MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_020564	TAA	3	9	2400154	2400162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219647
57502	NC_020564	AT	3	6	2400174	2400179	50 %	50 %	0 %	0 %	470219647
57503	NC_020564	GTA	2	6	2400212	2400217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219647
57504	NC_020564	TAA	2	6	2400232	2400237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219647
57505	NC_020564	TTA	2	6	2400255	2400260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219647
57506	NC_020564	CATC	2	8	2400324	2400331	25 %	25 %	0 %	50 %	470219647
57507	NC_020564	A	6	6	2400367	2400372	100 %	0 %	0 %	0 %	470219647
57508	NC_020564	AAT	2	6	2400379	2400384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219647
57509	NC_020564	ATA	2	6	2400396	2400401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219647
57510	NC_020564	TTTC	2	8	2400422	2400429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57511	NC_020564	ATAACG	2	12	2400469	2400480	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57512	NC_020564	ATG	2	6	2400551	2400556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219648
57513	NC_020564	ATT	2	6	2400629	2400634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219648
57514	NC_020564	AAT	2	6	2400677	2400682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219648
57515	NC_020564	ATA	2	6	2400814	2400819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219648
57516	NC_020564	AT	3	6	2400879	2400884	50 %	50 %	0 %	0 %	470219648
57517	NC_020564	T	6	6	2400893	2400898	0 %	100 %	0 %	0 %	470219648
57518	NC_020564	TCA	2	6	2400952	2400957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219648
57519	NC_020564	CTA	2	6	2400973	2400978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219648
57520	NC_020564	GAT	2	6	2400994	2400999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219648
57521	NC_020564	TTC	2	6	2401013	2401018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219648
57522	NC_020564	TGT	2	6	2401062	2401067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219648
57523	NC_020564	AT	3	6	2401071	2401076	50 %	50 %	0 %	0 %	470219648
57524	NC_020564	T	6	6	2401094	2401099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57525	NC_020564	CGC	2	6	2401220	2401225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470219649
57526	NC_020564	TAC	2	6	2401241	2401246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219649
57527	NC_020564	TG	3	6	2401280	2401285	0 %	50 %	50 %	0 %	470219649
57528	NC_020564	TAA	2	6	2401326	2401331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219649
57529	NC_020564	TCA	2	6	2401430	2401435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219649
57530	NC_020564	TTC	2	6	2401521	2401526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219649
57531	NC_020564	GTG	2	6	2401598	2401603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219649
57532	NC_020564	CAATC	2	10	2401706	2401715	40 %	20 %	0 %	40 %	470219649
57533	NC_020564	CTT	2	6	2401751	2401756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219649
57534	NC_020564	AT	3	6	2401775	2401780	50 %	50 %	0 %	0 %	470219649
57535	NC_020564	CTG	2	6	2401814	2401819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219649
57536	NC_020564	CAT	2	6	2401844	2401849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219649
57537	NC_020564	ATA	2	6	2401850	2401855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219649
57538	NC_020564	TCA	2	6	2402056	2402061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219649
57539	NC_020564	GCAAC	2	10	2402092	2402101	40 %	0 %	20 %	40 %	470219649
57540	NC_020564	CAT	2	6	2402139	2402144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219649
57541	NC_020564	TCT	3	9	2402173	2402181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219649
57542	NC_020564	T	6	6	2402183	2402188	0 %	100 %	0 %	0 %	470219649
57543	NC_020564	ACC	2	6	2402220	2402225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219649
57544	NC_020564	TTCAAT	2	12	2402256	2402267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470219649
57545	NC_020564	GTT	2	6	2402329	2402334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219649
57546	NC_020564	ATA	2	6	2402364	2402369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219649
57547	NC_020564	TTA	2	6	2402375	2402380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219649
57548	NC_020564	A	6	6	2402399	2402404	100 %	0 %	0 %	0 %	470219649
57549	NC_020564	ACC	2	6	2402478	2402483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219649
57550	NC_020564	CCT	2	6	2402682	2402687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219650
57551	NC_020564	ATA	2	6	2402737	2402742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219650
57552	NC_020564	TCC	2	6	2402770	2402775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219650
57553	NC_020564	TG	3	6	2402817	2402822	0 %	50 %	50 %	0 %	470219650
57554	NC_020564	ACC	2	6	2402824	2402829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219650
57555	NC_020564	ACA	2	6	2402939	2402944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219650
57556	NC_020564	ACC	2	6	2403028	2403033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219650
57557	NC_020564	TTA	2	6	2403056	2403061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219650
57558	NC_020564	ACC	2	6	2403130	2403135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219650
57559	NC_020564	GGC	2	6	2403170	2403175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470219650
57560	NC_020564	TA	3	6	2403186	2403191	50 %	50 %	0 %	0 %	470219650
57561	NC_020564	TTG	2	6	2403211	2403216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219650
