MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020564	AGA	2	6	568140	568145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_020564	AAT	2	6	568148	568153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_020564	TGA	2	6	568154	568159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_020564	GACT	2	8	568162	568169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13505	NC_020564	ATA	2	6	568187	568192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_020564	TAAA	2	8	568198	568205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_020564	TTG	2	6	568207	568212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_020564	T	6	6	568252	568257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_020564	AATT	2	8	568315	568322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_020564	TACAGC	2	12	568375	568386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218348
13511	NC_020564	TCA	2	6	568403	568408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218348
13512	NC_020564	AGAA	2	8	568472	568479	75 %	0 %	25 %	0 %	470218348
13513	NC_020564	AAT	2	6	568500	568505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218348
13514	NC_020564	TCT	2	6	568514	568519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218348
13515	NC_020564	ATC	2	6	568523	568528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218348
13516	NC_020564	CTT	2	6	568572	568577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218348
13517	NC_020564	TAA	2	6	568578	568583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218348
13518	NC_020564	TTA	2	6	568601	568606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218348
13519	NC_020564	TTGCTA	2	12	568656	568667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218348
13520	NC_020564	GATC	2	8	568824	568831	25 %	25 %	25 %	25 %	470218348
13521	NC_020564	ATT	2	6	568841	568846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218348
13522	NC_020564	T	6	6	568845	568850	0 %	100 %	0 %	0 %	470218348
13523	NC_020564	ACC	2	6	568918	568923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218348
13524	NC_020564	TGAA	2	8	568981	568988	50 %	25 %	25 %	0 %	470218348
13525	NC_020564	TCTA	2	8	569032	569039	25 %	50 %	0 %	25 %	470218348
13526	NC_020564	ACC	2	6	569077	569082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218348
13527	NC_020564	TTC	2	6	569092	569097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218348
13528	NC_020564	ACA	2	6	569117	569122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218348
13529	NC_020564	TAA	2	6	569131	569136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218348
13530	NC_020564	AGTA	2	8	569167	569174	50 %	25 %	25 %	0 %	470218348
13531	NC_020564	CAT	2	6	569190	569195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218348
13532	NC_020564	GCAT	2	8	569204	569211	25 %	25 %	25 %	25 %	470218348
13533	NC_020564	TTC	2	6	569410	569415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218348
13534	NC_020564	TAT	2	6	569475	569480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218348
13535	NC_020564	ACT	2	6	569513	569518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218348
13536	NC_020564	AAT	2	6	569525	569530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_020564	ATGA	2	8	569593	569600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_020564	TA	3	6	569668	569673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_020564	AAATCA	2	12	569779	569790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470218349
13540	NC_020564	ATT	2	6	569824	569829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218349
13541	NC_020564	CAA	2	6	569839	569844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218349
13542	NC_020564	AGC	2	6	569870	569875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218349
13543	NC_020564	CAAT	2	8	569914	569921	50 %	25 %	0 %	25 %	470218349
13544	NC_020564	ACG	2	6	569938	569943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218349
13545	NC_020564	AGA	2	6	569948	569953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218349
13546	NC_020564	TCAG	2	8	569996	570003	25 %	25 %	25 %	25 %	470218349
13547	NC_020564	GCT	2	6	570021	570026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218349
13548	NC_020564	ATG	2	6	570049	570054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218349
13549	NC_020564	ATT	2	6	570087	570092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218349
13550	NC_020564	GATG	2	8	570093	570100	25 %	25 %	50 %	0 %	470218349
13551	NC_020564	ATT	2	6	570120	570125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218349
13552	NC_020564	GAT	2	6	570147	570152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218349
13553	NC_020564	AAG	2	6	570169	570174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218349
13554	NC_020564	CAATA	2	10	570189	570198	60 %	20 %	0 %	20 %	470218349
13555	NC_020564	ATGG	2	8	570231	570238	25 %	25 %	50 %	0 %	470218349
13556	NC_020564	AGA	2	6	570275	570280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218349
13557	NC_020564	TTA	2	6	570288	570293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218349
13558	NC_020564	GAC	2	6	570303	570308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218349
