MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_020568	AT	3	6	2399991	2399996	50 %	50 %	0 %	0 %	470225436
57502	NC_020568	GTA	2	6	2400029	2400034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225436
57503	NC_020568	TAA	2	6	2400049	2400054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225436
57504	NC_020568	TTA	2	6	2400072	2400077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225436
57505	NC_020568	CATC	2	8	2400141	2400148	25 %	25 %	0 %	50 %	470225436
57506	NC_020568	A	6	6	2400184	2400189	100 %	0 %	0 %	0 %	470225436
57507	NC_020568	AAT	2	6	2400196	2400201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225436
57508	NC_020568	ATA	2	6	2400213	2400218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225436
57509	NC_020568	TTTC	2	8	2400239	2400246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57510	NC_020568	ATAACG	2	12	2400286	2400297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57511	NC_020568	ATG	2	6	2400368	2400373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225437
57512	NC_020568	ATT	2	6	2400446	2400451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225437
57513	NC_020568	AAT	2	6	2400494	2400499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225437
57514	NC_020568	ATA	2	6	2400631	2400636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225437
57515	NC_020568	AT	3	6	2400696	2400701	50 %	50 %	0 %	0 %	470225437
57516	NC_020568	T	6	6	2400710	2400715	0 %	100 %	0 %	0 %	470225437
57517	NC_020568	TCA	2	6	2400769	2400774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225437
57518	NC_020568	CTA	2	6	2400790	2400795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225437
57519	NC_020568	GAT	2	6	2400811	2400816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225437
57520	NC_020568	TTC	2	6	2400830	2400835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225437
57521	NC_020568	TGT	2	6	2400879	2400884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225437
57522	NC_020568	AT	3	6	2400888	2400893	50 %	50 %	0 %	0 %	470225437
57523	NC_020568	T	6	6	2400911	2400916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57524	NC_020568	CGC	2	6	2401037	2401042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470225438
57525	NC_020568	TAC	2	6	2401058	2401063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
57526	NC_020568	TG	3	6	2401097	2401102	0 %	50 %	50 %	0 %	470225438
57527	NC_020568	TAA	2	6	2401143	2401148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225438
57528	NC_020568	TCA	2	6	2401247	2401252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
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57531	NC_020568	CAATC	2	10	2401523	2401532	40 %	20 %	0 %	40 %	470225438
57532	NC_020568	CTT	2	6	2401568	2401573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225438
57533	NC_020568	AT	3	6	2401592	2401597	50 %	50 %	0 %	0 %	470225438
57534	NC_020568	CTG	2	6	2401631	2401636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225438
57535	NC_020568	CAT	2	6	2401661	2401666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
57536	NC_020568	ATA	2	6	2401667	2401672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225438
57537	NC_020568	TCA	2	6	2401873	2401878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
57538	NC_020568	GCAAC	2	10	2401909	2401918	40 %	0 %	20 %	40 %	470225438
57539	NC_020568	CAT	2	6	2401956	2401961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
57540	NC_020568	TCT	3	9	2401990	2401998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225438
57541	NC_020568	T	6	6	2402000	2402005	0 %	100 %	0 %	0 %	470225438
57542	NC_020568	ACC	2	6	2402037	2402042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225438
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57544	NC_020568	GTT	2	6	2402146	2402151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225438
57545	NC_020568	ATA	2	6	2402181	2402186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225438
57546	NC_020568	TTA	2	6	2402192	2402197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225438
57547	NC_020568	A	6	6	2402216	2402221	100 %	0 %	0 %	0 %	470225438
57548	NC_020568	ACC	2	6	2402295	2402300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225438
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57550	NC_020568	ATA	2	6	2402554	2402559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225439
57551	NC_020568	TCC	2	6	2402587	2402592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225439
57552	NC_020568	TG	3	6	2402634	2402639	0 %	50 %	50 %	0 %	470225439
57553	NC_020568	ACC	2	6	2402641	2402646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225439
57554	NC_020568	ACA	2	6	2402756	2402761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225439
57555	NC_020568	ACC	2	6	2402845	2402850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225439
57556	NC_020568	TTA	2	6	2402873	2402878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225439
57557	NC_020568	ACC	2	6	2402947	2402952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225439
57558	NC_020568	GGC	2	6	2402987	2402992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470225439
57559	NC_020568	TA	3	6	2403003	2403008	50 %	50 %	0 %	0 %	470225439
57560	NC_020568	TTG	2	6	2403028	2403033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225439
57561	NC_020568	ATA	2	6	2403052	2403057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225439
57562	NC_020568	TCG	2	6	2403124	2403129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225439
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57574	NC_020568	GTTT	2	8	2404118	2404125	0 %	75 %	25 %	0 %	470225439
57575	NC_020568	CTT	2	6	2404191	2404196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225439
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57578	NC_020568	ATG	2	6	2404233	2404238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225439
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57580	NC_020568	GCT	2	6	2404256	2404261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225439
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57584	NC_020568	CATAA	2	10	2404517	2404526	60 %	20 %	0 %	20 %	470225439
57585	NC_020568	ACA	2	6	2404655	2404660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225439
57586	NC_020568	CTT	2	6	2404683	2404688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225439
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57588	NC_020568	ACG	2	6	2404753	2404758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225439
57589	NC_020568	GAATT	2	10	2404888	2404897	40 %	40 %	20 %	0 %	470225439
57590	NC_020568	TCT	2	6	2404955	2404960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225439
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57596	NC_020568	TTCATC	2	12	2405134	2405145	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470225439
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57599	NC_020568	ATG	2	6	2405430	2405435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225439
57600	NC_020568	GGT	2	6	2405498	2405503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225439
57601	NC_020568	CAC	2	6	2405538	2405543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225439
57602	NC_020568	TGA	2	6	2405553	2405558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225439
57603	NC_020568	CTG	2	6	2405568	2405573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225439
57604	NC_020568	T	7	7	2405635	2405641	0 %	100 %	0 %	0 %	470225439
57605	NC_020568	TGC	2	6	2405659	2405664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225439
57606	NC_020568	GCTT	2	8	2405720	2405727	0 %	50 %	25 %	25 %	470225439
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57608	NC_020568	GCA	2	6	2405771	2405776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225439
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57611	NC_020568	TTG	2	6	2405953	2405958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225439
57612	NC_020568	TGT	2	6	2406031	2406036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225439
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57614	NC_020568	T	6	6	2406075	2406080	0 %	100 %	0 %	0 %	470225439
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57616	NC_020568	TCC	2	6	2406176	2406181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57731	NC_020568	ATTT	2	8	2411142	2411149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57733	NC_020568	AT	3	6	2411162	2411167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57978	NC_020568	TCA	2	6	2421601	2421606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225453
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57980	NC_020568	TAAT	2	8	2421679	2421686	50 %	50 %	0 %	0 %	470225453
57981	NC_020568	TGT	2	6	2421714	2421719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225453
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