MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_020564	ATG	2	6	2235831	2235836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53502	NC_020564	CTT	2	6	2235884	2235889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53503	NC_020564	T	6	6	2235936	2235941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53504	NC_020564	TTG	2	6	2236024	2236029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53505	NC_020564	TTTGT	2	10	2236040	2236049	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53506	NC_020564	TTTATA	2	12	2236090	2236101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53507	NC_020564	TTC	2	6	2236105	2236110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53508	NC_020564	T	6	6	2236121	2236126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53509	NC_020564	T	7	7	2236153	2236159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53510	NC_020564	CTC	2	6	2236175	2236180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53511	NC_020564	ATGG	2	8	2236201	2236208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53512	NC_020564	ATTA	2	8	2236213	2236220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53513	NC_020564	T	6	6	2236345	2236350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53514	NC_020564	TAC	2	6	2236377	2236382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53515	NC_020564	ATG	2	6	2236389	2236394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53516	NC_020564	ATC	2	6	2236431	2236436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53517	NC_020564	TCT	2	6	2236490	2236495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53518	NC_020564	GAA	2	6	2236519	2236524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53519	NC_020564	TCA	2	6	2236565	2236570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53520	NC_020564	TAA	2	6	2236576	2236581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53521	NC_020564	ATG	2	6	2236657	2236662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53522	NC_020564	TAA	2	6	2236668	2236673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53523	NC_020564	AGTA	2	8	2236674	2236681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53524	NC_020564	TTG	2	6	2236774	2236779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219521
53525	NC_020564	TCAA	2	8	2236858	2236865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53526	NC_020564	ATTTTG	2	12	2236879	2236890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53527	NC_020564	TTAAT	2	10	2236898	2236907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53528	NC_020564	ATGA	2	8	2236918	2236925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53529	NC_020564	CAT	2	6	2236951	2236956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53530	NC_020564	ATC	2	6	2236968	2236973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53531	NC_020564	ATT	2	6	2237027	2237032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53532	NC_020564	CAT	2	6	2237033	2237038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53533	NC_020564	TATC	2	8	2237063	2237070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53534	NC_020564	ATC	2	6	2237085	2237090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53535	NC_020564	AAT	2	6	2237129	2237134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53536	NC_020564	TAATT	2	10	2237146	2237155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53537	NC_020564	TG	3	6	2237161	2237166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53538	NC_020564	GTT	2	6	2237207	2237212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53539	NC_020564	ATTG	2	8	2237270	2237277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53540	NC_020564	ACATTC	2	12	2237347	2237358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53541	NC_020564	CTTTTT	2	12	2237376	2237387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53542	NC_020564	AAT	2	6	2237395	2237400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53543	NC_020564	AGT	2	6	2237430	2237435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53544	NC_020564	ATA	2	6	2237484	2237489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53545	NC_020564	TAAA	2	8	2237542	2237549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53546	NC_020564	TAAA	2	8	2237551	2237558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53547	NC_020564	AGT	2	6	2237613	2237618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53548	NC_020564	CTT	2	6	2237674	2237679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53549	NC_020564	TGA	2	6	2237697	2237702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53550	NC_020564	ACA	2	6	2237778	2237783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53551	NC_020564	TAG	2	6	2237868	2237873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53552	NC_020564	TAT	2	6	2237877	2237882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53553	NC_020564	GAT	2	6	2237907	2237912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53554	NC_020564	ATA	2	6	2237916	2237921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53555	NC_020564	AAT	2	6	2237928	2237933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53556	NC_020564	CTT	2	6	2237949	2237954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53557	NC_020564	ATT	2	6	2237975	2237980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53558	NC_020564	TTC	2	6	2237990	2237995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53559	NC_020564	ATC	2	6	2237997	2238002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53560	NC_020564	TAA	2	6	2238088	2238093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53561	NC_020564	TTG	2	6	2238130	2238135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53562	NC_020564	ATT	2	6	2238202	2238207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53563	NC_020564	A	7	7	2238252	2238258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53564	NC_020564	GATA	2	8	2238276	2238283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53565	NC_020564	TAAA	2	8	2238299	2238306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53566	NC_020564	AGA	2	6	2238321	