MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_020564	TCT	2	6	2110324	2110329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219434
50502	NC_020564	CTT	3	9	2110343	2110351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219434
50503	NC_020564	TCT	2	6	2110378	2110383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219434
50504	NC_020564	AAT	2	6	2110624	2110629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50505	NC_020564	TA	3	6	2110639	2110644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50506	NC_020564	A	7	7	2110646	2110652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50507	NC_020564	CGA	2	6	2110653	2110658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50508	NC_020564	TAA	2	6	2110715	2110720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50509	NC_020564	TA	3	6	2110737	2110742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50510	NC_020564	CAT	2	6	2110745	2110750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50511	NC_020564	TAC	2	6	2110823	2110828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50512	NC_020564	GAT	2	6	2110832	2110837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50513	NC_020564	TGC	3	9	2110988	2110996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50514	NC_020564	TAATT	2	10	2111008	2111017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50515	NC_020564	TCC	2	6	2111018	2111023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50516	NC_020564	TA	3	6	2111032	2111037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50517	NC_020564	ATT	2	6	2111038	2111043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50518	NC_020564	ATA	2	6	2111097	2111102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219435
50519	NC_020564	AT	3	6	2111106	2111111	50 %	50 %	0 %	0 %	470219435
50520	NC_020564	TAA	2	6	2111170	2111175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219435
50521	NC_020564	TAA	2	6	2111302	2111307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219435
50522	NC_020564	TAT	2	6	2111393	2111398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219435
50523	NC_020564	CCA	2	6	2111447	2111452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219435
50524	NC_020564	TG	3	6	2111456	2111461	0 %	50 %	50 %	0 %	470219435
50525	NC_020564	AAG	2	6	2111535	2111540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219435
50526	NC_020564	ACC	2	6	2111549	2111554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219435
50527	NC_020564	T	6	6	2111555	2111560	0 %	100 %	0 %	0 %	470219435
50528	NC_020564	TTTG	2	8	2111620	2111627	0 %	75 %	25 %	0 %	470219435
50529	NC_020564	T	7	7	2111638	2111644	0 %	100 %	0 %	0 %	470219435
50530	NC_020564	ATC	2	6	2111700	2111705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219435
50531	NC_020564	ATTT	2	8	2111798	2111805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50532	NC_020564	ACA	2	6	2111837	2111842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50533	NC_020564	AAT	2	6	2111860	2111865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50534	NC_020564	GAT	2	6	2111872	2111877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50535	NC_020564	TTA	2	6	2111891	2111896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50536	NC_020564	AAT	2	6	2111917	2111922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50537	NC_020564	TTTAGC	2	12	2111977	2111988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50538	NC_020564	GT	3	6	2112064	2112069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50539	NC_020564	TCC	2	6	2112082	2112087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50540	NC_020564	ATT	3	9	2112092	2112100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50541	NC_020564	ATA	2	6	2112109	2112114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50542	NC_020564	TGAA	2	8	2112116	2112123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50543	NC_020564	TGT	2	6	2112135	2112140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50544	NC_020564	ATCA	2	8	2112178	2112185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50545	NC_020564	ATA	2	6	2112217	2112222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50546	NC_020564	TTG	2	6	2112254	2112259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50547	NC_020564	A	7	7	2112261	2112267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50548	NC_020564	ATA	2	6	2112356	2112361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219436
50549	NC_020564	TTCT	2	8	2112379	2112386	0 %	75 %	0 %	25 %	470219436
50550	NC_020564	TGA	2	6	2112429	2112434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219436
50551	NC_020564	TC	3	6	2112440	2112445	0 %	50 %	0 %	50 %	470219436
50552	NC_020564	ATC	2	6	2112446	2112451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219436
50553	NC_020564	AAAACT	2	12	2112552	2112563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470219436
50554	NC_020564	TTA	2	6	2112567	2112572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219436
50555	NC_020564	ATG	2	6	2112574	2112579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219436
50556	NC_020564	CTT	2	6	2112583	2112588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219436
50557	NC_020564	AAAAT	2	10	2112612	2112621	80 %	20 %	0 %	0 %	470219436
50558	NC_020564	T	6	6	2112626	2112631	0 %	100 %	0 %	0 %	470219436
50559	NC_020564	CTA	2	6	2112649	2112654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219436
50560	NC_020564	TCAA	2	8	2112666	2112673	50 %	25 %	0 %	25 %	470219436
50561	NC_020564	AT	3	6	2112796	2112801	50 %	50 %	0 %	0 %	470219436
50562	NC_020564	TCG	2	6	2112827	2112832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219436
50563	NC_020564	GAAT	2	8	2112847	2112854	50 %	25 %	25 %	0 %	470219436
50564	NC_020564	T	6	6	2112854	2112859	0 %	100 %	0 %	0 %	470219436
50565	NC_020564	ATG	2	6	2112876	2112881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219436
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50572	NC_020564	TGAT	2	8	2113219	2113226	25 %	50 %	25 %	0 %	470219436
50573	NC_020564	ATA	2	6	2113263	2113268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219436
50574	NC_020564	TGCTG	2	10	2113329	2113338	0 %	40 %	40 %	20 %	470219436
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50588	NC_020564	GAT	2	6	2114073	2114078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219437
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50605	NC_020564	GTT	2	6	2114702	2114707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219438
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50611	NC_020564	TC	4	8	2115314	2115321	0 %	50 %	0 %	50 %	470219438
50612	NC_020564	CTTG	2	8	2115345	2115352	0 %	50 %	25 %	25 %	470219438
50613	NC_020564	CTT	2	6	2115377	2115382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50614	NC_020564	A	7	7	2115385	2115391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50615	NC_020564	CCA	2	6	2115415	2115420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219439
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50618	NC_020564	CTCC	2	8	2115613	2115620	0 %	25 %	0 %	75 %	470219439
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50980	NC_020564	TTC	2	6	2129882	2129887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219450
50981	NC_020564	TGAT	2	8	2129904	2129911	25 %	50 %	25 %	0 %	470219450
50982	NC_020564	TTC	3	9	2129912	2129920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219450
50983	NC_020564	TCT	2	6	2129931	2129936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219450
50984	NC_020564	TTC	2	6	2129948	2129953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219450
50985	NC_020564	ATC	2	6	2129957	2129962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219450
50986	NC_020564	ATC	2	6	2129978	2129983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219450
50987	NC_020564	GTC	2	6	2129984	2129989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219450
50988	NC_020564	AAT	2	6	2130009	2130014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219450
50989	NC_020564	TCT	2	6	2130027	2130032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219450
50990	NC_020564	TCA	2	6	2130033	2130038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219450
50991	NC_020564	ATC	2	6	2130092	2130097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219450
50992	NC_020564	A	6	6	2130144	2130149	100 %	0 %	0 %	0 %	470219450
50993	NC_020564	TTC	2	6	2130200	2130205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219450
50994	NC_020564	GAT	2	6	2130239	2130244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219450
50995	NC_020564	AAT	2	6	2130279	2130284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219450
50996	NC_020564	TCA	2	6	2130312	2130317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219450
50997	NC_020564	TTTGT	2	10	2130322	2130331	0 %	80 %	20 %	0 %	470219450
50998	NC_020564	TA	4	8	2130405	2130412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50999	NC_020564	ATC	2	6	2130494	2130499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219451
51000	NC_020564	ATT	2	6	2130551	2130556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219451

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