MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020561	CAGCTT	2	12	425290	425301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470212355
12002	NC_020561	GCG	2	6	425325	425330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212355
12003	NC_020561	CCA	2	6	425351	425356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212356
12004	NC_020561	GCCG	2	8	425367	425374	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12005	NC_020561	CGC	2	6	425376	425381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12006	NC_020561	GGC	2	6	425396	425401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12007	NC_020561	GAA	2	6	425403	425408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212356
12008	NC_020561	CG	3	6	425472	425477	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12009	NC_020561	CGGC	2	8	425506	425513	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12010	NC_020561	GCCC	2	8	425549	425556	0 %	0 %	25 %	75 %	470212356
12011	NC_020561	GAA	2	6	425562	425567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212356
12012	NC_020561	GAA	2	6	425571	425576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212356
12013	NC_020561	CGG	2	6	425672	425677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12014	NC_020561	GGC	2	6	425703	425708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12015	NC_020561	CCA	2	6	425720	425725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212356
12016	NC_020561	CGG	2	6	425765	425770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12017	NC_020561	CAG	2	6	425823	425828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212356
12018	NC_020561	ATC	2	6	425854	425859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212356
12019	NC_020561	TGA	2	6	425894	425899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212356
12020	NC_020561	CGTT	2	8	425911	425918	0 %	50 %	25 %	25 %	470212356
12021	NC_020561	GAT	2	6	425922	425927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212356
12022	NC_020561	CGG	2	6	425943	425948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12023	NC_020561	GGT	2	6	425964	425969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212356
12024	NC_020561	GAA	2	6	425970	425975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212356
12025	NC_020561	CGC	2	6	425996	426001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12026	NC_020561	CCCATC	2	12	426007	426018	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	470212356
12027	NC_020561	GCG	2	6	426084	426089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12028	NC_020561	GCC	2	6	426114	426119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12029	NC_020561	TTG	2	6	426163	426168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212356
12030	NC_020561	CCA	2	6	426212	426217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212356
12031	NC_020561	CG	3	6	426229	426234	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12032	NC_020561	CG	3	6	426260	426265	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12033	NC_020561	CGC	2	6	426299	426304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12034	NC_020561	CG	3	6	426332	426337	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12035	NC_020561	TCG	2	6	426400	426405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212356
12036	NC_020561	GAT	2	6	426417	426422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212356
12037	NC_020561	GGC	2	6	426516	426521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212356
12038	NC_020561	GCC	2	6	426534	426539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12039	NC_020561	CAT	2	6	426543	426548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212356
12040	NC_020561	TCG	2	6	426577	426582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212356
12041	NC_020561	CTGC	2	8	426590	426597	0 %	25 %	25 %	50 %	470212356
12042	NC_020561	GCC	3	9	426609	426617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12043	NC_020561	CGC	2	6	426629	426634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12044	NC_020561	GCC	2	6	426651	426656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212356
12045	NC_020561	TGG	2	6	426680	426685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212356
12046	NC_020561	CG	3	6	426688	426693	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12047	NC_020561	TGC	2	6	426702	426707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212356
12048	NC_020561	CGA	2	6	426743	426748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212356
12049	NC_020561	CG	3	6	426802	426807	0 %	0 %	50 %	50 %	470212356
12050	NC_020561	TGGC	2	8	426851	426858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12051	NC_020561	CGA	2	6	426909	426914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12052	NC_020561	TCC	2	6	426920	426925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212357
12053	NC_020561	CCG	2	6	426929	426934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212357
12054	NC_020561	GCCG	2	8	426945	426952	0 %	0 %	50 %	50 %	470212357
12055	NC_020561	CG	3	6	426967	426972	0 %	0 %	50 %	50 %	470212357
12056	NC_020561	CCG	3	9	426990	426998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212357
12057	NC_020561	ACG	2	6	427020	427025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12058	NC_020561	CGAGCG	2	12	427044	427055	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470212357
12059	NC_020561	TCA	2	6	427125	427130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212357
12060	NC_020561	CGG	2	6	427164	427169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212357
12061	NC_020561	GCG	2	6	427185	427190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212357
12062	NC_020561	GCCCGC	2	12	427195	427206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212357
12063	NC_020561	GCC	2	6	427240	427245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212357
12064	NC_020561	CGA	2	6	427257	427262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12065	NC_020561	CGAG	2	8	427278	427285	25 %	0 %	50 %	25 %	470212357
12066	NC_020561	CCAT	2	8	427364	427371	25 %	25 %	0 %	50 %	470212357
12067	NC_020561	GC	3	6	427377	427382	0 %	0 %	50 %	50 %	470212357
12068	NC_020561	CGC	3	9	427380	427388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212357
12069	NC_020561	GC	3	6	427410	427415	0 %	0 %	50 %	50 %	470212357
12070	NC_020561	CAG	2	6	427429	427434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12071	NC_020561	CTG	2	6	427438	427443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12072	NC_020561	GCT	2	6	427449	427454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12073	NC_020561	TCA	3	9	427473	427481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212357
12074	NC_020561	TGC	2	6	427526	427531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212357
