MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020561	CGG	2	6	38383	38388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212002
1002	NC_020561	GCCG	2	8	38407	38414	0 %	0 %	50 %	50 %	470212002
1003	NC_020561	CGG	3	9	38478	38486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212002
1004	NC_020561	CG	3	6	38519	38524	0 %	0 %	50 %	50 %	470212002
1005	NC_020561	TGC	2	6	38658	38663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212002
1006	NC_020561	GC	3	6	38700	38705	0 %	0 %	50 %	50 %	470212002
1007	NC_020561	CGG	2	6	38715	38720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212002
1008	NC_020561	GCG	2	6	38767	38772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212002
1009	NC_020561	GGC	2	6	38806	38811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212002
1010	NC_020561	GCC	2	6	38988	38993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1011	NC_020561	GC	3	6	39011	39016	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1012	NC_020561	GCCG	2	8	39018	39025	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1013	NC_020561	GAA	2	6	39063	39068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212003
1014	NC_020561	TCC	2	6	39092	39097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212003
1015	NC_020561	TCA	2	6	39098	39103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212003
1016	NC_020561	ACC	2	6	39104	39109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212003
1017	NC_020561	GCGG	2	8	39207	39214	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
1018	NC_020561	AT	3	6	39225	39230	50 %	50 %	0 %	0 %	470212003
1019	NC_020561	GTGC	2	8	39279	39286	0 %	25 %	50 %	25 %	470212003
1020	NC_020561	CGA	2	6	39294	39299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1021	NC_020561	GGA	2	6	39312	39317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212003
1022	NC_020561	CCT	2	6	39356	39361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212003
1023	NC_020561	GC	3	6	39422	39427	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1024	NC_020561	GAA	2	6	39471	39476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212003
1025	NC_020561	TCGA	2	8	39484	39491	25 %	25 %	25 %	25 %	470212003
1026	NC_020561	TGC	2	6	39545	39550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1027	NC_020561	GC	4	8	39549	39556	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1028	NC_020561	GAC	2	6	39571	39576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1029	NC_020561	CGC	2	6	39658	39663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1030	NC_020561	GCC	2	6	39668	39673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1031	NC_020561	GAT	2	6	39705	39710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212003
1032	NC_020561	GGCG	2	8	39723	39730	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
1033	NC_020561	GCC	2	6	39739	39744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1034	NC_020561	TCG	2	6	39758	39763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1035	NC_020561	CTG	2	6	39817	39822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1036	NC_020561	GGC	2	6	39864	39869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212003
1037	NC_020561	CCA	2	6	39884	39889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212003
1038	NC_020561	CTG	2	6	39916	39921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1039	NC_020561	TCG	2	6	39923	39928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1040	NC_020561	GAA	2	6	39984	39989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212003
1041	NC_020561	CTGG	2	8	40044	40051	0 %	25 %	50 %	25 %	470212003
1042	NC_020561	GCT	2	6	40065	40070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1043	NC_020561	AGG	2	6	40085	40090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212003
1044	NC_020561	GCG	3	9	40136	40144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212003
1045	NC_020561	GC	3	6	40157	40162	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1046	NC_020561	CGCTGG	2	12	40172	40183	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470212003
1047	NC_020561	TCC	2	6	40229	40234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212003
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1049	NC_020561	GGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
1050	NC_020561	GGC	2	6	40285	40290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212003
1051	NC_020561	CTG	2	6	40330	40335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1052	NC_020561	CGA	2	6	40353	40358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1053	NC_020561	CCA	2	6	40392	40397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212003
1054	NC_020561	CGCGG	2	10	40405	40414	0 %	0 %	60 %	40 %	470212003
1055	NC_020561	GCCG	2	8	40434	40441	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1056	NC_020561	GCG	2	6	40496	40501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212003
1057	NC_020561	CCG	2	6	40516	40521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1058	NC_020561	CG	4	8	40527	40534	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1059	NC_020561	GGC	3	9	40620	40628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212003
1060	NC_020561	GCC	2	6	40674	40679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1061	NC_020561	GCC	2	6	40690	40695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212003
1062	NC_020561	CG	3	6	40749	40754	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
1063	NC_020561	GCT	2	6	40775	40780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212003
1064	NC_020561	TCG	2	6	40870	40875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1065	NC_020561	CTGATC	2	12	40881	40892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470212004
