MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021005	AGTG	2	8	636509	636516	25 %	25 %	50 %	0 %	480530930
13002	NC_021005	GAT	2	6	636615	636620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530930
13003	NC_021005	TTG	2	6	636621	636626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530930
13004	NC_021005	AAC	2	6	636660	636665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530930
13005	NC_021005	ATC	2	6	636682	636687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530930
13006	NC_021005	TCT	2	6	636720	636725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530930
13007	NC_021005	GAT	3	9	636738	636746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530930
13008	NC_021005	GTA	2	6	636750	636755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530930
13009	NC_021005	GA	3	6	636810	636815	50 %	0 %	50 %	0 %	480530930
13010	NC_021005	ATA	2	6	636874	636879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530930
13011	NC_021005	GATATT	2	12	636897	636908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480530930
13012	NC_021005	ATG	2	6	637024	637029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530930
13013	NC_021005	CAT	2	6	637050	637055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530930
13014	NC_021005	GACA	2	8	637065	637072	50 %	0 %	25 %	25 %	480530930
13015	NC_021005	GGAT	2	8	637073	637080	25 %	25 %	50 %	0 %	480530930
13016	NC_021005	ATT	2	6	637122	637127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530930
13017	NC_021005	CCT	2	6	637171	637176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530931
13018	NC_021005	AGC	2	6	637208	637213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530931
13019	NC_021005	TAGC	2	8	637239	637246	25 %	25 %	25 %	25 %	480530931
13020	NC_021005	TGTC	2	8	637251	637258	0 %	50 %	25 %	25 %	480530931
13021	NC_021005	TAG	2	6	637262	637267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530931
13022	NC_021005	ACAT	2	8	637289	637296	50 %	25 %	0 %	25 %	480530931
13023	NC_021005	CTG	2	6	637314	637319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530931
13024	NC_021005	AGG	2	6	637365	637370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530931
13025	NC_021005	TTGC	2	8	637386	637393	0 %	50 %	25 %	25 %	480530931
13026	NC_021005	GAA	2	6	637395	637400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530931
13027	NC_021005	CTG	2	6	637453	637458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530931
13028	NC_021005	TCC	2	6	637510	637515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530931
13029	NC_021005	AGAA	2	8	637589	637596	75 %	0 %	25 %	0 %	480530931
13030	NC_021005	GAT	2	6	637681	637686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530931
13031	NC_021005	AGAA	2	8	637748	637755	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021005	CAA	2	6	637785	637790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_021005	ATA	2	6	637826	637831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_021005	TCT	2	6	637853	637858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_021005	ATA	2	6	637863	637868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_021005	T	6	6	637873	637878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021005	T	6	6	637895	637900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_021005	CAAA	2	8	637929	637936	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13039	NC_021005	CTTA	2	8	637994	638001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13040	NC_021005	AGG	2	6	638005	638010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_021005	TCA	2	6	638058	638063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530932
13042	NC_021005	CAA	2	6	638090	638095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530932
13043	NC_021005	AGC	2	6	638107	638112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530932
13044	NC_021005	CTT	2	6	638151	638156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530932
13045	NC_021005	TTAT	2	8	638217	638224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021005	A	6	6	638243	638248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_021005	AGG	2	6	638280	638285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_021005	GAA	2	6	638309	638314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530933
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13051	NC_021005	CTA	2	6	638478	638483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530933
13052	NC_021005	GAA	2	6	638591	638596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530933
13053	NC_021005	A	6	6	638612	638617	100 %	0 %	0 %	0 %	480530933
13054	NC_021005	CT	3	6	638678	638683	0 %	50 %	0 %	50 %	480530933
13055	NC_021005	CA	3	6	638701	638706	50 %	0 %	0 %	50 %	480530933
13056	NC_021005	CTTGA	2	10	638786	638795	20 %	40 %	20 %	20 %	480530933
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13059	NC_021005	TTC	2	6	638901	638906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530933
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13061	NC_021005	GCT	2	6	638924	638929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530933
13062	NC_021005	CACC	2	8	638944	638951	25 %	0 %	0 %	75 %	480530933
13063	NC_021005	GTGG	2	8	639017	639024	0 %	25 %	75 %	0 %	480530933
13064	NC_021005	CAT	2	6	639139	639144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530933
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13075	NC_021005	AAGCTA	2	12	639600	639611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480530933
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13087	NC_021005	TAA	2	6	640044	640049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_021005	TA	3	6	640098	640103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_021005	T	7	7	640163	640169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_021005	TAG	2	6	640177	640182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_021005	A	6	6	640225	640230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_021005	A	6	6	640299	640304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_021005	A	6	6	640342	640347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_021005	TTA	2	6	640351	640356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_021005	GTA	2	6	640364	640369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_021005	CTTA	2	8	640381	640388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_021005	AGG	2	6	640393	640398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13103	NC_021005	AG	3	6	640544	640549	50 %	0 %	50 %	0 %	480530934
13104	NC_021005	GTG	2	6	640719	640724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530934
13105	NC_021005	C	6	6	640806	640811	0 %	0 %	0 %	100 %	480530934
13106	NC_021005	CAT	2	6	640858	640863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530934
13107	NC_021005	G	6	6	640922	640927	0 %	0 %	100 %	0 %	480530934
13108	NC_021005	TTG	2	6	640980	640985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530934
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13110	NC_021005	TGC	2	6	641146	641151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530934
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13112	NC_021005	GGT	2	6	641183	641188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530934
13113	NC_021005	AAG	2	6	641229	641234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530934
13114	NC_021005	TCG	2	6	641284	641289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530934
13115	NC_021005	TTAT	2	8	641352	641359	25 %	75 %	0 %	0 %	480530934
13116	NC_021005	GGT	2	6	641372	641377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530934
13117	NC_021005	CAACC	2	10	641497	641506	40 %	0 %	0 %	60 %	480530934
13118	NC_021005	TTC	2	6	641577	641582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_021005	GAA	2	6	641591	641596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021005	ATCA	2	8	641644	641651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13121	NC_021005	CTA	2	6	641714	641719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_021005	TA	4	8	641718	641725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13124	NC_021005	ATA	2	6	641792	641797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13249	NC_021005	CTA	2	6	647764	647769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530941
13250	NC_021005	ATC	2	6	647793	647798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530941
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13357	NC_021005	TCA	2	6	654152	654157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530948
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13365	NC_021005	GCA	2	6	654550	654555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530948
13366	NC_021005	ACA	2	6	654714	654719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13367	NC_021005	AG	3	6	654748	654753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13369	NC_021005	GCA	2	6	654909	654914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530949
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13493	NC_021005	AC	3	6	661878	661883	50 %	0 %	0 %	50 %	480530954
13494	NC_021005	ATC	2	6	661900	661905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530954
13495	NC_021005	TCC	2	6	661940	661945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530954
13496	NC_021005	A	6	6	662004	662009	100 %	0 %	0 %	0 %	480530954
13497	NC_021005	GAC	2	6	662011	662016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530954
13498	NC_021005	GTC	2	6	662032	662037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530954
13499	NC_021005	TCT	2	6	662090	662095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530954
13500	NC_021005	TTCAC	2	10	662096	662105	20 %	40 %	0 %	40 %	480530954

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