MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62501	NC_020564	A	6	6	2611397	2611402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62502	NC_020564	T	6	6	2611461	2611466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62503	NC_020564	ACA	2	6	2611490	2611495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62504	NC_020564	TCATTT	2	12	2611510	2611521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62505	NC_020564	T	6	6	2611519	2611524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62506	NC_020564	AT	4	8	2611532	2611539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62507	NC_020564	T	6	6	2611633	2611638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62508	NC_020564	TAA	2	6	2611657	2611662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62509	NC_020564	TAC	2	6	2611666	2611671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62510	NC_020564	ATT	2	6	2611695	2611700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62511	NC_020564	AAG	2	6	2611727	2611732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62512	NC_020564	GAA	2	6	2611747	2611752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62513	NC_020564	GAA	2	6	2611792	2611797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62514	NC_020564	GAA	2	6	2611825	2611830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62515	NC_020564	AAG	2	6	2611835	2611840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62516	NC_020564	ATGC	2	8	2611846	2611853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62517	NC_020564	TAA	2	6	2611917	2611922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62518	NC_020564	ATT	2	6	2611932	2611937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62519	NC_020564	ATG	2	6	2611946	2611951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62520	NC_020564	TTC	2	6	2612010	2612015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62521	NC_020564	CAA	2	6	2612128	2612133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62522	NC_020564	TAA	2	6	2612159	2612164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62523	NC_020564	GCAAG	2	10	2612179	2612188	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62524	NC_020564	TTATT	2	10	2612212	2612221	20 %	80 %	0 %	0 %	470219803
62525	NC_020564	TTGA	2	8	2612250	2612257	25 %	50 %	25 %	0 %	470219803
62526	NC_020564	ATT	2	6	2612275	2612280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219803
62527	NC_020564	TCT	2	6	2612308	2612313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219803
62528	NC_020564	TCATTT	2	12	2612392	2612403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470219803
62529	NC_020564	ATGT	2	8	2612538	2612545	25 %	50 %	25 %	0 %	470219803
62530	NC_020564	TAACT	2	10	2612556	2612565	40 %	40 %	0 %	20 %	470219803
62531	NC_020564	TCA	2	6	2612581	2612586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219803
62532	NC_020564	TGAA	2	8	2612587	2612594	50 %	25 %	25 %	0 %	470219803
62533	NC_020564	TCC	2	6	2612605	2612610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219803
62534	NC_020564	CTG	2	6	2612613	2612618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219803
62535	NC_020564	ATA	2	6	2612652	2612657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219803
62536	NC_020564	TAC	2	6	2612672	2612677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219803
62537	NC_020564	TTG	2	6	2612703	2612708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219803
62538	NC_020564	TCT	2	6	2612719	2612724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219803
62539	NC_020564	TCC	2	6	2612815	2612820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62540	NC_020564	TGA	2	6	2612878	2612883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62541	NC_020564	CA	3	6	2612888	2612893	50 %	0 %	0 %	50 %	470219804
62542	NC_020564	ACAA	2	8	2612920	2612927	75 %	0 %	0 %	25 %	470219804
62543	NC_020564	TA	3	6	2613107	2613112	50 %	50 %	0 %	0 %	470219804
62544	NC_020564	ATA	2	6	2613182	2613187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219804
62545	NC_020564	GAA	2	6	2613259	2613264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219804
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62547	NC_020564	ATT	2	6	2613380	2613385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219804
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62549	NC_020564	TGG	2	6	2613472	2613477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219804
62550	NC_020564	CAT	2	6	2613482	2613487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219804
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62553	NC_020564	GAT	2	6	2613679	2613684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219804
62554	NC_020564	CTA	2	6	2613730	2613735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219804
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62556	NC_020564	TAC	2	6	2613853	2613858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219804
62557	NC_020564	AGA	2	6	2613909	2613914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219804
