MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_020568	TCCA	2	8	1731389	1731396	25 %	25 %	0 %	50 %	470224963
41502	NC_020568	AAT	2	6	1731461	1731466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224963
41503	NC_020568	T	6	6	1731493	1731498	0 %	100 %	0 %	0 %	470224963
41504	NC_020568	TAAA	2	8	1731540	1731547	75 %	25 %	0 %	0 %	470224963
41505	NC_020568	TGG	2	6	1731550	1731555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224963
41506	NC_020568	TCTCTG	2	12	1731576	1731587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470224963
41507	NC_020568	AT	3	6	1731593	1731598	50 %	50 %	0 %	0 %	470224963
41508	NC_020568	TAA	2	6	1731697	1731702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224963
41509	NC_020568	CTT	2	6	1731723	1731728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224963
41510	NC_020568	CTT	2	6	1731752	1731757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224963
41511	NC_020568	TCA	2	6	1731758	1731763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224963
41512	NC_020568	ATA	2	6	1731769	1731774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224963
41513	NC_020568	CTT	2	6	1731807	1731812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224963
41514	NC_020568	ATG	2	6	1731827	1731832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224963
41515	NC_020568	AAG	2	6	1731866	1731871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224963
41516	NC_020568	ATG	2	6	1731922	1731927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224963
41517	NC_020568	CTT	2	6	1731951	1731956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224963
41518	NC_020568	CAC	2	6	1731981	1731986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224963
41519	NC_020568	CAA	2	6	1731996	1732001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224963
41520	NC_020568	TTC	2	6	1732009	1732014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224963
41521	NC_020568	GTT	2	6	1732018	1732023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224963
41522	NC_020568	TGA	2	6	1732079	1732084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224963
41523	NC_020568	TTC	2	6	1732099	1732104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224963
41524	NC_020568	TA	3	6	1732188	1732193	50 %	50 %	0 %	0 %	470224963
41525	NC_020568	ATT	2	6	1732243	1732248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224963
41526	NC_020568	TTGT	2	8	1732296	1732303	0 %	75 %	25 %	0 %	470224963
41527	NC_020568	AGC	2	6	1732461	1732466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224964
41528	NC_020568	TAT	2	6	1732520	1732525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224964
41529	NC_020568	TAA	2	6	1732554	1732559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224964
41530	NC_020568	TTC	2	6	1732566	1732571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224964
41531	NC_020568	AAC	2	6	1732575	1732580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224964
41532	NC_020568	GGT	2	6	1732610	1732615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224964
41533	NC_020568	TAATG	2	10	1732620	1732629	40 %	40 %	20 %	0 %	470224964
41534	NC_020568	CTG	2	6	1732643	1732648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224964
41535	NC_020568	T	6	6	1732661	1732666	0 %	100 %	0 %	0 %	470224964
41536	NC_020568	CTG	2	6	1732682	1732687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224964
41537	NC_020568	CTT	2	6	1732709	1732714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224964
41538	NC_020568	CTG	2	6	1732743	1732748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224964
41539	NC_020568	TAAT	2	8	1732784	1732791	50 %	50 %	0 %	0 %	470224964
41540	NC_020568	TTG	2	6	1732881	1732886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224964
41541	NC_020568	CCT	2	6	1732940	1732945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470224964
41542	NC_020568	CAT	2	6	1732966	1732971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41543	NC_020568	AATTT	2	10	1733020	1733029	40 %	60 %	0 %	0 %	470224965
41544	NC_020568	TTG	2	6	1733038	1733043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224965
41545	NC_020568	T	6	6	1733060	1733065	0 %	100 %	0 %	0 %	470224965
41546	NC_020568	TAA	4	12	1733082	1733093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224965
41547	NC_020568	ATA	2	6	1733094	1733099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224965
41548	NC_020568	ATAA	2	8	1733213	1733220	75 %	25 %	0 %	0 %	470224965
41549	NC_020568	CTG	2	6	1733268	1733273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224965
41550	NC_020568	A	6	6	1733279	1733284	100 %	0 %	0 %	0 %	470224965
41551	NC_020568	CAT	2	6	1733346	1733351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224965
41552	NC_020568	TGC	2	6	1733374	1733379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224965
41553	NC_020568	CGTG	2	8	1733416	1733423	0 %	25 %	50 %	25 %	470224965
41554	NC_020568	T	6	6	1733437	1733442	0 %	100 %	0 %	0 %	470224965
41555	NC_020568	CGA	2	6	1733464	1733469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224965
