MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_020568	ACA	2	6	1832394	1832399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44002	NC_020568	TAT	2	6	1832457	1832462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_020568	ATG	2	6	1832503	1832508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_020568	CT	3	6	1832515	1832520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44005	NC_020568	AGA	2	6	1832574	1832579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_020568	GCA	2	6	1832584	1832589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44007	NC_020568	TACAGT	2	12	1832610	1832621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44008	NC_020568	GAA	2	6	1832638	1832643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_020568	TAT	2	6	1832700	1832705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44010	NC_020568	TCATA	2	10	1832782	1832791	40 %	40 %	0 %	20 %	470225034
44011	NC_020568	ATT	2	6	1832860	1832865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225034
44012	NC_020568	TACT	2	8	1832872	1832879	25 %	50 %	0 %	25 %	470225034
44013	NC_020568	TAAA	2	8	1832901	1832908	75 %	25 %	0 %	0 %	470225034
44014	NC_020568	GAT	2	6	1832924	1832929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225034
44015	NC_020568	TAT	2	6	1832930	1832935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225034
44016	NC_020568	TCA	2	6	1833025	1833030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225034
44017	NC_020568	AGAA	2	8	1833108	1833115	75 %	0 %	25 %	0 %	470225034
44018	NC_020568	ATT	2	6	1833161	1833166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225034
44019	NC_020568	ATTG	2	8	1833230	1833237	25 %	50 %	25 %	0 %	470225034
44020	NC_020568	CCA	2	6	1833279	1833284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225034
44021	NC_020568	TAG	2	6	1833312	1833317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225034
44022	NC_020568	ACT	2	6	1833322	1833327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225034
44023	NC_020568	AT	3	6	1833362	1833367	50 %	50 %	0 %	0 %	470225034
44024	NC_020568	ATTT	2	8	1833402	1833409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44025	NC_020568	T	6	6	1833407	1833412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44026	NC_020568	AT	3	6	1833454	1833459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44027	NC_020568	CTAT	2	8	1833483	1833490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44028	NC_020568	T	6	6	1833582	1833587	0 %	100 %	0 %	0 %	470225035
44029	NC_020568	GAA	2	6	1833641	1833646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225035
44030	NC_020568	TTG	2	6	1833659	1833664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225035
44031	NC_020568	AAT	2	6	1833683	1833688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225035
44032	NC_020568	TTTTA	2	10	1833811	1833820	20 %	80 %	0 %	0 %	470225035
44033	NC_020568	CTG	2	6	1833914	1833919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225035
44034	NC_020568	CAA	2	6	1833969	1833974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225035
44035	NC_020568	TAAA	2	8	1833996	1834003	75 %	25 %	0 %	0 %	470225035
44036	NC_020568	TCC	2	6	1834021	1834026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225035
44037	NC_020568	GTT	2	6	1834068	1834073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225035
44038	NC_020568	TGA	2	6	1834130	1834135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225035
44039	NC_020568	T	6	6	1834172	1834177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_020568	GGC	2	6	1834285	1834290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44041	NC_020568	ATC	2	6	1834306	1834311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44042	NC_020568	TAT	2	6	1834323	1834328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44043	NC_020568	CTTTT	2	10	1834329	1834338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44044	NC_020568	ATA	2	6	1834348	1834353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44045	NC_020568	CTT	2	6	1834358	1834363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44046	NC_020568	TTC	2	6	1834455	1834460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44047	NC_020568	ATTTC	2	10	1834558	1834567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44048	NC_020568	TTC	2	6	1834625	1834630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44049	NC_020568	GAT	2	6	1834676	1834681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44050	NC_020568	ATA	2	6	1834682	1834687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44051	NC_020568	TC	3	6	1834701	1834706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44052	NC_020568	AG	3	6	1834725	1834730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44053	NC_020568	CAT	2	6	1834763	1834768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44054	NC_020568	TCA	2	6	1834777	1834782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44055	NC_020568	T	7	7	1834800	1834806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44056	NC_020568	A	6	6	1834993	1834998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_020568	TGA	2	6	1835019	1835024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44058	NC_020568	ATA	3	9	1835099	1835107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44059	NC_020568	TAAT	2	8	1835156	1835163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44060	NC_020568	TGT	2	6	1835171	1835176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44061	NC_020568	CTT	2	6	1835227	1835232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225036
44062	NC_020568	TGA	2	6	1835250	1835255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225036
44063	NC_020568	TCA	2	6	1835331	1835336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225036
44064	NC_020568	TAG	2	6	1835421	1835426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225036
44065	NC_020568	GAT	2	6	1835462	1835467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225036
44066	NC_020568	ATA	2	6	1835471	1835476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225036
44067	NC_020568	AAT	2	6	1835483	1835488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225036
44068	NC_020568	TTGG	2	8	1835508	1835515	0 %	50 %	50 %	0 %	470225036