12075	NC_020561	ACGC	2	8	427576	427583	25 %	0 %	25 %	50 %	470212357
12076	NC_020561	GCG	2	6	427597	427602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212357
12077	NC_020561	CTC	2	6	427606	427611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212357
12078	NC_020561	GGT	2	6	427639	427644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212357
12079	NC_020561	TGG	4	12	427878	427889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212357
12080	NC_020561	GAC	2	6	428012	428017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12081	NC_020561	G	6	6	428022	428027	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_020561	CAG	2	6	428057	428062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212358
12083	NC_020561	GCG	2	6	428063	428068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212358
12084	NC_020561	GGC	3	9	428093	428101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212358
12085	NC_020561	ATG	2	6	428106	428111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212358
12086	NC_020561	CGC	2	6	428194	428199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212358
12087	NC_020561	TTG	3	9	428217	428225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212358
12088	NC_020561	CCA	2	6	428293	428298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212358
12089	NC_020561	ATC	2	6	428370	428375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212358
12090	NC_020561	GGC	2	6	428376	428381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212358
12091	NC_020561	CGG	2	6	428383	428388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212358
12092	NC_020561	GAT	3	9	428396	428404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212358
12093	NC_020561	GCC	2	6	428423	428428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212358
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12097	NC_020561	CGA	2	6	428504	428509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212358
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12101	NC_020561	CGC	2	6	428666	428671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212358
12102	NC_020561	CCA	3	9	428683	428691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212358
12103	NC_020561	GC	3	6	428703	428708	0 %	0 %	50 %	50 %	470212358
12104	NC_020561	CGTCG	2	10	428744	428753	0 %	20 %	40 %	40 %	470212358
12105	NC_020561	GTG	2	6	428814	428819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212358
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12107	NC_020561	CG	3	6	428833	428838	0 %	0 %	50 %	50 %	470212358
12108	NC_020561	AGCC	2	8	428843	428850	25 %	0 %	25 %	50 %	470212358
12109	NC_020561	TCG	2	6	428862	428867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212358
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12114	NC_020561	GAT	2	6	428951	428956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212358
12115	NC_020561	CGC	2	6	428957	428962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212358
12116	NC_020561	GCT	2	6	428981	428986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12117	NC_020561	CCG	2	6	429054	429059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212359
12118	NC_020561	GCCA	2	8	429137	429144	25 %	0 %	25 %	50 %	470212359
12119	NC_020561	GCG	2	6	429159	429164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212359
12120	NC_020561	CCG	2	6	429174	429179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212359
12121	NC_020561	GGTCAC	2	12	429214	429225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212359
12122	NC_020561	CG	3	6	429249	429254	0 %	0 %	50 %	50 %	470212359
12123	NC_020561	CG	3	6	429261	429266	0 %	0 %	50 %	50 %	470212359
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12240	NC_020561	CCG	2	6	433040	433045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212363
12241	NC_020561	CCG	2	6	433079	433084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212363
12242	NC_020561	GC	3	6	433125	433130	0 %	0 %	50 %	50 %	470212363
12243	NC_020561	GCC	2	6	433147	433152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212363
12244	NC_020561	CGAAA	2	10	433179	433188	60 %	0 %	20 %	20 %	470212363
12245	NC_020561	CCT	2	6	433208	433213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212363
12246	NC_020561	GAA	2	6	433245	433250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212363
12247	NC_020561	GGCCG	2	10	433296	433305	0 %	0 %	60 %	40 %	470212363
12248	NC_020561	CGCC	2	8	433333	433340	0 %	0 %	25 %	75 %	470212363
12249	NC_020561	CCG	2	6	433389	433394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212363
12250	NC_020561	GTC	2	6	433416	433421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212363
12251	NC_020561	CAG	2	6	433440	433445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212363
12252	NC_020561	ATG	2	6	433482	433487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212363
12253	NC_020561	CG	3	6	433518	433523	0 %	0 %	50 %	50 %	470212363
12254	NC_020561	GC	3	6	433560	433565	0 %	0 %	50 %	50 %	470212363
12255	NC_020561	CCG	2	6	433649	433654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212363
12256	NC_020561	GCC	2	6	433701	433706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212363
12257	NC_020561	CG	4	8	433825	433832	0 %	0 %	50 %	50 %	470212364
12258	NC_020561	GAT	2	6	433837	433842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212364
12259	NC_020561	CTG	3	9	433859	433867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212364
12260	NC_020561	TGG	2	6	433878	433883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212364
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12262	NC_020561	GCC	2	6	433925	433930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212364
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12264	NC_020561	CCCG	2	8	433975	433982	0 %	0 %	25 %	75 %	470212364
12265	NC_020561	GCCCGC	2	12	433999	434010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212364
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12267	NC_020561	GCG	2	6	434046	434051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212364
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12269	NC_020561	CGG	2	6	434095	434100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212364
12270	NC_020561	TCG	3	9	434115	434123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212364
12271	NC_020561	GCC	2	6	434202	434207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212364
12272	NC_020561	CTCG	2	8	434233	434240	0 %	25 %	25 %	50 %	470212364
12273	NC_020561	CGGCC	2	10	434242	434251	0 %	0 %	40 %	60 %	470212364
12274	NC_020561	CGC	2	6	434257	434262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212364
12275	NC_020561	CCCG	2	8	434263	434270	0 %	0 %	25 %	75 %	470212364
12276	NC_020561	GGCC	2	8	434386	434393	0 %	0 %	50 %	50 %	470212364
12277	NC_020561	TCG	2	6	434412	434417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212364