62558	NC_020564	AT	3	6	2613946	2613951	50 %	50 %	0 %	0 %	470219804
62559	NC_020564	TCAGCG	2	12	2613988	2613999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470219804
62560	NC_020564	CA	3	6	2614051	2614056	50 %	0 %	0 %	50 %	470219804
62561	NC_020564	TAG	2	6	2614074	2614079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219804
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62563	NC_020564	ATTT	2	8	2614217	2614224	25 %	75 %	0 %	0 %	470219804
62564	NC_020564	TCG	2	6	2614245	2614250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219804
62565	NC_020564	TGGT	2	8	2614308	2614315	0 %	50 %	50 %	0 %	470219804
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62568	NC_020564	ATAA	2	8	2614555	2614562	75 %	25 %	0 %	0 %	470219804
62569	NC_020564	TGG	2	6	2614584	2614589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219804
62570	NC_020564	AGA	2	6	2614675	2614680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62571	NC_020564	TAT	2	6	2614725	2614730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219805
62572	NC_020564	TAC	2	6	2614769	2614774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219805
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62581	NC_020564	TAT	2	6	2614972	2614977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219805
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62588	NC_020564	T	6	6	2615354	2615359	0 %	100 %	0 %	0 %	470219805
62589	NC_020564	TAC	2	6	2615384	2615389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219806
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62591	NC_020564	T	7	7	2615427	2615433	0 %	100 %	0 %	0 %	470219806
62592	NC_020564	CGT	2	6	2615434	2615439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219806
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62594	NC_020564	AATT	2	8	2615510	2615517	50 %	50 %	0 %	0 %	470219806
62595	NC_020564	TAT	2	6	2615518	2615523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219806
62596	NC_020564	T	6	6	2615529	2615534	0 %	100 %	0 %	0 %	470219806
62597	NC_020564	AT	4	8	2615555	2615562	50 %	50 %	0 %	0 %	470219806
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62599	NC_020564	ACTTTC	2	12	2615577	2615588	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470219806
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62603	NC_020564	T	6	6	2615712	2615717	0 %	100 %	0 %	0 %	470219806
62604	NC_020564	TCA	2	6	2615781	2615786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219806
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62607	NC_020564	TG	4	8	2615878	2615885	0 %	50 %	50 %	0 %	470219806
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62611	NC_020564	TTAT	2	8	2616118	2616125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62612	NC_020564	CAA	2	6	2616247	2616252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219807
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62614	NC_020564	TGT	2	6	2616330	2616335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219807
62615	NC_020564	T	6	6	2616356	2616361	0 %	100 %	0 %	0 %	470219807
62616	NC_020564	TAGG	2	8	2616419	2616426	25 %	25 %	50 %	0 %	470219807
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62982	NC_020564	CAG	2	6	2633434	2633439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219820
62983	NC_020564	AGA	2	6	2633533	2633538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219820
62984	NC_020564	AATC	2	8	2633568	2633575	50 %	25 %	0 %	25 %	470219820
62985	NC_020564	ACG	2	6	2633577	2633582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219820
62986	NC_020564	T	6	6	2633620	2633625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62987	NC_020564	ACT	2	6	2633633	2633638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62988	NC_020564	T	6	6	2633683	2633688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62989	NC_020564	GTAT	2	8	2633708	2633715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62990	NC_020564	A	7	7	2633726	2633732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62991	NC_020564	GTA	2	6	2633805	2633810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219821
62992	NC_020564	GTTT	2	8	2633833	2633840	0 %	75 %	25 %	0 %	470219821
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62994	NC_020564	AACTGA	2	12	2633967	2633978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470219821
62995	NC_020564	TAA	2	6	2634003	2634008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219821
62996	NC_020564	CAG	2	6	2634110	2634115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219821
62997	NC_020564	CTT	2	6	2634179	2634184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219821
62998	NC_020564	TTAA	2	8	2634214	2634221	50 %	50 %	0 %	0 %	470219821
62999	NC_020564	CTG	3	9	2634236	2634244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219821
63000	NC_020564	TAA	2	6	2634246	2634251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219821

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