MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_020564	ATC	2	6	2130570	2130575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51002	NC_020564	T	6	6	2130600	2130605	0 %	100 %	0 %	0 %	470219451
51003	NC_020564	TAAG	2	8	2130608	2130615	50 %	25 %	25 %	0 %	470219451
51004	NC_020564	AGC	2	6	2130680	2130685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219451
51005	NC_020564	ATCA	2	8	2130740	2130747	50 %	25 %	0 %	25 %	470219451
51006	NC_020564	TCT	2	6	2130789	2130794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219451
51007	NC_020564	CTT	3	9	2130865	2130873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219451
51008	NC_020564	CTA	3	9	2130937	2130945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51009	NC_020564	GAT	2	6	2130952	2130957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219451
51010	NC_020564	CAT	2	6	2130998	2131003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51011	NC_020564	A	6	6	2131118	2131123	100 %	0 %	0 %	0 %	470219451
51012	NC_020564	CAC	2	6	2131127	2131132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219451
51013	NC_020564	CAT	2	6	2131174	2131179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51014	NC_020564	CAT	2	6	2131186	2131191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51015	NC_020564	CTT	2	6	2131198	2131203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219451
51016	NC_020564	AT	3	6	2131217	2131222	50 %	50 %	0 %	0 %	470219451
51017	NC_020564	TTG	2	6	2131223	2131228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219451
51018	NC_020564	TTCA	2	8	2131232	2131239	25 %	50 %	0 %	25 %	470219451
51019	NC_020564	TCA	2	6	2131272	2131277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51020	NC_020564	AT	3	6	2131320	2131325	50 %	50 %	0 %	0 %	470219451
51021	NC_020564	TA	3	6	2131342	2131347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51022	NC_020564	ATT	2	6	2131366	2131371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51023	NC_020564	TAT	2	6	2131377	2131382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51024	NC_020564	ATT	2	6	2131397	2131402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51025	NC_020564	TAAA	2	8	2131413	2131420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51026	NC_020564	TTAT	2	8	2131425	2131432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51027	NC_020564	T	7	7	2131434	2131440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51028	NC_020564	TCA	2	6	2131474	2131479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51029	NC_020564	ACT	2	6	2131515	2131520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51030	NC_020564	ACTA	2	8	2131535	2131542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51031	NC_020564	ATA	2	6	2131575	2131580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51032	NC_020564	TA	4	8	2131579	2131586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51033	NC_020564	TAA	2	6	2131661	2131666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51034	NC_020564	TAT	2	6	2131671	2131676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51035	NC_020564	T	6	6	2131683	2131688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51036	NC_020564	TACTA	2	10	2131697	2131706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51037	NC_020564	TAA	2	6	2131725	2131730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51038	NC_020564	TGC	2	6	2131961	2131966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219452
51039	NC_020564	ATT	2	6	2132056	2132061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219452
51040	NC_020564	CGT	2	6	2132079	2132084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219452
51041	NC_020564	ACC	2	6	2132237	2132242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219452
51042	NC_020564	CAG	2	6	2132260	2132265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219452
51043	NC_020564	TAC	2	6	2132281	2132286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219452
51044	NC_020564	AGC	2	6	2132324	2132329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219452
51045	NC_020564	GTT	2	6	2132352	2132357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219452
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51047	NC_020564	ATA	2	6	2132428	2132433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219452
51048	NC_020564	TTA	2	6	2132439	2132444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219452
51049	NC_020564	GTT	2	6	2132571	2132576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51050	NC_020564	TAAA	2	8	2132578	2132585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51051	NC_020564	TA	3	6	2132589	2132594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51052	NC_020564	TTTTA	2	10	2132602	2132611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51053	NC_020564	TAT	2	6	2132647	2132652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51054	NC_020564	TTAC	2	8	2132660	2132667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51055	NC_020564	TCAAT	2	10	2132671	2132680	40 %	40 %	0 %	20 %	470219453
51056	NC_020564	ACCA	2	8	2132725	2132732	50 %	0 %	0 %	50 %	470219453
51057	NC_020564	ATC	2	6	2132767	2132772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219453
51058	NC_020564	ATA	2	6	2132888	2132893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219453
51059	NC_020564	T	7	7	2132900	2132906	0 %	100 %	0 %	0 %	470219453
51060	NC_020564	TAC	2	6	2132943	2132948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219453
51061	NC_020564	T	6	6	2132950	2132955	0 %	100 %	0 %	0 %	470219453
51062	NC_020564	TCA	2	6	2132972	2132977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219453
51063	NC_020564	TCA	2	6	2133030	2133035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219453
51064	NC_020564	CTT	2	6	2133036	2133041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219453
51065	NC_020564	TAG	2	6	2133061	2133066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219453
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51069	NC_020564	TCT	2	6	2133221	2133226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219453
51070	NC_020564	T	6	6	2133274	2133279	0 %	100 %	0 %	0 %	470219453
51071	NC_020564	AAAT	2	8	2133293	2133300	75 %	25 %	0 %	0 %	470219453
51072	NC_020564	CATT	2	8	2133302	2133309	25 %	50 %	0 %	25 %	470219453
51073	NC_020564	AT	3	6	2133315	2133320	50 %	50 %	0 %	0 %	470219453
51074	NC_020564	CATA	2	8	2133379	2133386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51075	NC_020564	CAA	2	6	2133403	2133408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51076	NC_020564	CAA	2	6	2133569	2133574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51077	NC_020564	A	6	6	2133676	2133681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51080	NC_020564	CAT	2	6	2133869	2133874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219454
51081	NC_020564	CTT	2	6	2133899	2133904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219454
