MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020568	ATG	2	6	420347	420352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224038
10002	NC_020568	AAC	2	6	420416	420421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224038
10003	NC_020568	TTA	2	6	420470	420475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224038
10004	NC_020568	A	6	6	420514	420519	100 %	0 %	0 %	0 %	470224038
10005	NC_020568	AAT	2	6	420587	420592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224038
10006	NC_020568	AAG	2	6	420631	420636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020568	CTT	2	6	420667	420672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_020568	GAT	2	6	420684	420689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020568	CTAT	2	8	420757	420764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_020568	TTTA	2	8	420791	420798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020568	TAA	2	6	420827	420832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_020568	ATT	2	6	420843	420848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_020568	TAA	2	6	420887	420892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_020568	TAA	2	6	420928	420933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_020568	GCA	2	6	420964	420969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224039
10016	NC_020568	TGT	2	6	421272	421277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224039
10017	NC_020568	AAG	2	6	421280	421285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224039
10018	NC_020568	TGG	2	6	421317	421322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224039
10019	NC_020568	TTA	2	6	421347	421352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224039
10020	NC_020568	TA	3	6	421357	421362	50 %	50 %	0 %	0 %	470224039
10021	NC_020568	AG	3	6	421385	421390	50 %	0 %	50 %	0 %	470224039
10022	NC_020568	TACG	2	8	421410	421417	25 %	25 %	25 %	25 %	470224039
10023	NC_020568	AGA	2	6	421440	421445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224039
10024	NC_020568	GGC	2	6	421555	421560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470224039
10025	NC_020568	TAT	2	6	421561	421566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224039
10026	NC_020568	TAA	2	6	421578	421583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224039
10027	NC_020568	A	6	6	421582	421587	100 %	0 %	0 %	0 %	470224039
10028	NC_020568	ACAA	2	8	421590	421597	75 %	0 %	0 %	25 %	470224039
10029	NC_020568	A	6	6	421634	421639	100 %	0 %	0 %	0 %	470224039
10030	NC_020568	ATA	2	6	421675	421680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_020568	GAG	2	6	421700	421705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020568	CTT	2	6	421728	421733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_020568	T	6	6	421732	421737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020568	AAT	2	6	421771	421776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020568	A	6	6	421892	421897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020568	A	6	6	421913	421918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_020568	TAAT	2	8	421919	421926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020568	TAAC	2	8	421943	421950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10039	NC_020568	TA	3	6	422008	422013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020568	TAG	2	6	422018	422023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_020568	AT	3	6	422061	422066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_020568	TTA	2	6	422147	422152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224040
10043	NC_020568	ACT	2	6	422153	422158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224040
10044	NC_020568	AAAAG	2	10	422194	422203	80 %	0 %	20 %	0 %	470224040
10045	NC_020568	AG	4	8	422206	422213	50 %	0 %	50 %	0 %	470224040
10046	NC_020568	ACA	2	6	422215	422220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224040
10047	NC_020568	TAC	2	6	422249	422254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224040
10048	NC_020568	TCA	2	6	422255	422260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224040
10049	NC_020568	ATT	2	6	422353	422358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224040
10050	NC_020568	TTA	2	6	422360	422365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224040
10051	NC_020568	AGATAA	2	12	422371	422382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470224040
10052	NC_020568	A	6	6	422387	422392	100 %	0 %	0 %	0 %	470224040
10053	NC_020568	AATT	2	8	422427	422434	50 %	50 %	0 %	0 %	470224040
10054	NC_020568	TGG	2	6	422461	422466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224040
10055	NC_020568	TCT	2	6	422489	422494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224040
10056	NC_020568	ATTT	2	8	422508	422515	25 %	75 %	0 %	0 %	470224040
10057	NC_020568	TAA	2	6	422518	422523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224040
10058	NC_020568	TAAT	2	8	422565	422572	50 %	50 %	0 %	0 %	470224040
10059	NC_020568	AGA	2	6	422575	422580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224040
10060	NC_020568	TA	3	6	422640	422645	50 %	50 %	0 %	0 %	470224040
