MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55502	NC_020564	T	6	6	2319377	2319382	0 %	100 %	0 %	0 %	470219582
55503	NC_020564	AAAT	2	8	2319431	2319438	75 %	25 %	0 %	0 %	470219582
55504	NC_020564	CCAATC	2	12	2319447	2319458	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	470219582
55505	NC_020564	TG	3	6	2319474	2319479	0 %	50 %	50 %	0 %	470219582
55506	NC_020564	ATA	2	6	2319515	2319520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219582
55507	NC_020564	CAAA	2	8	2319523	2319530	75 %	0 %	0 %	25 %	470219582
55508	NC_020564	TC	3	6	2319600	2319605	0 %	50 %	0 %	50 %	470219582
55509	NC_020564	T	7	7	2319633	2319639	0 %	100 %	0 %	0 %	470219582
55510	NC_020564	TAA	2	6	2319669	2319674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55511	NC_020564	ACA	2	6	2319724	2319729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219583
55512	NC_020564	ATA	2	6	2319768	2319773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219583
55513	NC_020564	TGAAT	2	10	2319835	2319844	40 %	40 %	20 %	0 %	470219583
55514	NC_020564	CAT	2	6	2319864	2319869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219583
55515	NC_020564	AT	3	6	2319868	2319873	50 %	50 %	0 %	0 %	470219583
55516	NC_020564	TAT	2	6	2319896	2319901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219583
55517	NC_020564	ACT	2	6	2319913	2319918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219583
55518	NC_020564	TAA	2	6	2319919	2319924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219583
55519	NC_020564	ATT	2	6	2320000	2320005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219583
55520	NC_020564	TTAT	2	8	2320059	2320066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55521	NC_020564	TTA	2	6	2320078	2320083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55522	NC_020564	TTC	2	6	2320107	2320112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55523	NC_020564	TA	3	6	2320174	2320179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55524	NC_020564	AT	3	6	2320253	2320258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55525	NC_020564	AT	3	6	2320261	2320266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55526	NC_020564	AT	3	6	2320269	2320274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55527	NC_020564	T	6	6	2320298	2320303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55528	NC_020564	A	7	7	2320317	2320323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55529	NC_020564	AAAC	2	8	2320351	2320358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55530	NC_020564	ACA	2	6	2320419	2320424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55531	NC_020564	TAA	2	6	2320436	2320441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55532	NC_020564	AT	3	6	2320443	2320448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55533	NC_020564	ATAG	2	8	2320493	2320500	50 %	25 %	25 %	0 %	470219584
55534	NC_020564	AT	3	6	2320510	2320515	50 %	50 %	0 %	0 %	470219584
55535	NC_020564	A	7	7	2320527	2320533	100 %	0 %	0 %	0 %	470219584
55536	NC_020564	TTA	2	6	2320601	2320606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219584
55537	NC_020564	CAT	2	6	2320617	2320622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219584
55538	NC_020564	AT	3	6	2320680	2320685	50 %	50 %	0 %	0 %	470219584
55539	NC_020564	CAT	2	6	2320704	2320709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219584
55540	NC_020564	TAC	2	6	2320777	2320782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219584
55541	NC_020564	TA	3	6	2320870	2320875	50 %	50 %	0 %	0 %	470219584
55542	NC_020564	ATT	2	6	2320978	2320983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219584
55543	NC_020564	TTA	2	6	2321016	2321021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219584
55544	NC_020564	CAAT	2	8	2321048	2321055	50 %	25 %	0 %	25 %	470219584
55545	NC_020564	TGA	2	6	2321068	2321073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219584
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55547	NC_020564	TGA	2	6	2321161	2321166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219584
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55550	NC_020564	TAT	2	6	2321231	2321236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219584
55551	NC_020564	CAT	2	6	2321262	2321267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219584
55552	NC_020564	TA	3	6	2321351	2321356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55553	NC_020564	ATA	2	6	2321376	2321381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55554	NC_020564	CAT	2	6	2321389	2321394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55555	NC_020564	AAAC	2	8	2321479	2321486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55556	NC_020564	ATTC	2	8	2321502	2321509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55557	NC_020564	AT	3	6	2321511	2321516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55558	NC_020564	TAA	2	6	2321535	2321540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55559	NC_020564	T	6	6	2321546	2321551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55560	NC_020564	ATA	2	6	2321580	2321585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55561	NC_020564	A	7	7	2321637	2321643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55562	NC_020564	TAA	2	6	2321680	2321685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55563	NC_020564	ATT	2	6	2321746	2321751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219585
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55573	NC_020564	TAA	2	6	2322070	2322075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219585
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55586	NC_020564	TTAA	2	8	2322647	2322654	50 %	50 %	0 %	0 %	470219585
55587	NC_020564	AAATTC	2	12	2322664	2322675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470219585
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55589	NC_020564	AT	3	6	2322773	2322778	50 %	50 %	0 %	0 %	470219585
55590	NC_020564	CTCA	2	8	2322796	2322803	25 %	25 %	0 %	50 %	470219585
55591	NC_020564	AT	3	6	2322825	2322830	50 %	50 %	0 %	0 %	470219585
55592	NC_020564	CTG	2	6	2322852	2322857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219585
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55594	NC_020564	TGT	2	6	2322898	2322903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219585
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55600	NC_020564	TGAT	2	8	2323129	2323136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55601	NC_020564	TAAA	2	8	2323139	2323146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55602	NC_020564	A	7	7	2323152	2323158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55603	NC_020564	ACT	2	6	2323234	2323239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55604	NC_020564	ATT	2	6	2323268	2323273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55605	NC_020564	A	6	6	2323287	2323292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55606	NC_020564	A	6	6	2323295	2323300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55607	NC_020564	TAA	2	6	2323364	2323369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55610	NC_020564	TAT	2	6	2323509	2323514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55611	NC_020564	ATT	2	6	2323548	2323553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55612	NC_020564	TAT	2	6	2323557	2323562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55613	NC_020564	ATTA	2	8	2323611	2323618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55614	NC_020564	TCA	2	6	2323664	2323669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55615	NC_020564	ATC	2	6	2323678	2323683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55616	NC_020564	ATTG	2	8	2323710	2323717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55617	NC_020564	A	7	7	2323718	2323724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55618	NC_020564	AGG	2	6	2323728	2323733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55619	NC_020564	TCA	2	6	2323738	2323743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55621	NC_020564	ATT	2	6	2323785	2323790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55623	NC_020564	ATC	2	6	2323896	2323901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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