MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020564	TTA	2	6	420549	420554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218250
10002	NC_020564	A	6	6	420593	420598	100 %	0 %	0 %	0 %	470218250
10003	NC_020564	AAT	2	6	420666	420671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218250
10004	NC_020564	AAG	2	6	420710	420715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020564	CTT	2	6	420746	420751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_020564	GAT	2	6	420763	420768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020564	CTAT	2	8	420836	420843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_020564	TTTA	2	8	420870	420877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020564	TAA	2	6	420906	420911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020564	ATT	2	6	420922	420927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020564	TAA	2	6	420966	420971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_020564	TAA	2	6	421007	421012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_020564	GCA	2	6	421043	421048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218251
10014	NC_020564	TGT	2	6	421351	421356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218251
10015	NC_020564	AAG	2	6	421359	421364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218251
10016	NC_020564	TGG	2	6	421396	421401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218251
10017	NC_020564	TTA	2	6	421426	421431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218251
10018	NC_020564	TA	3	6	421436	421441	50 %	50 %	0 %	0 %	470218251
10019	NC_020564	AG	3	6	421464	421469	50 %	0 %	50 %	0 %	470218251
10020	NC_020564	TACG	2	8	421489	421496	25 %	25 %	25 %	25 %	470218251
10021	NC_020564	AGA	2	6	421519	421524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218251
10022	NC_020564	GGC	2	6	421634	421639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218251
10023	NC_020564	TAT	2	6	421640	421645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218251
10024	NC_020564	TAA	2	6	421657	421662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218251
10025	NC_020564	A	6	6	421661	421666	100 %	0 %	0 %	0 %	470218251
10026	NC_020564	ACAA	2	8	421669	421676	75 %	0 %	0 %	25 %	470218251
10027	NC_020564	A	6	6	421713	421718	100 %	0 %	0 %	0 %	470218251
10028	NC_020564	ATA	2	6	421754	421759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020564	GAG	2	6	421779	421784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020564	CTT	2	6	421807	421812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_020564	T	6	6	421811	421816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020564	AAT	2	6	421850	421855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020564	A	6	6	421971	421976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020564	A	6	6	421992	421997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020564	TAAT	2	8	421998	422005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020564	TAAC	2	8	422022	422029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_020564	TA	3	6	422087	422092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020564	TAG	2	6	422097	422102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_020564	AT	3	6	422140	422145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020564	TTA	2	6	422226	422231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218252
10041	NC_020564	ACT	2	6	422232	422237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218252
10042	NC_020564	AAAAG	2	10	422273	422282	80 %	0 %	20 %	0 %	470218252
10043	NC_020564	AG	4	8	422285	422292	50 %	0 %	50 %	0 %	470218252
10044	NC_020564	ACA	2	6	422294	422299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218252
10045	NC_020564	TAC	2	6	422328	422333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218252
10046	NC_020564	TCA	2	6	422334	422339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218252
10047	NC_020564	ATT	2	6	422432	422437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218252
10048	NC_020564	TTA	2	6	422439	422444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218252
10049	NC_020564	AGATAA	2	12	422450	422461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470218252
10050	NC_020564	A	6	6	422466	422471	100 %	0 %	0 %	0 %	470218252
10051	NC_020564	AATT	2	8	422506	422513	50 %	50 %	0 %	0 %	470218252
10052	NC_020564	TGG	2	6	422540	422545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218252
10053	NC_020564	TCT	2	6	422568	422573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218252
10054	NC_020564	ATTT	2	8	422587	422594	25 %	75 %	0 %	0 %	470218252
10055	NC_020564	TAA	2	6	422597	422602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218252
10056	NC_020564	TAAT	2	8	422644	422651	50 %	50 %	0 %	0 %	470218252
10057	NC_020564	AGA	2	6	422654	422659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218252
10058	NC_020564	TA	3	6	422719	422724	50 %	50 %	0 %	0 %	470218252
10059	NC_020564	CAAT	2	8	422886	422893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_020564	TAA	2	6	422904	422909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020564	AGC	2	6	422916	422921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_020564	AATA	2	8	422939	422946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020564	TCC	2	6	422953	422958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_020564	ATTA	2	8	423072	423079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020564	TTC	2	6	423081	423086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_020564	TTTAAT	2	12	423098	423109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020564	GTCT	2	8	423129	423136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_020564	TAA	2	6	423149	423154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020564	TAT	2	6	423160	423165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020564	TAA	2	6	423176	423181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020564	AT	3	6	423192	423197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020564	ATATGA	2	12	423210	423221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470218253
