MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_020564	TAT	2	6	2088562	2088567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219417
50003	NC_020564	GTA	2	6	2088588	2088593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219417
50004	NC_020564	ATC	2	6	2088599	2088604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219417
50005	NC_020564	CTT	2	6	2088667	2088672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219417
50006	NC_020564	AAT	2	6	2088687	2088692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219417
50007	NC_020564	CAT	2	6	2088703	2088708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219417
50008	NC_020564	AT	3	6	2088707	2088712	50 %	50 %	0 %	0 %	470219417
50009	NC_020564	TTTAGC	2	12	2088752	2088763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470219417
50010	NC_020564	CG	3	6	2088772	2088777	0 %	0 %	50 %	50 %	470219417
50011	NC_020564	ATT	2	6	2088947	2088952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219417
50012	NC_020564	GTT	2	6	2089020	2089025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219417
50013	NC_020564	TTG	2	6	2089091	2089096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219417
50014	NC_020564	ATA	2	6	2089125	2089130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219417
50015	NC_020564	AGC	2	6	2089175	2089180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219417
50016	NC_020564	ATA	2	6	2089374	2089379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219417
50017	NC_020564	TATT	2	8	2089403	2089410	25 %	75 %	0 %	0 %	470219418
50018	NC_020564	GATAA	2	10	2089470	2089479	60 %	20 %	20 %	0 %	470219418
50019	NC_020564	ATAC	2	8	2089504	2089511	50 %	25 %	0 %	25 %	470219418
50020	NC_020564	GCATT	2	10	2089530	2089539	20 %	40 %	20 %	20 %	470219418
50021	NC_020564	AT	4	8	2089550	2089557	50 %	50 %	0 %	0 %	470219418
50022	NC_020564	TCT	2	6	2089565	2089570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219418
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50024	NC_020564	CTT	2	6	2089866	2089871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219418
50025	NC_020564	ATT	2	6	2089885	2089890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219418
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50027	NC_020564	ATGTT	2	10	2089976	2089985	20 %	60 %	20 %	0 %	470219418
50028	NC_020564	AAT	2	6	2090051	2090056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219418
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50030	NC_020564	ACT	2	6	2090212	2090217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219418
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50032	NC_020564	ATT	2	6	2090299	2090304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219418
50033	NC_020564	CAT	2	6	2090322	2090327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219418
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50035	NC_020564	AT	3	6	2090478	2090483	50 %	50 %	0 %	0 %	470219418
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50037	NC_020564	TAG	2	6	2090839	2090844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219419
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50040	NC_020564	T	6	6	2090938	2090943	0 %	100 %	0 %	0 %	470219419
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50043	NC_020564	TAT	2	6	2091086	2091091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219419
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50051	NC_020564	TTA	2	6	2091459	2091464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219419
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50054	NC_020564	ATTTTT	2	12	2091698	2091709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470219419
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50062	NC_020564	TA	3	6	2092028	2092033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50063	NC_020564	CGT	2	6	2092043	2092048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50064	NC_020564	AT	3	6	2092063	2092068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50065	NC_020564	ATA	2	6	2092081	2092086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50066	NC_020564	TA	3	6	2092143	2092148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50067	NC_020564	A	6	6	2092179	2092184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50070	NC_020564	GT	3	6	2092219	2092224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50071	NC_020564	ATT	2	6	2092243	2092248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50072	NC_020564	ACTT	2	8	2092259	2092266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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50074	NC_020564	T	7	7	2092312	2092318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50080	NC_020564	TAT	2	6	2092602	2092607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50082	NC_020564	ACTT	2	8	2092662	2092669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50083	NC_020564	TTC	2	6	2092671	2092676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50084	NC_020564	ATC	2	6	2092714	2092719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50085	NC_020564	TAA	2	6	2092760	2092765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50086	NC_020564	ATA	2	6	2092809	2092814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50087	NC_020564	TGT	2	6	2092827	2092832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50088	NC_020564	TAA	2	6	2092835	2092840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50091	NC_020564	ATG	2	6	2092997	2093002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50092	NC_020564	TACTA	2	10	2093051	2093060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50093	NC_020564	GT	3	6	2093090	2093095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50094	NC_020564	TAA	2	6	2093143	2093148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219420
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50104	NC_020564	TGA	2	6	2093458	2093463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219420
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50107	NC_020564	TGT	2	6	2093541	2093546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219420
50108	NC_020564	TA	3	6	2093547	2093552	50 %	50 %	0 %	0 %	470219420
50109	NC_020564	GCA	2	6	2093558	2093563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219420
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50117	NC_020564	TTAA	2	8	2093858	2093865	50 %	50 %	0 %	0 %	470219420
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50238	NC_020564	ATC	2	6	2098173	2098178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219424
50239	NC_020564	AAT	3	9	2098237	2098245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219424
50240	NC_020564	GCCT	2	8	2098308	2098315	0 %	25 %	25 %	50 %	470219424
50241	NC_020564	AAT	2	6	2098338	2098343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219424
50242	NC_020564	TTC	2	6	2098410	2098415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219424
50243	NC_020564	CTT	2	6	2098418	2098423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219424
50244	NC_020564	TAA	2	6	2098461	2098466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50245	NC_020564	TATTT	2	10	2098533	2098542	20 %	80 %	0 %	0 %	470219425
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50289	NC_020564	A	6	6	2100347	2100352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50291	NC_020564	TA	3	6	2100403	2100408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50310	NC_020564	T	6	6	2101335	2101340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50341	NC_020564	A	6	6	2102553	2102558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50342	NC_020564	T	8	8	2102597	2102604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50343	NC_020564	TTTTA	2	10	2102606	2102615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50344	NC_020564	CAAG	2	8	2102648	2102655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50345	NC_020564	TAC	2	6	2102746	2102751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50347	NC_020564	TAAT	2	8	2102859	2102866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50348	NC_020564	CA	3	6	2102941	2102946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50349	NC_020564	CTT	2	6	2102955	2102960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50352	NC_020564	CTGT	2	8	2102995	2103002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50353	NC_020564	TCC	2	6	2103057	2103062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50480	NC_020564	TTC	2	6	2109496	2109501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219432
50481	NC_020564	CTC	2	6	2109525	2109530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50482	NC_020564	TAAT	2	8	2109535	2109542	50 %	50 %	0 %	0 %	470219433
50483	NC_020564	CCA	2	6	2109629	2109634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219433
50484	NC_020564	TTG	2	6	2109685	2109690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219433
50485	NC_020564	CTT	2	6	2109720	2109725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219433
50486	NC_020564	TTG	2	6	2109750	2109755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219433
50487	NC_020564	TA	3	6	2109780	2109785	50 %	50 %	0 %	0 %	470219433
50488	NC_020564	TAT	2	6	2109831	2109836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219433
50489	NC_020564	CAT	2	6	2109850	2109855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219433
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50491	NC_020564	CTG	2	6	2109915	2109920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219433
50492	NC_020564	TTC	2	6	2109994	2109999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219433
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50496	NC_020564	GCCT	2	8	2110086	2110093	0 %	25 %	25 %	50 %	470219434
50497	NC_020564	TTTCT	2	10	2110139	2110148	0 %	80 %	0 %	20 %	470219434
50498	NC_020564	ATT	2	6	2110191	2110196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219434
50499	NC_020564	ACGT	2	8	2110266	2110273	25 %	25 %	25 %	25 %	470219434
50500	NC_020564	AAT	2	6	2110284	2110289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219434

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