MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_020561	TCGA	2	8	3820649	3820656	25 %	25 %	25 %	25 %	470215548
110002	NC_020561	GGC	2	6	3820657	3820662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110003	NC_020561	CCG	2	6	3820666	3820671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215548
110004	NC_020561	TGT	2	6	3820683	3820688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470215548
110005	NC_020561	GAG	2	6	3820754	3820759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470215548
110006	NC_020561	GGA	2	6	3820765	3820770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470215548
110007	NC_020561	GCG	3	9	3820801	3820809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110008	NC_020561	GCT	2	6	3820834	3820839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110009	NC_020561	TCG	2	6	3820884	3820889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110010	NC_020561	CAT	2	6	3820900	3820905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215548
110011	NC_020561	AGC	2	6	3820944	3820949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110012	NC_020561	TCG	2	6	3821061	3821066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110013	NC_020561	GTG	2	6	3821093	3821098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215548
110014	NC_020561	TCC	2	6	3821106	3821111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215548
110015	NC_020561	GCC	2	6	3821117	3821122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215548
110016	NC_020561	GTC	2	6	3821135	3821140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110017	NC_020561	GCAA	2	8	3821169	3821176	50 %	0 %	25 %	25 %	470215548
110018	NC_020561	CGG	2	6	3821178	3821183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110019	NC_020561	CG	3	6	3821189	3821194	0 %	0 %	50 %	50 %	470215548
110020	NC_020561	CGG	2	6	3821205	3821210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110021	NC_020561	CGA	2	6	3821257	3821262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110022	NC_020561	CGGG	2	8	3821297	3821304	0 %	0 %	75 %	25 %	470215548
110023	NC_020561	GTC	2	6	3821312	3821317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110024	NC_020561	TCG	2	6	3821325	3821330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110025	NC_020561	ACGC	2	8	3821339	3821346	25 %	0 %	25 %	50 %	470215548
110026	NC_020561	GCG	2	6	3821365	3821370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110027	NC_020561	GGC	2	6	3821375	3821380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110028	NC_020561	CTT	2	6	3821455	3821460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470215548
110029	NC_020561	CCG	2	6	3821463	3821468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215548
110030	NC_020561	CG	4	8	3821472	3821479	0 %	0 %	50 %	50 %	470215548
110031	NC_020561	GCG	2	6	3821489	3821494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110032	NC_020561	CGGC	2	8	3821616	3821623	0 %	0 %	50 %	50 %	470215548
110033	NC_020561	CGG	2	6	3821628	3821633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110034	NC_020561	CAT	2	6	3821671	3821676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215548
110035	NC_020561	AGC	2	6	3821679	3821684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110036	NC_020561	GCC	2	6	3821699	3821704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215548
110037	NC_020561	GATC	2	8	3821713	3821720	25 %	25 %	25 %	25 %	470215548
110038	NC_020561	TGG	2	6	3821721	3821726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215548
110039	NC_020561	TGC	2	6	3821738	3821743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215548
110040	NC_020561	GGT	2	6	3821791	3821796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215548
110041	NC_020561	CAT	2	6	3821821	3821826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215548
110042	NC_020561	CAA	2	6	3821854	3821859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470215548
110043	NC_020561	CGG	2	6	3821883	3821888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110044	NC_020561	CGG	2	6	3821912	3821917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110045	NC_020561	AT	3	6	3821923	3821928	50 %	50 %	0 %	0 %	470215548
110046	NC_020561	TGG	2	6	3821979	3821984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215548
110047	NC_020561	GC	3	6	3822019	3822024	0 %	0 %	50 %	50 %	470215548
110048	NC_020561	GCG	2	6	3822132	3822137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110049	NC_020561	CGG	2	6	3822158	3822163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215548
110050	NC_020561	CCG	2	6	3822195	3822200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110051	NC_020561	TCGCA	2	10	3822236	3822245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110052	NC_020561	CGC	2	6	3822250	3822255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110053	NC_020561	CAT	2	6	3822307	3822312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215549
110054	NC_020561	TCG	2	6	3822339	3822344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215549
110055	NC_020561	GC	3	6	3822429	3822434	0 %	0 %	50 %	50 %	470215549
110056	NC_020561	GAG	2	6	3822440	3822445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470215549
