MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020564	ATG	2	6	649967	649972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218409
15502	NC_020564	TTG	2	6	649997	650002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_020564	TATT	2	8	650003	650010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_020564	TCT	2	6	650033	650038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_020564	ATA	2	6	650048	650053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_020564	TGG	3	9	650058	650066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020564	TGG	2	6	650073	650078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020564	GATT	2	8	650151	650158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_020564	ATT	2	6	650173	650178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020564	ATC	2	6	650190	650195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_020564	ATA	2	6	650206	650211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_020564	T	6	6	650218	650223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_020564	AAC	2	6	650250	650255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_020564	GTT	2	6	650329	650334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_020564	TGT	2	6	650354	650359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_020564	ATT	2	6	650390	650395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_020564	AT	3	6	650429	650434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_020564	ATCA	2	8	650441	650448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15519	NC_020564	AT	3	6	650478	650483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_020564	ATT	2	6	650502	650507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020564	TAG	2	6	650531	650536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_020564	TAA	2	6	650548	650553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_020564	TGG	2	6	650555	650560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_020564	TTGT	2	8	650568	650575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020564	TACTTG	2	12	650641	650652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15526	NC_020564	AGA	2	6	650678	650683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_020564	G	6	6	650701	650706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_020564	GAT	2	6	650709	650714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218410
15529	NC_020564	TTA	2	6	650743	650748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15530	NC_020564	A	6	6	650781	650786	100 %	0 %	0 %	0 %	470218410
15531	NC_020564	CAC	2	6	650832	650837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218410
15532	NC_020564	ATT	2	6	650839	650844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15533	NC_020564	GGA	2	6	650899	650904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218410
15534	NC_020564	ATT	2	6	651054	651059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15535	NC_020564	ATTT	2	8	651098	651105	25 %	75 %	0 %	0 %	470218410
15536	NC_020564	TGC	2	6	651186	651191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218410
15537	NC_020564	ATT	2	6	651193	651198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15538	NC_020564	TGT	2	6	651201	651206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218410
15539	NC_020564	ATT	2	6	651214	651219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15540	NC_020564	TTA	2	6	651235	651240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15541	NC_020564	TCT	2	6	651347	651352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218410
15542	NC_020564	AGC	2	6	651372	651377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218410
15543	NC_020564	GCA	2	6	651433	651438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218410
15544	NC_020564	TTC	2	6	651487	651492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218410
15545	NC_020564	GCT	2	6	651547	651552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218410
15546	NC_020564	AACA	2	8	651660	651667	75 %	0 %	0 %	25 %	470218410
15547	NC_020564	TTG	2	6	651713	651718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218410
15548	NC_020564	TAT	2	6	651738	651743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15549	NC_020564	TAGTT	2	10	651747	651756	20 %	60 %	20 %	0 %	470218410
15550	NC_020564	CAATAT	2	12	651775	651786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218410
15551	NC_020564	A	6	6	651802	651807	100 %	0 %	0 %	0 %	470218410
15552	NC_020564	TAT	2	6	651831	651836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15553	NC_020564	GGC	2	6	651853	651858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218410
15554	NC_020564	ATT	2	6	651946	651951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218410
15555	NC_020564	TTTA	2	8	651975	651982	25 %	75 %	0 %	0 %	470218410
15556	NC_020564	T	6	6	651989	651994	0 %	100 %	0 %	0 %	470218410
15557	NC_020564	GGA	2	6	652020	652025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218410
15558	NC_020564	TAG	2	6	652076	652081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218410
15559	NC_020564	TGC	2	6	652104	652109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218410
15560	NC_020564	TGT	2	6	652113	652118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218410
15561	NC_020564	TAT	2	6	652253	652258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218411
15562	NC_020564	CTTT	2	8	652289	652296	0 %	75 %	0 %	25 %	470218411
15563	NC_020564	TA	3	6	652327	652332	50 %	50 %	0 %	0 %	470218411
15564	NC_020564	GAT	2	6	652351	652356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218411