10073	NC_020564	AAC	2	6	423265	423270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218253
10074	NC_020564	AATC	2	8	423290	423297	50 %	25 %	0 %	25 %	470218253
10075	NC_020564	A	6	6	423321	423326	100 %	0 %	0 %	0 %	470218253
10076	NC_020564	ACAA	2	8	423344	423351	75 %	0 %	0 %	25 %	470218253
10077	NC_020564	TTA	2	6	423415	423420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218253
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10079	NC_020564	AAAT	2	8	423490	423497	75 %	25 %	0 %	0 %	470218253
10080	NC_020564	A	6	6	423504	423509	100 %	0 %	0 %	0 %	470218253
10081	NC_020564	TAG	2	6	423543	423548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218253
10082	NC_020564	GAA	2	6	423558	423563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218253
10083	NC_020564	GTG	2	6	423576	423581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218253
10084	NC_020564	GAA	2	6	423586	423591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218253
10085	NC_020564	A	7	7	423641	423647	100 %	0 %	0 %	0 %	470218253
10086	NC_020564	TGA	2	6	423673	423678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218253
10087	NC_020564	GAA	2	6	423698	423703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218253
10088	NC_020564	A	6	6	423749	423754	100 %	0 %	0 %	0 %	470218253
10089	NC_020564	TTA	2	6	423795	423800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218253
10090	NC_020564	AAT	2	6	423912	423917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218253
10091	NC_020564	AT	3	6	423923	423928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020564	AAG	2	6	423942	423947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020564	TAA	2	6	423953	423958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020564	TAA	3	9	423989	423997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020564	TTA	2	6	424021	424026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020564	GCT	2	6	424028	424033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_020564	T	6	6	424033	424038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020564	A	7	7	424100	424106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020564	TAA	2	6	424164	424169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020564	TTTA	2	8	424179	424186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020564	TAA	2	6	424224	424229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020564	AT	3	6	424267	424272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_020564	AAAT	2	8	424285	424292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020564	CATTAG	2	12	424321	424332	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218254
10105	NC_020564	GT	3	6	424348	424353	0 %	50 %	50 %	0 %	470218254
10106	NC_020564	CAG	2	6	424357	424362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218254
10107	NC_020564	TGA	2	6	424394	424399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218254
10108	NC_020564	GAA	2	6	424446	424451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218254
10109	NC_020564	CAA	2	6	424462	424467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218254
10110	NC_020564	AAAT	2	8	424565	424572	75 %	25 %	0 %	0 %	470218254
10111	NC_020564	A	6	6	424579	424584	100 %	0 %	0 %	0 %	470218254
10112	NC_020564	AT	3	6	424638	424643	50 %	50 %	0 %	0 %	470218254
10113	NC_020564	GTAA	2	8	424692	424699	50 %	25 %	25 %	0 %	470218254
10114	NC_020564	A	6	6	424716	424721	100 %	0 %	0 %	0 %	470218254
10115	NC_020564	GTT	2	6	424754	424759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218254
10116	NC_020564	GAA	2	6	424773	424778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218254
10117	NC_020564	TTA	2	6	424870	424875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218254
10118	NC_020564	TGAATT	2	12	424978	424989	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218254
10119	NC_020564	ATA	2	6	425006	425011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_020564	AAG	2	6	425016	425021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020564	TA	3	6	425060	425065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020564	TGT	2	6	425089	425094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_020564	GTT	2	6	425098	425103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020564	CAT	2	6	425133	425138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_020564	GTA	2	6	425144	425149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10127	NC_020564	AAT	2	6	425179	425184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10288	NC_020564	TTG	2	6	431809	431814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10369	NC_020564	A	7	7	434874	434880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10370	NC_020564	AAT	2	6	434898	434903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10498	NC_020564	TGA	3	9	440259	440267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218269
10499	NC_020564	A	7	7	440274	440280	100 %	0 %	0 %	0 %	470218269
10500	NC_020564	GAA	2	6	440287	440292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218269

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