MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_020568	TA	3	6	2361133	2361138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56502	NC_020568	CAT	2	6	2361165	2361170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56503	NC_020568	T	6	6	2361220	2361225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56504	NC_020568	A	6	6	2361229	2361234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56505	NC_020568	TGT	2	6	2361282	2361287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56506	NC_020568	TTA	2	6	2361418	2361423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225409
56507	NC_020568	ATC	2	6	2361486	2361491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225409
56508	NC_020568	CTT	2	6	2361515	2361520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225409
56509	NC_020568	CAT	3	9	2361523	2361531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225409
56510	NC_020568	GAT	2	6	2361537	2361542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225409
56511	NC_020568	T	7	7	2361545	2361551	0 %	100 %	0 %	0 %	470225409
56512	NC_020568	AT	3	6	2361552	2361557	50 %	50 %	0 %	0 %	470225409
56513	NC_020568	CAAAAT	2	12	2361565	2361576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470225409
56514	NC_020568	CTGA	2	8	2361577	2361584	25 %	25 %	25 %	25 %	470225409
56515	NC_020568	GCA	2	6	2361591	2361596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225409
56516	NC_020568	TTC	2	6	2361639	2361644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225409
56517	NC_020568	TCT	2	6	2361654	2361659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225409
56518	NC_020568	TCTT	2	8	2361663	2361670	0 %	75 %	0 %	25 %	470225409
56519	NC_020568	TGTAT	2	10	2361719	2361728	20 %	60 %	20 %	0 %	470225409
56520	NC_020568	TCGTCT	2	12	2361748	2361759	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470225409
56521	NC_020568	T	6	6	2361881	2361886	0 %	100 %	0 %	0 %	470225409
56522	NC_020568	CTT	2	6	2361937	2361942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225409
56523	NC_020568	ACC	2	6	2362118	2362123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225409
56524	NC_020568	T	6	6	2362144	2362149	0 %	100 %	0 %	0 %	470225409
56525	NC_020568	TTAC	2	8	2362227	2362234	25 %	50 %	0 %	25 %	470225409
56526	NC_020568	AT	3	6	2362240	2362245	50 %	50 %	0 %	0 %	470225409
56527	NC_020568	AAG	2	6	2362270	2362275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225409
56528	NC_020568	CTT	2	6	2362381	2362386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225409
56529	NC_020568	TAT	2	6	2362399	2362404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225409
56530	NC_020568	TAA	2	6	2362415	2362420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225409
56531	NC_020568	ATT	2	6	2362442	2362447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225409
56532	NC_020568	ATA	2	6	2362518	2362523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225409
56533	NC_020568	A	6	6	2362539	2362544	100 %	0 %	0 %	0 %	470225409
56534	NC_020568	TTA	2	6	2362581	2362586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225409
56535	NC_020568	TA	3	6	2362615	2362620	50 %	50 %	0 %	0 %	470225409
56536	NC_020568	GAC	2	6	2362627	2362632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225409
56537	NC_020568	CAT	2	6	2362669	2362674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225409
56538	NC_020568	TTG	2	6	2362682	2362687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225409
56539	NC_020568	ATT	2	6	2362763	2362768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56540	NC_020568	ATT	2	6	2362771	2362776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56541	NC_020568	ATT	3	9	2362782	2362790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56542	NC_020568	ACTTT	2	10	2362832	2362841	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56543	NC_020568	TTA	2	6	2362853	2362858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56544	NC_020568	ATT	2	6	2362860	2362865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56545	NC_020568	CT	3	6	2362876	2362881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56546	NC_020568	AAG	2	6	2362896	2362901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56547	NC_020568	ATAC	2	8	2362909	2362916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56548	NC_020568	GAT	2	6	2362980	2362985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56549	NC_020568	TGA	2	6	2362986	2362991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56550	NC_020568	TAACT	2	10	2363158	2363167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56551	NC_020568	TCG	2	6	2363194	2363199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56552	NC_020568	TTTA	2	8	2363260	2363267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56553	NC_020568	TTAT	2	8	2363354	2363361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56554	NC_020568	ATT	2	6	2363408	2363413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56555	NC_020568	A	6	6	2363470	2363475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56556	NC_020568	AT	3	6	2363493	2363498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56557	NC_020568	TGC	2	6	2363525	2363530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56558	NC_020568	TAA	2	6	2363544	2363549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56559	NC_020568	ATC	2	6	2363555	2363560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56560	NC_020568	TAT	2	6	2363580	2363585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56561	NC_020568	TAT	2	6	2363614	2363619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225410
