MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 3822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020562	GC	3	6	157885	157890	0 %	0 %	50 %	50 %	472434136
3502	NC_020562	GCC	2	6	157937	157942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434136
3503	NC_020562	TGC	2	6	157977	157982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434136
3504	NC_020562	GCG	2	6	157996	158001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434136
3505	NC_020562	CGG	2	6	158019	158024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434136
3506	NC_020562	AGGGC	2	10	158028	158037	20 %	0 %	60 %	20 %	472434136
3507	NC_020562	CGC	2	6	158052	158057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434136
3508	NC_020562	CGA	2	6	158074	158079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434136
3509	NC_020562	GATG	2	8	158180	158187	25 %	25 %	50 %	0 %	472434137
3510	NC_020562	GGC	3	9	158189	158197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434137
3511	NC_020562	GGC	2	6	158216	158221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434137
3512	NC_020562	GCCGA	2	10	158232	158241	20 %	0 %	40 %	40 %	472434137
3513	NC_020562	CGA	2	6	158255	158260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434137
3514	NC_020562	CG	3	6	158313	158318	0 %	0 %	50 %	50 %	472434137
3515	NC_020562	GCG	2	6	158348	158353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434137
3516	NC_020562	GGC	2	6	158436	158441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_020562	GC	3	6	158446	158451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_020562	GCG	2	6	158487	158492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434138
3519	NC_020562	GC	3	6	158494	158499	0 %	0 %	50 %	50 %	472434138
3520	NC_020562	CCA	2	6	158506	158511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434138
3521	NC_020562	CGC	2	6	158533	158538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434138
3522	NC_020562	GCG	2	6	158549	158554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434138
3523	NC_020562	ACG	2	6	158591	158596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434138
3524	NC_020562	CAT	2	6	158621	158626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434138
3525	NC_020562	CTT	2	6	158651	158656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434138
3526	NC_020562	TTG	2	6	158691	158696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472434138
3527	NC_020562	TCC	2	6	158700	158705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434138
3528	NC_020562	TTG	2	6	158727	158732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472434138
3529	NC_020562	TTC	2	6	158942	158947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434138
3530	NC_020562	TCG	2	6	158988	158993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434138
3531	NC_020562	GCC	2	6	159032	159037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434138
3532	NC_020562	GCA	2	6	159076	159081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434138
3533	NC_020562	GTGC	2	8	159110	159117	0 %	25 %	50 %	25 %	472434138
3534	NC_020562	CAG	2	6	159185	159190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434138
3535	NC_020562	G	6	6	159220	159225	0 %	0 %	100 %	0 %	472434138
3536	NC_020562	ATC	2	6	159329	159334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434138
3537	NC_020562	AGC	2	6	159400	159405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_020562	GGGGA	2	10	159448	159457	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_020562	GGC	2	6	159482	159487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_020562	AAG	2	6	159650	159655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_020562	CCTG	2	8	159708	159715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_020562	CGC	2	6	159732	159737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_020562	GAA	6	18	159750	159767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_020562	CCG	2	6	159790	159795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_020562	GCC	2	6	159810	159815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_020562	TCC	2	6	159833	159838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_020562	ATG	2	6	159853	159858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_020562	CCG	2	6	159867	159872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_020562	TTTG	2	8	159881	159888	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_020562	GTG	2	6	159981	159986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_020562	AGC	2	6	160086	160091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_020562	GGC	2	6	160115	160120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_020562	T	6	6	160124	160129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_020562	ATC	2	6	160157	160162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_020562	AGGG	2	8	160262	160269	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020562	CAT	2	6	160282	160287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_020562	ATG	2	6	160310	160315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_020562	GGC	2	6	160400	160405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434139
3559	NC_020562	GAA	2	6	160427	160432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434139
3560	NC_020562	AGCG	2	8	160455	160462	25 %	0 %	50 %	25 %	472434139
3561	NC_020562	TGC	2	6	160497	160502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_020562	TCG	2	6	160524	160529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_020562	CG	3	6	160538	160543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_020562	GCA	2	6	160554	160559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_020562	GC	4	8	160616	160623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_020562	CAT	2	6	160629	160634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434140
3567	NC_020562	CGC	2	6	160640	160645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434140
3568	NC_020562	GGC	2	6	160648	160653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434140
3569	NC_020562	CG	3	6	160668	160673	0 %	0 %	50 %	50 %	472434140
3570	NC_020562	GC	3	6	160683	160688	0 %	0 %	50 %	50 %	472434140
3571	NC_020562	CGCC	2	8	160761	160768	0 %	0 %	25 %	75 %	472434140
3572	NC_020562	CG	3	6	160773	160778	0 %	0 %	50 %	50 %	472434140
3573	NC_020562	TCC	2	6	160796	160801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434140
3574	NC_020562	GCG	2	6	160811	160816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434140
3575	NC_020562	TTTC	2	8	160937	160944	0 %	75 %	0 %	25 %	472434140
3576	NC_020562	CCG	2	6	161011	161016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434140
3577	NC_020562	GGC	2	6	161165	161170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434140
3578	NC_020562	GCCGC	2	10	161190	161199	0 %	0 %	40 %	60 %	472434140
3579	NC_020562	GAT	2	6	161219	161224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434140
3580	NC_020562	TGA	2	6	161311	161316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434140
