MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021005	CAT	2	6	512412	512417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530825
10503	NC_021005	TCCAAA	2	12	512519	512530	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480530825
10504	NC_021005	TTA	2	6	512597	512602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530825
10505	NC_021005	TTA	2	6	512673	512678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530825
10506	NC_021005	A	6	6	512678	512683	100 %	0 %	0 %	0 %	480530825
10507	NC_021005	T	6	6	512696	512701	0 %	100 %	0 %	0 %	480530825
10508	NC_021005	ATT	2	6	512772	512777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530825
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10510	NC_021005	ATT	2	6	512885	512890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530825
10511	NC_021005	TAA	2	6	512926	512931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530825
10512	NC_021005	TAA	2	6	512942	512947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530825
10513	NC_021005	GAT	2	6	512961	512966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530825
10514	NC_021005	ATG	3	9	513127	513135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530825
10515	NC_021005	GTTT	2	8	513224	513231	0 %	75 %	25 %	0 %	480530825
10516	NC_021005	TGA	2	6	513234	513239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_021005	TTTAT	2	10	513319	513328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_021005	ATTA	2	8	513335	513342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_021005	ATT	2	6	513363	513368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_021005	CTTAG	2	10	513403	513412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10521	NC_021005	T	6	6	513428	513433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_021005	T	6	6	513447	513452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_021005	A	6	6	513460	513465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_021005	A	7	7	513494	513500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_021005	AAAG	2	8	513506	513513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_021005	ATC	2	6	513539	513544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530826
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10529	NC_021005	T	6	6	513629	513634	0 %	100 %	0 %	0 %	480530826
10530	NC_021005	CGC	2	6	513688	513693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530826
10531	NC_021005	TTG	2	6	513808	513813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530826
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10533	NC_021005	GCTT	2	8	513825	513832	0 %	50 %	25 %	25 %	480530826
10534	NC_021005	TTTC	2	8	513853	513860	0 %	75 %	0 %	25 %	480530826
10535	NC_021005	GCAA	2	8	513989	513996	50 %	0 %	25 %	25 %	480530826
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10538	NC_021005	TAC	2	6	514234	514239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530826
10539	NC_021005	TCCC	2	8	514288	514295	0 %	25 %	0 %	75 %	480530826
10540	NC_021005	CT	3	6	514349	514354	0 %	50 %	0 %	50 %	480530826
10541	NC_021005	CGT	2	6	514381	514386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530826
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10543	NC_021005	TC	3	6	514438	514443	0 %	50 %	0 %	50 %	480530826
10544	NC_021005	TCA	2	6	514517	514522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530826
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10552	NC_021005	CGT	2	6	514850	514855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530826
10553	NC_021005	ATG	2	6	514858	514863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530826
10554	NC_021005	A	6	6	514885	514890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_021005	GAG	2	6	514909	514914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_021005	CAG	2	6	514959	514964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_021005	GAG	2	6	514984	514989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_021005	GAA	2	6	514990	514995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_021005	GA	3	6	515038	515043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_021005	ATGA	2	8	515047	515054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_021005	AG	3	6	515066	515071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_021005	TA	4	8	515106	515113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_021005	AATT	2	8	515163	515170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_021005	AGT	2	6	515290	515295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10567	NC_021005	CT	3	6	515366	515371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10569	NC_021005	GGA	2	6	515515	515520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530827
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10593	NC_021005	ATA	2	6	516961	516966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530828
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10596	NC_021005	GAAA	2	8	517063	517070	75 %	0 %	25 %	0 %	480530828
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10612	NC_021005	A	6	6	517738	517743	100 %	0 %	0 %	0 %	480530829
10613	NC_021005	GACA	2	8	517800	517807	50 %	0 %	25 %	25 %	480530829
10614	NC_021005	ATGC	2	8	517960	517967	25 %	25 %	25 %	25 %	480530829
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10992	NC_021005	CTA	2	6	537569	537574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530844
10993	NC_021005	AAG	2	6	537649	537654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530844
10994	NC_021005	TTTA	2	8	537886	537893	25 %	75 %	0 %	0 %	480530845
10995	NC_021005	TATT	2	8	537955	537962	25 %	75 %	0 %	0 %	480530845
10996	NC_021005	CT	4	8	538186	538193	0 %	50 %	0 %	50 %	480530845
10997	NC_021005	GAG	2	6	538199	538204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530845
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11000	NC_021005	CCT	2	6	538320	538325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530845

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