41556	NC_020568	AAT	2	6	1733476	1733481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224965
41557	NC_020568	AT	3	6	1733522	1733527	50 %	50 %	0 %	0 %	470224965
41558	NC_020568	AAT	2	6	1733561	1733566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224965
41559	NC_020568	CAA	3	9	1733571	1733579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224965
41560	NC_020568	ATTT	2	8	1733646	1733653	25 %	75 %	0 %	0 %	470224965
41561	NC_020568	TGG	2	6	1733671	1733676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224965
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41563	NC_020568	CGC	2	6	1733743	1733748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470224965
41564	NC_020568	ATC	2	6	1733777	1733782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224965
41565	NC_020568	TTTA	2	8	1733838	1733845	25 %	75 %	0 %	0 %	470224966
41566	NC_020568	TTA	2	6	1733857	1733862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224966
41567	NC_020568	GTTT	2	8	1733867	1733874	0 %	75 %	25 %	0 %	470224966
41568	NC_020568	ATC	2	6	1733943	1733948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224966
41569	NC_020568	ACA	2	6	1734032	1734037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224966
41570	NC_020568	TTTC	2	8	1734076	1734083	0 %	75 %	0 %	25 %	470224966
41571	NC_020568	TAA	3	9	1734088	1734096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224966
41572	NC_020568	TCT	2	6	1734099	1734104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224966
41573	NC_020568	TAA	2	6	1734116	1734121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224966
41574	NC_020568	ATT	2	6	1734149	1734154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224966
41575	NC_020568	CAT	3	9	1734260	1734268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224966
41576	NC_020568	TTTA	2	8	1734308	1734315	25 %	75 %	0 %	0 %	470224966
41577	NC_020568	TCAAT	2	10	1734388	1734397	40 %	40 %	0 %	20 %	470224966
41578	NC_020568	TGG	2	6	1734428	1734433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224966
41579	NC_020568	TCA	2	6	1734472	1734477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224966
41580	NC_020568	TTCCA	2	10	1734479	1734488	20 %	40 %	0 %	40 %	470224966
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41582	NC_020568	AAC	2	6	1734569	1734574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224966
41583	NC_020568	TTC	2	6	1734575	1734580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224966
41584	NC_020568	ATCTA	2	10	1734596	1734605	40 %	40 %	0 %	20 %	470224966
41585	NC_020568	ACC	2	6	1734677	1734682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224966
41586	NC_020568	TTC	2	6	1734761	1734766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224966
41587	NC_020568	TGC	2	6	1734771	1734776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224966
41588	NC_020568	T	6	6	1734814	1734819	0 %	100 %	0 %	0 %	470224966
41589	NC_020568	ATAC	2	8	1734914	1734921	50 %	25 %	0 %	25 %	470224966
41590	NC_020568	ATT	2	6	1734977	1734982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224966
41591	NC_020568	T	7	7	1735001	1735007	0 %	100 %	0 %	0 %	470224966
41592	NC_020568	CAAG	2	8	1735045	1735052	50 %	0 %	25 %	25 %	470224966
41593	NC_020568	ATT	2	6	1735065	1735070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224966
41594	NC_020568	ATG	2	6	1735097	1735102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224967
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41596	NC_020568	GTA	2	6	1735142	1735147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224967
41597	NC_020568	TAC	2	6	1735167	1735172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224967
41598	NC_020568	ATTTA	2	10	1735216	1735225	40 %	60 %	0 %	0 %	470224967
41599	NC_020568	TCG	2	6	1735248	1735253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224967
41600	NC_020568	GAA	2	6	1735352	1735357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224967
41601	NC_020568	ATTT	2	8	1735377	1735384	25 %	75 %	0 %	0 %	470224967
41602	NC_020568	GACG	2	8	1735392	1735399	25 %	0 %	50 %	25 %	470224967
41603	NC_020568	ATT	2	6	1735402	1735407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224967
41604	NC_020568	ACC	3	9	1735525	1735533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224967
41605	NC_020568	CTAT	2	8	1735625	1735632	25 %	50 %	0 %	25 %	470224967
41606	NC_020568	T	6	6	1735703	1735708	0 %	100 %	0 %	0 %	470224967
41607	NC_020568	ATT	2	6	1735753	1735758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224967
41608	NC_020568	TACA	3	12	1735759	1735770	50 %	25 %	0 %	25 %	470224967
41609	NC_020568	TCTT	2	8	1735832	1735839	0 %	75 %	0 %	25 %	470224967
41610	NC_020568	ACGG	2	8	1735901	1735908	25 %	0 %	50 %	25 %	470224967
41611	NC_020568	ATT	2	6	1735928	1735933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224967
41612	NC_020568	ATT	2	6	1735981	1735986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224967
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41616	NC_020568	ATTG	2	8	1736126	1736133	25 %	50 %	25 %	0 %	470224967
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