MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020566	ATG	2	6	669495	669500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222246
16002	NC_020566	ATA	2	6	669501	669506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222246
16003	NC_020566	TTCAC	2	10	669605	669614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16004	NC_020566	TTAA	2	8	669616	669623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_020566	TTG	2	6	669625	669630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_020566	AAT	2	6	669661	669666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_020566	AT	3	6	669671	669676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_020566	GT	3	6	669680	669685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_020566	TTA	2	6	669773	669778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_020566	A	6	6	669780	669785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_020566	TTG	2	6	669861	669866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_020566	TATC	2	8	669894	669901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16013	NC_020566	AGA	2	6	669929	669934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_020566	A	6	6	669977	669982	100 %	0 %	0 %	0 %	470222247
16015	NC_020566	TCA	2	6	670025	670030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222247
16016	NC_020566	ATT	2	6	670123	670128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16017	NC_020566	TGG	2	6	670129	670134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222247
16018	NC_020566	TCA	2	6	670143	670148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222247
16019	NC_020566	TTA	2	6	670154	670159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16020	NC_020566	TATT	2	8	670175	670182	25 %	75 %	0 %	0 %	470222247
16021	NC_020566	ATT	2	6	670202	670207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16022	NC_020566	ATTT	2	8	670327	670334	25 %	75 %	0 %	0 %	470222247
16023	NC_020566	TTA	2	6	670352	670357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16024	NC_020566	TTAT	2	8	670394	670401	25 %	75 %	0 %	0 %	470222247
16025	NC_020566	ATT	2	6	670420	670425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16026	NC_020566	TAT	2	6	670477	670482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16027	NC_020566	TGAA	2	8	670617	670624	50 %	25 %	25 %	0 %	470222247
16028	NC_020566	AT	3	6	670625	670630	50 %	50 %	0 %	0 %	470222247
16029	NC_020566	ATT	2	6	670709	670714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16030	NC_020566	AATC	2	8	670810	670817	50 %	25 %	0 %	25 %	470222247
16031	NC_020566	GTTA	2	8	670825	670832	25 %	50 %	25 %	0 %	470222247
16032	NC_020566	AGT	2	6	670859	670864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16033	NC_020566	TGA	2	6	670936	670941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16034	NC_020566	ATG	2	6	670977	670982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16035	NC_020566	GAA	2	6	670984	670989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222247
16036	NC_020566	GAT	2	6	670997	671002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16037	NC_020566	AGTG	2	8	671029	671036	25 %	25 %	50 %	0 %	470222247
16038	NC_020566	GTAT	2	8	671091	671098	25 %	50 %	25 %	0 %	470222247
16039	NC_020566	GAT	2	6	671200	671205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16040	NC_020566	GAA	2	6	671261	671266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222247
16041	NC_020566	TTA	2	6	671268	671273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222247
16042	NC_020566	TGA	2	6	671317	671322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16043	NC_020566	CAACGT	2	12	671372	671383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470222247
16044	NC_020566	TGA	2	6	671431	671436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222247
16045	NC_020566	AGTGAA	2	12	671456	671467	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470222247
16046	NC_020566	AAG	2	6	671478	671483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222247
16047	NC_020566	AAC	2	6	671509	671514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222247
16048	NC_020566	A	6	6	671546	671551	100 %	0 %	0 %	0 %	470222247
16049	NC_020566	TA	4	8	671675	671682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_020566	TAA	2	6	671754	671759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020566	ATA	2	6	671807	671812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_020566	TAA	2	6	671823	671828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_020566	A	7	7	671844	671850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_020566	ACAT	2	8	671881	671888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16055	NC_020566	AT	3	6	671887	671892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_020566	TTC	2	6	671918	671923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_020566	A	6	6	672000	672005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_020566	GGTG	2	8	672016	672023	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_020566	TTA	2	6	672034	672039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16060	NC_020566	ATT	2	6	672046	672051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16061	NC_020566	TAT	2	6	672080	672085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16062	NC_020566	CAAT	2	8	672115	672122	50 %	25 %	0 %	25 %	470222248
16063	NC_020566	GTT	2	6	672133	672138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222248
16064	NC_020566	TTTA	2	8	672163	672170	25 %	75 %	0 %	0 %	470222248
16065	NC_020566	AGC	2	6	672201	672206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222248
16066	NC_020566	TCAG	2	8	672228	672235	25 %	25 %	25 %	25 %	470222248
