MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020564	TCA	2	6	2216178	2216183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
53002	NC_020564	AGC	2	6	2216219	2216224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219506
53003	NC_020564	AAT	2	6	2216337	2216342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
53004	NC_020564	TGC	2	6	2216387	2216392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219506
53005	NC_020564	AAT	2	6	2216526	2216531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
53006	NC_020564	TGT	2	6	2216596	2216601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219506
53007	NC_020564	AAG	2	6	2216622	2216627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219506
53008	NC_020564	TCT	2	6	2216637	2216642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219506
53009	NC_020564	CTTT	2	8	2216677	2216684	0 %	75 %	0 %	25 %	470219506
53010	NC_020564	CAT	2	6	2216704	2216709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
53011	NC_020564	CAT	2	6	2216713	2216718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
53012	NC_020564	AGTAA	2	10	2216719	2216728	60 %	20 %	20 %	0 %	470219506
53013	NC_020564	CTA	2	6	2216779	2216784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
53014	NC_020564	T	6	6	2216827	2216832	0 %	100 %	0 %	0 %	470219506
53015	NC_020564	AAT	2	6	2216844	2216849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
53016	NC_020564	TAA	2	6	2216900	2216905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
53017	NC_020564	TTC	2	6	2216930	2216935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219506
53018	NC_020564	CAT	2	6	2216999	2217004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
53019	NC_020564	CAC	2	6	2217016	2217021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219506
53020	NC_020564	TTA	2	6	2217057	2217062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219506
53021	NC_020564	T	6	6	2217085	2217090	0 %	100 %	0 %	0 %	470219506
53022	NC_020564	ATT	2	6	2217105	2217110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219506
53023	NC_020564	AAT	2	6	2217138	2217143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
53024	NC_020564	TCA	2	6	2217144	2217149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219507
53025	NC_020564	ATT	2	6	2217152	2217157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219507
53026	NC_020564	CTT	2	6	2217181	2217186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219507
53027	NC_020564	T	7	7	2217215	2217221	0 %	100 %	0 %	0 %	470219507
53028	NC_020564	AACC	2	8	2217289	2217296	50 %	0 %	0 %	50 %	470219507
53029	NC_020564	AAT	2	6	2217383	2217388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
53030	NC_020564	TCA	2	6	2217447	2217452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219507
53031	NC_020564	AAT	2	6	2217593	2217598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
53032	NC_020564	ATA	2	6	2217605	2217610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
53033	NC_020564	TAA	2	6	2217668	2217673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
53034	NC_020564	TAA	2	6	2217688	2217693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
53035	NC_020564	TGTT	2	8	2217743	2217750	0 %	75 %	25 %	0 %	470219507
53036	NC_020564	ATGC	2	8	2217805	2217812	25 %	25 %	25 %	25 %	470219507
53037	NC_020564	T	6	6	2217833	2217838	0 %	100 %	0 %	0 %	470219507
53038	NC_020564	ACC	2	6	2217932	2217937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219507
53039	NC_020564	TACT	2	8	2217946	2217953	25 %	50 %	0 %	25 %	470219507
53040	NC_020564	CAT	2	6	2217970	2217975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219507
53041	NC_020564	GGAT	2	8	2218013	2218020	25 %	25 %	50 %	0 %	470219507
53042	NC_020564	GTTAAA	2	12	2218026	2218037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470219507
53043	NC_020564	GTC	2	6	2218047	2218052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53044	NC_020564	TCA	2	6	2218095	2218100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219508
53045	NC_020564	T	6	6	2218163	2218168	0 %	100 %	0 %	0 %	470219508
53046	NC_020564	TAA	2	6	2218198	2218203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219508
53047	NC_020564	ATA	2	6	2218212	2218217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219508
53048	NC_020564	TAA	2	6	2218226	2218231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219508
53049	NC_020564	CCA	2	6	2218248	2218253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219508
53050	NC_020564	TTC	2	6	2218277	2218282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219508
53051	NC_020564	GAAC	2	8	2218323	2218330	50 %	0 %	25 %	25 %	470219508
53052	NC_020564	TTTA	2	8	2218340	2218347	25 %	75 %	0 %	0 %	470219508
53053	NC_020564	AAC	2	6	2218409	2218414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219508
53054	NC_020564	T	6	6	2218427	2218432	0 %	100 %	0 %	0 %	470219508
53055	NC_020564	TCC	2	6	2218580	2218585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53056	NC_020564	TTA	2	6	2218596	2218601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53057	NC_020564	ACC	2	6	2218628	2218633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53058	NC_020564	CAA	2	6	2218648	2218653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53059	NC_020564	CAA	2	6	2218687	2218692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53060	NC_020564	AT	3	6	2218740	2218745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53061	NC_020564	CAG	2	6	2218768	2218773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53062	NC_020564	CTT	2	6	2218849	2218854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53063	NC_020564	CAA	2	6	2218891	2218896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53064	NC_020564	CAA	2	6	2218924	2218929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53065	NC_020564	CAT	2	6	2218930	2218935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53066	NC_020564	TAA	2	6	2218946	2218951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53067	NC_020564	TGA	2	6	2218960	2218965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53068	NC_020564	CTT	2	6	2218966	2218971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53069	NC_020564	AAT	3	9	2219000	2219008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53070	NC_020564	ATA	2	6	2219013	2219018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53071	NC_020564	ATTT	2	8	2219068	2219075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53072	NC_020564	TAAACA	2	12	2219129	2219140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53073	NC_020564	ATA	2	6	2219155	2219160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_020564	TGTT	2	8	2219172	2219179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53075	NC_020564	GTT	2	6	2219223	2219228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53076	NC_020564	GTA	2	6	2219253	2219258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53077	NC_020564	A	7	7	2219294	2219300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53078	NC_020564	ATTCAC	2	12	2219321	2219332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53079	NC_020564	ACT	2	6	2219388	2219393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219509
