MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_020564	TCAATT	2	12	2462770	2462781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470219695
59002	NC_020564	GTT	2	6	2462827	2462832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219695
59003	NC_020564	TTA	2	6	2462911	2462916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219695
59004	NC_020564	TCCT	2	8	2462964	2462971	0 %	50 %	0 %	50 %	470219695
59005	NC_020564	A	6	6	2462975	2462980	100 %	0 %	0 %	0 %	470219695
59006	NC_020564	ATAAA	2	10	2462998	2463007	80 %	20 %	0 %	0 %	470219695
59007	NC_020564	CAT	2	6	2463061	2463066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59008	NC_020564	TATG	2	8	2463132	2463139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59009	NC_020564	TTTG	2	8	2463159	2463166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59010	NC_020564	ATG	2	6	2463207	2463212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59011	NC_020564	TTA	2	6	2463213	2463218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59012	NC_020564	ATT	3	9	2463222	2463230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59013	NC_020564	T	6	6	2463262	2463267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59014	NC_020564	TAT	2	6	2463279	2463284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59015	NC_020564	GTT	2	6	2463295	2463300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59016	NC_020564	A	6	6	2463308	2463313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59017	NC_020564	ATT	2	6	2463332	2463337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59018	NC_020564	TAA	2	6	2463356	2463361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59019	NC_020564	TCA	2	6	2463438	2463443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59020	NC_020564	GACA	2	8	2463527	2463534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59021	NC_020564	A	7	7	2463540	2463546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59022	NC_020564	CAAC	2	8	2463547	2463554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59023	NC_020564	GTT	2	6	2463569	2463574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59024	NC_020564	TGT	3	9	2463590	2463598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59025	NC_020564	ATTA	2	8	2463619	2463626	50 %	50 %	0 %	0 %	470219696
59026	NC_020564	AT	5	10	2463720	2463729	50 %	50 %	0 %	0 %	470219696
59027	NC_020564	TGT	2	6	2463733	2463738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219696
59028	NC_020564	TTC	2	6	2463783	2463788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219696
59029	NC_020564	TTC	2	6	2463823	2463828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219696
59030	NC_020564	T	6	6	2463837	2463842	0 %	100 %	0 %	0 %	470219696
59031	NC_020564	ATA	2	6	2463876	2463881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219696
59032	NC_020564	TTC	2	6	2463888	2463893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219696
59033	NC_020564	GCT	2	6	2463940	2463945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219696
59034	NC_020564	TCC	2	6	2463985	2463990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219696
59035	NC_020564	ATA	2	6	2464010	2464015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219696
59036	NC_020564	TAC	2	6	2464047	2464052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219696
59037	NC_020564	TAT	2	6	2464058	2464063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219696
59038	NC_020564	TTC	2	6	2464146	2464151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219696
59039	NC_020564	CT	3	6	2464162	2464167	0 %	50 %	0 %	50 %	470219696
59040	NC_020564	TCA	2	6	2464217	2464222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219696
59041	NC_020564	TAT	2	6	2464251	2464256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59042	NC_020564	AT	3	6	2464255	2464260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59043	NC_020564	A	6	6	2464272	2464277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59044	NC_020564	A	6	6	2464308	2464313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59045	NC_020564	TAT	3	9	2464324	2464332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59046	NC_020564	ATT	2	6	2464355	2464360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59047	NC_020564	T	6	6	2464359	2464364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59048	NC_020564	AATC	2	8	2464426	2464433	50 %	25 %	0 %	25 %	470219697
59049	NC_020564	TTA	2	6	2464448	2464453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
59050	NC_020564	CAT	2	6	2464503	2464508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59051	NC_020564	ATCAT	2	10	2464529	2464538	40 %	40 %	0 %	20 %	470219697
59052	NC_020564	ATT	2	6	2464651	2464656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
59053	NC_020564	TGC	2	6	2464666	2464671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219697
59054	NC_020564	AAT	2	6	2464699	2464704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219697
59055	NC_020564	AT	3	6	2464732	2464737	50 %	50 %	0 %	0 %	470219697
59056	NC_020564	TCA	2	6	2464827	2464832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59057	NC_020564	T	6	6	2464839	2464844	0 %	100 %	0 %	0 %	470219697
59058	NC_020564	ATT	2	6	2464846	2464851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
59059	NC_020564	CAT	2	6	2464878	2464883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59060	NC_020564	CAT	3	9	2464930	2464938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59061	NC_020564	TGC	2	6	2465020	2465025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219697
59062	NC_020564	AAC	2	6	2465026	2465031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219697
59063	NC_020564	ATT	2	6	2465042	2465047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
59064	NC_020564	T	6	6	2465046	2465051	0 %	100 %	0 %	0 %	470219697
59065	NC_020564	ATTCA	2	10	2465053	2465062	40 %	40 %	0 %	20 %	470219697
59066	NC_020564	ATT	2	6	2465072	2465077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
59067	NC_020564	A	7	7	2465106	2465112	100 %	0 %	0 %	0 %	470219697
59068	NC_020564	CAGTG	2	10	2465146	2465155	20 %	20 %	40 %	20 %	470219697
59069	NC_020564	CAT	2	6	2465161	2465166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59070	NC_020564	TCAA	2	8	2465197	2465204	50 %	25 %	0 %	25 %	470219697
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59073	NC_020564	TTA	2	6	2465267	2465272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
59074	NC_020564	AATT	2	8	2465275	2465282	50 %	50 %	0 %	0 %	470219697
59075	NC_020564	TA	3	6	2465298	2465303	50 %	50 %	0 %	0 %	470219697
59076	NC_020564	ATGA	2	8	2465414	2465421	50 %	25 %	25 %	0 %	470219697
59077	NC_020564	ATATC	2	10	2465425	2465434	40 %	40 %	0 %	20 %	470219697
59078	NC_020564	ATC	2	6	2465447	2465452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59079	NC_020564	CAT	2	6	2465461	2465466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219697
59080	NC_020564	ATT	2	6	2465485	2465490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
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59082	NC_020564	TAG	2	6	2465535	2465540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219697
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59085	NC_020564	CAA	2	6	2465685	2465690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219697
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59089	NC_020564	TTA	2	6	2465895	2465900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219697
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59091	NC_020564	AAT	2	6	2466005	2466010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219697
59092	NC_020564	AT	3	6	2466052	2466057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59093	NC_020564	AC	5	10	2466065	2466074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59094	NC_020564	AACC	2	8	2466078	2466085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59095	NC_020564	TTGG	2	8	2466101	2466108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59096	NC_020564	T	6	6	2466109	2466114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59097	NC_020564	TAAC	2	8	2466136	2466143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59098	NC_020564	AGA	2	6	2466187	2466192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59102	NC_020564	AGG	2	6	2466325	2466330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59103	NC_020564	TAA	2	6	2466332	2466337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59104	NC_020564	TAC	2	6	2466351	2466356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219698
59105	NC_020564	GGT	2	6	2466358	2466363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219698
59106	NC_020564	TCT	2	6	2466398	2466403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219698
59107	NC_020564	ACC	2	6	2466423	2466428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219698
59108	NC_020564	ACA	2	6	2466524	2466529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219698
59109	NC_020564	AGA	2	6	2466534	2466539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219698
59110	NC_020564	T	6	6	2466540	2466545	0 %	100 %	0 %	0 %	470219698
59111	NC_020564	CTC	2	6	2466546	2466551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219698
59112	NC_020564	ACA	2	6	2466606	2466611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219698
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59119	NC_020564	ATCAA	2	10	2466821	2466830	60 %	20 %	0 %	20 %	470219698
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