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51088	NC_020564	TAG	2	6	2134166	2134171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219454
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51092	NC_020564	CAG	2	6	2134322	2134327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219454
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51101	NC_020564	AT	3	6	2134609	2134614	50 %	50 %	0 %	0 %	470219454
51102	NC_020564	AAAT	2	8	2134618	2134625	75 %	25 %	0 %	0 %	470219454
51103	NC_020564	TGTC	2	8	2134745	2134752	0 %	50 %	25 %	25 %	470219454
51104	NC_020564	TAA	2	6	2134794	2134799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219454
51105	NC_020564	A	6	6	2134813	2134818	100 %	0 %	0 %	0 %	470219454
51106	NC_020564	AT	3	6	2134856	2134861	50 %	50 %	0 %	0 %	470219454
51107	NC_020564	ACA	2	6	2134882	2134887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219454
51108	NC_020564	ATT	2	6	2134932	2134937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219454
51109	NC_020564	AAT	2	6	2134979	2134984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219455
51110	NC_020564	ATT	2	6	2135034	2135039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219455
51111	NC_020564	TAAT	2	8	2135050	2135057	50 %	50 %	0 %	0 %	470219455
51112	NC_020564	TCA	2	6	2135061	2135066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219455
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51114	NC_020564	CTA	2	6	2135110	2135115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219455
51115	NC_020564	TTG	2	6	2135149	2135154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219455
51116	NC_020564	ATC	3	9	2135201	2135209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219455
51117	NC_020564	CTT	2	6	2135227	2135232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219455
51118	NC_020564	AAAT	2	8	2135246	2135253	75 %	25 %	0 %	0 %	470219455
51119	NC_020564	ATTC	2	8	2135278	2135285	25 %	50 %	0 %	25 %	470219455
51120	NC_020564	GATTT	2	10	2135348	2135357	20 %	60 %	20 %	0 %	470219455
51121	NC_020564	AT	3	6	2135371	2135376	50 %	50 %	0 %	0 %	470219455
51122	NC_020564	AAT	2	6	2135432	2135437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219455
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51142	NC_020564	TAA	2	6	2136263	2136268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51161	NC_020564	TCAA	2	8	2136916	2136923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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51227	NC_020564	TTGA	2	8	2139716	2139723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51228	NC_020564	CATA	2	8	2139775	2139782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51229	NC_020564	AAAC	2	8	2139809	2139816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51230	NC_020564	ACA	2	6	2139859	2139864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51231	NC_020564	A	6	6	2139920	2139925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51232	NC_020564	ATT	2	6	2139948	2139953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51233	NC_020564	AT	3	6	2140066	2140071	50 %	50 %	0 %	0 %	470219459
51234	NC_020564	T	6	6	2140081	2140086	0 %	100 %	0 %	0 %	470219459
51235	NC_020564	AAG	2	6	2140152	2140157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219459
51236	NC_020564	CTT	2	6	2140222	2140227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219459
51237	NC_020564	TTA	2	6	2140296	2140301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219459
51238	NC_020564	CAATA	2	10	2140340	2140349	60 %	20 %	0 %	20 %	470219459
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51240	NC_020564	TAT	2	6	2140446	2140451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219459
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51244	NC_020564	CTA	2	6	2140620	2140625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219459
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51255	NC_020564	GCTT	2	8	2141099	2141106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51256	NC_020564	TA	3	6	2141110	2141115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51257	NC_020564	TTC	2	6	2141117	2141122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51272	NC_020564	TGT	2	6	2141526	2141531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51358	NC_020564	TAAG	2	8	2145589	2145596	50 %	25 %	25 %	0 %	470219461
51359	NC_020564	TGT	3	9	2145611	2145619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219461
51360	NC_020564	ATTTTG	2	12	2145628	2145639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470219461
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51362	NC_020564	TC	4	8	2145792	2145799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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51364	NC_020564	TCA	2	6	2145936	2145941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51366	NC_020564	TTA	2	6	2146001	2146006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219462
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51384	NC_020564	TCAA	2	8	2146976	2146983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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51386	NC_020564	AAGC	2	8	2147094	2147101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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51484	NC_020564	TA	3	6	2151439	2151444	50 %	50 %	0 %	0 %	470219467
51485	NC_020564	GGA	2	6	2151457	2151462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470219467
51486	NC_020564	T	7	7	2151570	2151576	0 %	100 %	0 %	0 %	470219467
51487	NC_020564	ACG	2	6	2151604	2151609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219467
51488	NC_020564	ACC	2	6	2151642	2151647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219467
51489	NC_020564	CTG	2	6	2151653	2151658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219467
51490	NC_020564	AAAT	2	8	2151693	2151700	75 %	25 %	0 %	0 %	470219467
51491	NC_020564	TTAC	2	8	2151815	2151822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51492	NC_020564	TAA	2	6	2151909	2151914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51493	NC_020564	TAT	2	6	2151923	2151928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51494	NC_020564	T	6	6	2151966	2151971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51495	NC_020564	TTTTCT	2	12	2151973	2151984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51496	NC_020564	CTT	2	6	2151997	2152002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51497	NC_020564	TAA	2	6	2152013	2152018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51498	NC_020564	TCC	2	6	2152024	2152029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51499	NC_020564	GATTC	2	10	2152090	2152099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51500	NC_020564	AATTAA	2	12	2152163	2152174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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