53080	NC_020564	AT	3	6	2219397	2219402	50 %	50 %	0 %	0 %	470219509
53081	NC_020564	TCTTCA	2	12	2219424	2219435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470219509
53082	NC_020564	ATG	2	6	2219476	2219481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219509
53083	NC_020564	TCT	2	6	2219487	2219492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219509
53084	NC_020564	TTG	2	6	2219552	2219557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219509
53085	NC_020564	TCA	2	6	2219584	2219589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219509
53086	NC_020564	TTTA	2	8	2219597	2219604	25 %	75 %	0 %	0 %	470219509
53087	NC_020564	TAC	2	6	2219611	2219616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219509
53088	NC_020564	CAC	2	6	2219701	2219706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219509
53089	NC_020564	TGTT	2	8	2219732	2219739	0 %	75 %	25 %	0 %	470219509
53090	NC_020564	TAA	2	6	2219776	2219781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219509
53091	NC_020564	ATG	2	6	2219792	2219797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219509
53092	NC_020564	CTT	2	6	2219803	2219808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219509
53093	NC_020564	TGT	2	6	2219825	2219830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219509
53094	NC_020564	ATG	2	6	2219869	2219874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219509
53095	NC_020564	TA	3	6	2219888	2219893	50 %	50 %	0 %	0 %	470219509
53096	NC_020564	T	6	6	2219896	2219901	0 %	100 %	0 %	0 %	470219509
53097	NC_020564	CAC	2	6	2219971	2219976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219509
53098	NC_020564	CGA	2	6	2220058	2220063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219509
53099	NC_020564	CCT	2	6	2220147	2220152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219509
53100	NC_020564	TAA	2	6	2220219	2220224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53101	NC_020564	TAA	2	6	2220333	2220338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53102	NC_020564	TCAT	2	8	2220358	2220365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53103	NC_020564	TGA	2	6	2220512	2220517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219510
53104	NC_020564	ATT	2	6	2220562	2220567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219510
53105	NC_020564	AGA	2	6	2220569	2220574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219510
53106	NC_020564	GATTG	2	10	2220648	2220657	20 %	40 %	40 %	0 %	470219510
53107	NC_020564	CAA	2	6	2220675	2220680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219510
53108	NC_020564	TCA	2	6	2220691	2220696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219510
53109	NC_020564	TGA	2	6	2220743	2220748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219510
53110	NC_020564	TGG	2	6	2220848	2220853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219510
53111	NC_020564	TAT	2	6	2220874	2220879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219510
53112	NC_020564	CAT	2	6	2220905	2220910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219510
53113	NC_020564	TAAA	2	8	2220919	2220926	75 %	25 %	0 %	0 %	470219510
53114	NC_020564	TTG	2	6	2220946	2220951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219510
53115	NC_020564	TCA	2	6	2220960	2220965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219510
53116	NC_020564	ATT	2	6	2221020	2221025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219510
53117	NC_020564	GAC	2	6	2221077	2221082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219510
53118	NC_020564	ATT	2	6	2221251	2221256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53119	NC_020564	TGA	2	6	2221294	2221299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53121	NC_020564	A	6	6	2221366	2221371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53362	NC_020564	CAT	2	6	2231286	2231291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219517
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53371	NC_020564	GATT	2	8	2231720	2231727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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53374	NC_020564	ATT	2	6	2231959	2231964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53377	NC_020564	CAA	2	6	2232081	2232086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53381	NC_020564	TAA	2	6	2232274	2232279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53483	NC_020564	T	7	7	2235152	2235158	0 %	100 %	0 %	0 %	470219520
53484	NC_020564	TCA	2	6	2235165	2235170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219520
53485	NC_020564	GAT	2	6	2235174	2235179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219520
53486	NC_020564	TTAT	2	8	2235180	2235187	25 %	75 %	0 %	0 %	470219520
53487	NC_020564	TTA	2	6	2235198	2235203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219520
53488	NC_020564	TAA	2	6	2235208	2235213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219520
53489	NC_020564	CAC	2	6	2235250	2235255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53490	NC_020564	TAT	2	6	2235262	2235267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53491	NC_020564	AAT	2	6	2235287	2235292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53492	NC_020564	AATAT	2	10	2235299	2235308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53493	NC_020564	TAAT	2	8	2235310	2235317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53494	NC_020564	TTA	2	6	2235318	2235323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53495	NC_020564	TAT	2	6	2235344	2235349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53496	NC_020564	AT	3	6	2235443	2235448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53497	NC_020564	ATT	2	6	2235516	2235521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53499	NC_020564	GTT	2	6	2235702	2235707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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