MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_020568	GTAATG	2	12	2256092	2256103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225324
54002	NC_020568	CAC	2	6	2256131	2256136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225324
54003	NC_020568	AT	3	6	2256178	2256183	50 %	50 %	0 %	0 %	470225324
54004	NC_020568	CCA	3	9	2256319	2256327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225324
54005	NC_020568	GTT	2	6	2256354	2256359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225324
54006	NC_020568	T	6	6	2256369	2256374	0 %	100 %	0 %	0 %	470225324
54007	NC_020568	TAA	2	6	2256387	2256392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225324
54008	NC_020568	ACG	2	6	2256447	2256452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225324
54009	NC_020568	CCT	2	6	2256498	2256503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54010	NC_020568	TTA	2	6	2256518	2256523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54011	NC_020568	CTT	2	6	2256544	2256549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54012	NC_020568	TCT	2	6	2256569	2256574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54013	NC_020568	TTTG	2	8	2256575	2256582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54014	NC_020568	T	6	6	2256608	2256613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54015	NC_020568	TTC	2	6	2256665	2256670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54016	NC_020568	AGA	2	6	2256746	2256751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54017	NC_020568	CCT	2	6	2256807	2256812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225325
54018	NC_020568	T	6	6	2256817	2256822	0 %	100 %	0 %	0 %	470225325
54019	NC_020568	AGC	3	9	2256823	2256831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225325
54020	NC_020568	ACT	2	6	2256956	2256961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225325
54021	NC_020568	T	6	6	2256967	2256972	0 %	100 %	0 %	0 %	470225325
54022	NC_020568	GTT	2	6	2256975	2256980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225325
54023	NC_020568	ATA	2	6	2256990	2256995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225325
54024	NC_020568	ACG	2	6	2257099	2257104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225325
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54026	NC_020568	ACC	2	6	2257159	2257164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225325
54027	NC_020568	CTG	2	6	2257251	2257256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225325
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54029	NC_020568	CAT	2	6	2257404	2257409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225325
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54031	NC_020568	CTT	2	6	2257439	2257444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54032	NC_020568	ATT	2	6	2257445	2257450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225326
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54034	NC_020568	CTA	2	6	2257481	2257486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225326
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54036	NC_020568	ACT	2	6	2257552	2257557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225326
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54041	NC_020568	T	6	6	2257872	2257877	0 %	100 %	0 %	0 %	470225326
54042	NC_020568	TTA	2	6	2257897	2257902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225326
54043	NC_020568	TTA	2	6	2257909	2257914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225326
54044	NC_020568	T	6	6	2257926	2257931	0 %	100 %	0 %	0 %	470225326
54045	NC_020568	T	6	6	2257938	2257943	0 %	100 %	0 %	0 %	470225326
54046	NC_020568	ACA	2	6	2258005	2258010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225326
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54048	NC_020568	TTC	2	6	2258084	2258089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225326
54049	NC_020568	CCT	2	6	2258119	2258124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54050	NC_020568	TAT	2	6	2258134	2258139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54051	NC_020568	TG	3	6	2258234	2258239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54052	NC_020568	GTT	2	6	2258243	2258248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54053	NC_020568	GCACG	2	10	2258279	2258288	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54054	NC_020568	GAT	2	6	2258289	2258294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54055	NC_020568	TCT	2	6	2258372	2258377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54056	NC_020568	CTG	2	6	2258378	2258383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54057	NC_020568	ATCA	2	8	2258388	2258395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54058	NC_020568	TCTGAT	2	12	2258418	2258429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54059	NC_020568	T	6	6	2258429	2258434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54060	NC_020568	CCT	2	6	2258452	2258457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54061	NC_020568	GT	3	6	2258529	2258534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54062	NC_020568	GTTA	2	8	2258574	2258581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54063	NC_020568	TA	3	6	2258663	2258668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54064	NC_020568	T	6	6	2258697	2258702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54068	