MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020566	TGA	2	6	609795	609800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_020566	TTG	2	6	609801	609806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_020566	TCAT	2	8	609814	609821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14504	NC_020566	GAATG	2	10	609896	609905	40 %	20 %	40 %	0 %	470222199
14505	NC_020566	AAC	2	6	609927	609932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222199
14506	NC_020566	T	6	6	609960	609965	0 %	100 %	0 %	0 %	470222199
14507	NC_020566	AT	4	8	610010	610017	50 %	50 %	0 %	0 %	470222199
14508	NC_020566	GTT	2	6	610054	610059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222199
14509	NC_020566	GAT	2	6	610174	610179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222199
14510	NC_020566	TTGG	2	8	610292	610299	0 %	50 %	50 %	0 %	470222199
14511	NC_020566	TGA	2	6	610311	610316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222199
14512	NC_020566	ATT	2	6	610318	610323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222199
14513	NC_020566	TGT	2	6	610350	610355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222199
14514	NC_020566	A	6	6	610385	610390	100 %	0 %	0 %	0 %	470222199
14515	NC_020566	TAT	2	6	610419	610424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222199
14516	NC_020566	AATT	2	8	610527	610534	50 %	50 %	0 %	0 %	470222199
14517	NC_020566	AGCAG	2	10	610605	610614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14518	NC_020566	CATGAC	2	12	610621	610632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_020566	CATA	2	8	610653	610660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14520	NC_020566	AAC	2	6	610709	610714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_020566	TCG	2	6	610722	610727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_020566	TCA	2	6	610776	610781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_020566	GCT	2	6	610789	610794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_020566	GTAAA	2	10	610814	610823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020566	CAT	3	9	610837	610845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_020566	CAA	3	9	610873	610881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_020566	GAT	2	6	610894	610899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020566	CAA	2	6	610940	610945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_020566	TAA	2	6	610985	610990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_020566	TTA	2	6	611034	611039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_020566	TA	3	6	611049	611054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_020566	ATT	2	6	611073	611078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_020566	TAT	2	6	611079	611084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020566	GAT	2	6	611103	611108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020566	ACG	2	6	611191	611196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_020566	ATT	2	6	611220	611225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020566	TCAA	2	8	611254	611261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14538	NC_020566	GCTG	2	8	611272	611279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14539	NC_020566	TAT	2	6	611295	611300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_020566	TA	3	6	611318	611323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_020566	TGG	2	6	611370	611375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_020566	TCA	2	6	611384	611389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_020566	TAA	2	6	611481	611486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020566	AAT	2	6	611488	611493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_020566	A	7	7	611561	611567	100 %	0 %	0 %	0 %	470222200
14546	NC_020566	ATAG	2	8	611578	611585	50 %	25 %	25 %	0 %	470222200
14547	NC_020566	AAAAC	2	10	611595	611604	80 %	0 %	0 %	20 %	470222200
14548	NC_020566	GCA	2	6	611704	611709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222200
14549	NC_020566	ATT	2	6	611733	611738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14550	NC_020566	GTTA	2	8	611755	611762	25 %	50 %	25 %	0 %	470222200
14551	NC_020566	TAG	2	6	611771	611776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222200
14552	NC_020566	AG	3	6	611775	611780	50 %	0 %	50 %	0 %	470222200
14553	NC_020566	TCT	2	6	611843	611848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222200
14554	NC_020566	CAT	2	6	611849	611854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222200
14555	NC_020566	AAT	2	6	611944	611949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222200
14556	NC_020566	ATT	2	6	611998	612003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14557	NC_020566	TAC	2	6	612014	612019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222200
14558	NC_020566	ATT	2	6	612074	612079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14559	NC_020566	TG	3	6	612082	612087	0 %	50 %	50 %	0 %	470222200
14560	NC_020566	TCG	2	6	612098	612103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222200
14561	NC_020566	TAT	2	6	612104	612109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14562	NC_020566	TAA	2	6	612135	612140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222200
14563	NC_020566	ATA	2	6	612245	612250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222200
14564	NC_020566	CAG	2	6	612260	612265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222200
14565	NC_020566	AGC	2	6	612321	612326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222200
14566	NC_020566	TGT	2	6	612339	612344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222200
14567	NC_020566	TGGT	2	8	612360	612367	0 %	50 %	50 %	0 %	470222200