3581	NC_020562	CTTCCG	2	12	161351	161362	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	472434141
3582	NC_020562	CG	3	6	161370	161375	0 %	0 %	50 %	50 %	472434141
3583	NC_020562	CGC	2	6	161383	161388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434141
3584	NC_020562	CGT	2	6	161414	161419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434141
3585	NC_020562	CG	3	6	161429	161434	0 %	0 %	50 %	50 %	472434141
3586	NC_020562	AGC	2	6	161446	161451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434141
3587	NC_020562	GC	3	6	161450	161455	0 %	0 %	50 %	50 %	472434141
3588	NC_020562	ATC	2	6	161472	161477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434141
3589	NC_020562	GCC	2	6	161514	161519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434141
3590	NC_020562	GCG	2	6	161580	161585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_020562	CG	3	6	161584	161589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_020562	GCC	2	6	161644	161649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434142
3593	NC_020562	AAG	2	6	161684	161689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434142
3594	NC_020562	CCT	2	6	161712	161717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434142
3595	NC_020562	TTCG	2	8	161719	161726	0 %	50 %	25 %	25 %	472434142
3596	NC_020562	GCG	2	6	161744	161749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434142
3597	NC_020562	AGC	2	6	161750	161755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434142
3598	NC_020562	GCCTTG	2	12	161843	161854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434142
3599	NC_020562	TCT	2	6	161901	161906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434142
3600	NC_020562	GC	4	8	161948	161955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_020562	GCG	2	6	161980	161985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_020562	AG	3	6	162006	162011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_020562	GC	3	6	162019	162024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_020562	AAG	2	6	162050	162055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_020562	TCA	2	6	162102	162107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434143
3606	NC_020562	GCG	2	6	162152	162157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434143
3607	NC_020562	CGT	2	6	162214	162219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434143
3608	NC_020562	CG	3	6	162269	162274	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3609	NC_020562	GC	3	6	162326	162331	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3610	NC_020562	CG	3	6	162351	162356	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3611	NC_020562	TCG	2	6	162411	162416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434143
3612	NC_020562	CGG	2	6	162699	162704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434143
3613	NC_020562	CG	4	8	162763	162770	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3614	NC_020562	ATC	2	6	162785	162790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434143
3615	NC_020562	CGCC	2	8	162820	162827	0 %	0 %	25 %	75 %	472434143
3616	NC_020562	TGA	2	6	162906	162911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434143
3617	NC_020562	TGG	2	6	162936	162941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434143
3618	NC_020562	CGGGA	2	10	162950	162959	20 %	0 %	60 %	20 %	472434143
3619	NC_020562	CG	3	6	162981	162986	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3620	NC_020562	AGC	2	6	163002	163007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434143
3621	NC_020562	CG	3	6	163016	163021	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3622	NC_020562	CG	3	6	163076	163081	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3623	NC_020562	AGC	2	6	163122	163127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434143
3624	NC_020562	GTCG	2	8	163168	163175	0 %	25 %	50 %	25 %	472434143
3625	NC_020562	CG	4	8	163216	163223	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
3626	NC_020562	GCGCG	2	10	163252	163261	0 %	0 %	60 %	40 %	472434143
3627	NC_020562	TCGCG	2	10	163308	163317	0 %	20 %	40 %	40 %	472434143
3628	NC_020562	CG	3	6	163371	163376	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
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3635	NC_020562	GCATG	2	10	163651	163660	20 %	20 %	40 %	20 %	472434143
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3659	NC_020562	GC	3	6	164923	164928	0 %	0 %	50 %	50 %	472434143
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3743	NC_020562	CGCC	2	8	169296	169303	0 %	0 %	25 %	75 %	472434148
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3751	NC_020562	GACG	2	8	169574	169581	25 %	0 %	50 %	25 %	472434148
3752	NC_020562	CG	3	6	169580	169585	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3753	NC_020562	CGGC	2	8	169591	169598	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3754	NC_020562	GC	4	8	169612	169619	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3755	NC_020562	CGT	2	6	169645	169650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434148
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3758	NC_020562	GGC	2	6	169712	169717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434148
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3777	NC_020562	GCGAT	2	10	170400	170409	20 %	20 %	40 %	20 %	472434148
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3779	NC_020562	GC	3	6	170553	170558	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3780	NC_020562	GGT	2	6	170579	170584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434148
3781	NC_020562	CG	4	8	170599	170606	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3782	NC_020562	CG	3	6	170612	170617	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3783	NC_020562	TGC	2	6	170625	170630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434148
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3799	NC_020562	CGAT	2	8	171286	171293	25 %	25 %	25 %	25 %	472434148
3800	NC_020562	TCA	2	6	171304	171309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434148
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3814	NC_020562	CAA	2	6	171784	171789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434148
3815	NC_020562	CAG	2	6	171869	171874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434148
3816	NC_020562	CG	3	6	171878	171883	0 %	0 %	50 %	50 %	472434148
3817	NC_020562	GCC	2	6	171905	171910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434148
3818	NC_020562	CGC	2	6	172005	172010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434148
3819	NC_020562	TGGGA	2	10	172011	172020	20 %	20 %	60 %	0 %	472434148
3820	NC_020562	CCTCGA	2	12	172060	172071	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	472434148
3821	NC_020562	GCT	2	6	172090	172095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434148
3822	NC_020562	AAT	2	6	172126	172131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.