MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020568	AGC	2	6	2216034	2216039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225295
53002	NC_020568	AAT	2	6	2216152	2216157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225295
53003	NC_020568	TGC	2	6	2216202	2216207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225295
53004	NC_020568	AAT	2	6	2216341	2216346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225295
53005	NC_020568	TGT	2	6	2216411	2216416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225295
53006	NC_020568	AAG	2	6	2216437	2216442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225295
53007	NC_020568	TCT	2	6	2216452	2216457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225295
53008	NC_020568	CTTT	2	8	2216492	2216499	0 %	75 %	0 %	25 %	470225295
53009	NC_020568	CAT	2	6	2216519	2216524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225295
53010	NC_020568	CAT	2	6	2216528	2216533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225295
53011	NC_020568	AGTAA	2	10	2216534	2216543	60 %	20 %	20 %	0 %	470225295
53012	NC_020568	CTA	2	6	2216594	2216599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225295
53013	NC_020568	T	6	6	2216642	2216647	0 %	100 %	0 %	0 %	470225295
53014	NC_020568	AAT	2	6	2216659	2216664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225295
53015	NC_020568	TAA	2	6	2216715	2216720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225295
53016	NC_020568	TTC	2	6	2216745	2216750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225295
53017	NC_020568	CAT	2	6	2216814	2216819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225295
53018	NC_020568	CAC	2	6	2216831	2216836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225295
53019	NC_020568	TTA	2	6	2216872	2216877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225295
53020	NC_020568	T	6	6	2216900	2216905	0 %	100 %	0 %	0 %	470225295
53021	NC_020568	ATT	2	6	2216920	2216925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225295
53022	NC_020568	AAT	2	6	2216953	2216958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225296
53023	NC_020568	TCA	2	6	2216959	2216964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225296
53024	NC_020568	ATT	2	6	2216967	2216972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225296
53025	NC_020568	CTT	2	6	2216996	2217001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225296
53026	NC_020568	T	7	7	2217030	2217036	0 %	100 %	0 %	0 %	470225296
53027	NC_020568	AACC	2	8	2217104	2217111	50 %	0 %	0 %	50 %	470225296
53028	NC_020568	AAT	2	6	2217198	2217203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225296
53029	NC_020568	TCA	2	6	2217262	2217267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225296
53030	NC_020568	AAT	2	6	2217408	2217413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225296
53031	NC_020568	ATA	2	6	2217420	2217425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225296
53032	NC_020568	TAA	2	6	2217483	2217488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225296
53033	NC_020568	TAA	2	6	2217503	2217508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225296
53034	NC_020568	TGTT	2	8	2217558	2217565	0 %	75 %	25 %	0 %	470225296
53035	NC_020568	ATGC	2	8	2217620	2217627	25 %	25 %	25 %	25 %	470225296
53036	NC_020568	T	6	6	2217648	2217653	0 %	100 %	0 %	0 %	470225296
53037	NC_020568	ACC	2	6	2217747	2217752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225296
53038	NC_020568	TACT	2	8	2217761	2217768	25 %	50 %	0 %	25 %	470225296
53039	NC_020568	CAT	2	6	2217785	2217790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225296
53040	NC_020568	GGAT	2	8	2217828	2217835	25 %	25 %	50 %	0 %	470225296
53041	NC_020568	GTTAAA	2	12	2217841	2217852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470225296
53042	NC_020568	GTC	2	6	2217862	2217867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53043	NC_020568	TCA	2	6	2217910	2217915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225297
53044	NC_020568	T	6	6	2217978	2217983	0 %	100 %	0 %	0 %	470225297
53045	NC_020568	TAA	2	6	2218013	2218018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225297
53046	NC_020568	ATA	2	6	2218027	2218032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225297
53047	NC_020568	TAA	2	6	2218041	2218046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225297
53048	NC_020568	CCA	2	6	2218063	2218068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225297
53049	NC_020568	TTC	2	6	2218092	2218097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225297
53050	NC_020568	GAAC	2	8	2218138	2218145	50 %	0 %	25 %	25 %	470225297
53051	NC_020568	TTTA	2	8	2218155	2218162	25 %	75 %	0 %	0 %	470225297
53052	NC_020568	AAC	2	6	2218224	2218229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225297
53053	NC_020568	T	6	6	2218242	2218247	0 %	100 %	0 %	0 %	470225297
53054	NC_020568	TCC	2	6	2218395	2218400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53055	NC_020568	TTA	2	6	2218411	2218416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53056	NC_020568	ACC	2	6	2218443	2218448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53057	NC_020568	CAA	2	6	2218463	2218468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53058	NC_020568	CAA	2	6	2218502	2218507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53059	NC_020568	AT	3	6	2218555	2218560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53060	NC_020568	CAG	2	6	2218583	2218588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53061	NC_020568	CTT	2	6	2218664	2218669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53062	NC_020568	CAA	2	6	2218706	2218711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53063	NC_020568	CAA	2	6	2218739	2218744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53064	NC_020568	CAT	2	6	2218745	2218750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53065	NC_020568	TAA	2	6	2218761	2218766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53066	NC_020568	TGA	2	6	2218775	2218780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53067	NC_020568	CTT	2	6	2218781	2218786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53068	NC_020568	AAT	3	9	2218815	2218823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53069	