15565	NC_020564	TTTA	2	8	652400	652407	25 %	75 %	0 %	0 %	470218411
15566	NC_020564	TAA	2	6	652415	652420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218411
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15568	NC_020564	ATT	2	6	652540	652545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218411
15569	NC_020564	T	6	6	652594	652599	0 %	100 %	0 %	0 %	470218411
15570	NC_020564	AGAAAA	2	12	652620	652631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218411
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15572	NC_020564	GAT	2	6	652688	652693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218411
15573	NC_020564	ACAA	2	8	652694	652701	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15574	NC_020564	ATT	2	6	652716	652721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_020564	ATT	2	6	652731	652736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020564	ATC	2	6	652752	652757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_020564	TTTA	2	8	652760	652767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_020564	ACA	2	6	652785	652790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15579	NC_020564	ACA	2	6	652815	652820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_020564	GT	3	6	652846	652851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020564	TTTC	2	8	652873	652880	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15582	NC_020564	TGG	2	6	652946	652951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_020564	G	6	6	652950	652955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_020564	TGC	2	6	652998	653003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218412
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15588	NC_020564	TTA	2	6	653119	653124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218412
15589	NC_020564	ATTT	2	8	653143	653150	25 %	75 %	0 %	0 %	470218412
15590	NC_020564	TTA	2	6	653182	653187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218412
15591	NC_020564	TTA	2	6	653201	653206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218412
15592	NC_020564	TCGC	2	8	653237	653244	0 %	25 %	25 %	50 %	470218412
15593	NC_020564	GCT	2	6	653245	653250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218412
15594	NC_020564	A	6	6	653277	653282	100 %	0 %	0 %	0 %	470218412
15595	NC_020564	CA	4	8	653290	653297	50 %	0 %	0 %	50 %	470218412
15596	NC_020564	ATT	2	6	653307	653312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218412
15597	NC_020564	A	6	6	653359	653364	100 %	0 %	0 %	0 %	470218412
15598	NC_020564	T	6	6	653510	653515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_020564	TAT	2	6	653517	653522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_020564	TGT	2	6	653530	653535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_020564	GTT	2	6	653549	653554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_020564	ACAA	2	8	653562	653569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15603	NC_020564	ATAAA	2	10	653576	653585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_020564	AAT	2	6	653590	653595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_020564	AT	3	6	653624	653629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_020564	AG	3	6	653729	653734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_020564	TGT	2	6	653778	653783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218413
15608	NC_020564	TATT	2	8	653861	653868	25 %	75 %	0 %	0 %	470218413
15609	NC_020564	AATTT	2	10	653885	653894	40 %	60 %	0 %	0 %	470218413
15610	NC_020564	AT	3	6	653979	653984	50 %	50 %	0 %	0 %	470218413
15611	NC_020564	TGA	3	9	653993	654001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218413
15612	NC_020564	TAC	2	6	654021	654026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218413
15613	NC_020564	TTTA	2	8	654042	654049	25 %	75 %	0 %	0 %	470218413
15614	NC_020564	AGC	2	6	654081	654086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218413
15615	NC_020564	TGC	2	6	654096	654101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218413
15616	NC_020564	GCAA	2	8	654132	654139	50 %	0 %	25 %	25 %	470218413
15617	NC_020564	AAAGG	2	10	654145	654154	60 %	0 %	40 %	0 %	470218413
15618	NC_020564	ATT	2	6	654195	654200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218413
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15620	NC_020564	CTG	2	6	654209	654214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218413
15621	NC_020564	TAT	2	6	654216	654221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218413
15622	NC_020564	TTG	2	6	654269	654274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218413
15623	NC_020564	GTT	2	6	654285	654290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218413
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15625	NC_020564	TGGT	2	8	654317	654324	0 %	50 %	50 %	0 %	470218413
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15747	NC_020564	TAA	3	9	659235	659243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15995	NC_020564	CTT	2	6	669127	669132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218425
15996	NC_020564	ACTCA	2	10	669229	669238	40 %	20 %	0 %	40 %	470218425
15997	NC_020564	ATA	2	6	669251	669256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218425
15998	NC_020564	TCA	2	6	669284	669289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218425
15999	NC_020564	TCG	2	6	669426	669431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218425
16000	NC_020564	TGC	2	6	669472	669477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218425

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