MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_020561	CGC	2	6	322407	322412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9002	NC_020561	TAA	2	6	322416	322421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212256
9003	NC_020561	CCCG	2	8	322506	322513	0 %	0 %	25 %	75 %	470212256
9004	NC_020561	GC	3	6	322544	322549	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9005	NC_020561	GCC	2	6	322587	322592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9006	NC_020561	GCG	2	6	322619	322624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9007	NC_020561	GGA	2	6	322692	322697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212256
9008	NC_020561	CCAAT	2	10	322719	322728	40 %	20 %	0 %	40 %	470212256
9009	NC_020561	CGC	2	6	322962	322967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9010	NC_020561	GCCG	2	8	322977	322984	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9011	NC_020561	ATC	2	6	323030	323035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212256
9012	NC_020561	CG	3	6	323089	323094	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9013	NC_020561	CGCCC	2	10	323226	323235	0 %	0 %	20 %	80 %	470212256
9014	NC_020561	GGC	2	6	323244	323249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9015	NC_020561	AAG	2	6	323260	323265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470212256
9016	NC_020561	CGC	2	6	323327	323332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9017	NC_020561	TCC	2	6	323357	323362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212256
9018	NC_020561	CGC	2	6	323481	323486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9019	NC_020561	CCG	2	6	323532	323537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9020	NC_020561	CGC	2	6	323541	323546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9021	NC_020561	TCG	2	6	323555	323560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9022	NC_020561	CCGATC	2	12	323588	323599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212256
9023	NC_020561	AAGCC	2	10	323609	323618	40 %	0 %	20 %	40 %	470212256
9024	NC_020561	CAG	2	6	323638	323643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9025	NC_020561	ATG	2	6	323662	323667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212256
9026	NC_020561	CCG	2	6	323795	323800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9027	NC_020561	TCCGG	2	10	323824	323833	0 %	20 %	40 %	40 %	470212256
9028	NC_020561	CGG	2	6	323844	323849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9029	NC_020561	GCT	2	6	323862	323867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9030	NC_020561	GCC	3	9	323882	323890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9031	NC_020561	CGAT	2	8	323935	323942	25 %	25 %	25 %	25 %	470212256
9032	NC_020561	GCC	2	6	324022	324027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9033	NC_020561	CG	3	6	324044	324049	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9034	NC_020561	GGA	2	6	324096	324101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212256
9035	NC_020561	CG	3	6	324103	324108	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9036	NC_020561	GAC	2	6	324153	324158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9037	NC_020561	GCG	2	6	324164	324169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9038	NC_020561	CG	3	6	324264	324269	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9039	NC_020561	GCC	2	6	324290	324295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9040	NC_020561	GAC	2	6	324300	324305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9041	NC_020561	TCC	2	6	324355	324360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212256
9042	NC_020561	CAG	2	6	324391	324396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9043	NC_020561	CCAG	2	8	324422	324429	25 %	0 %	25 %	50 %	470212256
9044	NC_020561	CCG	2	6	324500	324505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9045	NC_020561	AAT	2	6	324514	324519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470212256
9046	NC_020561	GCT	3	9	324537	324545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9047	NC_020561	TCG	2	6	324566	324571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9048	NC_020561	GAG	2	6	324631	324636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212256
9049	NC_020561	CTG	2	6	324718	324723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9050	NC_020561	GGC	2	6	324728	324733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9051	NC_020561	CG	3	6	324772	324777	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9052	NC_020561	GGA	2	6	324780	324785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212256
9053	NC_020561	GC	3	6	324806	324811	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9054	NC_020561	GCG	2	6	324839	324844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9055	NC_020561	AT	3	6	324846	324851	50 %	50 %	0 %	0 %	470212256
9056	NC_020561	TCG	2	6	324854	324859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9057	NC_020561	GGC	2	6	324871	324876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
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9059	NC_020561	CGA	2	6	325004	325009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9060	NC_020561	CGG	2	6	325037	325042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9061	NC_020561	GC	3	6	325047	325052	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9062	NC_020561	CCATC	2	10	325074	325083	20 %	20 %	0 %	60 %	470212256
9063	NC_020561	GGA	2	6	325110	325115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212256
9064	NC_020561	TCG	2	6	325124	325129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9065	NC_020561	CAA	2	6	325164	325169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470212256
9066	NC_020561	GC	4	8	325217	325224	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9067	NC_020561	GGC	2	6	325237	325242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
9068	NC_020561	CGC	2	6	325257	325262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
