MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_020564	TAC	2	6	2256249	2256254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219535
54002	NC_020564	GTAATG	2	12	2256275	2256286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219535
54003	NC_020564	CAC	2	6	2256314	2256319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219535
54004	NC_020564	AT	3	6	2256361	2256366	50 %	50 %	0 %	0 %	470219535
54005	NC_020564	CCA	3	9	2256502	2256510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219535
54006	NC_020564	GTT	2	6	2256537	2256542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219535
54007	NC_020564	T	6	6	2256552	2256557	0 %	100 %	0 %	0 %	470219535
54008	NC_020564	TAA	2	6	2256570	2256575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219535
54009	NC_020564	ACG	2	6	2256630	2256635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219535
54010	NC_020564	CCT	2	6	2256681	2256686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54011	NC_020564	TTA	2	6	2256701	2256706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54012	NC_020564	CTT	2	6	2256727	2256732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54013	NC_020564	TCT	2	6	2256752	2256757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54014	NC_020564	TTTG	2	8	2256758	2256765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54015	NC_020564	T	6	6	2256791	2256796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54016	NC_020564	TTC	2	6	2256848	2256853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54017	NC_020564	AGA	2	6	2256929	2256934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54018	NC_020564	CCT	2	6	2256990	2256995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219536
54019	NC_020564	T	6	6	2257000	2257005	0 %	100 %	0 %	0 %	470219536
54020	NC_020564	AGC	3	9	2257006	2257014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219536
54021	NC_020564	ACT	2	6	2257139	2257144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219536
54022	NC_020564	T	6	6	2257150	2257155	0 %	100 %	0 %	0 %	470219536
54023	NC_020564	GTT	2	6	2257158	2257163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219536
54024	NC_020564	ATA	2	6	2257173	2257178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219536
54025	NC_020564	ACG	2	6	2257282	2257287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219536
54026	NC_020564	CTT	2	6	2257316	2257321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219536
54027	NC_020564	ACC	2	6	2257342	2257347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219536
54028	NC_020564	CTG	2	6	2257434	2257439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219536
54029	NC_020564	TAT	2	6	2257512	2257517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219536
54030	NC_020564	CAT	2	6	2257587	2257592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219536
54031	NC_020564	TCC	2	6	2257611	2257616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54032	NC_020564	CTT	2	6	2257622	2257627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54033	NC_020564	ATT	2	6	2257628	2257633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219537
54034	NC_020564	T	6	6	2257641	2257646	0 %	100 %	0 %	0 %	470219537
54035	NC_020564	CTA	2	6	2257664	2257669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219537
54036	NC_020564	T	6	6	2257674	2257679	0 %	100 %	0 %	0 %	470219537
54037	NC_020564	ACT	2	6	2257735	2257740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219537
54038	NC_020564	T	6	6	2257787	2257792	0 %	100 %	0 %	0 %	470219537
54039	NC_020564	ACCTTT	2	12	2257914	2257925	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470219537
54040	NC_020564	CTT	2	6	2257979	2257984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219537
54041	NC_020564	TGC	2	6	2258043	2258048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219537
54042	NC_020564	T	6	6	2258055	2258060	0 %	100 %	0 %	0 %	470219537
54043	NC_020564	TTA	2	6	2258080	2258085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219537
54044	NC_020564	TTA	2	6	2258092	2258097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219537
54045	NC_020564	T	6	6	2258109	2258114	0 %	100 %	0 %	0 %	470219537
54046	NC_020564	T	6	6	2258121	2258126	0 %	100 %	0 %	0 %	470219537
54047	NC_020564	ACA	2	6	2258188	2258193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219537
54048	NC_020564	CTA	2	6	2258207	2258212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219537
54049	NC_020564	TTC	2	6	2258267	2258272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219537
