MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37003	NC_020568	TCT	2	6	1542078	1542083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224819
37004	NC_020568	ATTT	2	8	1542103	1542110	25 %	75 %	0 %	0 %	470224819
37005	NC_020568	ATT	2	6	1542128	1542133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224819
37006	NC_020568	T	6	6	1542172	1542177	0 %	100 %	0 %	0 %	470224819
37007	NC_020568	CTT	3	9	1542188	1542196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37008	NC_020568	TTA	2	6	1542197	1542202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37009	NC_020568	T	7	7	1542214	1542220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37010	NC_020568	T	6	6	1542226	1542231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37011	NC_020568	GCT	2	6	1542247	1542252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37012	NC_020568	CAT	2	6	1542345	1542350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37013	NC_020568	TTC	2	6	1542351	1542356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37014	NC_020568	ATT	2	6	1542379	1542384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224820
37015	NC_020568	CTA	2	6	1542411	1542416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224820
37016	NC_020568	T	6	6	1542487	1542492	0 %	100 %	0 %	0 %	470224820
37017	NC_020568	AAT	2	6	1542599	1542604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224820
37018	NC_020568	ATT	2	6	1542631	1542636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224820
37019	NC_020568	TTG	2	6	1542637	1542642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224820
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37024	NC_020568	ATC	2	6	1542760	1542765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224820
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37026	NC_020568	GTT	3	9	1542846	1542854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224820
37027	NC_020568	TGA	2	6	1542867	1542872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224820
37028	NC_020568	GCA	2	6	1542909	1542914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224820
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37031	NC_020568	CTG	2	6	1543017	1543022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224820
37032	NC_020568	TA	3	6	1543044	1543049	50 %	50 %	0 %	0 %	470224820
37033	NC_020568	GAC	2	6	1543057	1543062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224820
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37039	NC_020568	AAT	2	6	1543162	1543167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224820
37040	NC_020568	GTC	2	6	1543168	1543173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224820
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37042	NC_020568	T	7	7	1543296	1543302	0 %	100 %	0 %	0 %	470224820
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37045	NC_020568	TTTA	2	8	1543417	1543424	25 %	75 %	0 %	0 %	470224820
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37051	NC_020568	AT	3	6	1543670	1543675	50 %	50 %	0 %	0 %	470224820
37052	NC_020568	AAT	2	6	1543698	1543703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224820
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37054	NC_020568	T	7	7	1543730	1543736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37055	NC_020568	ATC	3	9	1543772	1543780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37056	NC_020568	TTGTT	2	10	1543787	1543796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37057	NC_020568	TTCA	2	8	1543808	1543815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37058	NC_020568	ATA	2	6	1543872	1543877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37059	NC_020568	TAA	2	6	1543889	1543894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37060	NC_020568	TAA	2	6	1544017	1544022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37061	NC_020568	TTTA	2	8	1544147	1544154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37062	NC_020568	TTTG	2	8	1544272	1544279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37063	NC_020568	TA	4	8	1544326	1544333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37064	NC_020568	TCT	2	6	1544339	1544344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37102	NC_020568	AATT	2	8	1546343	1546350	50 %	50 %	0 %	0 %	470224822
37103	NC_020568	ATT	2	6	1546371	1546376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224822
37104	NC_020568	GTTT	2	8	1546390	1546397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37105	NC_020568	TTCAA	2	10	1546431	1546440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37106	NC_020568	TAA	2	6	1546486	1546491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37107	NC_020568	TTAAA	2	10	1546501	1546510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37108	NC_020568	TATT	2	8	1546521	1546528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37109	NC_020568	TAT	2	6	1546608	1546613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37110	NC_020568	CAA	2	6	1546624	1546629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37111	NC_020568	AT	3	6	1546642	1546647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37112	NC_020568	T	6	6	1546667	1546672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37113	NC_020568	ATT	2	6	1546709	1546714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37118	NC_020568	CGA	2	6	1547198	1547203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224823
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37242	NC_020568	ATC	2	6	1552570	1552575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224827
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37252	NC_020568	TCA	2	6	1553112	1553117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224828
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37347	NC_020568	TTC	2	6	1556770	1556775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37350	NC_020568	T	6	6	1556855	1556860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37353	NC_020568	TAT	2	6	1556932	1556937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37354	NC_020568	AT	3	6	1556985	1556990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37355	NC_020568	AATTC	2	10	1557022	1557031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37356	NC_020568	TAA	2	6	1557034	1557039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37481	NC_020568	TCT	2	6	1562047	1562052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224836
37482	NC_020568	AATA	2	8	1562082	1562089	75 %	25 %	0 %	0 %	470224836
37483	NC_020568	A	6	6	1562117	1562122	100 %	0 %	0 %	0 %	470224836
37484	NC_020568	TTA	2	6	1562159	1562164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224836
37485	NC_020568	ACC	2	6	1562169	1562174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224836
37486	NC_020568	TCC	2	6	1562181	1562186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470224836
37487	NC_020568	ATATTT	2	12	1562200	1562211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224836
37488	NC_020568	TAA	2	6	1562253	1562258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224836
37489	NC_020568	T	7	7	1562270	1562276	0 %	100 %	0 %	0 %	470224836
37490	NC_020568	ACAT	2	8	1562293	1562300	50 %	25 %	0 %	25 %	470224836
37491	NC_020568	CAC	2	6	1562336	1562341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224836
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37494	NC_020568	ATAA	2	8	1562467	1562474	75 %	25 %	0 %	0 %	470224836
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37496	NC_020568	ATT	2	6	1562607	1562612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224836
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