MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020564	GAT	2	6	589257	589262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218363
14002	NC_020564	ATA	2	6	589276	589281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14003	NC_020564	AAG	2	6	589282	589287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14004	NC_020564	AAT	2	6	589305	589310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14005	NC_020564	ACA	2	6	589314	589319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14006	NC_020564	CAA	2	6	589330	589335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14007	NC_020564	AAGA	2	8	589344	589351	75 %	0 %	25 %	0 %	470218363
14008	NC_020564	AGA	2	6	589382	589387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14009	NC_020564	CAA	2	6	589407	589412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14010	NC_020564	AGA	2	6	589502	589507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14011	NC_020564	AGA	2	6	589523	589528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14012	NC_020564	GAA	2	6	589529	589534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14013	NC_020564	CAAA	2	8	589590	589597	75 %	0 %	0 %	25 %	470218363
14014	NC_020564	CAAC	2	8	589644	589651	50 %	0 %	0 %	50 %	470218363
14015	NC_020564	AGA	2	6	589718	589723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14016	NC_020564	AAT	2	6	589731	589736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14017	NC_020564	TTAG	2	8	589755	589762	25 %	50 %	25 %	0 %	470218363
14018	NC_020564	CAA	2	6	589810	589815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14019	NC_020564	CAG	3	9	589867	589875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218363
14020	NC_020564	AAT	2	6	589884	589889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14021	NC_020564	GCA	2	6	589953	589958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218363
14022	NC_020564	A	6	6	590016	590021	100 %	0 %	0 %	0 %	470218363
14023	NC_020564	ATTA	2	8	590037	590044	50 %	50 %	0 %	0 %	470218363
14024	NC_020564	AT	3	6	590225	590230	50 %	50 %	0 %	0 %	470218363
14025	NC_020564	AAGC	2	8	590235	590242	50 %	0 %	25 %	25 %	470218363
14026	NC_020564	CAG	2	6	590281	590286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218363
14027	NC_020564	ATCT	2	8	590357	590364	25 %	50 %	0 %	25 %	470218363
14028	NC_020564	ACAA	2	8	590383	590390	75 %	0 %	0 %	25 %	470218363
14029	NC_020564	AAC	2	6	590398	590403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14030	NC_020564	A	7	7	590424	590430	100 %	0 %	0 %	0 %	470218363
14031	NC_020564	GAT	2	6	590472	590477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218363
14032	NC_020564	GTA	2	6	590503	590508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218363
14033	NC_020564	ATT	2	6	590511	590516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218363
14034	NC_020564	CAA	2	6	590559	590564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14035	NC_020564	ATA	2	6	590626	590631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14036	NC_020564	A	6	6	590631	590636	100 %	0 %	0 %	0 %	470218363
14037	NC_020564	TAA	2	6	590645	590650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14038	NC_020564	TAT	2	6	590690	590695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218363
14039	NC_020564	GTT	2	6	590700	590705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218363
14040	NC_020564	AAC	2	6	590765	590770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14041	NC_020564	TTA	2	6	590783	590788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218363
14042	NC_020564	GAA	2	6	590862	590867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14043	NC_020564	TATG	2	8	590889	590896	25 %	50 %	25 %	0 %	470218363
14044	NC_020564	GAAA	2	8	590936	590943	75 %	0 %	25 %	0 %	470218363
14045	NC_020564	TAC	2	6	590987	590992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218363
14046	NC_020564	GGT	2	6	591033	591038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218363
14047	NC_020564	CAA	2	6	591094	591099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14048	NC_020564	AAC	2	6	591110	591115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14049	NC_020564	GAT	2	6	591171	591176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218363
14050	NC_020564	TATG	2	8	591228	591235	25 %	50 %	25 %	0 %	470218363
14051	NC_020564	ACT	3	9	591336	591344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218363
14052	NC_020564	CAG	2	6	591412	591417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218363
14053	NC_020564	TAC	2	6	591440	591445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218363
14054	NC_020564	AAC	3	9	591473	591481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14055	NC_020564	ATA	2	6	591502	591507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14056	NC_020564	TAA	2	6	591575	591580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218363
14057	NC_020564	TTA	2	6	591633	591638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218363
14058	NC_020564	AAC	2	6	591662	591667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218363
14059	NC_020564	CTG	2	6	591742	591747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218363
14060	NC_020564	GAT	2	6	591780	591785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218363