9069	NC_020561	TGG	3	9	325274	325282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212256
9070	NC_020561	GC	3	6	325465	325470	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9071	NC_020561	CG	3	6	325482	325487	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9072	NC_020561	CGTC	2	8	325552	325559	0 %	25 %	25 %	50 %	470212256
9073	NC_020561	CGA	2	6	325602	325607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9074	NC_020561	TCG	2	6	325622	325627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
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9076	NC_020561	TGC	2	6	325685	325690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212256
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9078	NC_020561	CGCCCG	2	12	325733	325744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
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9080	NC_020561	CGATCG	2	12	325806	325817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212256
9081	NC_020561	CG	3	6	325816	325821	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9082	NC_020561	GGC	2	6	325834	325839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212256
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9084	NC_020561	CCGG	2	8	325881	325888	0 %	0 %	50 %	50 %	470212256
9085	NC_020561	GGT	2	6	325932	325937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212256
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9087	NC_020561	GCC	2	6	325975	325980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212256
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9089	NC_020561	CGC	2	6	326000	326005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212257
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9091	NC_020561	CG	3	6	326019	326024	0 %	0 %	50 %	50 %	470212257
9092	NC_020561	GCC	2	6	326040	326045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212257
9093	NC_020561	TGC	2	6	326083	326088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212257
9094	NC_020561	GCC	2	6	326118	326123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212257
9095	NC_020561	TCT	2	6	326215	326220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212257
9096	NC_020561	CG	3	6	326237	326242	0 %	0 %	50 %	50 %	470212257
9097	NC_020561	CAG	2	6	326282	326287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212257
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9099	NC_020561	ATC	2	6	326465	326470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_020561	GC	3	6	326501	326506	0 %	0 %	50 %	50 %	470212258
9101	NC_020561	CCG	2	6	326602	326607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212258
9102	NC_020561	ATG	2	6	326623	326628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212258
9103	NC_020561	CCG	2	6	326629	326634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212258
9104	NC_020561	GTG	2	6	326667	326672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212258
9105	NC_020561	TGG	2	6	326710	326715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212258
9106	NC_020561	CGGG	2	8	326727	326734	0 %	0 %	75 %	25 %	470212258
9107	NC_020561	CGG	2	6	326756	326761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212258
9108	NC_020561	GCC	2	6	326850	326855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212258
9109	NC_020561	GCG	2	6	326872	326877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212258
9110	NC_020561	CGA	2	6	326957	326962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212258
9111	NC_020561	GCT	2	6	326966	326971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212258
9112	NC_020561	GGC	2	6	326979	326984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212258
9113	NC_020561	CAG	2	6	326987	326992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212258
9114	NC_020561	CGCCAT	2	12	327011	327022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470212258
9115	NC_020561	GCC	3	9	327052	327060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212258
9116	NC_020561	AGC	2	6	327148	327153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212259
9117	NC_020561	GC	3	6	327152	327157	0 %	0 %	50 %	50 %	470212259
9118	NC_020561	CGT	2	6	327209	327214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212259
9119	NC_020561	GCC	2	6	327289	327294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212259
9120	NC_020561	CCGCC	2	10	327374	327383	0 %	0 %	20 %	80 %	470212259
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9122	NC_020561	CGCC	2	8	327467	327474	0 %	0 %	25 %	75 %	470212259
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9246	NC_020561	TGG	2	6	331427	331432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212262
9247	NC_020561	CGG	2	6	331470	331475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212262
9248	NC_020561	CCCGC	2	10	331504	331513	0 %	0 %	20 %	80 %	470212262
9249	NC_020561	CG	3	6	331527	331532	0 %	0 %	50 %	50 %	470212262
9250	NC_020561	CGG	3	9	331536	331544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212262
9251	NC_020561	GCGG	3	12	331541	331552	0 %	0 %	75 %	25 %	470212262
9252	NC_020561	CACCGA	2	12	331572	331583	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470212262
9253	NC_020561	GC	4	8	331588	331595	0 %	0 %	50 %	50 %	470212262
9254	NC_020561	CGTG	2	8	331607	331614	0 %	25 %	50 %	25 %	470212262
9255	NC_020561	GCT	2	6	331701	331706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212262
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9258	NC_020561	CAT	2	6	331813	331818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212263
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9260	NC_020561	GCT	2	6	331849	331854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212263
9261	NC_020561	GCGG	2	8	331859	331866	0 %	0 %	75 %	25 %	470212263
9262	NC_020561	CGG	2	6	331872	331877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212263
9263	NC_020561	CGG	2	6	331884	331889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212263
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9266	NC_020561	GCC	2	6	331924	331929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212263