54050	NC_020564	CCT	2	6	2258302	2258307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54051	NC_020564	TAT	2	6	2258317	2258322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54052	NC_020564	TG	3	6	2258417	2258422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54053	NC_020564	GTT	2	6	2258426	2258431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54054	NC_020564	GCACG	2	10	2258462	2258471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54055	NC_020564	GAT	2	6	2258472	2258477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54056	NC_020564	TCT	2	6	2258555	2258560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54057	NC_020564	CTG	2	6	2258561	2258566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54058	NC_020564	ATCA	2	8	2258571	2258578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54059	NC_020564	TCTGAT	2	12	2258601	2258612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54060	NC_020564	T	6	6	2258612	2258617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54061	NC_020564	CCT	2	6	2258635	2258640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54062	NC_020564	GT	3	6	2258712	2258717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54063	NC_020564	GTTA	2	8	2258757	2258764	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54064	NC_020564	TA	3	6	2258846	2258851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54065	NC_020564	T	6	6	2258880	2258885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54066	NC_020564	CTT	2	6	2258891	2258896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54067	NC_020564	TAT	3	9	2258925	2258933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54068	NC_020564	ATT	2	6	2258942	2258947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54069	NC_020564	TA	3	6	2258949	2258954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54070	NC_020564	GGT	2	6	2258970	2258975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54071	NC_020564	GAAT	2	8	2258976	2258983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54072	NC_020564	T	6	6	2259061	2259066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54073	NC_020564	TAT	2	6	2259139	2259144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54074	NC_020564	ATT	2	6	2259145	2259150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54075	NC_020564	ATT	2	6	2259185	2259190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54076	NC_020564	TAG	2	6	2259204	2259209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54077	NC_020564	T	6	6	2259214	2259219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54078	NC_020564	ATC	2	6	2259224	2259229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54079	NC_020564	CTT	2	6	2259232	2259237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54080	NC_020564	ATTTT	2	10	2259257	2259266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54081	NC_020564	TAT	2	6	2259294	2259299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54082	NC_020564	TA	3	6	2259311	2259316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54083	NC_020564	TAA	2	6	2259319	2259324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54084	NC_020564	AC	3	6	2259342	2259347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54085	NC_020564	AAT	2	6	2259369	2259374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54086	NC_020564	TA	3	6	2259397	2259402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54087	NC_020564	AGA	2	6	2259407	2259412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54088	NC_020564	CAA	2	6	2259421	2259426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54089	NC_020564	AAG	2	6	2259433	2259438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54090	NC_020564	ATA	2	6	2259469	2259474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54091	NC_020564	CTT	2	6	2259493	2259498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54092	NC_020564	A	6	6	2259519	2259524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54093	NC_020564	T	6	6	2259548	2259553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54094	NC_020564	GAAT	2	8	2259590	2259597	50 %	25 %	25 %	0 %	470219538
54095	NC_020564	ATAC	2	8	2259608	2259615	50 %	25 %	0 %	25 %	470219538
54096	NC_020564	CTT	2	6	2259629	2259634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219538
54097	NC_020564	T	6	6	2259639	2259644	0 %	100 %	0 %	0 %	470219538
54098	NC_020564	AAAT	2	8	2259671	2259678	75 %	25 %	0 %	0 %	470219538
54099	NC_020564	CAT	2	6	2259717	2259722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219538
54100	NC_020564	AATG	2	8	2259732	2259739	50 %	25 %	25 %	0 %	470219538
54101	NC_020564	ACC	2	6	2259805	2259810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219538
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54104	NC_020564	AAG	2	6	2259953	2259958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219538
54105	NC_020564	TTG	2	6	2259959	2259964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219538
54106	NC_020564	GTT	2	6	2259967	2259972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219538
54107	NC_020564	TAT	2	6	2260040	2260045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219538
54108	NC_020564	ATA	2	6	2260051	2260056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219538
54109	NC_020564	CTA	2	6	2260076	2260081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219538
54110	NC_020564	AATA	2	8	2260107	2260114	75 %	25 %	0 %	0 %	470219538
54111	NC_020564	TAA	2	6	2260149	2260154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219538
54112	NC_020564	GCA	2	6	2260183	2260188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219538
54113	NC_020564	AATC	2	8	2260242	2260249	50 %	25 %	0 %	25 %	470219538
54114	NC_020564	TGA	2	6	2260274	2260279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219538
54115	NC_020564	TAA	2	6	2260331	2260336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219538
