MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020561	C	7	7	390563	390569	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11002	NC_020561	GGA	2	6	390592	390597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_020561	CCG	2	6	390615	390620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212318
11004	NC_020561	GGCTGC	2	12	390683	390694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470212318
11005	NC_020561	GCC	2	6	390706	390711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212318
11006	NC_020561	CCG	2	6	390721	390726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212318
11007	NC_020561	CCG	2	6	390814	390819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212318
11008	NC_020561	GCG	2	6	390822	390827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212318
11009	NC_020561	CGC	2	6	390895	390900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212318
11010	NC_020561	GA	3	6	390925	390930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_020561	GCC	2	6	390972	390977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212319
11012	NC_020561	CCG	2	6	391008	391013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212319
11013	NC_020561	CG	3	6	391012	391017	0 %	0 %	50 %	50 %	470212319
11014	NC_020561	AAG	2	6	391030	391035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212319
11015	NC_020561	GAT	2	6	391050	391055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212319
11016	NC_020561	CTT	2	6	391056	391061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212319
11017	NC_020561	TCCG	2	8	391202	391209	0 %	25 %	25 %	50 %	470212319
11018	NC_020561	CGGC	2	8	391229	391236	0 %	0 %	50 %	50 %	470212319
11019	NC_020561	CGA	2	6	391266	391271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212319
11020	NC_020561	GC	3	6	391275	391280	0 %	0 %	50 %	50 %	470212319
11021	NC_020561	CGG	2	6	391284	391289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212319
11022	NC_020561	GCCG	2	8	391323	391330	0 %	0 %	50 %	50 %	470212319
11023	NC_020561	GGA	2	6	391335	391340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212319
11024	NC_020561	CCA	2	6	391359	391364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212319
11025	NC_020561	CCA	2	6	391373	391378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212319
11026	NC_020561	CTT	2	6	391489	391494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212319
11027	NC_020561	GC	4	8	391499	391506	0 %	0 %	50 %	50 %	470212319
11028	NC_020561	TTCC	2	8	391509	391516	0 %	50 %	0 %	50 %	470212319
11029	NC_020561	CG	3	6	391517	391522	0 %	0 %	50 %	50 %	470212319
11030	NC_020561	CGT	2	6	391545	391550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212319
11031	NC_020561	TCG	2	6	391631	391636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212319
11032	NC_020561	TGA	2	6	391661	391666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212319
11033	NC_020561	TCG	2	6	391667	391672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212319
11034	NC_020561	GCG	2	6	391673	391678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212319
11035	NC_020561	TCC	2	6	391720	391725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212319
11036	NC_020561	CGC	2	6	391768	391773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212319
11037	NC_020561	GCC	2	6	391812	391817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212319
11038	NC_020561	GCC	2	6	391854	391859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11039	NC_020561	CGC	3	9	391877	391885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_020561	CAT	2	6	391888	391893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_020561	CAT	2	6	391895	391900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_020561	CGG	2	6	391901	391906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_020561	GCC	2	6	391948	391953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_020561	CGG	2	6	391973	391978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212320
11045	NC_020561	GCC	2	6	392038	392043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212320
11046	NC_020561	TCGA	2	8	392099	392106	25 %	25 %	25 %	25 %	470212320
11047	NC_020561	GGCCA	2	10	392107	392116	20 %	0 %	40 %	40 %	470212320
11048	NC_020561	TAT	2	6	392160	392165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212320
11049	NC_020561	CCGC	2	8	392175	392182	0 %	0 %	25 %	75 %	470212320
11050	NC_020561	GCG	2	6	392200	392205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212320
11051	NC_020561	TGG	2	6	392238	392243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212320
11052	NC_020561	CGG	2	6	392292	392297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212320
11053	NC_020561	ACGGC	2	10	392316	392325	20 %	0 %	40 %	40 %	470212320
11054	NC_020561	CGA	2	6	392337	392342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212320
11055	NC_020561	CG	3	6	392364	392369	0 %	0 %	50 %	50 %	470212320
11056	NC_020561	CAC	2	6	392377	392382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212320
11057	NC_020561	CGT	2	6	392383	392388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212320
11058	NC_020561	GC	3	6	392395	392400	0 %	0 %	50 %	50 %	470212320
11059	NC_020561	CGC	2	6	392431	392436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212320
11060	NC_020561	GC	3	6	392461	392466	0 %	0 %	50 %	50 %	470212320
11061	NC_020561	CGC	2	6	392469	392474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212320
11062	NC_020561	AGCTGT	2	12	392481	392492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470212320
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11064	NC_020561	CGGC	2	8	392511	392518	0 %	0 %	50 %	50 %	470212320
11065	NC_020561	CAG	2	6	392536	392541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212320
11066	NC_020561	TCA	2	6	392550	392555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212320
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11068	NC_020561	GCA	2	6	392628	392633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212320
11069	NC_020561	GC	3	6	392646	392651	0 %	0 %	50 %	50 %	470212320
11070	NC_020561	TCCGA	2	10	392699	392708	20 %	20 %	20 %	40 %	470212320