56562	NC_020568	CAT	2	6	2363732	2363737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225410
56563	NC_020568	TAA	2	6	2363776	2363781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225410
56564	NC_020568	TAT	2	6	2363786	2363791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225410
56565	NC_020568	ATTT	2	8	2363812	2363819	25 %	75 %	0 %	0 %	470225410
56566	NC_020568	TTAT	2	8	2363838	2363845	25 %	75 %	0 %	0 %	470225410
56567	NC_020568	A	6	6	2363847	2363852	100 %	0 %	0 %	0 %	470225410
56568	NC_020568	TTA	2	6	2363853	2363858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225410
56569	NC_020568	TAT	2	6	2363956	2363961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225410
56570	NC_020568	ACA	2	6	2364028	2364033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225410
56571	NC_020568	AAG	2	6	2364034	2364039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225410
56572	NC_020568	CAA	3	9	2364132	2364140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225410
56573	NC_020568	CAA	2	6	2364148	2364153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225410
56574	NC_020568	ATT	2	6	2364156	2364161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225410
56575	NC_020568	ATAC	2	8	2364277	2364284	50 %	25 %	0 %	25 %	470225410
56576	NC_020568	ATC	2	6	2364309	2364314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225410
56577	NC_020568	TTGT	2	8	2364343	2364350	0 %	75 %	25 %	0 %	470225410
56578	NC_020568	GC	3	6	2364374	2364379	0 %	0 %	50 %	50 %	470225410
56579	NC_020568	TATC	2	8	2364406	2364413	25 %	50 %	0 %	25 %	470225410
56580	NC_020568	TTA	2	6	2364501	2364506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225410
56581	NC_020568	AGT	2	6	2364522	2364527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225410
56582	NC_020568	CGC	2	6	2364545	2364550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470225410
56583	NC_020568	TTTA	2	8	2364552	2364559	25 %	75 %	0 %	0 %	470225410
56584	NC_020568	CAAA	2	8	2364574	2364581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56585	NC_020568	TAT	3	9	2364583	2364591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56586	NC_020568	GTT	2	6	2364594	2364599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56587	NC_020568	ATAA	2	8	2364667	2364674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56588	NC_020568	TCA	2	6	2364686	2364691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56589	NC_020568	TA	3	6	2364695	2364700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56590	NC_020568	T	6	6	2364713	2364718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56591	NC_020568	TAC	2	6	2364754	2364759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56593	NC_020568	AAT	2	6	2364852	2364857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225411
56594	NC_020568	GT	3	6	2364866	2364871	0 %	50 %	50 %	0 %	470225411
56595	NC_020568	ATA	2	6	2364876	2364881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225411
56596	NC_020568	TGT	2	6	2364891	2364896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225411
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56598	NC_020568	ATC	2	6	2364915	2364920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225411
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56600	NC_020568	TTG	2	6	2364931	2364936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225411
56601	NC_020568	ATT	2	6	2364989	2364994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225411
56602	NC_020568	TCT	2	6	2365068	2365073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225411
56603	NC_020568	TTG	2	6	2365105	2365110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225411
56604	NC_020568	TGT	2	6	2365116	2365121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225411
56605	NC_020568	CTT	2	6	2365135	2365140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225411
56606	NC_020568	CAT	2	6	2365264	2365269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225411
56607	NC_020568	TGT	2	6	2365325	2365330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225411
56608	NC_020568	ATT	2	6	2365464	2365469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225411
56609	NC_020568	AAT	2	6	2365505	2365510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225412
56610	NC_020568	CTA	2	6	2365542	2365547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225412
56611	NC_020568	TAA	2	6	2365567	2365572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225412
56612	NC_020568	GTT	2	6	2365583	2365588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225412
56613	NC_020568	CAT	2	6	2365612	2365617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225412
56614	NC_020568	CTA	2	6	2365629	2365634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225412
56615	NC_020568	TGA	2	6	2365635	2365640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225412
56616	NC_020568	TACC	2	8	2365650	2365657	25 %	25 %	0 %	50 %	470225412
56617	NC_020568	ATT	2	6	2365661	2365666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225412
56618	NC_020568	TGTCT	2	10	2365706	2365715	0 %	60 %	20 %	20 %	470225412
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56620	NC_020568	CAAA	2	8	2365806	2365813	75 %	0 %	0 %	25 %	470225412
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56852	NC_020568	A	6	6	2375344	2375349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56853	NC_020568	T	7	7	2375389	2375395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56854	NC_020568	CAT	2	6	2375402	2375407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56855	NC_020568	ATT	2	6	2375420	2375425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225419
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