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54119	NC_020564	TAA	3	9	2260502	2260510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219538
54120	NC_020564	ACA	2	6	2260606	2260611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219538
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54122	NC_020564	TCT	2	6	2260750	2260755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219538
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54226	NC_020564	AAAAC	2	10	2265389	2265398	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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54230	NC_020564	AT	3	6	2265552	2265557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54231	NC_020564	TCG	2	6	2265559	2265564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54237	NC_020564	ATAA	2	8	2265803	2265810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54238	NC_020564	TGT	2	6	2265840	2265845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54239	NC_020564	ATTTT	2	10	2265885	2265894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54240	NC_020564	AAT	2	6	2265937	2265942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219542
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54242	NC_020564	GTC	2	6	2265968	2265973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219542
54243	NC_020564	AAT	2	6	2266021	2266026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219542
54244	NC_020564	CAA	2	6	2266057	2266062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219542
54245	NC_020564	GTC	2	6	2266064	2266069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219542
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54250	NC_020564	CTTT	2	8	2266174	2266181	0 %	75 %	0 %	25 %	470219542
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54261	NC_020564	TGACT	2	10	2266722	2266731	20 %	40 %	20 %	20 %	470219542
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54346	NC_020564	TTGCCC	2	12	2270261	2270272	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470219543
54347	NC_020564	CAA	3	9	2270335	2270343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219543
54348	NC_020564	TTTATC	2	12	2270348	2270359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470219543
54349	NC_020564	GTG	2	6	2270380	2270385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219543
54350	NC_020564	TTG	2	6	2270392	2270397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219543
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54353	NC_020564	TTCA	2	8	2270549	2270556	25 %	50 %	0 %	25 %	470219543
54354	NC_020564	T	6	6	2270570	2270575	0 %	100 %	0 %	0 %	470219543
54355	NC_020564	AATTT	2	10	2270670	2270679	40 %	60 %	0 %	0 %	470219543
54356	NC_020564	T	6	6	2270690	2270695	0 %	100 %	0 %	0 %	470219543
54357	NC_020564	TTC	2	6	2270702	2270707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219543
54358	NC_020564	TAT	2	6	2270725	2270730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219543
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54360	NC_020564	TTG	3	9	2270869	2270877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219543
54361	NC_020564	GTA	2	6	2270908	2270913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219543
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54417	NC_020564	TTG	2	6	2273913	2273918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54482	NC_020564	TTC	2	6	2276761	2276766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219547
54483	NC_020564	TGA	2	6	2276848	2276853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219547
54484	NC_020564	ATA	2	6	2276938	2276943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219547
54485	NC_020564	TGC	2	6	2276993	2276998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219547
54486	NC_020564	CCAT	2	8	2277046	2277053	25 %	25 %	0 %	50 %	470219547
54487	NC_020564	ATC	2	6	2277136	2277141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219547
54488	NC_020564	AAC	2	6	2277160	2277165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219547
54489	NC_020564	ATT	2	6	2277241	2277246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219547
54490	NC_020564	GATT	2	8	2277247	2277254	25 %	50 %	25 %	0 %	470219547
54491	NC_020564	ATC	2	6	2277265	2277270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219547
54492	NC_020564	CAT	2	6	2277309	2277314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219547
54493	NC_020564	T	6	6	2277332	2277337	0 %	100 %	0 %	0 %	470219547
54494	NC_020564	GATTT	2	10	2277382	2277391	20 %	60 %	20 %	0 %	470219547
54495	NC_020564	T	8	8	2277453	2277460	0 %	100 %	0 %	0 %	470219547
54496	NC_020564	TCA	2	6	2277500	2277505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219547
54497	NC_020564	ATC	2	6	2277541	2277546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219547
54498	NC_020564	AAT	2	6	2277570	2277575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219547
54499	NC_020564	CCT	2	6	2277668	2277673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54500	NC_020564	AAT	2	6	2277769	2277774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219548

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