MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020566	TATT	2	8	649950	649957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_020566	TCT	2	6	649980	649985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_020566	ATA	2	6	649995	650000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_020566	TGG	3	9	650005	650013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_020566	TGG	2	6	650020	650025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_020566	GATT	2	8	650098	650105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020566	ATT	2	6	650120	650125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020566	ATC	2	6	650137	650142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_020566	ATA	2	6	650153	650158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020566	T	6	6	650165	650170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_020566	AAC	2	6	650197	650202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_020566	GTT	2	6	650276	650281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_020566	TGT	2	6	650301	650306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_020566	ATT	2	6	650337	650342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_020566	AT	3	6	650376	650381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_020566	ATCA	2	8	650388	650395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15517	NC_020566	AT	3	6	650425	650430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_020566	ATT	2	6	650449	650454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_020566	TAG	2	6	650478	650483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_020566	TAA	2	6	650495	650500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020566	TGG	2	6	650502	650507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_020566	TTGT	2	8	650515	650522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_020566	TACTTG	2	12	650588	650599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15524	NC_020566	AGA	2	6	650625	650630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020566	G	6	6	650648	650653	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_020566	GAT	2	6	650656	650661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222231
15527	NC_020566	TTA	2	6	650690	650695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15528	NC_020566	A	6	6	650728	650733	100 %	0 %	0 %	0 %	470222231
15529	NC_020566	CAC	2	6	650779	650784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222231
15530	NC_020566	ATT	2	6	650786	650791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15531	NC_020566	GGA	2	6	650846	650851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470222231
15532	NC_020566	ATT	2	6	651001	651006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15533	NC_020566	ATTT	2	8	651045	651052	25 %	75 %	0 %	0 %	470222231
15534	NC_020566	TGC	2	6	651133	651138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222231
15535	NC_020566	ATT	2	6	651140	651145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15536	NC_020566	TGT	2	6	651148	651153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222231
15537	NC_020566	ATT	2	6	651161	651166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15538	NC_020566	TTA	2	6	651182	651187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15539	NC_020566	TCT	2	6	651294	651299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222231
15540	NC_020566	AGC	2	6	651319	651324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222231
15541	NC_020566	GCA	2	6	651380	651385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222231
15542	NC_020566	TTC	2	6	651434	651439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222231
15543	NC_020566	GCT	2	6	651494	651499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222231
15544	NC_020566	AACA	2	8	651607	651614	75 %	0 %	0 %	25 %	470222231
15545	NC_020566	TTG	2	6	651660	651665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222231
15546	NC_020566	TAT	2	6	651685	651690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15547	NC_020566	TAGTT	2	10	651694	651703	20 %	60 %	20 %	0 %	470222231
15548	NC_020566	CAATAT	2	12	651722	651733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470222231
15549	NC_020566	A	6	6	651749	651754	100 %	0 %	0 %	0 %	470222231
15550	NC_020566	TAT	2	6	651778	651783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15551	NC_020566	GGC	2	6	651800	651805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470222231
15552	NC_020566	ATT	2	6	651893	651898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222231
15553	NC_020566	TTTA	2	8	651922	651929	25 %	75 %	0 %	0 %	470222231
15554	NC_020566	T	6	6	651936	651941	0 %	100 %	0 %	0 %	470222231
15555	NC_020566	GGA	2	6	651967	651972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470222231
15556	NC_020566	TAG	2	6	652023	652028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222231
15557	NC_020566	TGC	2	6	652051	652056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222231
15558	NC_020566	TGT	2	6	652060	652065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222231
15559	NC_020566	TAT	2	6	652200	652205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222232
15560	NC_020566	CTTT	2	8	652236	652243	0 %	75 %	0 %	25 %	470222232
15561	NC_020566	TA	3	6	652274	652279	50 %	50 %	0 %	0 %	470222232
15562	NC_020566	GAT	2	6	652298	652303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222232
15563	NC_020566	TTTA	2	8	652347	652354	25 %	75 %	0 %	0 %	470222232
15564	NC_020566	TAA	2	6	652362	652367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222232
