MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_020568	CTT	3	9	2110160	2110168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225222
50502	NC_020568	TCT	2	6	2110195	2110200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225222
50503	NC_020568	AAT	2	6	2110441	2110446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50504	NC_020568	TA	3	6	2110456	2110461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50505	NC_020568	A	7	7	2110463	2110469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50506	NC_020568	CGA	2	6	2110470	2110475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50507	NC_020568	TAA	2	6	2110532	2110537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50508	NC_020568	TA	3	6	2110554	2110559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50509	NC_020568	CAT	2	6	2110562	2110567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50510	NC_020568	TAC	2	6	2110640	2110645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50511	NC_020568	GAT	2	6	2110649	2110654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50512	NC_020568	TGC	3	9	2110805	2110813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50513	NC_020568	TAATT	2	10	2110825	2110834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50514	NC_020568	TCC	2	6	2110835	2110840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50515	NC_020568	TA	3	6	2110849	2110854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50516	NC_020568	ATT	2	6	2110855	2110860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50517	NC_020568	ATA	2	6	2110914	2110919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225223
50518	NC_020568	AT	3	6	2110923	2110928	50 %	50 %	0 %	0 %	470225223
50519	NC_020568	TAA	2	6	2110987	2110992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225223
50520	NC_020568	TAA	2	6	2111119	2111124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225223
50521	NC_020568	TAT	2	6	2111210	2111215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225223
50522	NC_020568	CCA	2	6	2111264	2111269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225223
50523	NC_020568	TG	3	6	2111273	2111278	0 %	50 %	50 %	0 %	470225223
50524	NC_020568	AAG	2	6	2111352	2111357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225223
50525	NC_020568	ACC	2	6	2111366	2111371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225223
50526	NC_020568	T	6	6	2111372	2111377	0 %	100 %	0 %	0 %	470225223
50527	NC_020568	TTTG	2	8	2111437	2111444	0 %	75 %	25 %	0 %	470225223
50528	NC_020568	T	7	7	2111455	2111461	0 %	100 %	0 %	0 %	470225223
50529	NC_020568	ATC	2	6	2111517	2111522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225223
50530	NC_020568	ATTT	2	8	2111615	2111622	25 %	75 %	0 %	0 %	470225224
50531	NC_020568	ACA	2	6	2111654	2111659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225224
50532	NC_020568	AAT	2	6	2111677	2111682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225224
50533	NC_020568	GAT	2	6	2111689	2111694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225224
50534	NC_020568	TTA	2	6	2111708	2111713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225224
50535	NC_020568	AAT	2	6	2111734	2111739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225224
50536	NC_020568	TTTAGC	2	12	2111794	2111805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470225224
50537	NC_020568	GT	3	6	2111881	2111886	0 %	50 %	50 %	0 %	470225224
50538	NC_020568	TCC	2	6	2111899	2111904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225224
50539	NC_020568	ATT	3	9	2111909	2111917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225224
50540	NC_020568	ATA	2	6	2111926	2111931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225224
50541	NC_020568	TGAA	2	8	2111933	2111940	50 %	25 %	25 %	0 %	470225224
50542	NC_020568	TGT	2	6	2111952	2111957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225224
50543	NC_020568	ATCA	2	8	2111995	2112002	50 %	25 %	0 %	25 %	470225224
50544	NC_020568	ATA	2	6	2112034	2112039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225224
50545	NC_020568	TTG	2	6	2112071	2112076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225224
50546	NC_020568	A	8	8	2112078	2112085	100 %	0 %	0 %	0 %	470225224
50547	NC_020568	ATA	2	6	2112171	2112176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225225
50548	NC_020568	TTCT	2	8	2112194	2112201	0 %	75 %	0 %	25 %	470225225
50549	NC_020568	TGA	2	6	2112244	2112249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225225
50550	NC_020568	TC	3	6	2112255	2112260	0 %	50 %	0 %	50 %	470225225
50551	NC_020568	ATC	2	6	2112261	2112266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225225
50552	NC_020568	AAAACT	2	12	2112367	2112378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470225225
50553	NC_020568	TTA	2	6	2112382	2112387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225225
50554	NC_020568	ATG	2	6	2112389	2112394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225225
50555	NC_020568	CTT	2	6	2112398	2112403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225225
50556	NC_020568	AAAAT	2	10	2112427	2112436	80 %	20 %	0 %	0 %	470225225
50557	NC_020568	T	6	6	2112441	2112446	0 %	100 %	0 %	0 %	470225225
50558	NC_020568	CTA	2	6	2112464	2112469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225225
50559	NC_020568	TCAA	2	8	2112481	2112488	50 %	25 %	0 %	25 %	470225225
50560	NC_020568	AT	3	6	2112611	2112616	50 %	50 %	0 %	0 %	470225225
50561	NC_020568	TCG	2	6	2112642	2112647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225225
50562	NC_020568	GAAT	2	8	2112662	2112669	50 %	25 %	25 %	0 %	470225225
50563	NC_020568	T	6	6	2112669	2112674	0 %	100 %	0 %	0 %	470225225
50564	NC_020568	ATG	2	6	2112691	2112696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225225
50565	NC_020568	TCA	2	6	2112712	2112717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225225
