MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021005	CGA	2	6	612745	612750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530903
12502	NC_021005	GCT	2	6	612751	612756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530903
12503	NC_021005	T	6	6	612756	612761	0 %	100 %	0 %	0 %	480530903
12504	NC_021005	TTC	2	6	612768	612773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530903
12505	NC_021005	GCT	2	6	612781	612786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530903
12506	NC_021005	CTTT	2	8	612809	612816	0 %	75 %	0 %	25 %	480530903
12507	NC_021005	TCC	2	6	612906	612911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_021005	CAGC	2	8	612926	612933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_021005	CTC	2	6	612934	612939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_021005	CTGA	2	8	612956	612963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_021005	TAA	2	6	612977	612982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_021005	A	6	6	612991	612996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_021005	A	6	6	613013	613018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_021005	AAT	2	6	613031	613036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530904
12515	NC_021005	TTG	2	6	613042	613047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530904
12516	NC_021005	CTG	2	6	613054	613059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
12517	NC_021005	AGA	2	6	613175	613180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530904
12518	NC_021005	GCAG	2	8	613181	613188	25 %	0 %	50 %	25 %	480530904
12519	NC_021005	TCA	2	6	613196	613201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530904
12520	NC_021005	AG	3	6	613215	613220	50 %	0 %	50 %	0 %	480530904
12521	NC_021005	GGACT	2	10	613318	613327	20 %	20 %	40 %	20 %	480530904
12522	NC_021005	ACC	2	6	613354	613359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530904
12523	NC_021005	CTC	2	6	613372	613377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530904
12524	NC_021005	GAG	2	6	613380	613385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530904
12525	NC_021005	TGG	2	6	613441	613446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530904
12526	NC_021005	AGCA	2	8	613447	613454	50 %	0 %	25 %	25 %	480530904
12527	NC_021005	TCG	3	9	613478	613486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
12528	NC_021005	GAT	2	6	613572	613577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530904
12529	NC_021005	ACC	2	6	613606	613611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530904
12530	NC_021005	GCT	2	6	613686	613691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
12531	NC_021005	CGT	2	6	613779	613784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
12532	NC_021005	GAT	2	6	613896	613901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530904
12533	NC_021005	A	6	6	613912	613917	100 %	0 %	0 %	0 %	480530905
12534	NC_021005	GAG	2	6	613918	613923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530905
12535	NC_021005	CTG	2	6	613930	613935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530905
12536	NC_021005	GAA	2	6	613981	613986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
12537	NC_021005	TCG	2	6	614069	614074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530905
12538	NC_021005	TGG	2	6	614105	614110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530905
12539	NC_021005	AGA	2	6	614115	614120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
12540	NC_021005	ACT	2	6	614125	614130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530905
12541	NC_021005	CAA	2	6	614139	614144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530905
12542	NC_021005	TTGG	2	8	614305	614312	0 %	50 %	50 %	0 %	480530905
12543	NC_021005	CAGG	2	8	614335	614342	25 %	0 %	50 %	25 %	480530905
12544	NC_021005	CGT	2	6	614389	614394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530905
12545	NC_021005	AATCA	2	10	614404	614413	60 %	20 %	0 %	20 %	480530905
12546	NC_021005	GGT	2	6	614436	614441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530905
12547	NC_021005	GAA	2	6	614713	614718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
12548	NC_021005	AGCA	2	8	614719	614726	50 %	0 %	25 %	25 %	480530905
12549	NC_021005	GAG	2	6	614773	614778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530905
12550	NC_021005	A	6	6	614783	614788	100 %	0 %	0 %	0 %	480530905
12551	NC_021005	TC	3	6	614793	614798	0 %	50 %	0 %	50 %	480530905
12552	NC_021005	CAT	2	6	614799	614804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530905
12553	NC_021005	TAA	2	6	614847	614852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530905
12554	NC_021005	TGG	2	6	614861	614866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530905
12555	NC_021005	ATT	2	6	614943	614948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530905
12556	NC_021005	AG	3	6	615027	615032	50 %	0 %	50 %	0 %	480530905