2238326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53567	NC_020564	GAA	2	6	2238343	2238348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53568	NC_020564	CATAC	2	10	2238395	2238404	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53569	NC_020564	TAG	2	6	2238406	2238411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53570	NC_020564	TAT	2	6	2238529	2238534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53571	NC_020564	CAA	2	6	2238547	2238552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53572	NC_020564	AAG	2	6	2238557	2238562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53573	NC_020564	GAC	2	6	2238593	2238598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53574	NC_020564	ATC	2	6	2238626	2238631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53575	NC_020564	AGG	2	6	2238676	2238681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53576	NC_020564	TA	3	6	2238723	2238728	50 %	50 %	0 %	0 %	470219522
53577	NC_020564	A	6	6	2238837	2238842	100 %	0 %	0 %	0 %	470219522
53578	NC_020564	AGA	2	6	2238878	2238883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219522
53579	NC_020564	ATT	3	9	2238937	2238945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219522
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53581	NC_020564	TAAGT	2	10	2238953	2238962	40 %	40 %	20 %	0 %	470219522
53582	NC_020564	AAT	2	6	2239005	2239010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219522
53583	NC_020564	TGAC	2	8	2239081	2239088	25 %	25 %	25 %	25 %	470219522
53584	NC_020564	TCT	2	6	2239164	2239169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219522
53585	NC_020564	TA	3	6	2239189	2239194	50 %	50 %	0 %	0 %	470219522
53586	NC_020564	AATT	2	8	2239220	2239227	50 %	50 %	0 %	0 %	470219522
53587	NC_020564	AAT	2	6	2239275	2239280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219522
53588	NC_020564	CAT	2	6	2239288	2239293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219522
53589	NC_020564	A	7	7	2239350	2239356	100 %	0 %	0 %	0 %	470219522
53590	NC_020564	TCCT	2	8	2239369	2239376	0 %	50 %	0 %	50 %	470219522
53591	NC_020564	ATT	2	6	2239455	2239460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219522
53592	NC_020564	ATTAA	2	10	2239527	2239536	60 %	40 %	0 %	0 %	470219522
53593	NC_020564	ATT	2	6	2239539	2239544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219522
53594	NC_020564	AT	3	6	2239547	2239552	50 %	50 %	0 %	0 %	470219522
53595	NC_020564	TGA	2	6	2239586	2239591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219522
53596	NC_020564	A	7	7	2239608	2239614	100 %	0 %	0 %	0 %	470219522
53597	NC_020564	TTA	2	6	2239615	2239620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219522
53598	NC_020564	A	6	6	2239657	2239662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53599	NC_020564	AAT	2	6	2239739	2239744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53600	NC_020564	AC	3	6	2239751	2239756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53601	NC_020564	A	7	7	2239763	2239769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53602	NC_020564	ATA	2	6	2239779	2239784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53603	NC_020564	TA	3	6	2239798	2239803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53604	NC_020564	ACG	2	6	2239839	2239844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53605	NC_020564	GCT	2	6	2239846	2239851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53606	NC_020564	T	6	6	2239863	2239868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53607	NC_020564	AGTA	2	8	2239893	2239900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53608	NC_020564	TAA	2	6	2239944	2239949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53609	NC_020564	AGCTTG	2	12	2239974	2239985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53610	NC_020564	ACC	3	9	2239995	2240003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53611	NC_020564	CAT	2	6	2240021	2240026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53612	NC_020564	TGGT	2	8	2240055	2240062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53613	NC_020564	TTA	2	6	2240113	2240118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53614	NC_020564	ACG	2	6	2240172	2240177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53615	NC_020564	TCC	2	6	2240215	2240220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53616	NC_020564	GTT	2	6	2240253	2240258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53617	NC_020564	CCA	2	6	2240282	2240287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53618	NC_020564	T	6	6	2240299	2240304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53619	NC_020564	TTC	2	6	2240379	2240384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53620	NC_020564	CAG	2	6	2240394	2240399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53621	NC_020564	TGAT	2	8	2240400	2240407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53622	NC_020564	ACC	2	6	2240413	2240418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53623	NC_020564	GAT	2	6	2240421	2240426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53624	NC_020564	GTA	2	6	2240437	2240442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53625	NC_020564	TAA	2	6	2240490	2240495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53626	NC_020564	GTGTG	2	10	2240521	2240530	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53627	NC_020564	AGAT	2	8	2240556	2240563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53628	NC_020564	TGA	2	6	2240572	2240577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53634	NC_020564	TGT	2	6	2240783	2240788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53636	NC_020564	TAA	2	6	2240864	2240869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53995	NC_020564	TGA	2	6	2255874	2255879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219535
53996	NC_020564	T	6	6	2255880	2255885	0 %	100 %	0 %	0 %	470219535
53997	NC_020564	ACG	2	6	2255889	2255894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219535
53998	NC_020564	CAC	3	9	2255966	2255974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219535
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