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50568	NC_020568	TAG	2	6	2112812	2112817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225225
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50570	NC_020568	GTC	2	6	2112964	2112969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225225
50571	NC_020568	TGAT	2	8	2113034	2113041	25 %	50 %	25 %	0 %	470225225
50572	NC_020568	ATA	2	6	2113078	2113083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225225
50573	NC_020568	TGCTG	2	10	2113144	2113153	0 %	40 %	40 %	20 %	470225225
50574	NC_020568	AAC	3	9	2113155	2113163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225225
50575	NC_020568	T	6	6	2113178	2113183	0 %	100 %	0 %	0 %	470225225
50576	NC_020568	TCA	2	6	2113259	2113264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225225
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50583	NC_020568	TGC	2	6	2113427	2113432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225226
50584	NC_020568	TTC	2	6	2113470	2113475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225226
50585	NC_020568	CAA	3	9	2113525	2113533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225226
50586	NC_020568	T	6	6	2113703	2113708	0 %	100 %	0 %	0 %	470225226
50587	NC_020568	GAT	2	6	2113888	2113893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225226
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50589	NC_020568	TTC	2	6	2114006	2114011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225227
50590	NC_020568	TGA	2	6	2114038	2114043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225227
50591	NC_020568	TCA	2	6	2114070	2114075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225227
50592	NC_020568	GTT	2	6	2114085	2114090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225227
50593	NC_020568	GCA	2	6	2114091	2114096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225227
50594	NC_020568	CTT	2	6	2114200	2114205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225227
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50599	NC_020568	TGC	2	6	2114387	2114392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225227
50600	NC_020568	T	6	6	2114450	2114455	0 %	100 %	0 %	0 %	470225227
50601	NC_020568	TTC	2	6	2114459	2114464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225227
50602	NC_020568	ACC	2	6	2114480	2114485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225227
50603	NC_020568	TG	3	6	2114506	2114511	0 %	50 %	50 %	0 %	470225227
50604	NC_020568	GTT	2	6	2114517	2114522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225227
50605	NC_020568	CTA	2	6	2114566	2114571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225227
50606	NC_020568	TCA	2	6	2114721	2114726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225227
50607	NC_020568	ACC	2	6	2114819	2114824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225227
50608	NC_020568	CCA	2	6	2114994	2114999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225227
50609	NC_020568	TTA	2	6	2115033	2115038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225227
50610	NC_020568	TC	4	8	2115129	2115136	0 %	50 %	0 %	50 %	470225227
50611	NC_020568	CTTG	2	8	2115160	2115167	0 %	50 %	25 %	25 %	470225227
50612	NC_020568	CTT	2	6	2115192	2115197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50613	NC_020568	A	7	7	2115200	2115206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50614	NC_020568	CCA	2	6	2115230	2115235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225228
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50616	NC_020568	ATGC	2	8	2115325	2115332	25 %	25 %	25 %	25 %	470225228
50617	NC_020568	CTCC	2	8	2115428	2115435	0 %	25 %	0 %	75 %	470225228
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50979	NC_020568	TTC	2	6	2129697	2129702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225239
50980	NC_020568	TGAT	2	8	2129719	2129726	25 %	50 %	25 %	0 %	470225239
50981	NC_020568	TTC	3	9	2129727	2129735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225239
50982	NC_020568	TCT	2	6	2129746	2129751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225239
50983	NC_020568	TTC	2	6	2129763	2129768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225239
50984	NC_020568	ATC	2	6	2129772	2129777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225239
50985	NC_020568	ATC	2	6	2129793	2129798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225239
50986	NC_020568	GTC	2	6	2129799	2129804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225239
50987	NC_020568	AAT	2	6	2129824	2129829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225239
50988	NC_020568	TCT	2	6	2129842	2129847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225239
50989	NC_020568	TCA	2	6	2129848	2129853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225239
50990	NC_020568	ATC	2	6	2129907	2129912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225239
50991	NC_020568	A	6	6	2129959	2129964	100 %	0 %	0 %	0 %	470225239
50992	NC_020568	TTC	2	6	2130015	2130020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225239
50993	NC_020568	GAT	2	6	2130054	2130059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225239
50994	NC_020568	AAT	2	6	2130094	2130099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225239
50995	NC_020568	TCA	2	6	2130127	2130132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225239
50996	NC_020568	TTTGT	2	10	2130137	2130146	0 %	80 %	20 %	0 %	470225239
50997	NC_020568	TA	4	8	2130220	2130227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50998	NC_020568	ATC	2	6	2130309	2130314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225240
50999	NC_020568	ATT	2	6	2130366	2130371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225240
51000	NC_020568	ATC	2	6	2130385	2130390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225240

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