MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
102001	NC_020561	CGAT	2	8	3540756	3540763	25 %	25 %	25 %	25 %	470215285
102002	NC_020561	G	6	6	3540805	3540810	0 %	0 %	100 %	0 %	470215285
102003	NC_020561	CCG	2	6	3540847	3540852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215285
102004	NC_020561	CGA	2	6	3540865	3540870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215285
102005	NC_020561	GCCG	2	8	3540875	3540882	0 %	0 %	50 %	50 %	470215285
102006	NC_020561	GCC	2	6	3540933	3540938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215285
102007	NC_020561	ATGG	2	8	3540974	3540981	25 %	25 %	50 %	0 %	470215285
102008	NC_020561	CGC	2	6	3541001	3541006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215285
102009	NC_020561	CAG	3	9	3541007	3541015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215285
102010	NC_020561	CGG	2	6	3541045	3541050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215285
102011	NC_020561	TCC	2	6	3541077	3541082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215285
102012	NC_020561	GGA	2	6	3541096	3541101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470215285
102013	NC_020561	GCG	3	9	3541164	3541172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215285
102014	NC_020561	GGCGCC	2	12	3541184	3541195	0 %	0 %	50 %	50 %	470215285
102015	NC_020561	CGAT	2	8	3541367	3541374	25 %	25 %	25 %	25 %	470215285
102016	NC_020561	GGC	2	6	3541439	3541444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215285
102017	NC_020561	CGCC	2	8	3541484	3541491	0 %	0 %	25 %	75 %	470215286
102018	NC_020561	TCA	2	6	3541515	3541520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215286
102019	NC_020561	CGT	2	6	3541561	3541566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102020	NC_020561	GC	4	8	3541602	3541609	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102021	NC_020561	CGC	2	6	3541623	3541628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215286
102022	NC_020561	GCCG	2	8	3541633	3541640	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102023	NC_020561	TCG	2	6	3541643	3541648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102024	NC_020561	CG	3	6	3541657	3541662	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102025	NC_020561	TCG	2	6	3541715	3541720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102026	NC_020561	GCCG	2	8	3541724	3541731	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102027	NC_020561	GCGG	2	8	3541799	3541806	0 %	0 %	75 %	25 %	470215286
102028	NC_020561	GGC	2	6	3541911	3541916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215286
102029	NC_020561	CCAGCG	2	12	3541920	3541931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470215286
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102032	NC_020561	CG	3	6	3542011	3542016	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102033	NC_020561	CAG	2	6	3542026	3542031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102034	NC_020561	TCC	2	6	3542087	3542092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215286
102035	NC_020561	GTC	2	6	3542203	3542208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215286
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102037	NC_020561	GGATCG	2	12	3542255	3542266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470215286
102038	NC_020561	CTC	2	6	3542287	3542292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215286
102039	NC_020561	CGG	2	6	3542309	3542314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215286
102040	NC_020561	TCGCC	2	10	3542316	3542325	0 %	20 %	20 %	60 %	470215286
102041	NC_020561	CGG	2	6	3542338	3542343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215286
102042	NC_020561	GAGG	2	8	3542359	3542366	25 %	0 %	75 %	0 %	470215286
102043	NC_020561	CCA	2	6	3542388	3542393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470215286
102044	NC_020561	TCG	2	6	3542435	3542440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102045	NC_020561	GC	3	6	3542455	3542460	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102046	NC_020561	GGCA	2	8	3542468	3542475	25 %	0 %	50 %	25 %	470215286
102047	NC_020561	CATCGC	2	12	3542479	3542490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470215286
102048	NC_020561	GCGCG	2	10	3542518	3542527	0 %	0 %	60 %	40 %	470215286
102049	NC_020561	GC	3	6	3542531	3542536	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102050	NC_020561	CAG	2	6	3542551	3542556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102051	NC_020561	GGC	2	6	3542620	3542625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215286
102052	NC_020561	GC	3	6	3542631	3542636	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102053	NC_020561	GCC	2	6	3542671	3542676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215286
102054	NC_020561	GTC	2	6	3542711	3542716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215286
102055	NC_020561	CG	3	6	3542728	3542733	0 %	0 %	50 %	50 %	470215286
102056	NC_020561	CGA	2	6	3542760	3542765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215286
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102060	NC_020561	CG	3	6	3542931	3542936	0 %	0 %	50 %	50 %	470215287
102061	NC_020561	CG	3	6	3542939	3542944	0 %	0 %	50 %	50 %	470215287
102062	NC_020561	CGG	2	6	3542953	3542958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215287
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102066	NC_020561	GC	3	6	3543050	3543055	0 %	0 %	50 %	50 %	470215287