110057	NC_020561	CGAC	2	8	3822447	3822454	25 %	0 %	25 %	50 %	470215549
110058	NC_020561	CG	3	6	3822455	3822460	0 %	0 %	50 %	50 %	470215549
110059	NC_020561	CCG	3	9	3822531	3822539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215549
110060	NC_020561	CTT	2	6	3822605	3822610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470215549
110061	NC_020561	CGGACG	2	12	3822663	3822674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470215549
110062	NC_020561	TCG	2	6	3822678	3822683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215549
110063	NC_020561	CGG	3	9	3822691	3822699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215549
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110065	NC_020561	CGC	2	6	3822775	3822780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215549
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110067	NC_020561	CGG	2	6	3822883	3822888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215549
110068	NC_020561	CAT	2	6	3822943	3822948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215549
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110070	NC_020561	CGG	2	6	3822966	3822971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215549
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110072	NC_020561	CGCT	2	8	3822992	3822999	0 %	25 %	25 %	50 %	470215549
110073	NC_020561	GCC	2	6	3823076	3823081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215549
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110075	NC_020561	TCG	2	6	3823122	3823127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215549
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110078	NC_020561	GCT	2	6	3823198	3823203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215549
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110080	NC_020561	C	6	6	3823278	3823283	0 %	0 %	0 %	100 %	470215549
110081	NC_020561	GAA	2	6	3823292	3823297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470215549
110082	NC_020561	GCCG	2	8	3823300	3823307	0 %	0 %	50 %	50 %	470215549
110083	NC_020561	GCC	2	6	3823325	3823330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215549
110084	NC_020561	CTG	2	6	3823334	3823339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215549
110085	NC_020561	GC	3	6	3823354	3823359	0 %	0 %	50 %	50 %	470215549
110086	NC_020561	CG	3	6	3823373	3823378	0 %	0 %	50 %	50 %	470215549
110087	NC_020561	TGGG	2	8	3823412	3823419	0 %	25 %	75 %	0 %	470215549
110088	NC_020561	GGGC	2	8	3823433	3823440	0 %	0 %	75 %	25 %	470215549
110089	NC_020561	CGG	2	6	3823471	3823476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215549
110090	NC_020561	GGT	2	6	3823492	3823497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215549
110091	NC_020561	GCT	3	9	3823504	3823512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215549
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110095	NC_020561	GAGGG	2	10	3823752	3823761	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110096	NC_020561	TCC	2	6	3823765	3823770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110097	NC_020561	CG	3	6	3823840	3823845	0 %	0 %	50 %	50 %	470215550
110098	NC_020561	GCA	2	6	3823875	3823880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215550
110099	NC_020561	CG	3	6	3823892	3823897	0 %	0 %	50 %	50 %	470215550
110100	NC_020561	CGC	2	6	3823926	3823931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215550
110101	NC_020561	CGA	2	6	3823947	3823952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215550
110102	NC_020561	GCG	2	6	3823992	3823997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215550
110103	NC_020561	TGA	2	6	3824021	3824026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470215550
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110106	NC_020561	GGC	2	6	3824111	3824116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215551
110107	NC_020561	GC	3	6	3824143	3824148	0 %	0 %	50 %	50 %	470215551
110108	NC_020561	GAG	2	6	3824175	3824180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470215551
110109	NC_020561	GGC	2	6	3824210	3824215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215551
110110	NC_020561	GC	4	8	3824214	3824221	0 %	0 %	50 %	50 %	470215551
110111	NC_020561	GGC	2	6	3824330	3824335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215551
110112	NC_020561	CAG	2	6	3824375	3824380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215551
110113	NC_020561	CGC	2	6	3824488	3824493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215551
110114	NC_020561	AT	3	6	3824497	3824502	50 %	50 %	0 %	0 %	470215551
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110116	NC_020561	CGCC	2	8	3824611	3824618	0 %	0 %	25 %	75 %	470215551
110117	NC_020561	TCC	2	6	3824703	3824708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215551
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110214	NC_020561	GC	3	6	3828180	3828185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110215	NC_020561	GGC	2	6	3828204	3828209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110216	NC_020561	TTCCC	2	10	3828227	3828236	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
110217	NC_020561	CGAT	2	8	3828262	3828269	25 %	25 %	25 %	25 %	470215554
110218	NC_020561	GC	3	6	3828345	3828350	0 %	0 %	50 %	50 %	470215554
