MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020564	GTTT	2	8	164405	164412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020564	CAT	2	6	164425	164430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_020564	TCA	2	6	164511	164516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_020564	TGTA	2	8	164519	164526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020564	ATG	2	6	164538	164543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020564	TA	4	8	164634	164641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020564	TTTA	2	8	164644	164651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020564	AT	3	6	164687	164692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020564	A	7	7	164718	164724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020564	T	6	6	164766	164771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020564	AGG	2	6	164785	164790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020564	TTA	2	6	164793	164798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020564	ATT	2	6	164804	164809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218066
4014	NC_020564	TTA	2	6	164811	164816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218066
4015	NC_020564	AGA	2	6	164849	164854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218066
4016	NC_020564	GCA	2	6	164868	164873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218066
4017	NC_020564	TTATT	2	10	164939	164948	20 %	80 %	0 %	0 %	470218066
4018	NC_020564	AAG	2	6	165019	165024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218066
4019	NC_020564	GAA	2	6	165162	165167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218066
4020	NC_020564	ATGT	2	8	165196	165203	25 %	50 %	25 %	0 %	470218066
4021	NC_020564	TGA	2	6	165242	165247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218066
4022	NC_020564	CG	4	8	165261	165268	0 %	0 %	50 %	50 %	470218066
4023	NC_020564	TAA	2	6	165309	165314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218066
4024	NC_020564	ACA	2	6	165316	165321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_020564	TGA	2	6	165325	165330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020564	AT	3	6	165332	165337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020564	TA	3	6	165339	165344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020564	AGT	2	6	165401	165406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020564	GAA	2	6	165413	165418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020564	TAG	2	6	165470	165475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020564	CGT	2	6	165493	165498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_020564	ATC	2	6	165545	165550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020564	TAG	2	6	165627	165632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020564	CAA	2	6	165665	165670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218067
4035	NC_020564	ACA	2	6	165673	165678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218067
4036	NC_020564	CATC	2	8	165806	165813	25 %	25 %	0 %	50 %	470218067
4037	NC_020564	ATT	2	6	165827	165832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218067
4038	NC_020564	ACA	2	6	165847	165852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218067
4039	NC_020564	CAT	2	6	165884	165889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218067
4040	NC_020564	TGC	2	6	165894	165899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218067
4041	NC_020564	ACA	2	6	165918	165923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218067
4042	NC_020564	GGATT	2	10	165927	165936	20 %	40 %	40 %	0 %	470218067
4043	NC_020564	TGA	2	6	165952	165957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218067
4044	NC_020564	AGA	2	6	165991	165996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218067
4045	NC_020564	AAC	2	6	166038	166043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218067
4046	NC_020564	GATG	2	8	166090	166097	25 %	25 %	50 %	0 %	470218067
4047	NC_020564	TAT	2	6	166180	166185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218067
4048	NC_020564	TGA	2	6	166204	166209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218067
4049	NC_020564	ATT	2	6	166259	166264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218067
4050	NC_020564	ATC	3	9	166359	166367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218067
4051	NC_020564	ATT	2	6	166383	166388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218067
4052	NC_020564	GAGT	2	8	166395	166402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020564	TCA	2	6	166429	166434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218068
4054	NC_020564	TGA	3	9	166555	166563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218068
4055	NC_020564	A	6	6	166566	166571	100 %	0 %	0 %	0 %	470218068
4056	NC_020564	TTA	2	6	166572	166577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218068
4057	NC_020564	ATC	2	6	166588	166593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218068
4058	NC_020564	AAT	2	6	166623	166628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218068
4059	NC_020564	CAT	2	6	166746	166751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218068
4060	NC_020564	TAA	2	6	166799	166804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218068
4061	NC_020564	GAT	2	6	166809	166814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218068