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102096	NC_020561	TCCCTT	2	12	3543950	3543961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102097	NC_020561	CGCGC	2	10	3543977	3543986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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102102	NC_020561	CG	3	6	3544085	3544090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102103	NC_020561	CGG	2	6	3544106	3544111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102104	NC_020561	CG	3	6	3544186	3544191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102105	NC_020561	ATA	2	6	3544208	3544213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102106	NC_020561	CGG	2	6	3544232	3544237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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102113	NC_020561	TGGG	2	8	3544455	3544462	0 %	25 %	75 %	0 %	470215288
102114	NC_020561	GCC	2	6	3544506	3544511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215288
102115	NC_020561	TCT	3	9	3544522	3544530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470215288
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102234	NC_020561	GGCT	2	8	3548448	3548455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102235	NC_020561	GCG	4	12	3548472	3548483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102236	NC_020561	CGCC	2	8	3548515	3548522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102237	NC_020561	TCT	2	6	3548583	3548588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102238	NC_020561	GCGT	2	8	3548622	3548629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102239	NC_020561	GA	3	6	3548701	3548706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102241	NC_020561	GGC	2	6	3548765	3548770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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102317	NC_020561	CCG	4	12	3551790	3551801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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102333	NC_020561	GAT	2	6	3552373	3552378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470215295
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102337	NC_020561	CGGGG	2	10	3552560	3552569	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102338	NC_020561	GCC	2	6	3552591	3552596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102339	NC_020561	TCGC	2	8	3552639	3552646	0 %	25 %	25 %	50 %	470215296
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102344	NC_020561	GC	3	6	3552864	3552869	0 %	0 %	50 %	50 %	470215296
102345	NC_020561	GCC	2	6	3552897	3552902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215296
102346	NC_020561	GAAC	2	8	3552904	3552911	50 %	0 %	25 %	25 %	470215296
102347	NC_020561	GAT	2	6	3552932	3552937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470215297
102348	NC_020561	TCG	2	6	3552982	3552987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215297
102349	NC_020561	CGGC	2	8	3552994	3553001	0 %	0 %	50 %	50 %	470215297
102350	NC_020561	TCG	2	6	3553003	3553008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215297
102351	NC_020561	CGG	2	6	3553028	3553033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215297
102352	NC_020561	CCA	2	6	3553078	3553083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470215297
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102354	NC_020561	GTG	2	6	3553140	3553145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470215297
102355	NC_020561	TCA	2	6	3553150	3553155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215297
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102357	NC_020561	CGC	2	6	3553182	3553187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215297
102358	NC_020561	TCG	2	6	3553195	3553200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215297
102359	NC_020561	CGC	2	6	3553220	3553225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215297
102360	NC_020561	CTG	2	6	3553248	3553253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215297
102361	NC_020561	TCG	2	6	3553258	3553263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215297
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102367	NC_020561	CCG	2	6	3553459	3553464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102368	NC_020561	ACG	2	6	3553466	3553471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102369	NC_020561	GGCG	2	8	3553474	3553481	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102370	NC_020561	GCC	2	6	3553484	3553489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102371	NC_020561	CAT	2	6	3553500	3553505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102372	NC_020561	GCC	2	6	3553526	3553531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102373	NC_020561	GGA	2	6	3553548	3553553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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102376	NC_020561	GC	3	6	3553678	3553683	0 %	0 %	50 %	50 %	470215298
102377	NC_020561	GGC	3	9	3553684	3553692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215298
102378	NC_020561	CGG	2	6	3553701	3553706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215298
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102380	NC_020561	CAT	2	6	3553762	3553767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215298
102381	NC_020561	CGG	2	6	3553891	3553896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215298
102382	NC_020561	CGA	2	6	3553932	3553937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215298