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110223	NC_020561	G	6	6	3828422	3828427	0 %	0 %	100 %	0 %	470215554
110224	NC_020561	CAT	2	6	3828428	3828433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215554
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110227	NC_020561	GCGCC	2	10	3828638	3828647	0 %	0 %	40 %	60 %	470215554
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110229	NC_020561	GAAG	2	8	3828680	3828687	50 %	0 %	50 %	0 %	470215554
110230	NC_020561	CAT	2	6	3828698	3828703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215554
110231	NC_020561	TCC	2	6	3828712	3828717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215554
110232	NC_020561	CCT	2	6	3828758	3828763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215554
110233	NC_020561	GCCG	2	8	3828817	3828824	0 %	0 %	50 %	50 %	470215554
110234	NC_020561	CAA	3	9	3828899	3828907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470215554
110235	NC_020561	GGC	2	6	3828911	3828916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215554
110236	NC_020561	GCC	6	18	3828974	3828991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215554
110237	NC_020561	TGG	2	6	3828997	3829002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215554
110238	NC_020561	G	6	6	3829058	3829063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110239	NC_020561	CGG	2	6	3829075	3829080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215555
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110245	NC_020561	GCC	2	6	3829334	3829339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215555
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110249	NC_020561	CGG	2	6	3829521	3829526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215555
110250	NC_020561	CCG	2	6	3829559	3829564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110251	NC_020561	TTG	2	6	3829605	3829610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470215556
110252	NC_020561	GAC	2	6	3829652	3829657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215556
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110254	NC_020561	CGA	2	6	3829723	3829728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215556
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110260	NC_020561	CG	4	8	3829975	3829982	0 %	0 %	50 %	50 %	470215556
110261	NC_020561	ATC	2	6	3830040	3830045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215556
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110266	NC_020561	CG	3	6	3830228	3830233	0 %	0 %	50 %	50 %	470215556
110267	NC_020561	GC	3	6	3830279	3830284	0 %	0 %	50 %	50 %	470215556
110268	NC_020561	CGG	2	6	3830323	3830328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215556
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110302	NC_020561	CGG	2	6	3831436	3831441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215556
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110316	NC_020561	GGC	2	6	3831864	3831869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215557
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110328	NC_020561	GCC	2	6	3832321	3832326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215557
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110330	NC_020561	CCCG	2	8	3832442	3832449	0 %	0 %	25 %	75 %	470215557
110331	NC_020561	GCG	2	6	3832516	3832521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215557
110332	NC_020561	GCCC	2	8	3832606	3832613	0 %	0 %	25 %	75 %	470215558
110333	NC_020561	CGG	2	6	3832657	3832662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215558
110334	NC_020561	GGA	2	6	3832683	3832688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470215558
110335	NC_020561	TTC	2	6	3832690	3832695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470215558
110336	NC_020561	GATC	2	8	3832751	3832758	25 %	25 %	25 %	25 %	470215558
110337	NC_020561	TCA	2	6	3832799	3832804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215558
110338	NC_020561	GCT	3	9	3832869	3832877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215558
110339	NC_020561	ACGA	2	8	3832880	3832887	50 %	0 %	25 %	25 %	470215558
110340	NC_020561	GA	3	6	3832886	3832891	50 %	0 %	50 %	0 %	470215558
110341	NC_020561	CG	3	6	3832961	3832966	0 %	0 %	50 %	50 %	470215558
110342	NC_020561	CAG	2	6	3833056	3833061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215558
110343	NC_020561	CTG	2	6	3833065	3833070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215558
110344	NC_020561	GA	3	6	3833097	3833102	50 %	0 %	50 %	0 %	470215559
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110346	NC_020561	CG	3	6	3833134	3833139	0 %	0 %	50 %	50 %	470215559
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110455	NC_020561	GGC	2	6	3836080	3836085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215560
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110457	NC_020561	CGG	2	6	3836112	3836117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215560
110458	NC_020561	GCGG	2	8	3836126	3836133	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110459	NC_020561	GGCA	2	8	3836169	3836176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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