MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_020568	CTT	2	6	2235701	2235706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53502	NC_020568	T	6	6	2235753	2235758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53503	NC_020568	TTG	2	6	2235841	2235846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53504	NC_020568	TTTGT	2	10	2235857	2235866	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53505	NC_020568	TTTATA	2	12	2235907	2235918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53506	NC_020568	TTC	2	6	2235922	2235927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53507	NC_020568	T	6	6	2235938	2235943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53508	NC_020568	T	7	7	2235970	2235976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53509	NC_020568	CTC	2	6	2235992	2235997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53510	NC_020568	ATGG	2	8	2236018	2236025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53511	NC_020568	ATTA	2	8	2236030	2236037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53512	NC_020568	T	6	6	2236162	2236167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53513	NC_020568	TAC	2	6	2236194	2236199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53514	NC_020568	ATG	2	6	2236206	2236211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53515	NC_020568	ATC	2	6	2236248	2236253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53516	NC_020568	TCT	2	6	2236307	2236312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53517	NC_020568	GAA	2	6	2236336	2236341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53518	NC_020568	TCA	2	6	2236382	2236387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53519	NC_020568	TAA	2	6	2236393	2236398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53520	NC_020568	ATG	2	6	2236474	2236479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53521	NC_020568	TAA	2	6	2236485	2236490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53522	NC_020568	AGTA	2	8	2236491	2236498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53523	NC_020568	TTG	2	6	2236591	2236596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225310
53524	NC_020568	TCAA	2	8	2236675	2236682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53525	NC_020568	ATTTTG	2	12	2236696	2236707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53526	NC_020568	TTAAT	2	10	2236715	2236724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53527	NC_020568	ATGA	2	8	2236735	2236742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53528	NC_020568	CAT	2	6	2236768	2236773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53529	NC_020568	ATC	2	6	2236785	2236790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53530	NC_020568	ATT	2	6	2236844	2236849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53531	NC_020568	CAT	2	6	2236850	2236855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53532	NC_020568	TATC	2	8	2236880	2236887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53533	NC_020568	ATC	2	6	2236902	2236907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53534	NC_020568	AAT	2	6	2236946	2236951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53535	NC_020568	TAATT	2	10	2236963	2236972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53536	NC_020568	TG	3	6	2236978	2236983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53537	NC_020568	GTT	2	6	2237024	2237029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53538	NC_020568	ATTG	2	8	2237087	2237094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53539	NC_020568	ACATTC	2	12	2237164	2237175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53540	NC_020568	CTTTTT	2	12	2237193	2237204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53541	NC_020568	AAT	2	6	2237212	2237217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53542	NC_020568	AGT	2	6	2237247	2237252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53543	NC_020568	ATA	2	6	2237301	2237306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53544	NC_020568	TAAA	2	8	2237359	2237366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53545	NC_020568	TAAA	2	8	2237368	2237375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53546	NC_020568	AGT	2	6	2237430	2237435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53547	NC_020568	CTT	2	6	2237491	2237496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53548	NC_020568	TGA	2	6	2237514	2237519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53549	NC_020568	ACA	2	6	2237595	2237600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53550	NC_020568	TAG	2	6	2237685	2237690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53551	NC_020568	TAT	2	6	2237694	2237699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53552	NC_020568	GAT	2	6	2237724	2237729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53553	NC_020568	ATA	2	6	2237733	2237738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53554	NC_020568	AAT	2	6	2237745	2237750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53555	NC_020568	CTT	2	6	2237766	2237771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53556	NC_020568	ATT	2	6	2237792	2237797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53557	NC_020568	TTC	2	6	2237807	2237812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53558	NC_020568	ATC	2	6	2237814	2237819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53559	NC_020568	TAA	2	6	2237905	2237910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53560	