MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020561	GTTG	2	8	442544	442551	0 %	50 %	50 %	0 %	470212370
12502	NC_020561	ACC	2	6	442616	442621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212370
12503	NC_020561	ACC	2	6	442629	442634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_020561	TTA	2	6	442654	442659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020561	CCGG	2	8	442730	442737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_020561	CAT	2	6	442847	442852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212371
12507	NC_020561	GC	3	6	442892	442897	0 %	0 %	50 %	50 %	470212371
12508	NC_020561	GCC	2	6	442911	442916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212371
12509	NC_020561	CGCC	2	8	442928	442935	0 %	0 %	25 %	75 %	470212371
12510	NC_020561	GCC	2	6	442959	442964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212371
12511	NC_020561	TGC	2	6	442981	442986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212371
12512	NC_020561	ACC	2	6	442989	442994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212371
12513	NC_020561	GCC	2	6	442998	443003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212371
12514	NC_020561	CTG	2	6	443043	443048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212371
12515	NC_020561	GCG	2	6	443091	443096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212371
12516	NC_020561	GGC	2	6	443230	443235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212372
12517	NC_020561	CG	4	8	443236	443243	0 %	0 %	50 %	50 %	470212372
12518	NC_020561	GCC	2	6	443315	443320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212372
12519	NC_020561	GGC	2	6	443366	443371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212372
12520	NC_020561	TGA	2	6	443388	443393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212372
12521	NC_020561	CGG	2	6	443437	443442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212372
12522	NC_020561	GCC	2	6	443480	443485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212372
12523	NC_020561	T	6	6	443497	443502	0 %	100 %	0 %	0 %	470212372
12524	NC_020561	TCG	2	6	443520	443525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212372
12525	NC_020561	CCG	2	6	443550	443555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212372
12526	NC_020561	GAC	2	6	443581	443586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212372
12527	NC_020561	CGG	3	9	443599	443607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212372
12528	NC_020561	CCG	2	6	443646	443651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212372
12529	NC_020561	GCC	2	6	443672	443677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212372
12530	NC_020561	ATT	2	6	443697	443702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212372
12531	NC_020561	ATT	2	6	443730	443735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212372
12532	NC_020561	TCT	2	6	443778	443783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212372
12533	NC_020561	ATC	2	6	443787	443792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212372
12534	NC_020561	CGCC	2	8	443869	443876	0 %	0 %	25 %	75 %	470212372
12535	NC_020561	GCT	2	6	443917	443922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212372
12536	NC_020561	CGG	2	6	443992	443997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212372
12537	NC_020561	TGA	2	6	444015	444020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212372
12538	NC_020561	GCC	2	6	444025	444030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212372
12539	NC_020561	CGG	2	6	444074	444079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212373
12540	NC_020561	CGT	2	6	444093	444098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212373
12541	NC_020561	GCCTC	2	10	444145	444154	0 %	20 %	20 %	60 %	470212373
12542	NC_020561	ACG	2	6	444185	444190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212373
12543	NC_020561	CCG	2	6	444207	444212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212373
12544	NC_020561	GAG	2	6	444256	444261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212373
12545	NC_020561	TCGCCG	2	12	444302	444313	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470212373
12546	NC_020561	GATGG	2	10	444450	444459	20 %	20 %	60 %	0 %	470212373
12547	NC_020561	CG	3	6	444460	444465	0 %	0 %	50 %	50 %	470212373
12548	NC_020561	ATC	2	6	444503	444508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212373
12549	NC_020561	GC	3	6	444512	444517	0 %	0 %	50 %	50 %	470212373
12550	NC_020561	GCT	2	6	444594	444599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212373
12551	NC_020561	CG	3	6	444602	444607	0 %	0 %	50 %	50 %	470212373
12552	NC_020561	ATC	2	6	444694	444699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212374
12553	NC_020561	CGT	2	6	444705	444710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12554	NC_020561	AGC	2	6	444751	444756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12555	NC_020561	CAG	3	9	444759	444767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12556	NC_020561	CAG	2	6	444789	444794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12557	NC_020561	CCGCC	2	10	444815	444824	0 %	0 %	20 %	80 %	470212374
12558	NC_020561	GCCGC	2	10	444835	444844	0 %	0 %	40 %	60 %	470212374
12559	NC_020561	CAG	2	6	444849	444854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12560	NC_020561	CAG	2	6	444870	444875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12561	NC_020561	CGCC	2	8	444881	444888	0 %	0 %	25 %	75 %	470212374
12562	NC_020561	GCA	2	6	444938	444943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
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12564	NC_020561	CAG	2	6	444978	444983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12565	NC_020561	CGA	2	6	444995	445000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12566	NC_020561	GCC	2	6	445009	445014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212374
12567	NC_020561	AGC	2	6	445015	445020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12568	NC_020561	CAG	3	9	445038	445046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12569	NC_020561	GCC	3	9	445053	445061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212374