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102386	NC_020561	CGG	2	6	3554013	3554018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215298
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102388	NC_020561	G	6	6	3554062	3554067	0 %	0 %	100 %	0 %	470215298
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102392	NC_020561	CGA	2	6	3554127	3554132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215298
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102429	NC_020561	GC	3	6	3555527	3555532	0 %	0 %	50 %	50 %	470215299
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102437	NC_020561	CGG	2	6	3555771	3555776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215299
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102439	NC_020561	GGC	2	6	3555846	3555851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
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102441	NC_020561	CGG	2	6	3555961	3555966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102442	NC_020561	CGA	2	6	3555997	3556002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102443	NC_020561	CGGG	2	8	3556030	3556037	0 %	0 %	75 %	25 %	470215300
102444	NC_020561	TCG	2	6	3556051	3556056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102445	NC_020561	CGC	3	9	3556059	3556067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215300
102446	NC_020561	CTG	2	6	3556068	3556073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102447	NC_020561	GCT	2	6	3556109	3556114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102448	NC_020561	CAC	2	6	3556139	3556144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470215300
102449	NC_020561	GCCC	2	8	3556145	3556152	0 %	0 %	25 %	75 %	470215300
102450	NC_020561	TGC	2	6	3556153	3556158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102451	NC_020561	GCG	2	6	3556188	3556193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102452	NC_020561	GC	3	6	3556198	3556203	0 %	0 %	50 %	50 %	470215300
102453	NC_020561	TCA	2	6	3556321	3556326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215300
102454	NC_020561	GGCCG	2	10	3556334	3556343	0 %	0 %	60 %	40 %	470215300
102455	NC_020561	CGG	2	6	3556345	3556350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102456	NC_020561	GCCG	2	8	3556433	3556440	0 %	0 %	50 %	50 %	470215300
102457	NC_020561	GC	3	6	3556453	3556458	0 %	0 %	50 %	50 %	470215300
102458	NC_020561	CGGG	3	12	3556461	3556472	0 %	0 %	75 %	25 %	470215300
102459	NC_020561	TTTC	2	8	3556526	3556533	0 %	75 %	0 %	25 %	470215300
102460	NC_020561	GC	3	6	3556543	3556548	0 %	0 %	50 %	50 %	470215300
102461	NC_020561	ATC	2	6	3556566	3556571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470215300
102462	NC_020561	GGC	2	6	3556608	3556613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102463	NC_020561	CTG	2	6	3556614	3556619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102464	NC_020561	GGGCGC	2	12	3556628	3556639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102465	NC_020561	GC	3	6	3556648	3556653	0 %	0 %	50 %	50 %	470215300
102466	NC_020561	TGC	3	9	3556654	3556662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102467	NC_020561	GGC	2	6	3556706	3556711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102468	NC_020561	TCG	2	6	3556885	3556890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102469	NC_020561	GGC	2	6	3556907	3556912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
102470	NC_020561	GCA	2	6	3556915	3556920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102471	NC_020561	GCTG	2	8	3556930	3556937	0 %	25 %	50 %	25 %	470215300
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102474	NC_020561	GCT	3	9	3556997	3557005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102475	NC_020561	GCGCT	2	10	3557007	3557016	0 %	20 %	40 %	40 %	470215300
102476	NC_020561	CTC	2	6	3557051	3557056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470215300
102477	NC_020561	TCG	2	6	3557074	3557079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215300
102478	NC_020561	GATC	2	8	3557132	3557139	25 %	25 %	25 %	25 %	470215300
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102482	NC_020561	GGC	2	6	3557333	3557338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470215300
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102485	NC_020561	GCC	2	6	3557411	3557416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102486	NC_020561	GCG	2	6	3557437	3557442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102487	NC_020561	AAG	2	6	3557454	3557459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102488	NC_020561	CGCCC	2	10	3557501	3557510	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102489	NC_020561	GCC	2	6	3557511	3557516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102490	NC_020561	GAC	2	6	3557541	3557546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102491	NC_020561	CG	3	6	3557556	3557561	0 %	0 %	50 %	50 %	470215301
102492	NC_020561	CAG	3	9	3557564	3557572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470215301
102493	NC_020561	GTGCCG	2	12	3557580	3557591	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470215301
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102496	NC_020561	CG	3	6	3557708	3557713	0 %	0 %	50 %	50 %	470215301
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102499	NC_020561	TGC	2	6	3557770	3557775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470215301
102500	NC_020561	CGC	2	6	3557830	3557835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470215301

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