MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_020564	TAATT	2	10	2001345	2001354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48002	NC_020564	TCT	2	6	2001370	2001375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48003	NC_020564	AAT	2	6	2001384	2001389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48004	NC_020564	AAATA	2	10	2001434	2001443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48005	NC_020564	ATTG	2	8	2001559	2001566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48006	NC_020564	TGT	2	6	2001586	2001591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48007	NC_020564	ACTT	2	8	2001603	2001610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48008	NC_020564	CTA	2	6	2001624	2001629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48009	NC_020564	TTC	2	6	2001735	2001740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219363
48010	NC_020564	TTC	2	6	2001768	2001773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219363
48011	NC_020564	CCA	2	6	2001820	2001825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219363
48012	NC_020564	AT	3	6	2001853	2001858	50 %	50 %	0 %	0 %	470219363
48013	NC_020564	TAT	2	6	2001875	2001880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219363
48014	NC_020564	TAA	2	6	2001987	2001992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219363
48015	NC_020564	TTGTT	2	10	2002048	2002057	0 %	80 %	20 %	0 %	470219363
48016	NC_020564	TCA	2	6	2002087	2002092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219363
48017	NC_020564	GCAT	2	8	2002135	2002142	25 %	25 %	25 %	25 %	470219363
48018	NC_020564	CCA	2	6	2002222	2002227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219363
48019	NC_020564	T	6	6	2002241	2002246	0 %	100 %	0 %	0 %	470219363
48020	NC_020564	CTT	2	6	2002292	2002297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219363
48021	NC_020564	TCC	2	6	2002378	2002383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48022	NC_020564	A	6	6	2002388	2002393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48023	NC_020564	TTC	2	6	2002431	2002436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48024	NC_020564	TA	3	6	2002437	2002442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48025	NC_020564	ATA	2	6	2002487	2002492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48026	NC_020564	TCA	2	6	2002543	2002548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48027	NC_020564	GTC	2	6	2002629	2002634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48028	NC_020564	CAATAA	2	12	2002643	2002654	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48029	NC_020564	TATT	2	8	2002684	2002691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48030	NC_020564	ATT	2	6	2002701	2002706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48031	NC_020564	CT	3	6	2002719	2002724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48032	NC_020564	AAT	2	6	2002725	2002730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48033	NC_020564	ATCA	2	8	2002770	2002777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48034	NC_020564	T	6	6	2002781	2002786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48035	NC_020564	ATTA	2	8	2003006	2003013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48036	NC_020564	GTT	2	6	2003041	2003046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48037	NC_020564	T	7	7	2003045	2003051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48038	NC_020564	CTT	2	6	2003053	2003058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48039	NC_020564	CAA	2	6	2003059	2003064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48040	NC_020564	TCC	2	6	2003188	2003193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48041	NC_020564	ATA	2	6	2003201	2003206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48042	NC_020564	TAT	2	6	2003214	2003219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48043	NC_020564	TTC	2	6	2003290	2003295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48044	NC_020564	AAT	2	6	2003304	2003309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48045	NC_020564	TA	3	6	2003415	2003420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48046	NC_020564	TCT	2	6	2003429	2003434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48047	NC_020564	ATT	2	6	2003455	2003460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48048	NC_020564	T	6	6	2003518	2003523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48049	NC_020564	TCT	2	6	2003538	2003543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48050	NC_020564	TAT	2	6	2003573	2003578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48051	NC_020564	TAA	2	6	2003609	2003614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48052	NC_020564	T	6	6	2003694	2003699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48053	NC_020564	AAC	2	6	2003721	2003726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48054	NC_020564	ATC	2	6	2003792	2003797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48055	NC_020564	CGA	2	6	2003828	2003833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48056	NC_020564	T	8	8	2003862	2003869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48057	NC_020564	TAA	2	6	2003889	2003894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48058	NC_020564	TGATT	2	10	2003951	2003960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48059	NC_020564	CAA	2	6	2003964	2003969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48060	NC_020564	AAC	2	6	2004060	2004065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48061	NC_020564	TTC	2	6	2004109	2004114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219364
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48063	NC_020564	TAT	2	6	2004174	2004179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219364
48064	NC_020564	ATC	2	6	2004226	2004231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219364
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48067	NC_020564	ACGT	2	8	2004302	2004309	25 %	25 %	25 %	25 %	470219364
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48082	NC_020564	TCT	2	6	2004974	2004979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219364
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48088	NC_020564	GTT	2	6	2005180	2005185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219364
48089	NC_020564	TAA	2	6	2005194	2005199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219364
48090	NC_020564	CCT	2	6	2005253	2005258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48093	NC_020564	ATTT	2	8	2005347	2005354	25 %	75 %	0 %	0 %	470219365
48094	NC_020564	T	6	6	2005352	2005357	0 %	100 %	0 %	0 %	470219365
48095	NC_020564	TTAC	2	8	2005408	2005415	25 %	50 %	0 %	25 %	470219365
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48104	NC_020564	TA	3	6	2005826	2005831	50 %	50 %	0 %	0 %	470219365
48105	NC_020564	CTA	2	6	2005844	2005849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219365
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48109	NC_020564	TCTTTT	2	12	2006036	2006047	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470219366
48110	NC_020564	TCA	2	6	2006048	2006053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219366
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48118	NC_020564	CTCA	2	8	2006437	2006444	25 %	25 %	0 %	50 %	470219366
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48494	NC_020564	CTTT	2	8	2021795	2021802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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48497	NC_020564	TTA	2	6	2021871	2021876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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