15565	NC_020566	ATTA	2	8	652385	652392	50 %	50 %	0 %	0 %	470222232
15566	NC_020566	ATT	2	6	652487	652492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222232
15567	NC_020566	T	6	6	652541	652546	0 %	100 %	0 %	0 %	470222232
15568	NC_020566	AGAAAA	2	12	652567	652578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470222232
15569	NC_020566	AAG	2	6	652591	652596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222232
15570	NC_020566	GAT	2	6	652635	652640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222232
15571	NC_020566	ACAA	2	8	652641	652648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15572	NC_020566	ATT	2	6	652663	652668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_020566	ATT	2	6	652678	652683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_020566	ATC	2	6	652699	652704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_020566	TTTA	2	8	652707	652714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020566	ACA	2	6	652732	652737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_020566	ACA	2	6	652762	652767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_020566	GT	3	6	652793	652798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020566	TTTC	2	8	652820	652827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15580	NC_020566	TGG	2	6	652893	652898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020566	G	6	6	652897	652902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_020566	TGC	2	6	652945	652950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222233
15583	NC_020566	TGT	3	9	652956	652964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222233
15584	NC_020566	TTA	2	6	652983	652988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
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15586	NC_020566	TTA	2	6	653066	653071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
15587	NC_020566	ATTT	2	8	653090	653097	25 %	75 %	0 %	0 %	470222233
15588	NC_020566	TTA	2	6	653129	653134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
15589	NC_020566	TTA	2	6	653148	653153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
15590	NC_020566	TCGC	2	8	653184	653191	0 %	25 %	25 %	50 %	470222233
15591	NC_020566	GCT	2	6	653192	653197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222233
15592	NC_020566	A	6	6	653224	653229	100 %	0 %	0 %	0 %	470222233
15593	NC_020566	CA	4	8	653237	653244	50 %	0 %	0 %	50 %	470222233
15594	NC_020566	ATT	2	6	653254	653259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
15595	NC_020566	A	6	6	653306	653311	100 %	0 %	0 %	0 %	470222233
15596	NC_020566	T	6	6	653457	653462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_020566	TAT	2	6	653464	653469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_020566	TGT	2	6	653477	653482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_020566	GTT	2	6	653496	653501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_020566	ACAA	2	8	653509	653516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15601	NC_020566	ATAAA	2	10	653523	653532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_020566	AAT	2	6	653537	653542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_020566	AT	3	6	653571	653576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_020566	AG	3	6	653676	653681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_020566	TGT	2	6	653725	653730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
15606	NC_020566	TATT	2	8	653808	653815	25 %	75 %	0 %	0 %	470222234
15607	NC_020566	AATTT	2	10	653832	653841	40 %	60 %	0 %	0 %	470222234
15608	NC_020566	AT	3	6	653926	653931	50 %	50 %	0 %	0 %	470222234
15609	NC_020566	TGA	3	9	653940	653948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
15610	NC_020566	TAC	2	6	653968	653973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222234
15611	NC_020566	TTTA	2	8	653989	653996	25 %	75 %	0 %	0 %	470222234
15612	NC_020566	AGC	2	6	654028	654033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222234
15613	NC_020566	TGC	2	6	654043	654048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222234
15614	NC_020566	GCAA	2	8	654079	654086	50 %	0 %	25 %	25 %	470222234
15615	NC_020566	AAAGG	2	10	654092	654101	60 %	0 %	40 %	0 %	470222234
15616	NC_020566	ATT	2	6	654142	654147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
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15618	NC_020566	CTG	2	6	654156	654161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222234
15619	NC_020566	TAT	2	6	654163	654168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
15620	NC_020566	TTG	2	6	654216	654221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
15621	NC_020566	GTT	2	6	654232	654237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
15622	NC_020566	TGG	2	6	654253	654258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222234
15623	NC_020566	TGGT	2	8	654264	654271	0 %	50 %	50 %	0 %	470222234
15624	NC_020566	ATT	2	6	654350	654355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
15625	NC_020566	GCA	2	6	654419	654424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222234
15626	NC_020566	GTAC	2	8	654473	654480	25 %	25 %	25 %	25 %	470222234
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15736	NC_020566	AACC	2	8	658913	658920	50 %	0 %	0 %	50 %	470222236
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15745	NC_020566	TAA	3	9	659182	659190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15746	NC_020566	T	6	6	659200	659205	0 %	100 %	0 %	0 %	470222237
15747	NC_020566	TTTC	2	8	659223	659230	0 %	75 %	0 %	25 %	470222237
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