MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_020564	ACA	2	6	2422587	2422592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219664
58002	NC_020564	CAA	2	6	2422621	2422626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219664
58003	NC_020564	ACCAA	2	10	2422671	2422680	60 %	0 %	0 %	40 %	470219664
58004	NC_020564	AT	3	6	2422689	2422694	50 %	50 %	0 %	0 %	470219664
58005	NC_020564	TCA	3	9	2422735	2422743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219664
58006	NC_020564	CAT	2	6	2422748	2422753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219664
58007	NC_020564	AAT	2	6	2422775	2422780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219664
58008	NC_020564	TAA	2	6	2422790	2422795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219664
58009	NC_020564	GCC	2	6	2422817	2422822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470219664
58010	NC_020564	CTTGT	2	10	2422867	2422876	0 %	60 %	20 %	20 %	470219664
58011	NC_020564	A	6	6	2422932	2422937	100 %	0 %	0 %	0 %	470219664
58012	NC_020564	TGT	2	6	2422940	2422945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219664
58013	NC_020564	ATA	2	6	2422986	2422991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219664
58014	NC_020564	TAA	2	6	2423024	2423029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219664
58015	NC_020564	A	6	6	2423033	2423038	100 %	0 %	0 %	0 %	470219664
58016	NC_020564	TAA	2	6	2423056	2423061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219664
58017	NC_020564	TTC	2	6	2423079	2423084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219664
58018	NC_020564	A	6	6	2423113	2423118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58019	NC_020564	AC	3	6	2423121	2423126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58020	NC_020564	A	6	6	2423161	2423166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58021	NC_020564	TTA	2	6	2423178	2423183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58022	NC_020564	AGT	2	6	2423222	2423227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58023	NC_020564	ATA	2	6	2423236	2423241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58024	NC_020564	AGG	2	6	2423250	2423255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58025	NC_020564	TCG	2	6	2423286	2423291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58026	NC_020564	ATT	2	6	2423338	2423343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58027	NC_020564	AAT	2	6	2423363	2423368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58028	NC_020564	ACTC	2	8	2423490	2423497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58029	NC_020564	T	7	7	2423516	2423522	0 %	100 %	0 %	0 %	470219665
58030	NC_020564	AGT	2	6	2423526	2423531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219665
58031	NC_020564	ATC	2	6	2423551	2423556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219665
58032	NC_020564	TAAT	2	8	2423597	2423604	50 %	50 %	0 %	0 %	470219665
58033	NC_020564	TAAT	2	8	2423637	2423644	50 %	50 %	0 %	0 %	470219665
58034	NC_020564	GAATT	2	10	2423649	2423658	40 %	40 %	20 %	0 %	470219665
58035	NC_020564	CAT	2	6	2423770	2423775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219665
58036	NC_020564	CGA	2	6	2423798	2423803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219665
58037	NC_020564	TAAG	2	8	2423809	2423816	50 %	25 %	25 %	0 %	470219665
58038	NC_020564	GTT	2	6	2423823	2423828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219665
58039	NC_020564	CAG	2	6	2423838	2423843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219665
58040	NC_020564	CAT	2	6	2423853	2423858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219665
58041	NC_020564	ACG	2	6	2423863	2423868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219665
58042	NC_020564	TTC	2	6	2423884	2423889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219665
58043	NC_020564	CAT	2	6	2423907	2423912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219665
58044	NC_020564	TTTA	2	8	2423914	2423921	25 %	75 %	0 %	0 %	470219665
58045	NC_020564	CCA	2	6	2423933	2423938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219665
58046	NC_020564	TA	3	6	2423967	2423972	50 %	50 %	0 %	0 %	470219665
58047	NC_020564	TTG	2	6	2423983	2423988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219665
58048	NC_020564	TAA	2	6	2424034	2424039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219665
58049	NC_020564	GAC	2	6	2424183	2424188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219665
58050	NC_020564	AATT	2	8	2424193	2424200	50 %	50 %	0 %	0 %	470219665
58051	NC_020564	GAT	2	6	2424262	2424267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58052	NC_020564	TTTTC	2	10	2424281	2424290	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58053	NC_020564	AT	3	6	2424292	2424297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58054	NC_020564	CATTTT	2	12	2424358	2424369	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58055	NC_020564	T	6	6	2424366	2424371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58056	NC_020564	ACC	2	6	2424392	2424397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58057	NC_020564	TAA	2	6	2424398	2424403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58058	NC_020564	A	6	6	2424447	2424452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58059	NC_020564	TAA	2	6	2424481	2424486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58060	NC_020564	CCT	2	6	2424492	2424497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58061	NC_020564	TA	3	6	2424506	2424511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58062	NC_020564	T	6	6	2424579	2424584	0 %	100 %	0 %	0 %	470219666