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9270	NC_020561	CGA	2	6	332005	332010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212263
9271	NC_020561	TGC	2	6	332016	332021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212263
9272	NC_020561	CG	3	6	332063	332068	0 %	0 %	50 %	50 %	470212263
9273	NC_020561	TCG	2	6	332085	332090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212263
9274	NC_020561	CGC	2	6	332122	332127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212263
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9276	NC_020561	CGGG	2	8	332172	332179	0 %	0 %	75 %	25 %	470212263
9277	NC_020561	ATCGGC	2	12	332192	332203	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212263
9278	NC_020561	CGG	2	6	332213	332218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212263
9279	NC_020561	GCG	2	6	332291	332296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212263
9280	NC_020561	GCCA	2	8	332327	332334	25 %	0 %	25 %	50 %	470212263
9281	NC_020561	CGC	2	6	332346	332351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212263
9282	NC_020561	TCG	2	6	332370	332375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212263
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9285	NC_020561	CG	3	6	332415	332420	0 %	0 %	50 %	50 %	470212263
9286	NC_020561	CGA	2	6	332473	332478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212263
9287	NC_020561	GCGCG	2	10	332563	332572	0 %	0 %	60 %	40 %	470212263
9288	NC_020561	GCC	2	6	332632	332637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212263
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9292	NC_020561	CGTG	2	8	332770	332777	0 %	25 %	50 %	25 %	470212263
9293	NC_020561	CGAGGG	2	12	332779	332790	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470212263
9294	NC_020561	CGCT	2	8	332855	332862	0 %	25 %	25 %	50 %	470212263
9295	NC_020561	G	6	6	332863	332868	0 %	0 %	100 %	0 %	470212263
9296	NC_020561	CGGCCT	2	12	332872	332883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470212263
9297	NC_020561	TCC	3	9	332967	332975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212263
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9300	NC_020561	TCA	2	6	333008	333013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212263
9301	NC_020561	GC	3	6	333057	333062	0 %	0 %	50 %	50 %	470212263
9302	NC_020561	GGA	2	6	333094	333099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9303	NC_020561	GCCAGG	2	12	333156	333167	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470212264
9304	NC_020561	CGG	2	6	333169	333174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212264
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9319	NC_020561	GCCC	2	8	333947	333954	0 %	0 %	25 %	75 %	470212264
9320	NC_020561	GC	3	6	333975	333980	0 %	0 %	50 %	50 %	470212264
9321	NC_020561	TCG	2	6	334011	334016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212264
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9327	NC_020561	TCCTGG	2	12	334240	334251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212265
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9332	NC_020561	GCC	2	6	334330	334335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212265
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9336	NC_020561	TGC	2	6	334564	334569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212265
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9349	NC_020561	CGCC	2	8	335002	335009	0 %	0 %	25 %	75 %	470212265
9350	NC_020561	CGT	2	6	335060	335065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212265
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9352	NC_020561	TCG	2	6	335142	335147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212265
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9354	NC_020561	CAT	2	6	335180	335185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212265
9355	NC_020561	TCGTC	2	10	335197	335206	0 %	40 %	20 %	40 %	470212265
9356	NC_020561	GAT	2	6	335214	335219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212265
9357	NC_020561	CGC	2	6	335225	335230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212265
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9359	NC_020561	CGG	2	6	335330	335335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212265
9360	NC_020561	TGC	2	6	335338	335343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212265
9361	NC_020561	CG	3	6	335355	335360	0 %	0 %	50 %	50 %	470212265
9362	NC_020561	GTG	2	6	335379	335384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212265
9363	NC_020561	GCC	2	6	335388	335393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212265
9364	NC_020561	GAC	2	6	335435	335440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212265
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9487	NC_020561	CG	3	6	339272	339277	0 %	0 %	50 %	50 %	470212270
9488	NC_020561	CTG	3	9	339323	339331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212270
9489	NC_020561	GGA	2	6	339358	339363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212270
9490	NC_020561	GCC	3	9	339435	339443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212270
9491	NC_020561	GGA	2	6	339460	339465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212270
9492	NC_020561	GCG	2	6	339477	339482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212270
9493	NC_020561	CGAG	2	8	339522	339529	25 %	0 %	50 %	25 %	470212270
9494	NC_020561	ATC	2	6	339551	339556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212270
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9496	NC_020561	CGA	2	6	339664	339669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212270
9497	NC_020561	CGGGCG	2	12	339800	339811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212271
9498	NC_020561	GGCGC	3	15	339843	339857	0 %	0 %	60 %	40 %	470212271
9499	NC_020561	GTC	2	6	339865	339870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212271
9500	NC_020561	CGG	2	6	339879	339884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212271

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