14568	NC_020566	CAA	2	6	612371	612376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222200
14569	NC_020566	TCA	2	6	612378	612383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222200
14570	NC_020566	CAT	2	6	612428	612433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222200
14571	NC_020566	GCAATT	2	12	612460	612471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470222200
14572	NC_020566	ATG	2	6	612472	612477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222200
14573	NC_020566	TGA	2	6	612506	612511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222200
14574	NC_020566	TAT	2	6	612549	612554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14575	NC_020566	CAA	2	6	612557	612562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222200
14576	NC_020566	TAG	2	6	612617	612622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222200
14577	NC_020566	GT	3	6	612623	612628	0 %	50 %	50 %	0 %	470222200
14578	NC_020566	GAA	2	6	612650	612655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222200
14579	NC_020566	TTA	2	6	612710	612715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14580	NC_020566	ATT	2	6	612735	612740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14581	NC_020566	AACA	2	8	612748	612755	75 %	0 %	0 %	25 %	470222200
14582	NC_020566	TAT	2	6	612792	612797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222200
14583	NC_020566	TCAT	2	8	612811	612818	25 %	50 %	0 %	25 %	470222200
14584	NC_020566	GTT	2	6	612828	612833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222200
14585	NC_020566	GCA	2	6	612853	612858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222200
14586	NC_020566	ATTGC	2	10	612877	612886	20 %	40 %	20 %	20 %	470222200
14587	NC_020566	ATC	2	6	612898	612903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222200
14588	NC_020566	ATG	2	6	612953	612958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222200
14589	NC_020566	TGA	2	6	612999	613004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222200
14590	NC_020566	GAA	2	6	613012	613017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222200
14591	NC_020566	GAAAAA	2	12	613021	613032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470222200
14592	NC_020566	ATA	2	6	613038	613043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222200
14593	NC_020566	CTT	2	6	613063	613068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_020566	T	6	6	613091	613096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_020566	TAT	2	6	613098	613103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_020566	TA	4	8	613136	613143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_020566	AATT	2	8	613218	613225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_020566	AAT	2	6	613243	613248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020566	ATTG	2	8	613296	613303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_020566	TAA	2	6	613317	613322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_020566	T	6	6	613330	613335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_020566	ATG	2	6	613393	613398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_020566	TA	3	6	613471	613476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020566	GAA	2	6	613497	613502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020566	CCAT	2	8	613514	613521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14606	NC_020566	GATA	2	8	613546	613553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020566	AGA	2	6	613583	613588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_020566	CCA	2	6	613741	613746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222201
14609	NC_020566	TTA	2	6	613769	613774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222201
14610	NC_020566	ATA	2	6	613810	613815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222201
14611	NC_020566	ATCA	2	8	613977	613984	50 %	25 %	0 %	25 %	470222201
14612	NC_020566	ACC	2	6	613989	613994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222201
14613	NC_020566	TGC	2	6	614025	614030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222201
14614	NC_020566	CTG	2	6	614053	614058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222201
14615	NC_020566	AT	3	6	614073	614078	50 %	50 %	0 %	0 %	470222201
14616	NC_020566	T	6	6	614078	614083	0 %	100 %	0 %	0 %	470222201
14617	NC_020566	ATT	2	6	614118	614123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222201
14618	NC_020566	TTA	2	6	614143	614148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222201
14619	NC_020566	TTA	2	6	614162	614167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222201
14620	NC_020566	T	7	7	614277	614283	0 %	100 %	0 %	0 %	470222201
14621	NC_020566	TCT	2	6	614302	614307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222201
14622	NC_020566	AGC	2	6	614346	614351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222201
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14624	NC_020566	TTC	2	6	614391	614396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222201
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14994	NC_020566	ATT	2	6	629744	629749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222214
14995	NC_020566	TGG	2	6	629890	629895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222214
14996	NC_020566	TAT	2	6	629980	629985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222214
14997	NC_020566	CTG	2	6	629991	629996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222214
14998	NC_020566	CAT	2	6	630010	630015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222214
14999	NC_020566	T	6	6	630097	630102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15000	NC_020566	TTATTT	2	12	630109	630120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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