14061	NC_020564	TGG	2	6	591797	591802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218363
14062	NC_020564	ATG	2	6	591829	591834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218363
14063	NC_020564	GAA	2	6	591861	591866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218363
14064	NC_020564	TCAGAC	2	12	591885	591896	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14065	NC_020564	TCAGAC	2	12	591903	591914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14066	NC_020564	GACTCA	2	12	592116	592127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14067	NC_020564	GACTCA	2	12	592134	592145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14068	NC_020564	GACTCA	2	12	592152	592163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14069	NC_020564	GATTCA	2	12	592170	592181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218363
14070	NC_020564	GACTCA	2	12	592242	592253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14071	NC_020564	GACTCA	2	12	592260	592271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218363
14072	NC_020564	TAC	2	6	592343	592348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218363
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14074	NC_020564	TGG	2	6	592427	592432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218363
14075	NC_020564	ATT	2	6	592433	592438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218363
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14078	NC_020564	GTC	2	6	592468	592473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218363
14079	NC_020564	A	6	6	592476	592481	100 %	0 %	0 %	0 %	470218363
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14081	NC_020564	T	8	8	592524	592531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020564	ATAAA	2	10	592564	592573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14084	NC_020564	AAAT	2	8	592671	592678	75 %	25 %	0 %	0 %	470218364
14085	NC_020564	GTT	2	6	592687	592692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218364
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14087	NC_020564	ATG	2	6	592779	592784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218364
14088	NC_020564	CAAT	2	8	592815	592822	50 %	25 %	0 %	25 %	470218364
14089	NC_020564	ATG	2	6	592905	592910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218364
14090	NC_020564	AT	3	6	592916	592921	50 %	50 %	0 %	0 %	470218364
14091	NC_020564	T	6	6	592951	592956	0 %	100 %	0 %	0 %	470218364
14092	NC_020564	ATC	2	6	592968	592973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218364
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14098	NC_020564	A	6	6	593155	593160	100 %	0 %	0 %	0 %	470218364
14099	NC_020564	CAG	2	6	593192	593197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218364
14100	NC_020564	CAA	2	6	593198	593203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218364
14101	NC_020564	T	6	6	593204	593209	0 %	100 %	0 %	0 %	470218364
14102	NC_020564	AGA	2	6	593215	593220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218364
14103	NC_020564	AAT	2	6	593258	593263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218364
14104	NC_020564	GTT	3	9	593333	593341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218364
14105	NC_020564	CCGGTA	2	12	593364	593375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470218364
14106	NC_020564	TAA	2	6	593407	593412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218364
14107	NC_020564	TTG	2	6	593433	593438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218364
14108	NC_020564	AACAG	2	10	593443	593452	60 %	0 %	20 %	20 %	470218364
14109	NC_020564	AT	3	6	593473	593478	50 %	50 %	0 %	0 %	470218364
14110	NC_020564	AAAAT	2	10	593481	593490	80 %	20 %	0 %	0 %	470218364
14111	NC_020564	ATCA	2	8	593546	593553	50 %	25 %	0 %	25 %	470218364
14112	NC_020564	ATCAT	2	10	593565	593574	40 %	40 %	0 %	20 %	470218364
14113	NC_020564	AGA	2	6	593713	593718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218364
14114	NC_020564	ATCA	2	8	593945	593952	50 %	25 %	0 %	25 %	470218364
14115	NC_020564	ATA	2	6	593982	593987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218364
14116	NC_020564	ACT	2	6	594047	594052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218364
14117	NC_020564	A	6	6	594094	594099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_020564	ATC	2	6	594113	594118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14493	NC_020564	ATG	2	6	609244	609249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218376
14494	NC_020564	TTG	2	6	609278	609283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218376
14495	NC_020564	AATTT	2	10	609308	609317	40 %	60 %	0 %	0 %	470218376
14496	NC_020564	GTA	2	6	609377	609382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218376
14497	NC_020564	ATC	2	6	609391	609396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218376
14498	NC_020564	CTA	2	6	609455	609460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218376
14499	NC_020564	GTT	2	6	609575	609580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218376
14500	NC_020564	CTTT	2	8	609752	609759	0 %	75 %	0 %	25 %	470218377

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