11071	NC_020561	GATCG	2	10	392741	392750	20 %	20 %	40 %	20 %	470212320
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11076	NC_020561	CGATCA	2	12	392886	392897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470212320
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11080	NC_020561	CG	3	6	392987	392992	0 %	0 %	50 %	50 %	470212321
11081	NC_020561	GCC	2	6	393014	393019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212321
11082	NC_020561	CGAA	2	8	393025	393032	50 %	0 %	25 %	25 %	470212321
11083	NC_020561	CTT	2	6	393059	393064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212321
11084	NC_020561	CTCG	2	8	393101	393108	0 %	25 %	25 %	50 %	470212321
11085	NC_020561	AGA	2	6	393163	393168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212321
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11091	NC_020561	CAGCTC	2	12	393275	393286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212321
11092	NC_020561	GCG	2	6	393403	393408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212321
11093	NC_020561	CG	3	6	393472	393477	0 %	0 %	50 %	50 %	470212321
11094	NC_020561	CAC	3	9	393503	393511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212321
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11101	NC_020561	GCCG	2	8	393811	393818	0 %	0 %	50 %	50 %	470212321
11102	NC_020561	CT	3	6	393876	393881	0 %	50 %	0 %	50 %	470212321
11103	NC_020561	GCC	2	6	393893	393898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212321
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11105	NC_020561	GC	3	6	393924	393929	0 %	0 %	50 %	50 %	470212321
11106	NC_020561	TTG	2	6	394047	394052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212321
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11109	NC_020561	GAT	2	6	394163	394168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212321
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11111	NC_020561	TCC	2	6	394248	394253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_020561	A	6	6	394279	394284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_020561	AT	3	6	394320	394325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_020561	GAT	2	6	394365	394370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_020561	CCGG	2	8	394371	394378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11116	NC_020561	CAGCC	2	10	394390	394399	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11117	NC_020561	TCT	2	6	394456	394461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212322
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11122	NC_020561	CGG	2	6	394627	394632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212322
11123	NC_020561	CCTT	2	8	394651	394658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11124	NC_020561	GGC	2	6	394685	394690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_020561	ATC	2	6	394800	394805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212323
11126	NC_020561	GCC	2	6	394811	394816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212323
11127	NC_020561	GAC	2	6	394871	394876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212323
11128	NC_020561	GGC	3	9	394877	394885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212323
11129	NC_020561	CGG	2	6	394912	394917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212323
11130	NC_020561	CAG	2	6	394928	394933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212323
11131	NC_020561	CTTC	2	8	394936	394943	0 %	50 %	0 %	50 %	470212323
11132	NC_020561	GCA	2	6	394954	394959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212323
11133	NC_020561	CGTC	2	8	394960	394967	0 %	25 %	25 %	50 %	470212323
11134	NC_020561	CGA	2	6	395053	395058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212323
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11141	NC_020561	GCC	2	6	395297	395302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212323
11142	NC_020561	CCG	2	6	395314	395319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212323
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11146	NC_020561	CCGAT	2	10	395476	395485	20 %	20 %	20 %	40 %	470212323
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11148	NC_020561	CGA	2	6	395559	395564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11157	NC_020561	CGC	2	6	395736	395741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212324
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11182	NC_020561	CTGCC	2	10	396499	396508	0 %	20 %	20 %	60 %	470212324
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11184	NC_020561	GCCC	2	8	396583	396590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11185	NC_020561	GAC	2	6	396604	396609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11203	NC_020561	GTC	2	6	397118	397123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11230	NC_020561	CGC	2	6	398357	398362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212328
11231	NC_020561	CGC	2	6	398408	398413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212328
11232	NC_020561	GAA	2	6	398433	398438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212328
11233	NC_020561	GAAA	2	8	398474	398481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_020561	GGC	2	6	398503	398508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11235	NC_020561	CCTG	2	8	398515	398522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11236	NC_020561	GCG	2	6	398542	398547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
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11240	NC_020561	CGC	2	6	398654	398659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212329
11241	NC_020561	CGCC	2	8	398695	398702	0 %	0 %	25 %	75 %	470212329
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11243	NC_020561	GCG	2	6	398758	398763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212329
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11246	NC_020561	CAGC	2	8	398822	398829	25 %	0 %	25 %	50 %	470212329
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11264	NC_020561	GAT	2	6	399668	399673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212330
