MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020566	TCA	2	6	547665	547670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222158
13003	NC_020566	AGA	2	6	547722	547727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222158
13004	NC_020566	A	6	6	547750	547755	100 %	0 %	0 %	0 %	470222158
13005	NC_020566	GGT	2	6	547873	547878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222158
13006	NC_020566	CAT	2	6	547897	547902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222158
13007	NC_020566	ATT	2	6	547952	547957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222158
13008	NC_020566	A	6	6	547991	547996	100 %	0 %	0 %	0 %	470222158
13009	NC_020566	ATT	2	6	548035	548040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222158
13010	NC_020566	AAG	2	6	548042	548047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222158
13011	NC_020566	AATT	2	8	548168	548175	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
13012	NC_020566	GC	3	6	548181	548186	0 %	0 %	50 %	50 %	470222158
13013	NC_020566	CTA	2	6	548195	548200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222158
13014	NC_020566	AT	3	6	548220	548225	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
13015	NC_020566	ATGA	2	8	548266	548273	50 %	25 %	25 %	0 %	470222158
13016	NC_020566	AATA	2	8	548329	548336	75 %	25 %	0 %	0 %	470222158
13017	NC_020566	ACA	2	6	548350	548355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222158
13018	NC_020566	ATT	2	6	548445	548450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222158
13019	NC_020566	AGA	2	6	548562	548567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222158
13020	NC_020566	CAA	2	6	548603	548608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_020566	ATT	2	6	548623	548628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_020566	AT	3	6	548647	548652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020566	GTAC	2	8	548678	548685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_020566	TAA	2	6	548716	548721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_020566	A	6	6	548738	548743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020566	GAA	2	6	548810	548815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_020566	TTTA	2	8	548925	548932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020566	A	6	6	548934	548939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020566	GAA	2	6	548942	548947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020566	ATT	2	6	548959	548964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_020566	AAATA	2	10	548965	548974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020566	TTG	2	6	549022	549027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222159
13033	NC_020566	ATT	2	6	549051	549056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222159
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13035	NC_020566	AAG	2	6	549088	549093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222159
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13038	NC_020566	A	6	6	549142	549147	100 %	0 %	0 %	0 %	470222159
13039	NC_020566	T	6	6	549182	549187	0 %	100 %	0 %	0 %	470222159
13040	NC_020566	CAC	2	6	549196	549201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222159
13041	NC_020566	AAAAAG	2	12	549268	549279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470222159
13042	NC_020566	AGA	2	6	549314	549319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222159
13043	NC_020566	TTA	2	6	549376	549381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222159
13044	NC_020566	CGT	2	6	549390	549395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222159
13045	NC_020566	TAA	2	6	549533	549538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222159
13046	NC_020566	GCA	2	6	549693	549698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222159
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13048	NC_020566	ATG	2	6	549733	549738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222159
13049	NC_020566	AGA	2	6	549835	549840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222160
13050	NC_020566	ATT	2	6	549899	549904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222160
13051	NC_020566	TGAG	2	8	550074	550081	25 %	25 %	50 %	0 %	470222160
13052	NC_020566	ATC	2	6	550117	550122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222160
13053	NC_020566	GA	3	6	550135	550140	50 %	0 %	50 %	0 %	470222160
13054	NC_020566	GAT	2	6	550178	550183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222160
13055	NC_020566	TCT	2	6	550220	550225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222160
13056	NC_020566	A	6	6	550245	550250	100 %	0 %	0 %	0 %	470222160
13057	NC_020566	CAT	2	6	550262	550267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222160
13058	NC_020566	TAGA	2	8	550332	550339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020566	ATTA	2	8	550452	550459	50 %	50 %	0 %	0 %	470222161
13060	NC_020566	AGA	2	6	550500	550505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222161
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13062	NC_020566	AGC	2	6	550568	550573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222161
13063	NC_020566	ATT	2	6	550619	550624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222161
13064	NC_020566	ATT	2	6	550724	550729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222161
13065	NC_020566	TG	3	6	550808	550813	0 %	50 %	50 %	0 %	470222161
13066	NC_020566	GA	3	6	550827	550832	50 %	0 %	50 %	0 %	470222161
13067	NC_020566	ATAAA	2	10	550895	550904	80 %	20 %	0 %	0 %	470222161