44069	NC_020568	TTC	2	6	1835545	1835550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225036
44070	NC_020568	AGT	2	6	1835642	1835647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225036
44071	NC_020568	TTG	2	6	1835686	1835691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225036
44072	NC_020568	ATT	2	6	1835758	1835763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44073	NC_020568	TGA	2	6	1835791	1835796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44074	NC_020568	GTTTT	2	10	1835817	1835826	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44075	NC_020568	GA	3	6	1835836	1835841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44076	NC_020568	ATG	2	6	1835846	1835851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44077	NC_020568	ATT	2	6	1835908	1835913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44078	NC_020568	ATT	2	6	1835923	1835928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44079	NC_020568	A	7	7	1836041	1836047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44080	NC_020568	AT	3	6	1836079	1836084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44081	NC_020568	TAAT	2	8	1836115	1836122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44082	NC_020568	AAAC	2	8	1836140	1836147	75 %	0 %	0 %	25 %	470225037
44083	NC_020568	T	6	6	1836149	1836154	0 %	100 %	0 %	0 %	470225037
44084	NC_020568	T	6	6	1836165	1836170	0 %	100 %	0 %	0 %	470225037
44085	NC_020568	ATCT	2	8	1836215	1836222	25 %	50 %	0 %	25 %	470225037
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44087	NC_020568	T	6	6	1836245	1836250	0 %	100 %	0 %	0 %	470225037
44088	NC_020568	GTT	2	6	1836251	1836256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225037
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44090	NC_020568	T	6	6	1836348	1836353	0 %	100 %	0 %	0 %	470225037
44091	NC_020568	ATA	2	6	1836381	1836386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225037
44092	NC_020568	TAA	2	6	1836428	1836433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225037
44093	NC_020568	ATCA	2	8	1836441	1836448	50 %	25 %	0 %	25 %	470225037
44094	NC_020568	TTAAA	2	10	1836455	1836464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_020568	TCG	2	6	1836478	1836483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44096	NC_020568	CTT	2	6	1836484	1836489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44097	NC_020568	CT	3	6	1836538	1836543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44098	NC_020568	TAG	2	6	1836565	1836570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44099	NC_020568	CTGA	2	8	1836572	1836579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44100	NC_020568	TTCATT	2	12	1836618	1836629	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44101	NC_020568	TTA	2	6	1836640	1836645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44102	NC_020568	CTT	2	6	1836701	1836706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44103	NC_020568	AGA	2	6	1836731	1836736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44104	NC_020568	TA	3	6	1836744	1836749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44105	NC_020568	T	6	6	1836753	1836758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44106	NC_020568	TGT	2	6	1836760	1836765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44107	NC_020568	TCT	2	6	1836788	1836793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44108	NC_020568	TTG	2	6	1836802	1836807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225038
44109	NC_020568	GAA	2	6	1836818	1836823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225038
44110	NC_020568	T	6	6	1836832	1836837	0 %	100 %	0 %	0 %	470225038
44111	NC_020568	GTT	2	6	1836838	1836843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225038
44112	NC_020568	ATA	2	6	1836955	1836960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225038
44113	NC_020568	A	7	7	1836971	1836977	100 %	0 %	0 %	0 %	470225038
44114	NC_020568	TAA	2	6	1836981	1836986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225038
44115	NC_020568	T	7	7	1836992	1836998	0 %	100 %	0 %	0 %	470225038
44116	NC_020568	TAA	2	6	1837003	1837008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225038
44117	NC_020568	TACA	2	8	1837009	1837016	50 %	25 %	0 %	25 %	470225038
44118	NC_020568	CTA	2	6	1837116	1837121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225038
44119	NC_020568	TCATC	2	10	1837126	1837135	20 %	40 %	0 %	40 %	470225038
44120	NC_020568	ATTTA	2	10	1837172	1837181	40 %	60 %	0 %	0 %	470225038
44121	NC_020568	TTTG	2	8	1837220	1837227	0 %	75 %	25 %	0 %	470225038
44122	NC_020568	GTA	2	6	1837275	1837280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225038
44123	NC_020568	CTT	2	6	1837292	1837297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225038
44124	NC_020568	TTG	2	6	1837449	1837454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225039
44125	NC_020568	CTT	3	9	1837478	1837486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225039
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44130	NC_020568	AGT	2	6	1837781	1837786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225039
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44167	NC_020568	TAA	2	6	1839219	1839224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44182	NC_020568	TTG	2	6	1839915	1839920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44233	NC_020568	TAAT	2	8	1842165	1842172	50 %	50 %	0 %	0 %	470225042
44234	NC_020568	AATA	2	8	1842187	1842194	75 %	25 %	0 %	0 %	470225042
44235	NC_020568	CCA	2	6	1842195	1842200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225042
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44238	NC_020568	TGT	2	6	1842413	1842418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225042
44239	NC_020568	TGA	2	6	1842466	1842471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225042
44240	NC_020568	T	6	6	1842500	1842505	0 %	100 %	0 %	0 %	470225042
44241	NC_020568	ATT	2	6	1842507	1842512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225042
44242	NC_020568	A	6	6	1842579	1842584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44243	NC_020568	GAAT	2	8	1842595	1842602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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