MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020564	ATA	3	9	609784	609792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218377
14502	NC_020564	TCA	2	6	609799	609804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218377
14503	NC_020564	TGA	2	6	609848	609853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_020564	TTG	2	6	609854	609859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_020564	TCAT	2	8	609867	609874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14506	NC_020564	GAATG	2	10	609949	609958	40 %	20 %	40 %	0 %	470218378
14507	NC_020564	AAC	2	6	609980	609985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218378
14508	NC_020564	T	6	6	610013	610018	0 %	100 %	0 %	0 %	470218378
14509	NC_020564	AT	4	8	610063	610070	50 %	50 %	0 %	0 %	470218378
14510	NC_020564	GTT	2	6	610107	610112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218378
14511	NC_020564	GAT	2	6	610227	610232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218378
14512	NC_020564	TTGG	2	8	610345	610352	0 %	50 %	50 %	0 %	470218378
14513	NC_020564	TGA	2	6	610364	610369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218378
14514	NC_020564	ATT	2	6	610371	610376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218378
14515	NC_020564	TGT	2	6	610403	610408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218378
14516	NC_020564	A	6	6	610438	610443	100 %	0 %	0 %	0 %	470218378
14517	NC_020564	TAT	2	6	610472	610477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218378
14518	NC_020564	AATT	2	8	610580	610587	50 %	50 %	0 %	0 %	470218378
14519	NC_020564	AGCAG	2	10	610658	610667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14520	NC_020564	CATGAC	2	12	610674	610685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_020564	CATA	2	8	610706	610713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14522	NC_020564	AAC	2	6	610762	610767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_020564	TCG	2	6	610775	610780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_020564	TCA	2	6	610829	610834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_020564	GCT	2	6	610842	610847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_020564	GTAAA	2	10	610867	610876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_020564	CAT	3	9	610890	610898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_020564	CAA	3	9	610926	610934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_020564	GAT	2	6	610947	610952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_020564	CAA	2	6	610993	610998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_020564	TAA	2	6	611038	611043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_020564	TTA	2	6	611087	611092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_020564	TA	3	6	611102	611107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020564	ATT	2	6	611126	611131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020564	TAT	2	6	611132	611137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_020564	GAT	2	6	611156	611161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020564	ACG	2	6	611244	611249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_020564	ATT	2	6	611273	611278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_020564	TCAA	2	8	611307	611314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14540	NC_020564	GCTG	2	8	611325	611332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14541	NC_020564	TAT	2	6	611348	611353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_020564	TA	3	6	611371	611376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_020564	TGG	2	6	611423	611428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020564	TCA	2	6	611437	611442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_020564	TAA	2	6	611534	611539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_020564	AAT	2	6	611541	611546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_020564	A	7	7	611614	611620	100 %	0 %	0 %	0 %	470218379
14548	NC_020564	ATAG	2	8	611631	611638	50 %	25 %	25 %	0 %	470218379
14549	NC_020564	AAAAC	2	10	611648	611657	80 %	0 %	0 %	20 %	470218379
14550	NC_020564	GCA	2	6	611757	611762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218379
14551	NC_020564	ATT	2	6	611786	611791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14552	NC_020564	GTTA	2	8	611808	611815	25 %	50 %	25 %	0 %	470218379
14553	NC_020564	TAG	2	6	611824	611829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218379
14554	NC_020564	AG	3	6	611828	611833	50 %	0 %	50 %	0 %	470218379
14555	NC_020564	TCT	2	6	611896	611901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218379
14556	NC_020564	CAT	2	6	611902	611907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218379
14557	NC_020564	AAT	2	6	611997	612002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218379
14558	NC_020564	ATT	2	6	612051	612056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14559	NC_020564	TAC	2	6	612067	612072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218379
14560	NC_020564	ATT	2	6	612127	612132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14561	NC_020564	TG	3	6	612135	612140	0 %	50 %	50 %	0 %	470218379
14562	NC_020564	TCG	2	6	612151	612156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218379
14563	NC_020564	TAT	2	6	612157	612162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14564	NC_020564	TAA	2	6	612188	612193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218379
14565	NC_020564	ATA	2	6	612298	612303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218379
14566	NC_020564	CAG	2	6	612313	612318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218379
14567	NC_020564	AGC	2	6	612374	612379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218379
14568	NC_020564	TGT	2	6	612392	612397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218379