NC_020568	ATA	2	6	2218828	2218833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53070	NC_020568	ATTT	2	8	2218883	2218890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53071	NC_020568	TAAACA	2	12	2218944	2218955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53072	NC_020568	ATA	2	6	2218970	2218975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53073	NC_020568	TGTT	2	8	2218987	2218994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_020568	GTT	2	6	2219038	2219043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53075	NC_020568	GTA	2	6	2219068	2219073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53076	NC_020568	A	7	7	2219109	2219115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53077	NC_020568	ATTCAC	2	12	2219136	2219147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53078	NC_020568	ACT	2	6	2219203	2219208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225298
53079	NC_020568	AT	3	6	2219212	2219217	50 %	50 %	0 %	0 %	470225298
53080	NC_020568	TCTTCA	2	12	2219239	2219250	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470225298
53081	NC_020568	ATG	2	6	2219291	2219296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225298
53082	NC_020568	TCT	2	6	2219302	2219307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225298
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53085	NC_020568	TTTA	2	8	2219412	2219419	25 %	75 %	0 %	0 %	470225298
53086	NC_020568	TAC	2	6	2219426	2219431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225298
53087	NC_020568	CAC	2	6	2219516	2219521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225298
53088	NC_020568	TGTT	2	8	2219547	2219554	0 %	75 %	25 %	0 %	470225298
53089	NC_020568	TAA	2	6	2219591	2219596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225298
53090	NC_020568	ATG	2	6	2219607	2219612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225298
53091	NC_020568	CTT	2	6	2219618	2219623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225298
53092	NC_020568	TGT	2	6	2219640	2219645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225298
53093	NC_020568	ATG	2	6	2219684	2219689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225298
53094	NC_020568	TA	3	6	2219703	2219708	50 %	50 %	0 %	0 %	470225298
53095	NC_020568	T	6	6	2219711	2219716	0 %	100 %	0 %	0 %	470225298
53096	NC_020568	CAC	2	6	2219786	2219791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225298
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53098	NC_020568	CCT	2	6	2219962	2219967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225298
53099	NC_020568	TAA	2	6	2220034	2220039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53100	NC_020568	TAA	2	6	2220148	2220153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53101	NC_020568	TCAT	2	8	2220173	2220180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53102	NC_020568	TGA	2	6	2220327	2220332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225299
53103	NC_020568	ATT	2	6	2220377	2220382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225299
53104	NC_020568	AGA	2	6	2220384	2220389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225299
53105	NC_020568	GATTG	2	10	2220463	2220472	20 %	40 %	40 %	0 %	470225299
53106	NC_020568	CAA	2	6	2220490	2220495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225299
53107	NC_020568	TCA	2	6	2220506	2220511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225299
53108	NC_020568	TGA	2	6	2220558	2220563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225299
53109	NC_020568	TGG	2	6	2220663	2220668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225299
53110	NC_020568	TAT	2	6	2220689	2220694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225299
53111	NC_020568	CAT	2	6	2220720	2220725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225299
53112	NC_020568	TAAA	2	8	2220734	2220741	75 %	25 %	0 %	0 %	470225299
53113	NC_020568	TTG	2	6	2220761	2220766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225299
53114	NC_020568	TCA	2	6	2220775	2220780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225299
53115	NC_020568	ATT	2	6	2220835	2220840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225299
53116	NC_020568	GAC	2	6	2220892	2220897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225299
53117	NC_020568	ATT	2	6	2221066	2221071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53118	NC_020568	TGA	2	6	2221109	2221114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53119	NC_020568	T	7	7	2221119	2221125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53484	NC_020568	GAT	2	6	2234991	2234996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225309
53485	NC_020568	TTAT	2	8	2234997	2235004	25 %	75 %	0 %	0 %	470225309
53486	NC_020568	TTA	2	6	2235015	2235020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225309
53487	NC_020568	TAA	2	6	2235025	2235030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225309
53488	NC_020568	CAC	2	6	2235067	2235072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53489	NC_020568	TAT	2	6	2235079	2235084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53490	NC_020568	AAT	2	6	2235104	2235109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53491	NC_020568	AATAT	2	10	2235116	2235125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53492	NC_020568	TAAT	2	8	2235127	2235134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53493	NC_020568	TTA	2	6	2235135	2235140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53494	NC_020568	TAT	2	6	2235161	2235166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53495	NC_020568	AT	3	6	2235260	2235265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53496	NC_020568	ATT	2	6	2235333	2235338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53497	NC_020568	TAA	2	6	2235426	2235431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53498	NC_020568	GTT	2	6	2235519	2235524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53499	NC_020568	TAA	2	6	2235581	2235586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53500	NC_020568	ATG	2	6	2235648	2235653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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