4062	NC_020564	CAG	2	6	166924	166929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218068
4063	NC_020564	TGA	2	6	167036	167041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218068
4064	NC_020564	TG	3	6	167064	167069	0 %	50 %	50 %	0 %	470218068
4065	NC_020564	ATGA	2	8	167154	167161	50 %	25 %	25 %	0 %	470218068
4066	NC_020564	GCAA	2	8	167164	167171	50 %	0 %	25 %	25 %	470218068
4067	NC_020564	CAT	2	6	167190	167195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218068
4068	NC_020564	ACA	2	6	167300	167305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218068
4069	NC_020564	ATG	2	6	167329	167334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218068
4070	NC_020564	TTG	2	6	167338	167343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218068
4071	NC_020564	AGG	2	6	167359	167364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218068
4072	NC_020564	TAT	2	6	167410	167415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020564	TAT	2	6	167422	167427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020564	ATT	3	9	167453	167461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218069
4075	NC_020564	TGT	2	6	167587	167592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218069
4076	NC_020564	TTG	2	6	167597	167602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218069
4077	NC_020564	CTT	2	6	167620	167625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218069
4078	NC_020564	GGAA	2	8	167630	167637	50 %	0 %	50 %	0 %	470218069
4079	NC_020564	ACA	2	6	167649	167654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218069
4080	NC_020564	TGT	2	6	167713	167718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218069
4081	NC_020564	TTGGTA	2	12	167727	167738	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470218069
4082	NC_020564	GCGATT	2	12	167747	167758	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218069
4083	NC_020564	GCT	2	6	167768	167773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218069
4084	NC_020564	T	6	6	167773	167778	0 %	100 %	0 %	0 %	470218069
4085	NC_020564	AAATTT	2	12	167845	167856	50 %	50 %	0 %	0 %	470218069
4086	NC_020564	GGT	2	6	167862	167867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218069
4087	NC_020564	AT	3	6	167880	167885	50 %	50 %	0 %	0 %	470218069
4088	NC_020564	T	6	6	167995	168000	0 %	100 %	0 %	0 %	470218069
4089	NC_020564	AGA	2	6	168031	168036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218069
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4091	NC_020564	ATT	2	6	168064	168069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218069
4092	NC_020564	TAT	2	6	168076	168081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218069
4093	NC_020564	AGA	2	6	168119	168124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218069
4094	NC_020564	GA	3	6	168138	168143	50 %	0 %	50 %	0 %	470218070
4095	NC_020564	TGA	3	9	168144	168152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218070
4096	NC_020564	TAG	2	6	168192	168197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218070
4097	NC_020564	TGA	2	6	168202	168207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218070
4098	NC_020564	TAT	2	6	168215	168220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218070
4099	NC_020564	CAA	2	6	168236	168241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218070
4100	NC_020564	GGC	2	6	168268	168273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218070
4101	NC_020564	A	6	6	168280	168285	100 %	0 %	0 %	0 %	470218070
4102	NC_020564	ACA	2	6	168323	168328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218070
4103	NC_020564	AAT	2	6	168395	168400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218070
4104	NC_020564	ACA	2	6	168406	168411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218070
4105	NC_020564	AC	3	6	168499	168504	50 %	0 %	0 %	50 %	470218070
4106	NC_020564	GTAA	2	8	168548	168555	50 %	25 %	25 %	0 %	470218070
4107	NC_020564	AAG	2	6	168561	168566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218070
4108	NC_020564	ATT	2	6	168570	168575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218070
4109	NC_020564	ATC	2	6	168598	168603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218070
4110	NC_020564	A	6	6	168660	168665	100 %	0 %	0 %	0 %	470218070
4111	NC_020564	T	6	6	168670	168675	0 %	100 %	0 %	0 %	470218070
4112	NC_020564	ATC	2	6	168740	168745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218070
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4116	NC_020564	AG	3	6	168932	168937	50 %	0 %	50 %	0 %	470218070
4117	NC_020564	TAACT	2	10	168964	168973	40 %	40 %	0 %	20 %	470218070
4118	NC_020564	GAA	2	6	169000	169005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218070
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4120	NC_020564	GTC	2	6	169046	169051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218070
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4122	NC_020564	AC	3	6	169071	169076	50 %	0 %	0 %	50 %	470218070
4123	NC_020564	TTC	3	9	169112	169120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218070