12570	NC_020561	GCG	2	6	445067	445072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212374
12571	NC_020561	GCCC	2	8	445073	445080	0 %	0 %	25 %	75 %	470212374
12572	NC_020561	GCA	2	6	445088	445093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
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12576	NC_020561	CGC	3	9	445205	445213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212374
12577	NC_020561	GCGAG	2	10	445238	445247	20 %	0 %	60 %	20 %	470212374
12578	NC_020561	GCCG	2	8	445290	445297	0 %	0 %	50 %	50 %	470212374
12579	NC_020561	CG	3	6	445315	445320	0 %	0 %	50 %	50 %	470212374
12580	NC_020561	CCA	2	6	445334	445339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212374
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12582	NC_020561	CAC	2	6	445350	445355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212374
12583	NC_020561	CAG	2	6	445356	445361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12584	NC_020561	CAG	2	6	445380	445385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212374
12585	NC_020561	GCG	2	6	445407	445412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212374
12586	NC_020561	CAT	2	6	445415	445420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212374
12587	NC_020561	CATG	2	8	445446	445453	25 %	25 %	25 %	25 %	470212374
12588	NC_020561	GGCGAT	2	12	445464	445475	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12589	NC_020561	CGCC	2	8	445582	445589	0 %	0 %	25 %	75 %	470212375
12590	NC_020561	GCC	2	6	445602	445607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212375
12591	NC_020561	CCG	2	6	445624	445629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212375
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12593	NC_020561	GC	3	6	445668	445673	0 %	0 %	50 %	50 %	470212375
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12599	NC_020561	GCG	2	6	445810	445815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212375
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12602	NC_020561	CG	4	8	445874	445881	0 %	0 %	50 %	50 %	470212375
12603	NC_020561	CCA	2	6	445904	445909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212375
12604	NC_020561	GGCT	2	8	445917	445924	0 %	25 %	50 %	25 %	470212375
12605	NC_020561	CGC	2	6	445952	445957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212375
12606	NC_020561	GCGCC	2	10	445958	445967	0 %	0 %	40 %	60 %	470212375
12607	NC_020561	CGG	2	6	446102	446107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212375
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12610	NC_020561	CGC	2	6	446198	446203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212375
12611	NC_020561	CCA	3	9	446279	446287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_020561	GGC	2	6	446354	446359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212376
12613	NC_020561	GC	3	6	446368	446373	0 %	0 %	50 %	50 %	470212376
12614	NC_020561	GCG	2	6	446389	446394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212376
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12618	NC_020561	CCG	2	6	446434	446439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212376
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12743	NC_020561	GCAG	2	8	450969	450976	25 %	0 %	50 %	25 %	470212382
12744	NC_020561	GGA	2	6	450978	450983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212382
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12800	NC_020561	GCC	2	6	453029	453034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12801	NC_020561	CGC	2	6	453056	453061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12832	NC_020561	GATC	2	8	454024	454031	25 %	25 %	25 %	25 %	470212385
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12845	NC_020561	CCGCC	3	15	454431	454445	0 %	0 %	20 %	80 %	470212385
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12847	NC_020561	CCGCG	2	10	454634	454643	0 %	0 %	40 %	60 %	470212385
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12851	NC_020561	GGC	2	6	454723	454728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12852	NC_020561	GCC	2	6	454739	454744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12853	NC_020561	CGGC	2	8	454790	454797	0 %	0 %	50 %	50 %	470212386
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12857	NC_020561	ATCGAG	2	12	454925	454936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470212386
12858	NC_020561	CGG	2	6	454939	454944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212386
12859	NC_020561	CAG	2	6	454949	454954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212386
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12982	NC_020561	CGC	2	6	458881	458886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212388
12983	NC_020561	GGCT	2	8	458918	458925	0 %	25 %	50 %	25 %	470212388
12984	NC_020561	GGCG	2	8	458980	458987	0 %	0 %	75 %	25 %	470212388
12985	NC_020561	TCG	2	6	459024	459029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212388
12986	NC_020561	CCG	2	6	459048	459053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212388
12987	NC_020561	CGG	2	6	459088	459093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212388
12988	NC_020561	GCC	2	6	459125	459130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212388
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12990	NC_020561	GCC	2	6	459170	459175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212388
12991	NC_020561	CCA	2	6	459186	459191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212388
12992	NC_020561	GGCC	2	8	459193	459200	0 %	0 %	50 %	50 %	470212388
12993	NC_020561	CATC	2	8	459205	459212	25 %	25 %	0 %	50 %	470212388
12994	NC_020561	CGG	2	6	459213	459218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212388
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12998	NC_020561	CGA	2	6	459358	459363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212388
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13000	NC_020561	AAT	2	6	459407	459412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212388

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