58063	NC_020564	ATG	2	6	2424591	2424596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219666
58064	NC_020564	CTA	2	6	2424626	2424631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219666
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58067	NC_020564	CTT	2	6	2424710	2424715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219666
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58069	NC_020564	CTT	2	6	2424797	2424802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219666
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58073	NC_020564	TCT	2	6	2425072	2425077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219666
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58078	NC_020564	AAT	2	6	2425224	2425229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219666
58079	NC_020564	ATA	2	6	2425246	2425251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219666
58080	NC_020564	TA	4	8	2425335	2425342	50 %	50 %	0 %	0 %	470219666
58081	NC_020564	ACC	2	6	2425408	2425413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58082	NC_020564	TAGTA	2	10	2425420	2425429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58083	NC_020564	ATGA	2	8	2425438	2425445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58084	NC_020564	ATTTTA	2	12	2425449	2425460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58085	NC_020564	ATTC	2	8	2425506	2425513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58086	NC_020564	AAT	2	6	2425526	2425531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58087	NC_020564	ATTT	2	8	2425549	2425556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58088	NC_020564	TAG	2	6	2425576	2425581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58089	NC_020564	GCC	2	6	2425634	2425639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58090	NC_020564	TA	3	6	2425732	2425737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58091	NC_020564	GAA	2	6	2425738	2425743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58092	NC_020564	TCTAC	2	10	2425775	2425784	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58093	NC_020564	CT	3	6	2425789	2425794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58094	NC_020564	TCC	2	6	2425808	2425813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58095	NC_020564	TATT	2	8	2425816	2425823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58096	NC_020564	CTTA	2	8	2425857	2425864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58097	NC_020564	T	6	6	2425894	2425899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58098	NC_020564	TAA	2	6	2425939	2425944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58099	NC_020564	AAAG	2	8	2426012	2426019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58100	NC_020564	AT	3	6	2426040	2426045	50 %	50 %	0 %	0 %	470219667
58101	NC_020564	GCA	2	6	2426065	2426070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219667
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58104	NC_020564	AAC	2	6	2426161	2426166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219667
58105	NC_020564	CAA	2	6	2426179	2426184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219667
58106	NC_020564	AGA	2	6	2426223	2426228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219667
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58108	NC_020564	CAA	2	6	2426335	2426340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219667
58109	NC_020564	TAACT	2	10	2426370	2426379	40 %	40 %	0 %	20 %	470219667
58110	NC_020564	A	7	7	2426387	2426393	100 %	0 %	0 %	0 %	470219667
58111	NC_020564	CAA	2	6	2426434	2426439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219667
58112	NC_020564	TCT	2	6	2426461	2426466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219667
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58118	NC_020564	TAG	2	6	2426792	2426797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219667
58119	NC_020564	AAAG	2	8	2426814	2426821	75 %	0 %	25 %	0 %	470219667
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58121	NC_020564	CAC	2	6	2426855	2426860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219667
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58357	NC_020564	TATC	2	8	2437056	2437063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58358	NC_020564	TAT	2	6	2437101	2437106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58359	NC_020564	CTG	2	6	2437121	2437126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219677
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58484	NC_020564	ATGC	2	8	2442394	2442401	25 %	25 %	25 %	25 %	470219679
58485	NC_020564	AAC	2	6	2442482	2442487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219679
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