NC_020568	TTG	2	6	2237947	2237952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53561	NC_020568	ATT	2	6	2238019	2238024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53562	NC_020568	A	7	7	2238069	2238075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53563	NC_020568	GATA	2	8	2238093	2238100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53564	NC_020568	TAAA	2	8	2238116	2238123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53565	NC_020568	AGA	2	6	2238138	2238143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53567	NC_020568	CATAC	2	10	2238212	2238221	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53568	NC_020568	TAG	2	6	2238223	2238228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53569	NC_020568	TAT	2	6	2238346	2238351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53571	NC_020568	AAG	2	6	2238374	2238379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53572	NC_020568	GAC	2	6	2238410	2238415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53584	NC_020568	TA	3	6	2239006	2239011	50 %	50 %	0 %	0 %	470225311
53585	NC_020568	AATT	2	8	2239037	2239044	50 %	50 %	0 %	0 %	470225311
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53589	NC_020568	TCCT	2	8	2239186	2239193	0 %	50 %	0 %	50 %	470225311
53590	NC_020568	ATT	2	6	2239272	2239277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225311
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53592	NC_020568	ATT	2	6	2239356	2239361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225311
53593	NC_020568	AT	3	6	2239364	2239369	50 %	50 %	0 %	0 %	470225311
53594	NC_020568	TGA	2	6	2239403	2239408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225311
53595	NC_020568	A	7	7	2239425	2239431	100 %	0 %	0 %	0 %	470225311
53596	NC_020568	TTA	2	6	2239432	2239437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225311
53597	NC_020568	A	6	6	2239474	2239479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53598	NC_020568	AAT	2	6	2239556	2239561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53599	NC_020568	AC	3	6	2239568	2239573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53600	NC_020568	A	7	7	2239580	2239586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53601	NC_020568	ATA	2	6	2239596	2239601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53602	NC_020568	TA	3	6	2239615	2239620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53603	NC_020568	ACG	2	6	2239656	2239661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53604	NC_020568	GCT	2	6	2239663	2239668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53605	NC_020568	T	6	6	2239680	2239685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53606	NC_020568	AGTA	2	8	2239710	2239717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53607	NC_020568	TAA	2	6	2239761	2239766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53608	NC_020568	AGCTTG	2	12	2239791	2239802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53609	NC_020568	ACC	3	9	2239812	2239820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53610	NC_020568	CAT	2	6	2239838	2239843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53611	NC_020568	TGGT	2	8	2239872	2239879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53612	NC_020568	TTA	2	6	2239930	2239935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53613	NC_020568	ACG	2	6	2239989	2239994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53614	NC_020568	TCC	2	6	2240032	2240037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53615	NC_020568	GTT	2	6	2240070	2240075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53616	NC_020568	CCA	2	6	2240099	2240104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53617	NC_020568	T	6	6	2240116	2240121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53618	NC_020568	TTC	2	6	2240196	2240201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53619	NC_020568	CAG	2	6	2240211	2240216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53620	NC_020568	TGAT	2	8	2240217	2240224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53621	NC_020568	ACC	2	6	2240230	2240235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53622	NC_020568	GAT	2	6	2240238	2240243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53623	NC_020568	GTA	2	6	2240254	2240259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53624	NC_020568	TAA	2	6	2240307	2240312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53625	NC_020568	GTGTG	2	10	2240338	2240347	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53626	NC_020568	AGAT	2	8	2240373	2240380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53627	NC_020568	TGA	2	6	2240389	2240394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53633	NC_020568	TGT	2	6	2240600	2240605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53635	NC_020568	TAA	2	6	2240681	2240686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53995	NC_020568	T	6	6	2255697	2255702	0 %	100 %	0 %	0 %	470225324
53996	NC_020568	ACG	2	6	2255706	2255711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225324
53997	NC_020568	CAC	3	9	2255783	2255791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225324
53998	NC_020568	CTT	2	6	2255984	2255989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225324
53999	NC_020568	TGT	2	6	2256059	2256064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225324
54000	NC_020568	TAC	2	6	2256066	2256071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225324

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