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11275	NC_020561	CGG	2	6	399863	399868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212330
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11351	NC_020561	CG	5	10	402249	402258	0 %	0 %	50 %	50 %	470212332
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11358	NC_020561	TCA	2	6	402419	402424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11359	NC_020561	TGA	2	6	402438	402443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11361	NC_020561	CGG	2	6	402488	402493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11362	NC_020561	CCGGCC	2	12	402532	402543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11363	NC_020561	GGA	2	6	402548	402553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11364	NC_020561	GCC	2	6	402558	402563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212333
11365	NC_020561	AGC	2	6	402615	402620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212333
11366	NC_020561	GC	5	10	402664	402673	0 %	0 %	50 %	50 %	470212333
11367	NC_020561	CTC	2	6	402692	402697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212333
11368	NC_020561	CGC	2	6	402755	402760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212333
11369	NC_020561	CCG	2	6	402764	402769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212333
11370	NC_020561	CCT	2	6	402784	402789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212333
11371	NC_020561	CGG	2	6	402790	402795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212333
11372	NC_020561	GCA	2	6	402808	402813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212333
11373	NC_020561	GGA	2	6	402833	402838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212333
11374	NC_020561	TCC	2	6	402858	402863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212333
11375	NC_020561	GAC	2	6	402926	402931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212333
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11378	NC_020561	AGC	2	6	403020	403025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212333
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11382	NC_020561	TCT	2	6	403168	403173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212333
11383	NC_020561	TCCGG	2	10	403192	403201	0 %	20 %	40 %	40 %	470212333
11384	NC_020561	GCCCG	2	10	403230	403239	0 %	0 %	40 %	60 %	470212333
11385	NC_020561	CAGGC	2	10	403248	403257	20 %	0 %	40 %	40 %	470212333
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11394	NC_020561	CCCG	2	8	403584	403591	0 %	0 %	25 %	75 %	470212333
11395	NC_020561	GCA	3	9	403690	403698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212333
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11400	NC_020561	TCC	3	9	403797	403805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212333
11401	NC_020561	GCC	2	6	403826	403831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212333
11402	NC_020561	GGC	2	6	403844	403849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212333
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11412	NC_020561	CGG	2	6	404188	404193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212333
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11423	NC_020561	GCCC	2	8	404462	404469	0 %	0 %	25 %	75 %	470212333
11424	NC_020561	CGAT	2	8	404484	404491	25 %	25 %	25 %	25 %	470212333
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11427	NC_020561	CGGCT	2	10	404636	404645	0 %	20 %	40 %	40 %	470212333
11428	NC_020561	GC	3	6	404658	404663	0 %	0 %	50 %	50 %	470212333
11429	NC_020561	GAG	2	6	404757	404762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11430	NC_020561	CGC	3	9	404808	404816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11431	NC_020561	CG	3	6	404830	404835	0 %	0 %	50 %	50 %	470212334
11432	NC_020561	CGGC	2	8	404849	404856	0 %	0 %	50 %	50 %	470212334
11433	NC_020561	CGG	2	6	404884	404889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212334
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11442	NC_020561	ATC	2	6	405139	405144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212334
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11444	NC_020561	CAGCC	2	10	405165	405174	20 %	0 %	20 %	60 %	470212334
11445	NC_020561	CGG	2	6	405235	405240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11479	NC_020561	GGC	2	6	406233	406238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212335
11480	NC_020561	GATG	2	8	406259	406266	25 %	25 %	50 %	0 %	470212335
11481	NC_020561	CCG	3	9	406267	406275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212335
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11484	NC_020561	CAA	2	6	406361	406366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212335
11485	NC_020561	CGC	2	6	406370	406375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212335
11486	NC_020561	GCG	2	6	406378	406383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212335
11487	NC_020561	CGG	2	6	406412	406417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212335
11488	NC_020561	GGA	2	6	406433	406438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212335
11489	NC_020561	TCG	2	6	406447	406452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212335
11490	NC_020561	CGCC	2	8	406469	406476	0 %	0 %	25 %	75 %	470212335
11491	NC_020561	CCCG	2	8	406542	406549	0 %	0 %	25 %	75 %	470212336
11492	NC_020561	CGG	3	9	406588	406596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212336
11493	NC_020561	CGG	2	6	406611	406616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212336
11494	NC_020561	GCC	3	9	406652	406660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212336
11495	NC_020561	TCGGC	2	10	406792	406801	0 %	20 %	40 %	40 %	470212336
11496	NC_020561	GCTCAC	2	12	406852	406863	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212336
11497	NC_020561	GGC	2	6	406892	406897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212336
11498	NC_020561	TCC	2	6	406902	406907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212336
11499	NC_020561	CG	3	6	406911	406916	0 %	0 %	50 %	50 %	470212336
11500	NC_020561	GGGCT	2	10	406928	406937	0 %	20 %	60 %	20 %	470212336

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