14569	NC_020564	TGGT	2	8	612413	612420	0 %	50 %	50 %	0 %	470218379
14570	NC_020564	CAA	2	6	612424	612429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218379
14571	NC_020564	TCA	2	6	612431	612436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218379
14572	NC_020564	CAT	2	6	612481	612486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218379
14573	NC_020564	GCAATT	2	12	612513	612524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218379
14574	NC_020564	ATG	2	6	612525	612530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218379
14575	NC_020564	TGA	2	6	612559	612564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218379
14576	NC_020564	TAT	2	6	612602	612607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14577	NC_020564	CAA	2	6	612610	612615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218379
14578	NC_020564	TAG	2	6	612670	612675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218379
14579	NC_020564	GT	3	6	612676	612681	0 %	50 %	50 %	0 %	470218379
14580	NC_020564	GAA	2	6	612703	612708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218379
14581	NC_020564	TTA	2	6	612763	612768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14582	NC_020564	ATT	2	6	612788	612793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14583	NC_020564	AACA	2	8	612801	612808	75 %	0 %	0 %	25 %	470218379
14584	NC_020564	TAT	2	6	612845	612850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218379
14585	NC_020564	TCAT	2	8	612864	612871	25 %	50 %	0 %	25 %	470218379
14586	NC_020564	GTT	2	6	612881	612886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218379
14587	NC_020564	GCA	2	6	612906	612911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218379
14588	NC_020564	ATTGC	2	10	612930	612939	20 %	40 %	20 %	20 %	470218379
14589	NC_020564	ATC	2	6	612951	612956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218379
14590	NC_020564	ATG	2	6	613006	613011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218379
14591	NC_020564	TGA	2	6	613052	613057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218379
14592	NC_020564	GAA	2	6	613065	613070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218379
14593	NC_020564	GAAAAA	2	12	613074	613085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470218379
14594	NC_020564	ATA	2	6	613091	613096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218379
14595	NC_020564	CTT	2	6	613116	613121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_020564	T	6	6	613144	613149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_020564	TAT	2	6	613151	613156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_020564	TA	4	8	613189	613196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020564	AATT	2	8	613271	613278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_020564	AAT	2	6	613296	613301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_020564	ATTG	2	8	613349	613356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_020564	TAA	2	6	613370	613375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_020564	T	6	6	613383	613388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020564	ATG	2	6	613446	613451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020564	TA	3	6	613524	613529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_020564	GAA	2	6	613550	613555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020564	CCAT	2	8	613567	613574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14608	NC_020564	GATA	2	8	613599	613606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_020564	AGA	2	6	613636	613641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_020564	CCA	2	6	613794	613799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218380
14611	NC_020564	TTA	2	6	613822	613827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218380
14612	NC_020564	ATA	2	6	613863	613868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218380
14613	NC_020564	ATCA	2	8	614030	614037	50 %	25 %	0 %	25 %	470218380
14614	NC_020564	ACC	2	6	614042	614047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218380
14615	NC_020564	TGC	2	6	614078	614083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218380
14616	NC_020564	CTG	2	6	614106	614111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218380
14617	NC_020564	AT	3	6	614126	614131	50 %	50 %	0 %	0 %	470218380
14618	NC_020564	T	6	6	614131	614136	0 %	100 %	0 %	0 %	470218380
14619	NC_020564	ATT	2	6	614171	614176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218380
14620	NC_020564	TTA	2	6	614196	614201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218380
14621	NC_020564	TTA	2	6	614215	614220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218380
14622	NC_020564	T	7	7	614330	614336	0 %	100 %	0 %	0 %	470218380
14623	NC_020564	TCT	2	6	614355	614360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218380
14624	NC_020564	AGC	2	6	614399	614404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218380
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14855	NC_020564	TGT	2	6	624033	624038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14868	NC_020564	CAA	2	6	624688	624693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218388
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14994	NC_020564	ACGTG	2	10	629709	629718	20 %	20 %	40 %	20 %	470218393
14995	NC_020564	CAG	2	6	629726	629731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218393
14996	NC_020564	ATT	2	6	629797	629802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218393
14997	NC_020564	TGG	2	6	629943	629948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218393
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14999	NC_020564	CTG	2	6	630044	630049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218393
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