12278	NC_020561	CGAG	2	8	434439	434446	25 %	0 %	50 %	25 %	470212364
12279	NC_020561	CAA	2	6	434512	434517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212364
12280	NC_020561	ACA	2	6	434583	434588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12281	NC_020561	AT	3	6	434620	434625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12282	NC_020561	GTC	2	6	434642	434647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12283	NC_020561	TCAT	2	8	434648	434655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12284	NC_020561	CGG	2	6	434743	434748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12285	NC_020561	TCC	2	6	434792	434797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212365
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12288	NC_020561	GAC	2	6	434836	434841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212365
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12290	NC_020561	ACGCCG	2	12	434920	434931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212365
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12304	NC_020561	CAACAC	2	12	435339	435350	50 %	0 %	0 %	50 %	470212365
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12310	NC_020561	GAC	2	6	435568	435573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212365
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12312	NC_020561	TCA	2	6	435617	435622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212365
12313	NC_020561	GAT	2	6	435720	435725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212365
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12315	NC_020561	CTG	2	6	435832	435837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212365
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12319	NC_020561	CCG	2	6	435961	435966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212365
12320	NC_020561	CGG	2	6	436028	436033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212365
12321	NC_020561	CAA	3	9	436062	436070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212365
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12323	NC_020561	GCG	2	6	436123	436128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212365
12324	NC_020561	CTT	2	6	436161	436166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212365
12325	NC_020561	CGCGA	2	10	436195	436204	20 %	0 %	40 %	40 %	470212365
12326	NC_020561	GCA	3	9	436256	436264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212365
12327	NC_020561	GC	3	6	436292	436297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12328	NC_020561	GCG	2	6	436312	436317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12329	NC_020561	GCC	2	6	436329	436334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12330	NC_020561	CCTGCT	2	12	436393	436404	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470212366
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12336	NC_020561	CGT	2	6	436645	436650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
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12344	NC_020561	CGG	2	6	437061	437066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
12345	NC_020561	TCA	2	6	437091	437096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212366
12346	NC_020561	CAC	2	6	437104	437109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212366
12347	NC_020561	GGC	2	6	437162	437167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212366
12348	NC_020561	CGGC	2	8	437181	437188	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
12349	NC_020561	CGC	2	6	437206	437211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
12350	NC_020561	CCT	2	6	437214	437219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212366
12351	NC_020561	CG	3	6	437238	437243	0 %	0 %	50 %	50 %	470212366
12352	NC_020561	TGC	2	6	437247	437252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
12353	NC_020561	GCTC	2	8	437259	437266	0 %	25 %	25 %	50 %	470212366
12354	NC_020561	CGC	2	6	437286	437291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
12355	NC_020561	TCA	2	6	437310	437315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212366
12356	NC_020561	TGC	2	6	437328	437333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
12357	NC_020561	GCC	2	6	437424	437429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212366
12358	NC_020561	GTC	2	6	437431	437436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212366
12359	NC_020561	ACA	3	9	437640	437648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212366
12360	NC_020561	CAA	2	6	437665	437670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212366
12361	NC_020561	CCTCG	2	10	437671	437680	0 %	20 %	20 %	60 %	470212366
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12479	NC_020561	CG	3	6	441613	441618	0 %	0 %	50 %	50 %	470212369
12480	NC_020561	GAC	2	6	441665	441670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212369
12481	NC_020561	GAA	3	9	441674	441682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212369
12482	NC_020561	GCA	2	6	441709	441714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212369
12483	NC_020561	CGAC	2	8	441748	441755	25 %	0 %	25 %	50 %	470212369
12484	NC_020561	CGC	2	6	441776	441781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212369
12485	NC_020561	ACG	2	6	441798	441803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212369
12486	NC_020561	TGA	2	6	441808	441813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212369
12487	NC_020561	AAT	2	6	441859	441864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212369
12488	NC_020561	TCG	2	6	441933	441938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212369
12489	NC_020561	ACG	2	6	442019	442024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212370
12490	NC_020561	GCG	2	6	442091	442096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212370
12491	NC_020561	CCG	2	6	442133	442138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212370
12492	NC_020561	CGC	2	6	442143	442148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212370
12493	NC_020561	TGA	2	6	442209	442214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212370
12494	NC_020561	GCT	2	6	442335	442340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212370
12495	NC_020561	GCCAGC	2	12	442403	442414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212370
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12497	NC_020561	TGAT	2	8	442436	442443	25 %	50 %	25 %	0 %	470212370
12498	NC_020561	ACCGCG	2	12	442457	442468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212370
12499	NC_020561	CGG	2	6	442488	442493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212370
12500	NC_020561	CGCCTT	2	12	442521	442532	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470212370

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