16067	NC_020566	TTTGCA	2	12	672253	672264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470222248
16068	NC_020566	ATG	2	6	672283	672288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222248
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16070	NC_020566	ATT	2	6	672333	672338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16071	NC_020566	ATT	2	6	672373	672378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16072	NC_020566	TTGG	2	8	672386	672393	0 %	50 %	50 %	0 %	470222248
16073	NC_020566	ATG	2	6	672448	672453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222248
16074	NC_020566	ATGA	2	8	672505	672512	50 %	25 %	25 %	0 %	470222248
16075	NC_020566	ATG	2	6	672535	672540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222248
16076	NC_020566	ATT	2	6	672640	672645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16077	NC_020566	TTG	2	6	672655	672660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222248
16078	NC_020566	AGAA	2	8	672680	672687	75 %	0 %	25 %	0 %	470222248
16079	NC_020566	ATT	2	6	672691	672696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16080	NC_020566	TTC	2	6	672733	672738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222248
16081	NC_020566	AGC	2	6	672762	672767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222248
16082	NC_020566	ATC	3	9	672784	672792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222248
16083	NC_020566	TTA	2	6	672800	672805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16084	NC_020566	GGAT	2	8	672868	672875	25 %	25 %	50 %	0 %	470222248
16085	NC_020566	GT	3	6	672914	672919	0 %	50 %	50 %	0 %	470222248
16086	NC_020566	ATG	2	6	672956	672961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222248
16087	NC_020566	TGGT	2	8	672967	672974	0 %	50 %	50 %	0 %	470222248
16088	NC_020566	CAA	2	6	672979	672984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222248
16089	NC_020566	TGT	2	6	673014	673019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222248
16090	NC_020566	ACACC	2	10	673054	673063	40 %	0 %	0 %	60 %	470222248
16091	NC_020566	TTA	2	6	673073	673078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16092	NC_020566	TTG	2	6	673145	673150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222248
16093	NC_020566	ATG	2	6	673189	673194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222248
16094	NC_020566	TAT	2	6	673196	673201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16095	NC_020566	ATT	2	6	673218	673223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222248
16096	NC_020566	CAG	2	6	673226	673231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222248
16097	NC_020566	ATA	2	6	673278	673283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_020566	TAA	2	6	673293	673298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_020566	GTC	2	6	673313	673318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_020566	T	6	6	673345	673350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_020566	ATT	2	6	673351	673356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_020566	ATT	2	6	673456	673461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_020566	TTTGT	2	10	673511	673520	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_020566	TAT	2	6	673521	673526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_020566	ACA	2	6	673529	673534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_020566	GAA	2	6	673557	673562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_020566	AATGA	2	10	673584	673593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020566	ATT	2	6	673623	673628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_020566	TTA	2	6	673645	673650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_020566	TTC	2	6	673661	673666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_020566	TGT	2	6	673731	673736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_020566	CTA	2	6	673738	673743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_020566	TAA	2	6	673755	673760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_020566	AT	3	6	673761	673766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_020566	TGC	2	6	673835	673840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222249
16116	NC_020566	TAT	2	6	673856	673861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222249
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16118	NC_020566	TAT	2	6	673911	673916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222249
16119	NC_020566	CTT	2	6	673946	673951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222249
16120	NC_020566	ATTG	2	8	673964	673971	25 %	50 %	25 %	0 %	470222249
16121	NC_020566	TGG	2	6	674105	674110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222249
16122	NC_020566	ACA	2	6	674157	674162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222249
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16124	NC_020566	TGCTT	2	10	674222	674231	0 %	60 %	20 %	20 %	470222249
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16137	NC_020566	T	6	6	674693	674698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16243	NC_020566	A	6	6	679042	679047	100 %	0 %	0 %	0 %	470222254
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16495	NC_020566	ATA	2	6	688967	688972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222263
16496	NC_020566	GTT	2	6	688990	688995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222263
16497	NC_020566	CTAT	2	8	689034	689041	25 %	50 %	0 %	25 %	470222263
16498	NC_020566	TTTAT	2	10	689086	689095	20 %	80 %	0 %	0 %	470222263
16499	NC_020566	T	6	6	689122	689127	0 %	100 %	0 %	0 %	470222263
16500	NC_020566	GAA	2	6	689160	689165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222263

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