MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020566	AAT	2	6	420578	420583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222073
10002	NC_020566	AAG	2	6	420622	420627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_020566	CTT	2	6	420658	420663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_020566	GAT	2	6	420675	420680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020566	CTAT	2	8	420748	420755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10006	NC_020566	TTTA	2	8	420782	420789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020566	TAA	2	6	420818	420823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_020566	ATT	2	6	420834	420839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020566	TAA	2	6	420878	420883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020566	TAA	2	6	420919	420924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020566	GCA	2	6	420955	420960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222074
10012	NC_020566	TGT	2	6	421263	421268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222074
10013	NC_020566	AAG	2	6	421271	421276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222074
10014	NC_020566	TGG	2	6	421308	421313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222074
10015	NC_020566	TTA	2	6	421338	421343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222074
10016	NC_020566	TA	3	6	421348	421353	50 %	50 %	0 %	0 %	470222074
10017	NC_020566	AG	3	6	421376	421381	50 %	0 %	50 %	0 %	470222074
10018	NC_020566	TACG	2	8	421401	421408	25 %	25 %	25 %	25 %	470222074
10019	NC_020566	AGA	2	6	421431	421436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222074
10020	NC_020566	GGC	2	6	421546	421551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470222074
10021	NC_020566	TAT	2	6	421552	421557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222074
10022	NC_020566	TAA	2	6	421569	421574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222074
10023	NC_020566	A	6	6	421573	421578	100 %	0 %	0 %	0 %	470222074
10024	NC_020566	ACAA	2	8	421581	421588	75 %	0 %	0 %	25 %	470222074
10025	NC_020566	A	6	6	421625	421630	100 %	0 %	0 %	0 %	470222074
10026	NC_020566	ATA	2	6	421666	421671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_020566	GAG	2	6	421691	421696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_020566	CTT	2	6	421719	421724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_020566	T	6	6	421723	421728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020566	AAT	2	6	421762	421767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_020566	A	6	6	421883	421888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020566	A	6	6	421904	421909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020566	TAAT	2	8	421910	421917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020566	TAAC	2	8	421934	421941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10035	NC_020566	TA	3	6	421999	422004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020566	TAG	2	6	422009	422014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_020566	AT	3	6	422052	422057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020566	TTA	2	6	422138	422143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222075
10039	NC_020566	ACT	2	6	422144	422149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222075
10040	NC_020566	AAAAG	2	10	422185	422194	80 %	0 %	20 %	0 %	470222075
10041	NC_020566	AG	4	8	422197	422204	50 %	0 %	50 %	0 %	470222075
10042	NC_020566	ACA	2	6	422206	422211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222075
10043	NC_020566	TAC	2	6	422240	422245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222075
10044	NC_020566	TCA	2	6	422246	422251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222075
10045	NC_020566	ATT	2	6	422344	422349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222075
10046	NC_020566	TTA	2	6	422351	422356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222075
10047	NC_020566	AGATAA	2	12	422362	422373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470222075
10048	NC_020566	A	6	6	422378	422383	100 %	0 %	0 %	0 %	470222075
10049	NC_020566	AATT	2	8	422418	422425	50 %	50 %	0 %	0 %	470222075
10050	NC_020566	TGG	2	6	422452	422457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222075
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10052	NC_020566	ATTT	2	8	422499	422506	25 %	75 %	0 %	0 %	470222075
10053	NC_020566	TAA	2	6	422509	422514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222075
10054	NC_020566	TAAT	2	8	422556	422563	50 %	50 %	0 %	0 %	470222075
10055	NC_020566	AGA	2	6	422566	422571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222075
10056	NC_020566	TA	3	6	422631	422636	50 %	50 %	0 %	0 %	470222075
10057	NC_020566	CAAT	2	8	422798	422805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_020566	TAA	2	6	422816	422821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_020566	AGC	2	6	422828	422833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_020566	AATA	2	8	422851	422858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020566	TCC	2	6	422865	422870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_020566	ATTA	2	8	422984	422991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020566	TTC	2	6	422993	422998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_020566	TTTAAT	2	12	423010	423021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020566	GTCT	2	8	423041	423048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_020566	TAA	2	6	423061	423066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020566	TAT	2	6	423072	423077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_020566	TAA	2	6	423088	423093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020566	AT	3	6	423104	423109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020566	ATATGA	2	12	423122	423133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470222076
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10072	NC_020566	AATC	2	8	423202	423209	50 %	25 %	0 %	25 %	470222076
10073	NC_020566	A	6	6	423233	423238	100 %	0 %	0 %	0 %	470222076
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10075	NC_020566	TTA	2	6	423327	423332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222076
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10078	NC_020566	A	6	6	423416	423421	100 %	0 %	0 %	0 %	470222076
10079	NC_020566	TAG	2	6	423455	423460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222076
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10081	NC_020566	GTG	2	6	423488	423493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222076
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10083	NC_020566	A	7	7	423553	423559	100 %	0 %	0 %	0 %	470222076
10084	NC_020566	TGA	2	6	423585	423590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222076
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10089	NC_020566	AT	3	6	423835	423840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_020566	AAG	2	6	423854	423859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_020566	TAA	2	6	423865	423870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020566	TAA	3	9	423901	423909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020566	TTA	2	6	423933	423938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020566	GCT	2	6	423940	423945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_020566	T	6	6	423945	423950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020566	A	7	7	424012	424018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_020566	TAA	2	6	424076	424081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020566	TTTA	2	8	424091	424098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020566	TAA	2	6	424136	424141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020566	AT	3	6	424179	424184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020566	AAAT	2	8	424197	424204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020566	CATTAG	2	12	424233	424244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470222077
10103	NC_020566	GT	3	6	424260	424265	0 %	50 %	50 %	0 %	470222077
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10105	NC_020566	TGA	2	6	424306	424311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222077
10106	NC_020566	GAA	2	6	424358	424363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222077
10107	NC_020566	CAA	2	6	424374	424379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222077
10108	NC_020566	AAAT	2	8	424477	424484	75 %	25 %	0 %	0 %	470222077
10109	NC_020566	A	6	6	424491	424496	100 %	0 %	0 %	0 %	470222077
10110	NC_020566	AT	3	6	424550	424555	50 %	50 %	0 %	0 %	470222077
10111	NC_020566	GTAA	2	8	424604	424611	50 %	25 %	25 %	0 %	470222077
10112	NC_020566	A	6	6	424628	424633	100 %	0 %	0 %	0 %	470222077
10113	NC_020566	GTT	2	6	424666	424671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222077
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10115	NC_020566	TTA	2	6	424782	424787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222077
10116	NC_020566	TGAATT	2	12	424890	424901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470222077
10117	NC_020566	ATA	2	6	424918	424923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_020566	AAG	2	6	424928	424933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_020566	TA	3	6	424972	424977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_020566	TGT	2	6	425001	425006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020566	GTT	2	6	425010	425015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020566	CAT	2	6	425045	425050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_020566	GTA	2	6	425056	425061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020566	AAC	2	6	425078	425083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_020566	AAT	2	6	425091	425096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_020566	AT	3	6	425123	425128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_020566	AAT	2	6	425144	425149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020566	TAA	2	6	425200	425205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10499	NC_020566	ATA	2	6	440348	440353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222092
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