MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020566	GTT	2	6	482007	482012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_020566	TAA	2	6	482024	482029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_020566	TAAT	2	8	482036	482043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020566	A	6	6	482057	482062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_020566	A	6	6	482105	482110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020566	ATT	2	6	482131	482136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_020566	CAT	2	6	482159	482164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_020566	GGC	2	6	482206	482211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_020566	GCTT	2	8	482249	482256	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_020566	GCG	2	6	482268	482273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_020566	ACCT	2	8	482297	482304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11512	NC_020566	ATA	2	6	482346	482351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_020566	GCA	2	6	482525	482530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_020566	CGC	2	6	482572	482577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_020566	GTGA	2	8	482578	482585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020566	TTA	2	6	482613	482618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020566	GAA	2	6	482621	482626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020566	GTAA	2	8	482634	482641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020566	CAG	2	6	482693	482698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_020566	ATT	2	6	482734	482739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020566	GC	3	6	482749	482754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11522	NC_020566	T	6	6	482763	482768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_020566	AGA	2	6	482834	482839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020566	GGA	2	6	482884	482889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_020566	TGC	2	6	483029	483034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_020566	GAA	2	6	483148	483153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020566	GGT	2	6	483223	483228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020566	GTC	2	6	483237	483242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_020566	TCGTG	2	10	483246	483255	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11530	NC_020566	CAT	2	6	483305	483310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_020566	GGA	2	6	483349	483354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_020566	ATC	2	6	483373	483378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_020566	AC	3	6	483400	483405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_020566	GTT	2	6	483465	483470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020566	AC	3	6	483569	483574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11536	NC_020566	CAC	2	6	483584	483589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_020566	CCT	2	6	483711	483716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_020566	AT	3	6	483725	483730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020566	TCT	2	6	483739	483744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_020566	TGTT	2	8	483788	483795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020566	GGT	2	6	483858	483863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_020566	TTAAT	2	10	483886	483895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020566	AGG	2	6	483944	483949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020566	CCA	2	6	483974	483979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_020566	TAAG	2	8	484003	484010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020566	AAT	2	6	484079	484084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_020566	TAA	2	6	484115	484120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020566	TGG	2	6	484179	484184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020566	TTA	2	6	484199	484204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020566	ACG	2	6	484256	484261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_020566	GTAA	2	8	484279	484286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_020566	GGA	2	6	484405	484410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020566	AGAA	2	8	484413	484420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020566	TAG	2	6	484434	484439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020566	GCGA	2	8	484442	484449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11556	NC_020566	CAA	2	6	484468	484473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_020566	GCTT	2	8	484474	484481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11558	NC_020566	GAC	2	6	484518	484523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_020566	ATC	2	6	484533	484538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_020566	TAA	2	6	484561	484566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_020566	TGT	2	6	484582	484587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_020566	CT	3	6	484588	484593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_020566	ACG	2	6	484610	484615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_020566	GGA	2	6	484643	484648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020566	CT	3	6	484669	484674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_020566	AGT	2	6	484764	484769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_020566	GGA	2	6	484960	484965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020566	TC	3	6	485046	485051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_020566	TGA	2	6	485079	485084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11572	NC_020566	AT	3	6	485245	485250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11574	NC_020566	CAT	2	6	485310	485315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_020566	ACC	2	6	485630	485635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_020566	G	6	6	485655	485660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_020566	GATTG	2	10	485686	485695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11581	NC_020566	CGG	2	6	486119	486124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_020566	GA	3	6	486217	486222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020566	TAGG	2	8	486335	486342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_020566	TGG	2	6	486381	486386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_020566	TAC	2	6	486389	486394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_020566	GTG	2	6	486432	486437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020566	CCT	2	6	486476	486481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_020566	TCAT	2	8	486528	486535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11593	NC_020566	GAG	2	6	486856	486861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020566	TG	3	6	486942	486947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020566	C	6	6	486983	486988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11597	NC_020566	ATCG	2	8	487092	487099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_020566	AAAT	2	8	487112	487119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020566	TACT	2	8	487143	487150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_020566	AGG	2	6	487201	487206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_020566	A	6	6	487300	487305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_020566	T	8	8	487342	487349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020566	AAAG	2	8	487381	487388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020566	TAG	2	6	487449	487454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020566	AAGC	2	8	487492	487499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11606	NC_020566	A	6	6	487576	487581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020566	T	7	7	487618	487624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020566	TAG	2	6	487725	487730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_020566	AAGC	2	8	487768	487775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11610	NC_020566	AATG	2	8	487858	487865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020566	TAA	2	6	487899	487904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020566	ATT	2	6	487917	487922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_020566	TAT	2	6	487963	487968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020566	CAG	2	6	487979	487984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_020566	ATC	2	6	488006	488011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_020566	CTG	2	6	488015	488020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_020566	ATTA	2	8	488070	488077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020566	AAG	2	6	488124	488129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020566	TA	3	6	488136	488141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_020566	TAAA	2	8	488179	488186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020566	TAAA	2	8	488216	488223	75 %	25 %	0 %	0 %	470222120
11622	NC_020566	AAG	3	9	488240	488248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222120
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11627	NC_020566	CAC	2	6	488436	488441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222120
11628	NC_020566	A	6	6	488479	488484	100 %	0 %	0 %	0 %	470222120
11629	NC_020566	CAA	2	6	488545	488550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222120
11630	NC_020566	TAA	2	6	488598	488603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222120
11631	NC_020566	AAT	2	6	488623	488628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222120
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11633	NC_020566	GC	3	6	488750	488755	0 %	0 %	50 %	50 %	470222120
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