1066	NC_020561	TGA	2	6	40894	40899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212004
1067	NC_020561	GAT	2	6	40928	40933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212004
1068	NC_020561	GCG	2	6	40959	40964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212004
1069	NC_020561	CGT	2	6	40988	40993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1070	NC_020561	CAT	2	6	41054	41059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212004
1071	NC_020561	CCG	2	6	41065	41070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212004
1072	NC_020561	CTG	2	6	41088	41093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1073	NC_020561	ATC	2	6	41100	41105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212004
1074	NC_020561	CGC	3	9	41282	41290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212004
1075	NC_020561	ATCG	2	8	41312	41319	25 %	25 %	25 %	25 %	470212004
1076	NC_020561	GGT	2	6	41336	41341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212004
1077	NC_020561	CAT	2	6	41372	41377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212004
1078	NC_020561	TCA	2	6	41407	41412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212004
1079	NC_020561	CGGCTT	2	12	41414	41425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1080	NC_020561	GGT	2	6	41450	41455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212004
1081	NC_020561	CG	5	10	41483	41492	0 %	0 %	50 %	50 %	470212004
1082	NC_020561	TCG	2	6	41524	41529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1083	NC_020561	CAGA	2	8	41538	41545	50 %	0 %	25 %	25 %	470212004
1084	NC_020561	CTGG	2	8	41573	41580	0 %	25 %	50 %	25 %	470212004
1085	NC_020561	TGC	2	6	41596	41601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1086	NC_020561	GC	3	6	41608	41613	0 %	0 %	50 %	50 %	470212004
1087	NC_020561	TCT	2	6	41686	41691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212004
1088	NC_020561	TTC	4	12	41712	41723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212004
1089	NC_020561	TCT	2	6	41725	41730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212004
1090	NC_020561	CGCTAC	2	12	41754	41765	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212004
1091	NC_020561	GGCTG	2	10	41779	41788	0 %	20 %	60 %	20 %	470212004
1092	NC_020561	GCT	2	6	41810	41815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212004
1093	NC_020561	CT	3	6	41904	41909	0 %	50 %	0 %	50 %	470212005
1094	NC_020561	TTC	2	6	41948	41953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212005
1095	NC_020561	CGA	2	6	41964	41969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212005
1096	NC_020561	GAA	2	6	41986	41991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212005
1097	NC_020561	TGCGC	2	10	42022	42031	0 %	20 %	40 %	40 %	470212005
1098	NC_020561	GAG	2	6	42047	42052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212005
1099	NC_020561	CG	3	6	42120	42125	0 %	0 %	50 %	50 %	470212005
1100	NC_020561	ACG	2	6	42126	42131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212005
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1102	NC_020561	CAC	2	6	42142	42147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212005
1103	NC_020561	CGACAT	2	12	42154	42165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470212005
1104	NC_020561	TCG	2	6	42219	42224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212005
1105	NC_020561	CG	3	6	42255	42260	0 %	0 %	50 %	50 %	470212005
1106	NC_020561	GCT	2	6	42286	42291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212005
1107	NC_020561	CGC	2	6	42322	42327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212005
1108	NC_020561	GCC	2	6	42335	42340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212005
1109	NC_020561	CAT	2	6	42514	42519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212006
1110	NC_020561	CG	3	6	42550	42555	0 %	0 %	50 %	50 %	470212006
1111	NC_020561	CTT	2	6	42592	42597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212006
1112	NC_020561	CGG	2	6	42603	42608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212006
1113	NC_020561	TCG	2	6	42621	42626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
1114	NC_020561	TGC	2	6	42645	42650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
1115	NC_020561	CTGTTC	2	12	42683	42694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470212006
1116	NC_020561	ATG	2	6	42701	42706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212006
1117	NC_020561	GC	3	6	42730	42735	0 %	0 %	50 %	50 %	470212006
1118	NC_020561	TGC	2	6	42765	42770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
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1120	NC_020561	CCG	2	6	42807	42812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212006
1121	NC_020561	GC	4	8	42839	42846	0 %	0 %	50 %	50 %	470212006
1122	NC_020561	CGC	3	9	42844	42852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212006
1123	NC_020561	TGC	2	6	42942	42947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
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1125	NC_020561	CGG	2	6	42991	42996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212006
1126	NC_020561	CCCG	2	8	42999	43006	0 %	0 %	25 %	75 %	470212006
1127	NC_020561	CGT	2	6	43031	43036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212006
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1129	NC_020561	ATC	3	9	43177	43185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212007
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1132	NC_020561	GCC	2	6	43297	43302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212007
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1134	NC_020561	CCGCGG	2	12	43344	43355	0 %	0 %	50 %	50 %	470212007