12557	NC_021005	GAA	2	6	615046	615051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
12558	NC_021005	AAAT	2	8	615102	615109	75 %	25 %	0 %	0 %	480530905
12559	NC_021005	AGA	2	6	615117	615122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
12560	NC_021005	TTA	2	6	615237	615242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530906
12561	NC_021005	GTT	2	6	615257	615262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530906
12562	NC_021005	A	7	7	615290	615296	100 %	0 %	0 %	0 %	480530906
12563	NC_021005	ATT	2	6	615315	615320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530906
12564	NC_021005	TCAG	2	8	615330	615337	25 %	25 %	25 %	25 %	480530906
12565	NC_021005	TCTG	2	8	615403	615410	0 %	50 %	25 %	25 %	480530906
12566	NC_021005	GAG	2	6	615470	615475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530906
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12568	NC_021005	CTG	2	6	615684	615689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530906
12569	NC_021005	TA	3	6	615738	615743	50 %	50 %	0 %	0 %	480530906
12570	NC_021005	ATTA	2	8	615747	615754	50 %	50 %	0 %	0 %	480530906
12571	NC_021005	TTA	2	6	615944	615949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530907
12572	NC_021005	CAGA	2	8	616024	616031	50 %	0 %	25 %	25 %	480530907
12573	NC_021005	GT	3	6	616085	616090	0 %	50 %	50 %	0 %	480530907
12574	NC_021005	CATT	2	8	616113	616120	25 %	50 %	0 %	25 %	480530907
12575	NC_021005	GCT	2	6	616273	616278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530907
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12579	NC_021005	CCT	2	6	616572	616577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530907
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12582	NC_021005	CTA	2	6	616720	616725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530908
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12587	NC_021005	CGA	2	6	616877	616882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530908
12588	NC_021005	AAC	2	6	616947	616952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530908
12589	NC_021005	TGA	2	6	617035	617040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530908
12590	NC_021005	AGC	2	6	617076	617081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530908
12591	NC_021005	ATC	2	6	617091	617096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530908
12592	NC_021005	AGTCT	2	10	617134	617143	20 %	40 %	20 %	20 %	480530908
12593	NC_021005	ACA	2	6	617223	617228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530908
12594	NC_021005	T	6	6	617256	617261	0 %	100 %	0 %	0 %	480530908
12595	NC_021005	TTG	2	6	617388	617393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530908
12596	NC_021005	CT	3	6	617416	617421	0 %	50 %	0 %	50 %	480530908
12597	NC_021005	AGCT	2	8	617428	617435	25 %	25 %	25 %	25 %	480530908
12598	NC_021005	GTT	2	6	617489	617494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_021005	CTT	2	6	617542	617547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530909
12600	NC_021005	TAG	2	6	617549	617554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530909
12601	NC_021005	TCA	2	6	617628	617633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530909
12602	NC_021005	TCT	2	6	617790	617795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530909
12603	NC_021005	TCTT	2	8	617874	617881	0 %	75 %	0 %	25 %	480530909
12604	NC_021005	TGG	2	6	617934	617939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530909
12605	NC_021005	AAG	2	6	617997	618002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530909
12606	NC_021005	CGT	2	6	618034	618039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530909
12607	NC_021005	GAAG	2	8	618067	618074	50 %	0 %	50 %	0 %	480530909
12608	NC_021005	TCC	2	6	618195	618200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530909
12609	NC_021005	AG	3	6	618236	618241	50 %	0 %	50 %	0 %	480530909
12610	NC_021005	CCATC	2	10	618247	618256	20 %	20 %	0 %	60 %	480530909
12611	NC_021005	CATTT	2	10	618305	618314	20 %	60 %	0 %	20 %	480530909
12612	NC_021005	GA	3	6	618336	618341	50 %	0 %	50 %	0 %	480530909
12613	NC_021005	TCAT	2	8	618375	618382	25 %	50 %	0 %	25 %	480530909
12614	NC_021005	CGA	2	6	618394	618399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530909
12615	NC_021005	ATA	2	6	618405	618410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530909
12616	NC_021005	TTG	2	6	618419	618424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530909
12617	NC_021005	AGA	2	6	618470	618475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530909
12618	NC_021005	TCT	2	6	618504	618509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530910
12619	NC_021005	A	7	7	618512	618518	100 %	0 %	0 %	0 %	480530910
12620	NC_021005	ATG	2	6	618558	618563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530910
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12622	NC_021005	TAT	2	6	618589	618594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530910
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