13559	NC_020564	GGC	2	6	570420	570425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218349
13560	NC_020564	CAT	2	6	570493	570498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218349
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13562	NC_020564	ATT	2	6	570660	570665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218349
13563	NC_020564	TGA	2	6	570668	570673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218349
13564	NC_020564	A	6	6	570673	570678	100 %	0 %	0 %	0 %	470218349
13565	NC_020564	ATTT	3	12	570865	570876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_020564	T	7	7	570904	570910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_020564	GTTTA	2	10	570914	570923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_020564	T	6	6	571009	571014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_020564	ATT	2	6	571033	571038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_020564	GT	3	6	571077	571082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_020564	TAG	2	6	571098	571103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_020564	TA	3	6	571108	571113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_020564	TAAG	2	8	571155	571162	50 %	25 %	25 %	0 %	470218350
13574	NC_020564	CAAC	2	8	571163	571170	50 %	0 %	0 %	50 %	470218350
13575	NC_020564	AGA	2	6	571183	571188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218350
13576	NC_020564	TGA	2	6	571299	571304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218350
13577	NC_020564	TGC	2	6	571306	571311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218350
13578	NC_020564	AG	3	6	571315	571320	50 %	0 %	50 %	0 %	470218350
13579	NC_020564	TAT	2	6	571326	571331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218350
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13582	NC_020564	CAT	2	6	571391	571396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218350
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13584	NC_020564	GAAA	2	8	571513	571520	75 %	0 %	25 %	0 %	470218350
13585	NC_020564	A	7	7	571534	571540	100 %	0 %	0 %	0 %	470218350
13586	NC_020564	TGC	2	6	571612	571617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218350
13587	NC_020564	GTT	2	6	571619	571624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218350
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13592	NC_020564	TTA	2	6	571856	571861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218350
13593	NC_020564	AGT	2	6	571879	571884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218350
13594	NC_020564	ACG	2	6	571887	571892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218350
13595	NC_020564	GAA	2	6	571902	571907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218350
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13597	NC_020564	ATAA	2	8	572004	572011	75 %	25 %	0 %	0 %	470218350
13598	NC_020564	ATTA	2	8	572018	572025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_020564	GAG	2	6	572026	572031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_020564	T	8	8	572058	572065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_020564	TAT	2	6	572100	572105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_020564	TAA	2	6	572136	572141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_020564	GGA	2	6	572158	572163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_020564	ATG	2	6	572167	572172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218351
13605	NC_020564	GT	3	6	572213	572218	0 %	50 %	50 %	0 %	470218351
13606	NC_020564	TAAT	2	8	572222	572229	50 %	50 %	0 %	0 %	470218351
13607	NC_020564	AGT	2	6	572244	572249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218351
13608	NC_020564	CATA	2	8	572317	572324	50 %	25 %	0 %	25 %	470218351
13609	NC_020564	ATT	2	6	572345	572350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218351
13610	NC_020564	GAA	2	6	572362	572367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218351
13611	NC_020564	AT	3	6	572376	572381	50 %	50 %	0 %	0 %	470218351
13612	NC_020564	TAG	2	6	572414	572419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218351
13613	NC_020564	CTA	2	6	572444	572449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218351
13614	NC_020564	CAT	2	6	572536	572541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218351
13615	NC_020564	AAG	2	6	572552	572557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218351
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13617	NC_020564	TAG	2	6	572625	572630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218351
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13621	NC_020564	TAT	2	6	572700	572705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218351
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13986	NC_020564	ATAA	2	8	588667	588674	75 %	25 %	0 %	0 %	470218362
13987	NC_020564	T	6	6	588705	588710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13988	NC_020564	T	6	6	588760	588765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13989	NC_020564	A	6	6	588766	588771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13990	NC_020564	A	6	6	588876	588881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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