NC_020568	TA	3	6	2258766	2258771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54069	NC_020568	GGT	2	6	2258787	2258792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54071	NC_020568	T	6	6	2258878	2258883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54072	NC_020568	TAT	2	6	2258956	2258961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54073	NC_020568	ATT	2	6	2258962	2258967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54074	NC_020568	ATT	2	6	2259002	2259007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54075	NC_020568	TAG	2	6	2259021	2259026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54079	NC_020568	ATTTT	2	10	2259074	2259083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54081	NC_020568	TA	3	6	2259128	2259133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54082	NC_020568	TAA	2	6	2259136	2259141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54083	NC_020568	AC	3	6	2259159	2259164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54084	NC_020568	AAT	2	6	2259186	2259191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54085	NC_020568	TA	3	6	2259214	2259219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54086	NC_020568	AGA	2	6	2259224	2259229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54088	NC_020568	AAG	2	6	2259250	2259255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54089	NC_020568	ATA	2	6	2259286	2259291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54090	NC_020568	CTT	2	6	2259310	2259315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54091	NC_020568	A	6	6	2259336	2259341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54092	NC_020568	T	6	6	2259365	2259370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54093	NC_020568	GAAT	2	8	2259407	2259414	50 %	25 %	25 %	0 %	470225327
54094	NC_020568	ATAC	2	8	2259425	2259432	50 %	25 %	0 %	25 %	470225327
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54097	NC_020568	AAAT	2	8	2259488	2259495	75 %	25 %	0 %	0 %	470225327
54098	NC_020568	CAT	2	6	2259534	2259539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225327
54099	NC_020568	AATG	2	8	2259549	2259556	50 %	25 %	25 %	0 %	470225327
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54106	NC_020568	TAT	2	6	2259857	2259862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225327
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54108	NC_020568	CTA	2	6	2259893	2259898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225327
54109	NC_020568	AATA	2	8	2259924	2259931	75 %	25 %	0 %	0 %	470225327
54110	NC_020568	TAA	2	6	2259966	2259971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225327
54111	NC_020568	GCA	2	6	2260000	2260005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225327
54112	NC_020568	AATC	2	8	2260059	2260066	50 %	25 %	0 %	25 %	470225327
54113	NC_020568	TGA	2	6	2260091	2260096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225327
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54115	NC_020568	TGG	2	6	2260179	2260184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225327
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54118	NC_020568	TAA	3	9	2260319	2260327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225327
54119	NC_020568	ACA	2	6	2260423	2260428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225327
54120	NC_020568	TGC	2	6	2260518	2260523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225327
54121	NC_020568	TCT	2	6	2260567	2260572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225327
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54123	NC_020568	TAA	2	6	2260765	2260770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54244	NC_020568	GTC	2	6	2265881	2265886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225331
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54484	NC_020568	TGC	2	6	2276810	2276815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225336
54485	NC_020568	CCAT	2	8	2276863	2276870	25 %	25 %	0 %	50 %	470225336
54486	NC_020568	ATC	2	6	2276953	2276958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225336
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54488	NC_020568	ATT	2	6	2277058	2277063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225336
54489	NC_020568	GATT	2	8	2277064	2277071	25 %	50 %	25 %	0 %	470225336
54490	NC_020568	ATC	2	6	2277082	2277087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225336
54491	NC_020568	CAT	2	6	2277126	2277131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225336
54492	NC_020568	T	6	6	2277149	2277154	0 %	100 %	0 %	0 %	470225336
54493	NC_020568	GATTT	2	10	2277199	2277208	20 %	60 %	20 %	0 %	470225336
54494	NC_020568	T	8	8	2277270	2277277	0 %	100 %	0 %	0 %	470225336
54495	NC_020568	TCA	2	6	2277317	2277322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225336
54496	NC_020568	ATC	2	6	2277358	2277363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225336
54497	NC_020568	AAT	2	6	2277387	2277392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225336
54498	NC_020568	CCT	2	6	2277485	2277490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54499	NC_020568	AAT	2	6	2277586	2277591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225337
54500	NC_020568	AT	4	8	2277608	2277615	50 %	50 %	0 %	0 %	470225337

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