57562	NC_020564	ATA	2	6	2403235	2403240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219650
57563	NC_020564	TCG	2	6	2403307	2403312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57564	NC_020564	CTG	2	6	2403339	2403344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57565	NC_020564	CAG	2	6	2403396	2403401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57566	NC_020564	TTC	2	6	2403442	2403447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57567	NC_020564	ATC	2	6	2403562	2403567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219650
57568	NC_020564	TTC	2	6	2403604	2403609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57569	NC_020564	GCT	2	6	2404022	2404027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57570	NC_020564	TGT	2	6	2404102	2404107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219650
57571	NC_020564	TCT	2	6	2404127	2404132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57572	NC_020564	TAA	2	6	2404159	2404164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219650
57573	NC_020564	GAT	2	6	2404260	2404265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219650
57574	NC_020564	TCT	2	6	2404283	2404288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57575	NC_020564	GTTT	2	8	2404301	2404308	0 %	75 %	25 %	0 %	470219650
57576	NC_020564	CTT	2	6	2404374	2404379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57577	NC_020564	ACA	2	6	2404386	2404391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219650
57578	NC_020564	TTA	2	6	2404400	2404405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219650
57579	NC_020564	ATG	2	6	2404416	2404421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219650
57580	NC_020564	AACC	2	8	2404424	2404431	50 %	0 %	0 %	50 %	470219650
57581	NC_020564	GCT	2	6	2404439	2404444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57582	NC_020564	GTG	2	6	2404584	2404589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219650
57583	NC_020564	GAC	2	6	2404638	2404643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57584	NC_020564	CCA	2	6	2404676	2404681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219650
57585	NC_020564	CATAA	2	10	2404700	2404709	60 %	20 %	0 %	20 %	470219650
57586	NC_020564	ACA	2	6	2404838	2404843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219650
57587	NC_020564	CTT	2	6	2404866	2404871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57588	NC_020564	TCG	2	6	2404901	2404906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57589	NC_020564	ACG	2	6	2404936	2404941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57590	NC_020564	GAATT	2	10	2405071	2405080	40 %	40 %	20 %	0 %	470219650
57591	NC_020564	TCT	2	6	2405138	2405143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57592	NC_020564	CTT	2	6	2405164	2405169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57593	NC_020564	TCT	2	6	2405171	2405176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57594	NC_020564	TAC	2	6	2405206	2405211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219650
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57596	NC_020564	TGT	2	6	2405263	2405268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219650
57597	NC_020564	TTCATC	2	12	2405317	2405328	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470219650
57598	NC_020564	GCA	2	6	2405444	2405449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57599	NC_020564	ATA	2	6	2405603	2405608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219650
57600	NC_020564	ATG	2	6	2405613	2405618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219650
57601	NC_020564	GGT	2	6	2405681	2405686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219650
57602	NC_020564	CAC	2	6	2405721	2405726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219650
57603	NC_020564	TGA	2	6	2405736	2405741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219650
57604	NC_020564	CTG	2	6	2405751	2405756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57605	NC_020564	T	7	7	2405818	2405824	0 %	100 %	0 %	0 %	470219650
57606	NC_020564	TGC	2	6	2405842	2405847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57607	NC_020564	GCTT	2	8	2405903	2405910	0 %	50 %	25 %	25 %	470219650
57608	NC_020564	CAA	2	6	2405937	2405942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219650
57609	NC_020564	GCA	2	6	2405954	2405959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
57610	NC_020564	TCT	2	6	2405978	2405983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
57611	NC_020564	AT	3	6	2406020	2406025	50 %	50 %	0 %	0 %	470219650
57612	NC_020564	TTG	2	6	2406136	2406141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219650
57613	NC_020564	TGT	2	6	2406214	2406219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219650
57614	NC_020564	CTT	2	6	2406225	2406230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
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57616	NC_020564	TACTTT	2	12	2406273	2406284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470219650
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57731	NC_020564	AT	3	6	2411304	2411309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57732	NC_020564	ATTT	2	8	2411325	2411332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57733	NC_020564	AGCA	2	8	2411334	2411341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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57979	NC_020564	TCA	2	6	2421784	2421789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219664
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57981	NC_020564	TAAT	2	8	2421862	2421869	50 %	50 %	0 %	0 %	470219664
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