MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020564	TTA	2	6	547625	547630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218335
13003	NC_020564	TGG	2	6	547637	547642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218335
13004	NC_020564	GTG	2	6	547664	547669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218335
13005	NC_020564	TCA	2	6	547719	547724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218335
13006	NC_020564	AGA	2	6	547776	547781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218335
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13008	NC_020564	GGT	2	6	547927	547932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218335
13009	NC_020564	CAT	2	6	547951	547956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218335
13010	NC_020564	ATT	2	6	548006	548011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218335
13011	NC_020564	A	6	6	548045	548050	100 %	0 %	0 %	0 %	470218335
13012	NC_020564	ATT	2	6	548089	548094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218335
13013	NC_020564	AAG	2	6	548096	548101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218335
13014	NC_020564	AATT	2	8	548222	548229	50 %	50 %	0 %	0 %	470218335
13015	NC_020564	GC	3	6	548235	548240	0 %	0 %	50 %	50 %	470218335
13016	NC_020564	CTA	2	6	548249	548254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218335
13017	NC_020564	AT	3	6	548274	548279	50 %	50 %	0 %	0 %	470218335
13018	NC_020564	ATGA	2	8	548320	548327	50 %	25 %	25 %	0 %	470218335
13019	NC_020564	AATA	2	8	548383	548390	75 %	25 %	0 %	0 %	470218335
13020	NC_020564	ACA	2	6	548404	548409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218335
13021	NC_020564	ATT	2	6	548499	548504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218335
13022	NC_020564	AGA	2	6	548616	548621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218335
13023	NC_020564	CAA	2	6	548657	548662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_020564	ATT	2	6	548677	548682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_020564	AT	3	6	548701	548706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020564	GTAC	2	8	548732	548739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_020564	TAA	2	6	548770	548775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020564	A	6	6	548792	548797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020564	GAA	2	6	548864	548869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020564	TTTA	2	8	548979	548986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_020564	A	6	6	548988	548993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020564	GAA	2	6	548996	549001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020564	ATT	2	6	549013	549018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020564	AAATA	2	10	549019	549028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_020564	TTG	2	6	549076	549081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218336
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13041	NC_020564	A	6	6	549196	549201	100 %	0 %	0 %	0 %	470218336
13042	NC_020564	T	6	6	549236	549241	0 %	100 %	0 %	0 %	470218336
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13051	NC_020564	ATG	2	6	549787	549792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218336
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13053	NC_020564	ATT	2	6	549953	549958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218337
13054	NC_020564	TGAG	2	8	550128	550135	25 %	25 %	50 %	0 %	470218337
13055	NC_020564	ATC	2	6	550171	550176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218337
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13057	NC_020564	GAT	2	6	550232	550237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218337
13058	NC_020564	TCT	2	6	550274	550279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218337
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13060	NC_020564	CAT	2	6	550316	550321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218337
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13062	NC_020564	ATTA	2	8	550506	550513	50 %	50 %	0 %	0 %	470218338
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13072	NC_020564	TTAC	2	8	551016	551023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13073	NC_020564	GTATA	2	10	551054	551063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_020564	TAT	2	6	551068	551073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_020564	ATT	2	6	551089	551094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13083	NC_020564	A	6	6	551340	551345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13087	NC_020564	TAT	2	6	551463	551468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_020564	GAA	2	6	551495	551500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218339
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13093	NC_020564	A	7	7	551675	551681	100 %	0 %	0 %	0 %	470218339
13094	NC_020564	TGCAGG	2	12	551776	551787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470218339
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13097	NC_020564	TAG	2	6	551973	551978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218339
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13099	NC_020564	TTA	2	6	552051	552056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020564	A	6	6	552072	552077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_020564	T	6	6	552087	552092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020564	AGG	2	6	552204	552209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_020564	A	6	6	552224	552229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_020564	GTT	2	6	552239	552244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_020564	CAC	2	6	552279	552284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_020564	CAT	2	6	552319	552324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_020564	ATT	2	6	552374	552379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_020564	CATTTA	2	12	552411	552422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13109	NC_020564	A	6	6	552455	552460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_020564	CAAA	2	8	552492	552499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_020564	GCT	2	6	552569	552574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_020564	GAA	2	6	552578	552583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_020564	TAT	2	6	552595	552600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020564	GTA	2	6	552615	552620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_020564	AAT	2	6	552636	552641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020564	ATA	2	6	552696	552701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_020564	ATG	2	6	552702	552707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020564	TGAT	2	8	552740	552747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_020564	TTC	2	6	552764	552769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_020564	TGT	2	6	552770	552775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_020564	GGA	2	6	552808	552813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_020564	AGG	2	6	552834	552839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_020564	A	6	6	552854	552859	100 %	0 %	0 %	0 %	470218340
13124	NC_020564	AAG	2	6	552873	552878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218340
13125	NC_020564	GAA	2	6	552917	552922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218340
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13127	NC_020564	CAA	2	6	553016	553021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218340
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13147	NC_020564	TTAT	2	8	553662	553669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13148	NC_020564	TGA	2	6	553712	553717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13201	NC_020564	AATA	2	8	555571	555578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13234	NC_020564	CGT	2	6	557140	557145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218343
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13251	NC_020564	GAA	2	6	558109	558114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218343
13252	NC_020564	GAA	2	6	558259	558264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218343
13253	NC_020564	GAA	2	6	558376	558381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218343
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13256	NC_020564	TG	3	6	558467	558472	0 %	50 %	50 %	0 %	470218343
13257	NC_020564	GAA	2	6	558514	558519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218343
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13259	NC_020564	CGAT	2	8	558548	558555	25 %	25 %	25 %	25 %	470218343
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13360	NC_020564	TA	3	6	563010	563015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_020564	ATT	2	6	563056	563061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_020564	GGA	2	6	563129	563134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_020564	ATT	2	6	563138	563143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13364	NC_020564	AACA	2	8	563169	563176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13365	NC_020564	AAAG	2	8	563216	563223	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13366	NC_020564	ATT	2	6	563241	563246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_020564	ATCA	2	8	563292	563299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13368	NC_020564	T	6	6	563318	563323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13493	NC_020564	TTC	2	6	567830	567835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218347
13494	NC_020564	TAC	2	6	567865	567870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218347
13495	NC_020564	GTT	2	6	567884	567889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218347
13496	NC_020564	GTT	2	6	568025	568030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218347
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13498	NC_020564	TA	3	6	568068	568073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_020564	AGA	2	6	568077	568082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_020564	T	7	7	568101	568107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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