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4125	NC_020564	T	6	6	169195	169200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020564	TTG	2	6	169213	169218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020564	T	6	6	169224	169229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_020564	ATA	2	6	169233	169238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4130	NC_020564	TAA	2	6	169341	169346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4221	NC_020564	TAT	2	6	173011	173016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4241	NC_020564	GT	3	6	173726	173731	0 %	50 %	50 %	0 %	470218073
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4373	NC_020564	ATG	2	6	179341	179346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
4374	NC_020564	TTG	2	6	179366	179371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
4375	NC_020564	GAT	2	6	179389	179394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
4376	NC_020564	GTT	2	6	179395	179400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218073
4377	NC_020564	ATT	2	6	179422	179427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218073
4378	NC_020564	TGA	4	12	179457	179468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218073
4379	NC_020564	CAA	2	6	179518	179523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218073
4380	NC_020564	CAT	2	6	179524	179529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
4381	NC_020564	AT	3	6	179539	179544	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
4382	NC_020564	AGA	2	6	179586	179591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218073
4383	NC_020564	ACT	2	6	179628	179633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218073
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4386	NC_020564	AC	3	6	179909	179914	50 %	0 %	0 %	50 %	470218073
4387	NC_020564	TAA	2	6	179943	179948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218073
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4390	NC_020564	AACATT	2	12	180105	180116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218073
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4392	NC_020564	TAAC	2	8	180155	180162	50 %	25 %	0 %	25 %	470218073
4393	NC_020564	AT	3	6	180186	180191	50 %	50 %	0 %	0 %	470218073
4394	NC_020564	TAAG	2	8	180207	180214	50 %	25 %	25 %	0 %	470218073
4395	NC_020564	GAA	2	6	180271	180276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218074
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4399	NC_020564	AAAG	2	8	180667	180674	75 %	0 %	25 %	0 %	470218074
4400	NC_020564	ATTG	2	8	180684	180691	25 %	50 %	25 %	0 %	470218074
4401	NC_020564	TATGA	2	10	180721	180730	40 %	40 %	20 %	0 %	470218074
4402	NC_020564	ATCA	2	8	180746	180753	50 %	25 %	0 %	25 %	470218074
4403	NC_020564	GTGAA	2	10	180755	180764	40 %	20 %	40 %	0 %	470218074
4404	NC_020564	ATTT	2	8	180774	180781	25 %	75 %	0 %	0 %	470218074
4405	NC_020564	A	6	6	180835	180840	100 %	0 %	0 %	0 %	470218074
4406	NC_020564	AGT	2	6	180862	180867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218074
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4408	NC_020564	ATA	2	6	181053	181058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_020564	ACG	2	6	181066	181071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4410	NC_020564	ATCAT	2	10	181108	181117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4411	NC_020564	TAA	2	6	181124	181129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_020564	ATCA	2	8	181142	181149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4413	NC_020564	GAT	2	6	181162	181167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_020564	TTAAT	2	10	181198	181207	40 %	60 %	0 %	0 %	470218075
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4420	NC_020564	T	6	6	181411	181416	0 %	100 %	0 %	0 %	470218075
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4425	NC_020564	AAT	2	6	181741	181746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4450	NC_020564	ATG	2	6	182738	182743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218077
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4480	NC_020564	TTG	2	6	184285	184290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218078
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4482	NC_020564	TCAT	2	8	184425	184432	25 %	50 %	0 %	25 %	470218078
4483	NC_020564	AAT	3	9	184496	184504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218078
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4485	NC_020564	T	6	6	184522	184527	0 %	100 %	0 %	0 %	470218078
4486	NC_020564	TAA	2	6	184531	184536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218078
4487	NC_020564	TAA	2	6	184550	184555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218078
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4490	NC_020564	AT	3	6	184691	184696	50 %	50 %	0 %	0 %	470218078
4491	NC_020564	CTA	2	6	184753	184758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218078
4492	NC_020564	AGGG	2	8	184759	184766	25 %	0 %	75 %	0 %	470218078
4493	NC_020564	TTAC	2	8	184776	184783	25 %	50 %	0 %	25 %	470218078
4494	NC_020564	ATT	2	6	184820	184825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218078
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4496	NC_020564	TGT	2	6	184860	184865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218078
4497	NC_020564	TG	3	6	184918	184923	0 %	50 %	50 %	0 %	470218078
4498	NC_020564	AATT	2	8	184958	184965	50 %	50 %	0 %	0 %	470218078
4499	NC_020564	ATC	2	6	185007	185012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218078
4500	NC_020564	CCT	2	6	185020	185025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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