005	ATCA	2	8	664011	664018	50 %	25 %	0 %	25 %	480530956
13544	NC_021005	CAT	2	6	664209	664214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530956
13545	NC_021005	TCA	2	6	664237	664242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530956
13546	NC_021005	AAT	2	6	664344	664349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530956
13547	NC_021005	T	7	7	664408	664414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_021005	CAT	2	6	664448	664453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_021005	TGT	2	6	664459	664464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_021005	AGAA	2	8	664472	664479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_021005	TTA	2	6	664552	664557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530957
13552	NC_021005	A	7	7	664598	664604	100 %	0 %	0 %	0 %	480530957
13553	NC_021005	AG	3	6	664701	664706	50 %	0 %	50 %	0 %	480530957
13554	NC_021005	CAT	2	6	664747	664752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530957
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13556	NC_021005	TTTGG	2	10	664776	664785	0 %	60 %	40 %	0 %	480530957
13557	NC_021005	A	6	6	664853	664858	100 %	0 %	0 %	0 %	480530957
13558	NC_021005	T	6	6	665029	665034	0 %	100 %	0 %	0 %	480530957
13559	NC_021005	A	6	6	665035	665040	100 %	0 %	0 %	0 %	480530957
13560	NC_021005	A	6	6	665069	665074	100 %	0 %	0 %	0 %	480530958
13561	NC_021005	CTA	2	6	665110	665115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530958
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13566	NC_021005	AAAT	2	8	665540	665547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_021005	T	6	6	665571	665576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13569	NC_021005	GAA	2	6	665587	665592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_021005	AAG	2	6	665601	665606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530959
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13579	NC_021005	AAG	2	6	666129	666134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530959
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13582	NC_021005	AGA	2	6	666256	666261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13592	NC_021005	GGT	3	9	666802	666810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530960
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13595	NC_021005	GTCA	2	8	666896	666903	25 %	25 %	25 %	25 %	480530960
13596	NC_021005	ATGCAG	2	12	666917	666928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480530960
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13601	NC_021005	GA	3	6	667062	667067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_021005	TATC	2	8	667122	667129	25 %	50 %	0 %	25 %	480530961
13603	NC_021005	A	6	6	667150	667155	100 %	0 %	0 %	0 %	480530961
13604	NC_021005	TTAC	2	8	667200	667207	25 %	50 %	0 %	25 %	480530961
13605	NC_021005	AAG	2	6	667226	667231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530961
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13607	NC_021005	ATC	2	6	667348	667353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13609	NC_021005	GAA	2	6	667442	667447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530962
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13611	NC_021005	CTT	2	6	667488	667493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530962
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13988	NC_021005	CAT	2	6	686034	686039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530978
13989	NC_021005	GAA	3	9	686063	686071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530978
13990	NC_021005	GAAA	2	8	686088	686095	75 %	0 %	25 %	0 %	480530978
13991	NC_021005	CGT	2	6	686141	686146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530978
13992	NC_021005	AAC	2	6	686181	686186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530978
13993	NC_021005	GAA	2	6	686227	686232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13994	NC_021005	GAA	2	6	686359	686364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530979
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13996	NC_021005	CTG	2	6	686450	686455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530979
13997	NC_021005	TCTG	2	8	686536	686543	0 %	50 %	25 %	25 %	480530979
13998	NC_021005	TG	3	6	686542	686547	0 %	50 %	50 %	0 %	480530979
13999	NC_021005	AAG	2	6	686602	686607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530979
14000	NC_021005	TGA	2	6	686667	686672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530979

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