10061	NC_020568	CAAT	2	8	422807	422814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_020568	TAA	2	6	422825	422830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020568	AGC	2	6	422837	422842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_020568	AATA	2	8	422860	422867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020568	TCC	2	6	422874	422879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_020568	ATTA	2	8	422993	423000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020568	TTC	2	6	423002	423007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_020568	TTTAAT	2	12	423019	423030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020568	GTCT	2	8	423050	423057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10070	NC_020568	TAA	2	6	423070	423075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020568	TAT	2	6	423081	423086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020568	TAA	2	6	423097	423102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_020568	AT	3	6	423113	423118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_020568	ATATGA	2	12	423131	423142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470224041
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10076	NC_020568	AATC	2	8	423211	423218	50 %	25 %	0 %	25 %	470224041
10077	NC_020568	A	6	6	423242	423247	100 %	0 %	0 %	0 %	470224041
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10079	NC_020568	TTA	2	6	423336	423341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224041
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10081	NC_020568	AAAT	2	8	423411	423418	75 %	25 %	0 %	0 %	470224041
10082	NC_020568	A	6	6	423425	423430	100 %	0 %	0 %	0 %	470224041
10083	NC_020568	TAG	2	6	423464	423469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224041
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10088	NC_020568	TGA	2	6	423594	423599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224041
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10090	NC_020568	A	6	6	423670	423675	100 %	0 %	0 %	0 %	470224041
10091	NC_020568	TTA	2	6	423716	423721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224041
10092	NC_020568	AAT	2	6	423833	423838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224041
10093	NC_020568	AT	3	6	423844	423849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020568	AAG	2	6	423863	423868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020568	TAA	2	6	423874	423879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020568	TAA	3	9	423910	423918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_020568	TTA	2	6	423942	423947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020568	GCT	2	6	423949	423954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_020568	T	6	6	423954	423959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020568	A	7	7	424021	424027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020568	TAA	2	6	424085	424090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020568	TTTA	2	8	424100	424107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_020568	TAA	2	6	424145	424150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020568	AT	3	6	424188	424193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_020568	AAAT	2	8	424206	424213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_020568	CATTAG	2	12	424242	424253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470224042
10107	NC_020568	GT	3	6	424269	424274	0 %	50 %	50 %	0 %	470224042
10108	NC_020568	CAG	2	6	424278	424283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224042
10109	NC_020568	TGA	2	6	424315	424320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224042
10110	NC_020568	GAA	2	6	424367	424372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224042
10111	NC_020568	CAA	2	6	424383	424388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224042
10112	NC_020568	AAAT	2	8	424486	424493	75 %	25 %	0 %	0 %	470224042
10113	NC_020568	A	6	6	424500	424505	100 %	0 %	0 %	0 %	470224042
10114	NC_020568	AT	3	6	424559	424564	50 %	50 %	0 %	0 %	470224042
10115	NC_020568	GTAA	2	8	424613	424620	50 %	25 %	25 %	0 %	470224042
10116	NC_020568	A	6	6	424637	424642	100 %	0 %	0 %	0 %	470224042
10117	NC_020568	GTT	2	6	424675	424680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224042
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10121	NC_020568	ATA	2	6	424927	424932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020568	AAG	2	6	424937	424942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_020568	TA	3	6	424981	424986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020568	TGT	2	6	425010	425015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_020568	GTT	2	6	425019	425024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_020568	CAT	2	6	425054	425059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_020568	GTA	2	6	425065	425070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10129	NC_020568	AAT	2	6	425100	425105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_020568	AAT	2	6	425153	425158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10281	NC_020568	GAA	2	6	431426	431431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224047
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10371	NC_020568	A	7	7	434795	434801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10372	NC_020568	AAT	2	6	434819	434824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10498	NC_020568	AC	3	6	440112	440117	50 %	0 %	0 %	50 %	470224057
10499	NC_020568	ATA	2	6	440152	440157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224057
10500	NC_020568	TGA	3	9	440180	440188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224057

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