13068	NC_020566	TGAAT	2	10	550943	550952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020566	TTAC	2	8	550962	550969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_020566	GTATA	2	10	551000	551009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_020566	TAT	2	6	551014	551019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_020566	ATT	2	6	551035	551040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_020566	AAG	2	6	551102	551107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_020566	CAA	2	6	551114	551119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_020566	CA	3	6	551158	551163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_020566	AAAT	2	8	551179	551186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_020566	ATA	2	6	551196	551201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_020566	ATA	2	6	551207	551212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_020566	A	6	6	551246	551251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020566	A	6	6	551286	551291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020566	CGA	2	6	551301	551306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_020566	AAG	2	6	551307	551312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_020566	TTC	2	6	551354	551359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_020566	TAT	2	6	551409	551414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_020566	GAA	2	6	551441	551446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222162
13086	NC_020566	CATA	2	8	551474	551481	50 %	25 %	0 %	25 %	470222162
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13090	NC_020566	A	7	7	551621	551627	100 %	0 %	0 %	0 %	470222162
13091	NC_020566	TGCAGG	2	12	551722	551733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470222162
13092	NC_020566	AGA	2	6	551758	551763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222162
13093	NC_020566	AAAGA	2	10	551795	551804	80 %	0 %	20 %	0 %	470222162
13094	NC_020566	TAG	2	6	551919	551924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222162
13095	NC_020566	TTAA	2	8	551980	551987	50 %	50 %	0 %	0 %	470222162
13096	NC_020566	TTA	2	6	551997	552002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_020566	A	6	6	552018	552023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_020566	T	6	6	552033	552038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_020566	AGG	2	6	552150	552155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020566	A	6	6	552170	552175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_020566	GTT	2	6	552185	552190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020566	CAC	2	6	552225	552230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_020566	CAT	2	6	552265	552270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_020566	ATT	2	6	552320	552325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_020566	CATTTA	2	12	552357	552368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13106	NC_020566	A	6	6	552401	552406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_020566	CAAA	2	8	552438	552445	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_020566	GCT	2	6	552515	552520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_020566	GAA	2	6	552524	552529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_020566	TAT	2	6	552541	552546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020566	GTA	2	6	552561	552566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_020566	AAT	2	6	552582	552587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_020566	ATA	2	6	552642	552647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020566	ATG	2	6	552648	552653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_020566	TGAT	2	8	552686	552693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020566	TTC	2	6	552710	552715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_020566	TGT	2	6	552716	552721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020566	GGA	2	6	552754	552759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_020566	AGG	2	6	552780	552785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_020566	A	6	6	552800	552805	100 %	0 %	0 %	0 %	470222163
13121	NC_020566	AAG	2	6	552819	552824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222163
13122	NC_020566	GAA	2	6	552863	552868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222163
13123	NC_020566	AATTA	2	10	552871	552880	60 %	40 %	0 %	0 %	470222163
13124	NC_020566	CAA	2	6	552962	552967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222163
13125	NC_020566	GTG	2	6	552972	552977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222163
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13127	NC_020566	GCA	2	6	553058	553063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222163
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13251	NC_020566	CGA	2	6	558330	558335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222166
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13357	NC_020566	TA	3	6	562956	562961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_020566	ATT	2	6	563002	563007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13359	NC_020566	GGA	2	6	563075	563080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_020566	ATT	2	6	563084	563089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_020566	AACA	2	8	563115	563122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13362	NC_020566	AAAG	2	8	563162	563169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_020566	ATT	2	6	563187	563192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13364	NC_020566	ATCA	2	8	563238	563245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13365	NC_020566	T	6	6	563264	563269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13366	NC_020566	TAG	2	6	563323	563328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_020566	TACT	2	8	563359	563366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13368	NC_020566	TTTA	2	8	563371	563378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13369	NC_020566	ACC	2	6	563391	563396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13498	NC_020566	AGA	2	6	568086	568091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_020566	AAT	2	6	568094	568099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_020566	TGA	2	6	568100	568105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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