1135	NC_020561	CGA	2	6	43368	43373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212007
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1138	NC_020561	GCT	2	6	43471	43476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
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1158	NC_020561	CGA	2	6	44226	44231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212008
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1162	NC_020561	CGT	2	6	44302	44307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212008
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1249	NC_020561	GCC	2	6	47025	47030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212009
1250	NC_020561	CAC	2	6	47046	47051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212009
1251	NC_020561	GCTC	2	8	47109	47116	0 %	25 %	25 %	50 %	470212010
1252	NC_020561	TGC	2	6	47118	47123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212010
1253	NC_020561	CGA	2	6	47154	47159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212010
1254	NC_020561	GCC	3	9	47195	47203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212010
1255	NC_020561	GCT	2	6	47209	47214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212010
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1260	NC_020561	CTT	2	6	47335	47340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212010
1261	NC_020561	GATCCT	2	12	47374	47385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470212010
1262	NC_020561	TGGGCA	2	12	47397	47408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470212010
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1264	NC_020561	CTG	2	6	47429	47434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212010
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1298	NC_020561	CGC	2	6	48543	48548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1299	NC_020561	CGGG	2	8	48602	48609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1300	NC_020561	CGGG	2	8	48621	48628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1301	NC_020561	CGC	2	6	48638	48643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1302	NC_020561	CGCC	2	8	48695	48702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1303	NC_020561	CCTC	2	8	48770	48777	0 %	25 %	0 %	75 %	470212011
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1318	NC_020561	TGGAT	2	10	49245	49254	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1319	NC_020561	GAC	2	6	49267	49272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212012
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1338	NC_020561	GGATC	2	10	50041	50050	20 %	20 %	40 %	20 %	470212012
1339	NC_020561	GCC	2	6	50125	50130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212012
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1342	NC_020561	CG	4	8	50172	50179	0 %	0 %	50 %	50 %	470212012
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1364	NC_020561	ATC	2	6	50891	50896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212012
1365	NC_020561	AGGG	2	8	50906	50913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1366	NC_020561	CTT	2	6	50970	50975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212013
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1370	NC_020561	GC	3	6	51044	51049	0 %	0 %	50 %	50 %	470212013
1371	NC_020561	CGC	3	9	51047	51055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212013
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1373	NC_020561	TCT	2	6	51167	51172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212013
1374	NC_020561	CGG	2	6	51184	51189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212013
1375	NC_020561	G	6	6	51199	51204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_020561	GCCC	2	8	51210	51217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1377	NC_020561	GGC	3	9	51240	51248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212014
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1439	NC_020561	GCC	2	6	53245	53250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1463	NC_020561	GAC	2	6	54300	54305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1465	NC_020561	GAC	2	6	54322	54327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1483	NC_020561	GCC	2	6	55104	55109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1486	NC_020561	CG	3	6	55226	55231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1487	NC_020561	CGA	2	6	55250	55255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1488	NC_020561	GCC	2	6	55270	55275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1489	NC_020561	CGGCT	2	10	55293	55302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1490	NC_020561	TA	3	6	55318	55323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1491	NC_020561	TGGCC	2	10	55329	55338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1492	NC_020561	CCCG	2	8	55361	55368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1493	NC_020561	GCA	2	6	55391	55396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1494	NC_020561	TCG	2	6	55462	55467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1495	NC_020561	CGA	2	6	55473	55478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1496	NC_020561	CAT	2	6	55553	55558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1497	NC_020561	TCG	2	6	55585	55590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_020561	TCC	2	6	55612	55617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_020561	TGC	2	6	55645	55650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_020561	GGCG	2	8	55651	55658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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